单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 34287 篇文献，本页显示第 2201 - 2220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2201 | 2025-11-21 |
Unravelling cell heterogeneity and gene regulation mechanisms in multiple myeloma through single-cell RNA-seq
2025-Nov-16, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.11.006
PMID:41253222
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究多发性骨髓瘤的细胞异质性和基因调控机制 | 首次整合四个公共scRNA-Seq数据集，识别24个MM细胞簇并预测651个调控子 | 仅使用公共数据集，缺乏实验验证 | 解析多发性骨髓瘤的细胞异质性和基因调控机制 | 多发性骨髓瘤细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个数据集共包含597、172、477和51,840个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2202 | 2025-11-21 |
Exhausted KLRG1hi CD8+ T and pathogenic GZMA+ Th17 cells are associated with the mild Mycoplasma pneumoniae pneumonia in children
2025-Nov, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2025.106642
PMID:41173398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术揭示了儿童轻度肺炎支原体肺炎中T细胞和B淋巴细胞的功能障碍特征 | 首次在MPP患儿中系统描述了耗竭性KLRG1hi CD8+ T细胞和致病性GZMA+ Th17细胞的免疫特征 | 研究仅限于轻度肺炎支原体肺炎患儿，未涉及重症病例 | 阐明适应性免疫在儿童肺炎支原体肺炎发病机制中的作用 | 肺炎支原体单一感染的轻度肺炎患儿 | 免疫学 | 肺炎支原体肺炎 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2203 | 2025-11-21 |
The cervicovaginal microbiome associates with spatially restricted host transcriptional signatures throughout the human ectocervical epithelium and submucosa
2025-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013677
PMID:41218071
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示宫颈阴道微生物组与人类宫颈上皮及黏膜下组织转录特征的空间关联 | 首次发现微生物组定植虽局限于腔面，但其转录影响贯穿整个黏膜层，在基底膜两侧最为显著 | 样本量较小（n=21），仅针对肯尼亚女性性工作者群体 | 探究宫颈阴道微生物组对宫颈转录景观的影响及其与HIV易感性的关联 | 肯尼亚女性性工作者的宫颈组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学 | 加权基因共表达分析 | 空间转录组数据 | 21例宫颈组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2204 | 2025-11-21 |
Comparative genomics, integrated with single-cell sequencing and genetic analyses, reveal roles of transcription factor AP2-M2 in asexual replication of Babesia parasite
2025-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013699
PMID:41231960
|
研究论文 | 本研究通过比较基因组学、单细胞测序和遗传分析揭示了转录因子AP2-M2在巴贝斯虫无性繁殖阶段的关键调控作用 | 首次构建了新疆巴贝斯虫染色体级别参考基因组，结合单细胞RNA测序揭示了寄生虫无性发育阶段的转录异质性和BxAP2-M2的持续表达特征 | 研究主要聚焦于单一巴贝斯虫物种，调控机制的具体分子通路仍需进一步验证 | 探索巴贝斯虫无性繁殖阶段的分子调控机制 | 新疆巴贝斯虫及其无性发育阶段 | 基因组学 | 巴贝斯虫病 | 单细胞RNA测序, 比较基因组学, 遗传分析 | 伪时间分析 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2205 | 2025-11-21 |
Library size-stabilized metacells construction enhances co-expression network analysis in single-cell data
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013697
PMID:41231963
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研究论文 | 提出一种通过稳定文库大小构建元细胞的计算框架LSMetacell，用于改善单细胞数据中共表达网络分析的准确性 | 首次在元细胞构建过程中显式稳定文库大小，有效减少组成性噪声同时保持细胞异质性 | 仅通过数学建模和模拟验证，需要在更多实际数据集上进一步验证 | 解决单细胞RNA测序数据中的组成性偏差问题，提高共表达网络分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LSMetacell框架 | 基因表达数据 | 死后阿尔茨海默病大脑单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2206 | 2025-11-21 |
Single-Cell RNA Seq in Sydenham Chorea Shows B Cell HLA-DR/DQ Upregulation and Plasma Cell Proteasomal Activation
2025-Nov, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70179
PMID:40859454
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析Sydenham舞蹈症患者外周免疫细胞，发现B细胞HLA-DR/DQ上调和浆细胞蛋白酶体通路激活 | 首次在Sydenham舞蹈症中应用单细胞RNA测序技术揭示B细胞和浆细胞的特定分子通路异常 | 样本量较小（仅1例患者和2例对照），需要更大规模研究验证 | 探究Sydenham舞蹈症的免疫病理机制 | Sydenham舞蹈症患者和性别匹配对照的外周免疫细胞 | 单细胞组学 | 神经系统自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30,794个外周免疫细胞（来自1例患者和2例对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2207 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial omics reveal progressive loss of xylem developmental complexity across seed plants
2025-Oct-31, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf253
PMID:41109686
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间组学技术揭示了裸子植物木质部发育的复杂性，并提出了种子植物维管发育的简化进化轨迹 | 首次在裸子植物中重建木质部分化轨迹，发现裸子植物特有的木质部细胞群体，提出轴向发育程序从裸子植物到被子植物逐渐简化的新理论 | 研究主要集中于针叶树类裸子植物，可能无法完全代表所有裸子植物的多样性 | 探究种子植物木质部发育的进化轨迹和复杂性变化 | 裸子植物（杉木）和被子植物的木质部细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学，空间蛋白质组学，空间代谢组学 | Seurat, scVI | 单细胞RNA测序数据，空间多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，空间蛋白质组学，空间代谢组学 | NA | NA |
| 2208 | 2025-11-21 |
Molecular subtypes and prognostic signature rooted in disulfidptosis highlight tumor microenvironment in lung adenocarcinoma
2025-Oct-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
|
研究论文 | 本研究基于二硫死亡相关基因识别肺腺癌分子亚型并构建预后特征模型 | 首次将新型细胞死亡方式二硫死亡应用于肺腺癌分子分型及预后模型构建 | 研究样本量有限，需进一步多中心验证 | 探索二硫死亡相关基因在肺腺癌肿瘤微环境及预后中的作用 | 肺腺癌患者组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 免疫组化, RT-qPCR | 多变量Cox回归模型, 风险评分模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2209 | 2025-11-21 |
[Traditional Chinese medicine for regulating glycolysis to remodel the tumor immune microenvironment: research progress and future prospects]
2025-Oct-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
|
综述 | 本文综述了中医药通过调控糖酵解重塑肿瘤免疫微环境的研究进展与未来展望 | 系统阐述了中医药通过多靶点调控糖酵解关键酶、代谢信号通路和非编码RNA来改善肿瘤免疫微环境的协同作用机制 | 中医药调控糖酵解与肿瘤微环境相互作用的动态机制尚未完全阐明 | 探讨中医药通过调控糖酵解重塑肿瘤免疫微环境的机制及未来研究方向 | 肿瘤细胞、免疫细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序、纳米递送系统 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2210 | 2025-11-21 |
MSR1 + macrophages passivate antitumor immunity by inducing ITM2A + CD4T exhaustion differentiation
2025-Oct-17, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001578
PMID:41104544
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研究论文 | 本研究揭示了MSR1+巨噬细胞通过调控ITM2A-ZAP70轴诱导CD4T细胞耗竭分化的机制，并开发了靶向CD4T的抗体药物偶联物 | 首次发现MSR1+巨噬细胞通过ITM2A-ZAP70轴调控CD4T细胞耗竭，并成功开发靶向该通路的新型ADC药物 | 研究主要聚焦于肝细胞癌模型，在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证 | 探索膜蛋白在抗肿瘤免疫中的作用并挖掘可靶向的膜蛋白 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是MSR1+巨噬细胞和ITM2A+CD4T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，TimiGP分析，分子动力学模拟，生物化学实验，生物工程技术 | 基因敲除小鼠模型，原位移植模型，质粒衍生自发肝癌模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据，蛋白质相互作用数据 | 基于TCGA和ICGC数据库的临床样本，基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2211 | 2025-11-21 |
Neutrophils predominate as IL1B-expressing cells in Schnitzler syndrome: Insights from the SCan study to evaluate the efficacy and safety of canakinumab in Japanese patients
2025-Oct, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2025.04.003
PMID:40393905
|
研究论文 | 本研究通过SCan试验揭示施尼茨勒综合征中IL1B表达细胞主要为中性粒细胞，并证实卡那单抗通过调节中性粒细胞动态改善临床症状 | 首次在施尼茨勒综合征患者中通过单细胞RNA测序和空间转录组学确定中性粒细胞是IL1B的主要表达细胞 | 样本量较小（仅5名日本患者），且仅对2例患者进行了单细胞分析 | 评估卡那单抗在日本施尼茨勒综合征患者中的疗效和安全性，并探究疾病发病机制 | 5名日本施尼茨勒综合征患者 | 单细胞组学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 临床数据 | 5名患者（其中2名进行了单细胞分析） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2212 | 2025-11-21 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579839
PMID:38405697
|
研究论文 | 提出一种名为NCLUSION的非参数聚类方法，能够在单细胞RNA测序数据中同时进行细胞聚类和标记基因选择 | 使用无限混合模型结合贝叶斯稀疏先验，实现聚类与标记基因选择的同步进行，避免了传统方法中差异表达分析带来的假发现率膨胀问题 | NA | 开发可扩展的单细胞RNA测序数据分析方法，解决现有聚类方法的局限性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无限混合模型，变分推断算法 | 基因表达数据 | 可达数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2213 | 2025-11-21 |
Diversity and heterogeneity in human pancreaticobiliary maljunction revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Mar-21, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-05997-w
PMID:40116982
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类胰胆管合流异常的细胞多样性和异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘胰胆管合流异常的细胞图谱，发现成纤维细胞亚型的主导作用及WNT/TWEAK信号通路异常激活 | 样本量较小（仅6例患者），需更大规模研究验证 | 阐明胰胆管合流异常的病因和发病机制 | 胰胆管合流异常患者和非患者的胆管组织 | 单细胞组学 | 胰胆管合流异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例PBM，3例非PBM） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2214 | 2025-11-21 |
Immune Microenvironmental Differences Between Obese and Healthy People in a High-Altitude Hypoxic Environment
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S562386
PMID:41243986
|
研究论文 | 比较肥胖与正常体重个体在高海拔缺氧环境下的免疫微环境差异 | 首次在单细胞水平揭示肥胖个体在高海拔缺氧环境下Treg细胞比例减少的免疫机制 | 探索性研究，样本量有限，需要进一步验证 | 探索肥胖加剧高海拔缺氧反应的发病机制并寻找潜在生物标志物 | 肥胖与正常体重个体及动物模型 | 单细胞组学 | 高原病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2215 | 2025-11-21 |
The Role of Fibroblasts in Atopic Dermatitis: Establishing Proinflammatory Microenvironments and Mediating Cellular Crosstalk
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S558464
PMID:41243996
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综述 | 本文总结了成纤维细胞在特应性皮炎中通过建立促炎微环境和介导细胞间通讯的作用机制 | 突破传统聚焦免疫细胞和角质形成细胞的研究局限，系统阐述成纤维细胞在AD中的主动免疫调节功能 | NA | 深入理解特应性皮炎的致病机制并为常规治疗反应不佳患者提供新治疗策略 | 特应性皮炎中的成纤维细胞 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2216 | 2025-11-21 |
1-stearoyl-2-arachidonoyl-driven B Cell metabolic dysregulation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: insights from Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1719897
PMID:41244838
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序研究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中B细胞代谢失调的机制 | 首次发现HLA-DR+ CD33- B细胞和脂质代谢物1-硬脂酰-2-花生四烯酰在CRSwNP中的风险作用，并揭示代谢影响B细胞亚群塑造免疫微环境的新机制 | NA | 探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉的免疫代谢失调机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的免疫细胞和代谢物 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,基因集富集分析,机器学习 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据,代谢组数据,基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2217 | 2025-11-21 |
Decoding the immune microenvironment in osteosarcoma: new insights into checkpoints, vaccines, and CAR-T cells
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1702219
PMID:41244900
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综述 | 本文全面概述骨肉瘤的免疫微环境特征及当前新兴的免疫治疗策略 | 整合单细胞转录组学对骨肉瘤免疫微环境的新见解，系统探讨检查点抑制剂、肿瘤疫苗和CAR-T细胞等联合治疗策略 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证提出的治疗策略 | 改善骨肉瘤患者临床预后的免疫治疗策略研究 | 骨肉瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2218 | 2025-11-21 |
Spatial transcriptomics reveals an unexpected impact of tau and tau pathology on the expression of transthyretin
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1656850
PMID:41245137
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了tau蛋白对转甲状腺素蛋白(TTR)表达的意外调控作用 | 首次发现tau蛋白对Ttr mRNA和蛋白表达的调控作用，揭示了tau可能通过影响TTR参与Aβ疾病进展的反馈环路 | 研究仅使用小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究tau蛋白如何改变大脑中mRNA表达 | THY-Tau22转基因小鼠和TauKO基因敲除小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 两种小鼠模型（THY-Tau22和TauKO） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2219 | 2025-11-21 |
Fibroblast-derived interleukin-11 as a potential biomarker for intestinal fibrostenosis in Crohn's disease
2025, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848251391093
PMID:41245384
|
研究论文 | 本研究探讨白细胞介素-11作为克罗恩病肠道纤维狭窄潜在生物标志物的价值 | 首次发现成纤维细胞来源的IL-11在克罗恩病纤维狭窄组织中富集并促进肠道纤维化 | 观察性研究设计，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 研究白细胞介素在检测克罗恩病相关肠道纤维狭窄中的价值 | 克罗恩病患者的肠道组织和血清样本 | 生物标志物研究 | 克罗恩病 | RNA测序,实时聚合酶链反应,免疫组织化学,单细胞RNA测序,Luminex血清检测 | NA | 转录组数据,血清蛋白数据,组织学数据 | 克罗恩病患者手术切除的配对组织样本（包含未受累和纤维狭窄段） | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2220 | 2025-11-21 |
Functional analysis of TWIST1 domains regulating smooth muscle cell phenotype
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1659847
PMID:41246007
|
研究论文 | 本研究通过分析TWIST1转录因子的不同结构域和二聚体组成对平滑肌细胞表型的调控机制 | 首次系统解析TWIST1不同结构域和不同二聚体组合对平滑肌细胞表型调控的独立功能 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步体内验证 | 阐明TWIST1在血管疾病中调控平滑肌细胞表型的分子机制 | 人冠状动脉平滑肌细胞(HCASMCs) | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA测序, 增殖和迁移实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |