单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 22181 - 22200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22181 | 2024-08-08 |
Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Cardiovascular Research
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.810232
PMID:35174168
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术如何帮助识别心血管疾病治疗的新靶点 | NA | 总结单细胞RNA测序技术在心血管系统胚胎发育和疾病发病机制及治疗中的最新发现 | 心血管系统的胚胎发育、心血管疾病的发病机制及治疗 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22182 | 2024-08-08 |
Complex Involvement of the Extracellular Matrix, Immune Effect, and Lipid Metabolism in the Development of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.800747
PMID:35174208
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研究论文 | 本研究通过mRNA测序和其他技术分析了特发性肺纤维化（IPF）患者肺组织中的基因表达，揭示了细胞外基质（ECM）重塑、脂质代谢和免疫效应在IPF早期发展中的复杂作用 | 首次全面揭示了IPF中涉及的380个差异表达转录本（DETs），并验证了其中21个基因的表达，通过单细胞RNA测序追踪了这些基因的细胞来源 | 研究样本量较小，且仅包括早期和移植阶段的IPF患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨特发性肺纤维化（IPF）的病理机制，特别是细胞外基质重塑、脂质代谢和免疫效应的作用 | 特发性肺纤维化（IPF）患者的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | mRNA测序, 实时定量PCR (RT-qPCR), 免疫组化, 蛋白质印迹, 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 7例早期IPF患者, 2例移植阶段IPF患者, 6例健康对照 |
| 22183 | 2024-08-08 |
Loss of Foxd4 Impacts Neurulation and Cranial Neural Crest Specification During Early Head Development
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.777652
PMID:35178396
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研究论文 | 本研究探讨了Foxd4基因在早期头部发育中的作用，特别是在神经管闭合和颅神经嵴分化中的作用 | 通过CRISPR-Cas9基因编辑技术在胚胎干细胞中生成Foxd4的双等位基因移码突变，揭示了Foxd4在早期神经上皮发育中的关键作用 | NA | 研究Foxd4基因在早期头部发育中的功能和机制 | Foxd4基因在胚胎干细胞中的功能及其对头部发育的影响 | NA | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据 | E7.75和E8.25的小鼠胚胎 |
| 22184 | 2024-08-08 |
Single-Cell Differential Network Analysis with Sparse Bayesian Factor Models
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.810816
PMID:35186014
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研究论文 | 本文提出了一种稀疏分层贝叶斯因子模型，用于在不同生物条件下从单细胞RNA测序数据中识别网络结构的差异 | 利用潜在因子影响每个细胞的基因表达值，以解释单细胞RNA测序数据特有的零膨胀、细胞间变异增加和过度分散问题 | NA | 探索在不同生物条件下基因相互作用的变化 | 单细胞RNA测序数据中的基因-基因相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 稀疏分层贝叶斯因子模型 | 基因表达数据 | NA |
| 22185 | 2024-08-08 |
CD44-Mediated Poor Prognosis in Glioma Is Associated With M2-Polarization of Tumor-Associated Macrophages and Immunosuppression
2021, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2021.775194
PMID:35187044
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研究论文 | 本研究探讨了CD44在胶质瘤中的作用，通过大规模转录组、空间和单细胞转录组水平分析，发现CD44与胶质瘤的恶性程度和预后负相关，并与肿瘤相关巨噬细胞的M2极化和免疫抑制有关。 | 本研究首次揭示了CD44作为新的M2型肿瘤相关巨噬细胞标志物，在胶质瘤微环境中促进肿瘤进展和免疫抑制的作用。 | NA | 阐明CD44在胶质瘤中的作用及其与预后的关系。 | 胶质瘤及其相关基因CD44。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 研究包括来自TCGA、CGGA、Ivy Glioblastoma Atlas Project和GSE103224的多种胶质瘤样本。 |
| 22186 | 2024-08-08 |
Highly Regional Genes: graph-based gene selection for single-cell RNA-seq data
2022-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.01.004
PMID:35144027
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研究论文 | 提出了一种名为HRG的新特征选择方法，用于在单细胞RNA-seq数据中选择显示区域表达模式的基因 | HRG方法通过模仿人类在细胞二维可视化中的标记选择，能够找到具有区域表达模式的基因，提高了准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种新的基因选择方法，以提高单细胞RNA-seq数据分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22187 | 2024-08-08 |
Generation of a recessive dystrophic epidermolysis bullosa mouse model with patient-derived compound heterozygous mutations
2022-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-022-00735-5
PMID:35152273
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研究论文 | 本文通过CRISPR-based基因编辑技术i-GONAD，成功建立了携带患者来源的复合杂合突变的隐性营养不良型大疱性表皮松解症（RDEB）小鼠模型 | 首次成功建立了携带患者特异性复合杂合突变的RDEB小鼠模型，为研究RDEB的发病机制和治疗提供了新的工具 | NA | 建立一个可靠的RDEB小鼠模型，以研究其发病机制并开发治疗方法 | 隐性营养不良型大疱性表皮松解症（RDEB）及其小鼠模型 | NA | 隐性营养不良型大疱性表皮松解症 | CRISPR-based基因编辑技术 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序 | 包括c.5818delC和E2857X突变的小鼠 |
| 22188 | 2024-08-08 |
A Multicancer Malignant Pleural Effusion Diagnostic Test Using Hexokinase 2 and Single-Cell Sequencing
2022-05-18, Clinical chemistry
IF:7.1Q1
DOI:10.1093/clinchem/hvac003
PMID:35142335
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研究论文 | 本文报道了一种基于己糖激酶2（HK2）和单细胞测序的新型诊断方法（HK2-seq），用于多癌种恶性胸腔积液（MPE）的诊断 | HK2-seq方法利用HK2作为新的代谢功能相关标记物，通过检测多种癌症类型的胸腔积液中参与增加糖酵解的播散性肿瘤细胞，结合单细胞测序确认高糖酵解肿瘤细胞（hgTCs）的恶性程度，从而建立明确的MPE诊断 | NA | 开发一种新的诊断方法，用于提高多癌种恶性胸腔积液的诊断准确性 | 恶性胸腔积液及其相关肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 111名胸腔积液患者 |
| 22189 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of the prognostic and role in immune cell infiltration of MSR1 expression in lower-grade gliomas
2022-05, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.4603
PMID:35142109
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研究论文 | 本研究旨在验证巨噬细胞清道夫受体1（MSR1）在低级别胶质瘤（LGG）患者中的预后和免疫相关作用 | 首次全面分析了MSR1在低级别胶质瘤中的表达与预后及免疫细胞浸润的关系 | 研究数据来源于公共数据库，实验验证部分有限 | 验证MSR1在低级别胶质瘤患者中的预后价值和免疫相关作用 | 低级别胶质瘤（LGG）患者 | 数字病理学 | 脑瘤 | 基因集富集分析（GSEA） | NA | 基因表达数据 | 数据来源于公共数据库，具体样本量未详细说明 |
| 22190 | 2024-08-08 |
MAX deficiency impairs human endometrial decidualization through down-regulating OSR2 in women with recurrent spontaneous abortion
2022-May, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-022-03579-z
PMID:35146559
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫组化等技术，研究了MAX缺陷如何通过下调OSR2影响人类子宫内膜蜕膜化，进而导致习惯性流产 | 首次揭示了MAX通过直接调控OSR2的表达，影响子宫内膜蜕膜化和细胞增殖，从而导致习惯性流产的分子机制 | NA | 探讨习惯性流产中子宫内膜蜕膜化的分子机制 | 人类子宫内膜间质细胞和蜕膜组织 | NA | 习惯性流产 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化（IHC）、定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR）、RNA测序、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、切割目标并使用核酸酶释放测序（CUT&RUN-seq） | NA | RNA | 来自习惯性流产女性的蜕膜组织和子宫内膜间质细胞 |
| 22191 | 2024-08-08 |
An MRI radiomics approach to predict survival and tumour-infiltrating macrophages in gliomas
2022-04-29, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awab340
PMID:35136934
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研究论文 | 本研究构建了一个基于术前T2加权MRI的放射组学模型，用于预测胶质瘤患者的生存和肿瘤浸润巨噬细胞 | 开发了一个基于14个放射组学特征的预测模型，显示出高度稳健的预测能力，并关联了免疫反应，特别是肿瘤巨噬细胞浸润 | NA | 构建一个稳定且可验证的术前T2加权MRI放射组学模型，用于预测胶质瘤患者的生存 | 652名胶质瘤患者的术前T2加权MRI图像、RNA-seq和临床数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 放射组学 | 机器学习 | 图像 | 652名胶质瘤患者 |
| 22192 | 2024-08-08 |
Neuron-derived neuropeptide Y fine-tunes the splenic immune responses
2022-04-20, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.01.010
PMID:35139365
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研究论文 | 本文研究了神经系统和免疫系统之间的相互作用，特别是神经元衍生的神经肽Y（NPY）对脾脏免疫反应的精细调节作用 | 首次揭示了NPY在神经系统和免疫系统交叉对话中的古老语言作用，并探讨了其在调节感染期间的炎症风暴和自身免疫疾病中的潜在应用 | NA | 探讨神经肽Y在神经系统和免疫系统交叉对话中的作用及其在疾病治疗中的潜在应用 | 神经肽Y（NPY）及其在脾脏免疫反应中的作用 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | 涉及大鼠、果蝇模型以及人类自身免疫疾病患者和鼠模型实验 |
| 22193 | 2024-08-08 |
Optimal transport improves cell-cell similarity inference in single-cell omics data
2022-04-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac084
PMID:35157031
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研究论文 | 本文提出使用最优传输（OT）作为单细胞组学数据中细胞间相似性度量的方法 | 引入最优传输作为细胞间相似性度量，并通过熵正则化加速计算，以处理单细胞数据的高维度 | NA | 改进单细胞组学数据中细胞间相似性的推断和细胞聚类 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）和单细胞DNA甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 最优传输（OT） | NA | 单细胞组学数据 | 13个独立数据集，包括模拟数据、scRNA-seq、scATAC-seq和单细胞DNA甲基化数据 |
| 22194 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional analysis of human endothelial colony-forming cells from patients with low VWF levels
2022-04-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021010683
PMID:35143643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自低VWF水平患者的内皮集落形成细胞，以识别VWF水平的新调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别内皮集落形成细胞中VWF水平的新调节因子，并通过siRNA实验进一步验证 | NA | 旨在识别内皮集落形成细胞中VWF水平的新调节因子 | 来自低VWF水平患者和健康对照的内皮集落形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自低VWF水平患者和健康对照的内皮集落形成细胞，以及人脐静脉内皮细胞作为对照 |
| 22195 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals induction of distinct trained-immunity programs in human monocytes
2022-04-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147719
PMID:35133977
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类单核细胞在训练免疫诱导下的不同转录程序 | 首次探索了先天免疫细胞中训练免疫诱导的潜在异质性 | NA | 研究训练免疫在单核细胞中的转录程序及其在免疫介导疾病中的影响 | 人类单核细胞及其在不同诱导剂下的训练免疫反应 | NA | 溃疡性结肠炎、脓毒症、COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个患者样本 |
| 22196 | 2024-08-08 |
Fusion prior gene network for high reliable single-cell gene regulatory network inference
2022-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105279
PMID:35134605
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研究论文 | 本文提出了一种名为FGRNAE的框架，用于提高单细胞基因调控网络推断的可靠性 | 利用随机游走重启算法和随机森林算法，结合共功能网络数据，提高了单细胞基因调控网络推断的准确性 | NA | 提高单细胞基因调控网络推断的准确性 | 单细胞基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因网络数据 | NA |
| 22197 | 2024-08-08 |
The atlas of ACE2 expression in fetal and adult human hearts reveals the potential mechanism of heart-injured patients infected with SARS-CoV-2
2022-04-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00169.2021
PMID:35138176
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研究论文 | 本研究深入分析了胎儿和成人心脏中单细胞表达谱，以探索SARS-CoV-2对心脏造成伤害的潜在机制 | 通过单细胞转录组分析，揭示了心脏发育不同阶段中ACE2表达水平的变化，并确认了其在SARS-CoV-2感染风险中的作用 | NA | 探索SARS-CoV-2通过ACE2感染心脏的潜在机制 | 胎儿和成人心脏中的ACE2表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 单细胞转录组数据 | 涉及胎儿和成人心脏样本 |
| 22198 | 2024-08-08 |
Uterine fluid microRNAs are dysregulated in women with recurrent implantation failure
2022-04-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac019
PMID:35147192
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研究论文 | 本研究探讨了反复植入失败（RIF）女性子宫液中microRNAs（miRNAs）的组成与健康生育女性之间的差异，并发现RIF女性的子宫液miRNAs组成与健康女性不同，这些失调的miRNAs与子宫内膜容受性和胚胎植入受损有关。 | 首次全面分析了具有生育能力健康女性和被诊断为RIF女性的接受期子宫液中总miRNAs的分布，为RIF的分子机制提供了新的见解，并可能对未来的生物标志物和临床治疗研究产生影响。 | 这是一项描述性研究，参与研究的人数有限。此外，识别出的差异丰富的miRNAs应在更大的研究队列中进行验证，并且RIF中预测的miRNA靶基因和富集途径需要在体外进一步确认和探索。 | 研究反复植入失败女性子宫液中miRNAs的组成与健康生育女性之间的差异。 | 反复植入失败女性和健康生育女性的子宫液中的miRNAs。 | NA | 生殖健康问题 | small RNA sequencing, quantitative real-time PCR (RT-PCR) | NA | miRNA | 健康生育女性17人，反复植入失败女性34人 |
| 22199 | 2024-08-08 |
Second Heart Field-Derived Cells Contribute to Angiotensin II-Mediated Ascending Aortopathies
2022-03-29, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究探讨了第二心场（SHF）来源的细胞在血管紧张素II（AngII）介导的升主动脉病变中的作用 | 发现SHF来源的细胞通过LRP1和转化生长因子-β信号通路在维持血管完整性中起关键作用，并揭示了PAI1在AngII诱导的升主动脉病变中的重要作用 | NA | 确定SHF来源的细胞是否以及如何参与升主动脉病变 | 升主动脉病变患者和AngII注射小鼠的升主动脉 | 心血管疾病 | NA | 质谱辅助蛋白质组学和单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质和mRNA | 人类升主动脉瘤组织和AngII注射小鼠的升主动脉 |
| 22200 | 2024-08-08 |
Blue light responses in Cancer borealis stomatogastric ganglion neurons
2022-03-28, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.01.064
PMID:35148862
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研究论文 | 研究了蓝光对Cancer borealis螃蟹的口胃神经系统（STG）神经元活动的影响 | 首次发现并研究了STG神经元对蓝光的固有反应，并识别了潜在的介导分子cryptochrome | NA | 探索蓝光如何影响STG神经元的活动及其潜在机制 | Cancer borealis螃蟹的STG神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |