单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2201	2025-03-20	Bioengineered vascular grafts with a pathogenic TGFBR1 variant model aneurysm formation in vivo and reveal underlying collagen defects 2024-May-08, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adg6298 PMID:38718134	研究论文	本研究通过结合人类诱导多能干细胞、生物工程血管移植物和基因编辑技术，在动物宿主中建立了功能性的人类胸主动脉瘤模型，揭示了胶原缺陷在疾病形成中的作用	首次在动物宿主中结合hiPSCs、BVGs和基因编辑技术，成功模拟了人类胸主动脉瘤的形成，并揭示了胶原修饰酶活性降低在疾病中的关键作用	研究主要依赖于动物模型，可能无法完全反映人类疾病的复杂性	建立更好的人类胸主动脉瘤疾病模型，以深入理解其发病机制	人类诱导多能干细胞、生物工程血管移植物、裸鼠	生物医学工程	胸主动脉瘤	基因编辑、空间转录组学分析、组织学分析、蛋白质测定	NA	基因表达数据、蛋白质数据、组织学数据	NA
2202	2025-03-20	Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells from Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway 2024-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.18.585556 PMID:38562805	研究论文	本研究探讨了Ibudilast在保护视网膜双极细胞免受兴奋性毒性视网膜损伤中的作用，并激活了mTOR通路	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了Ibudilast在视网膜损伤中的神经保护机制，并发现其通过激活mTOR通路发挥作用	研究主要基于鸡的兴奋性毒性视网膜损伤模型，尚未在人体中进行验证	研究Ibudilast在保护视网膜神经元免受兴奋性毒性损伤中的作用及其机制	视网膜双极细胞和Müller胶质细胞	神经科学	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	鸡的兴奋性毒性视网膜损伤模型
2203	2025-03-20	The BCL-2 inhibitor APG-2575 resets tumor-associated macrophages toward the M1 phenotype, promoting a favorable response to anti-PD-1 therapy via NLRP3 activation 2024-01, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-023-01112-y PMID:38062129	研究论文	本文研究了BCL-2抑制剂APG-2575如何通过激活NLRP3信号通路，将肿瘤相关巨噬细胞从M2型转化为M1型，从而增强抗PD-1疗法的效果	首次发现APG-2575通过直接结合NF-κB p65激活NLRP3信号通路，介导巨噬细胞重极化，从而改善肿瘤免疫微环境	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索APG-2575如何通过改变肿瘤微环境增强抗PD-1疗法的效果	小鼠模型和人类肿瘤样本	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序，多重免疫组化	小鼠模型	RNA测序数据，免疫组化数据	小鼠模型和人类肿瘤样本
2204	2025-03-20	Hepatic lipid-associated macrophages mediate the beneficial effects of bariatric surgery against MASH 2023-Nov-02, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3446960/v1 PMID:37961666	研究论文	本文探讨了垂直袖状胃切除术（VSG）通过肝脏脂质相关巨噬细胞（LAMs）改善代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）的机制	研究发现VSG通过增加表达TREM2的LAMs的溶酶体活性和抑制炎症来改善MASH，且这一过程与体重减轻无关	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究旨在揭示VSG改善MASH的免疫调节机制	肥胖和代谢综合征患者	NA	代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	小鼠模型
2205	2025-03-20	FRC transplantation restores lymph node conduit defects in laminin α4-deficient mice 2023-04-24, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.167816 PMID:37092548	研究论文	本研究揭示了细胞外基质Lama4在调节淋巴结导管中的特定作用，并探讨了FRC移植对Lama4缺陷小鼠淋巴结导管缺陷的修复作用	首次揭示了FRC衍生的Lama4在维持导管纤维完整性中的关键作用，并展示了通过FRC移植修复Lama4缺陷小鼠的淋巴结导管结构和功能的创新方法	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨FRC衍生的Lama4在调节淋巴结导管结构和功能中的作用，并评估FRC移植对Lama4缺陷小鼠的修复效果	Lama4缺陷小鼠及其淋巴结导管	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	Lama4缺陷小鼠及其淋巴结组织
2206	2025-03-20	LAL deficiency induced myeloid-derived suppressor cells as targets and biomarkers for lung cancer 2023-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2022-006272 PMID:36914206	研究论文	本文探讨了溶酶体酸性脂肪酶（LAL）缺乏诱导的髓系来源抑制细胞（MDSCs）在肺癌中的潜在作用及其作为抗癌免疫治疗靶点和生物标志物的可能性	揭示了LAL缺乏如何通过改变代谢途径诱导MDSCs的产生，并展示了这些细胞在肿瘤免疫抑制和促进肿瘤生长中的作用	研究主要基于小鼠模型和人类血液样本，缺乏直接的人体组织验证	探索LAL缺乏诱导的MDSCs在肺癌中的机制及其作为治疗靶点的潜力	小鼠骨髓来源的Ly6G+髓系细胞和非小细胞肺癌（NSCLC）患者的血液样本	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术	NA	基因表达数据，细胞表型数据	小鼠骨髓细胞和NSCLC患者的血液样本
2207	2025-03-19	Insight into perfluorooctanoic acid-induced impairment of mouse embryo implantation via single-cell RNA-seq 2025-May-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137375 PMID:39892134	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了全氟辛酸（PFOA）对小鼠胚胎植入的影响及其机制	首次利用单细胞RNA测序技术揭示了PFOA通过干扰ANGPTL信号通路影响子宫内膜上皮细胞功能和发育的具体机制	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本	探讨PFOA对子宫内膜接受性和胚胎植入的影响及其分子机制	小鼠子宫内膜	生殖医学	不孕症	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
2208	2025-03-19	SPP1 + macrophages in colorectal cancer: Markers of malignancy and promising therapeutic targets 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101340 PMID:40092488	研究论文	本研究通过整合单细胞和空间转录组学以及批量测序技术，探讨了SPP1+巨噬细胞在结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的角色和机制	揭示了SPP1+巨噬细胞在CRC中的显著升高及其作为恶性肿瘤标志物的潜力，提出了这些巨噬细胞作为治疗靶点的可能性	研究中未明确提及样本量，且对于SPP1+巨噬细胞的具体作用机制仍需进一步探索	探讨SPP1+巨噬细胞在结直肠癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力	结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的SPP1+巨噬细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量测序	NA	转录组数据	NA
2209	2025-03-19	Comprehensive analysis of immune subtype characterization on identification of potential cells and drugs to predict response to immune checkpoint inhibitors for hepatocellular carcinoma 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101471 PMID:40092490	研究论文	本文通过免疫亚型分类，研究了肝细胞癌（HCC）患者对免疫检查点抑制剂（ICIs）反应的预测，并探讨了细胞异质性和候选药物的作用	本研究首次整合了细胞异质性和免疫表型分析，以预测HCC患者对ICIs的反应，并识别了与ICI反应相关的关键细胞和候选药物	研究样本量有限，且未进行大规模临床试验验证	预测肝细胞癌患者对免疫检查点抑制剂的反应，并探索相关细胞和药物	肝细胞癌（HCC）患者	数字病理学	肝癌	单细胞测序技术	NA	基因表达数据	151个免疫相关基因集
2210	2025-03-19	The scRNA-sequencing landscape of pancreatic ductal adenocarcinoma revealed distinct cell populations associated with tumor initiation and progression 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101323 PMID:40092486	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）中与肿瘤起始和进展相关的不同细胞群体	首次在PDAC患者中通过单细胞RNA测序技术识别了与肿瘤起始和淋巴结转移相关的关键细胞群体和基因	样本量较小，仅包括8名PDAC患者，且未涉及其他类型的胰腺癌	探索胰腺导管腺癌（PDAC）的转录组景观，以理解其发展机制并寻找新的治疗策略	8名不同淋巴结转移状态的PDAC患者	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	8名PDAC患者
2211	2025-03-19	Radiation from frequent whole-body CT scans induces systemic immunosuppression and immune activation of tumor tissue 2025-Apr, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102326 PMID:40014978	研究论文	本研究探讨了重复全身CT扫描对系统性免疫、肿瘤免疫微环境及肿瘤控制的影响	首次揭示了重复全身CT扫描辐射诱导系统性免疫抑制和肿瘤组织免疫激活的现象	研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明重复全身CT扫描对免疫系统及肿瘤控制的影响	Lewis肺癌小鼠模型	医学影像学	肺癌	ELISA、流式细胞术、免疫组化、RNA测序、单细胞测序	NA	生物样本数据	两组小鼠（对照组和多次全身CT扫描辐射组）
2212	2025-03-19	IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics 2025-Mar-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.111994 PMID:40071147	研究论文	本文探讨了IQGAP2蛋白在调节血脑屏障免疫动态中的作用	揭示了IQGAP2在维持血脑屏障免疫特权中的关键作用，并发现其在阿尔茨海默病中的表达减少	研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，人类数据较少	研究IQGAP2在血脑屏障免疫细胞渗透中的作用	小鼠、斑马鱼和人类组织	分子生物学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、组织样本	小鼠、斑马鱼模型及人类组织样本
2213	2025-03-19	Mediation of macrophage M1 polarization dynamics change by ubiquitin-autophagy-pathway regulated NLRP3 inflammasomes in PD-1 inhibitor-related myocardial inflammatory injury 2025-Mar-18, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2 DOI:10.1007/s00011-024-01979-1 PMID:40097836	研究论文	本文探讨了免疫检查点抑制剂（ICIs）引起的心肌炎症损伤的机制，特别是通过单细胞测序和动物模型研究了PD-1抑制剂如何通过STAT1/NF-κB/NLRP3信号通路激活心肌炎症，并探讨了泛素-自噬途径在炎症消退中的作用	首次揭示了PD-1抑制剂通过STAT1/NF-κB/NLRP3信号通路激活心肌炎症的机制，并发现泛素-自噬途径在炎症消退中的关键作用	研究主要基于动物模型和单细胞测序数据，临床样本量有限，需要进一步的大规模临床验证	探讨免疫检查点抑制剂（ICIs）引起的心肌炎症损伤的机制，并寻找潜在的治疗方法	肺癌患者和动物模型	免疫学	肺癌	单细胞测序（scRNA-seq）	动物模型和细胞模型	临床数据和实验数据	肺癌患者和动物模型
2214	2025-03-19	PLXDC1+ Tumor-Associated Pancreatic Stellate Cells Promote Desmoplastic and Immunosuppressive Niche in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 2025-Mar-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415756 PMID:40091495	研究论文	本研究通过RNA测序和ATAC-seq技术，结合单细胞和空间转录组学，揭示了胰腺星状细胞（PSCs）在胰腺导管腺癌（PDAC）中的异质性和功能，特别是PLXDC1+肿瘤相关PSCs在肿瘤边界形成促纤维化和免疫抑制微环境的作用	首次通过单细胞和空间转录组学结合ATAC-seq技术，系统性地揭示了PSCs在PDAC中的异质性和功能，并发现了PLXDC1+ TPSCs在免疫治疗中的关键作用	研究主要基于PDAC患者的样本，未涉及其他类型的胰腺癌或其他癌症类型	探究胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的功能和异质性，及其在免疫治疗中的作用	胰腺星状细胞（PSCs）和胰腺导管腺癌（PDAC）	数字病理学	胰腺癌	RNA测序、ATAC-seq、单细胞转录组学、空间转录组学、原位测序	NA	RNA测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据	来自PDAC患者和正常组织的胰腺星状细胞样本
2215	2025-03-19	Decoding Long-Distance Communication Under Mineral Stress: Advances in Vascular Signalling and Molecular Tools for Plant Resilience 2025-Mar-17, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15475 PMID:40091594	review	本文探讨了植物在矿物质缺乏条件下的长距离信号传导机制，强调了其在根与茎之间作为通信网络的重要性	揭示了长距离信号传导在维持矿物质稳态和优化生长中的关键作用，并介绍了TRAP-Seq、异种嫁接和单细胞RNA测序等分子工具的新进展	NA	研究植物在矿物质缺乏条件下的长距离信号传导机制，以提高作物的抗逆性和矿物质利用效率	植物	植物生物学	NA	TRAP-Seq, 异种嫁接, 单细胞RNA测序	NA	分子数据	NA
2216	2025-03-19	The dynamically evolving cell states and ecosystem from benign nevi to melanoma 2025-Mar-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2971 PMID:40094420	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了从良性痣到黑色素瘤的动态细胞状态变化及其关键机制	首次在先天性黑色素细胞痣（CMN）患者中，通过单细胞转录组测序识别了从痣到黑色素瘤进展过程中的四种不同黑色素细胞亚群状态，并揭示了其功能和调控途径的动态变化	样本量较小，仅涉及5名患者，可能限制了结果的普遍性	探索从良性痣到黑色素瘤的恶性转化过程中的细胞状态变化及其关键机制	5名诊断为先天性黑色素细胞痣（CMN）并发展为黑色素瘤的患者的多对组织样本	数字病理学	黑色素瘤	单细胞转录组测序，bulk RNA-seq	NA	单细胞转录组数据，bulk RNA-seq数据	5名患者的多对组织样本
2217	2025-03-19	Harnessing the Foundation Model for Exploration of Single-cell Expression Atlases in Plants 2025-Mar-17, Genomics, proteomics & bioinformatics DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf024 PMID:40094454	研究论文	本文介绍了一种名为scPlantLLM的Transformer模型，用于处理植物单细胞RNA测序数据，以解决批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战	开发了scPlantLLM模型，采用顺序预训练策略，结合掩码语言建模和细胞类型注释任务，生成鲁棒且可解释的单细胞数据嵌入	NA	解决植物单细胞RNA测序数据中的批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战	植物单细胞RNA测序数据	自然语言处理	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Transformer	单细胞RNA测序数据	数百万个植物单细胞数据点
2218	2025-03-19	Cell Fate Determination of the Potato Shoot Apex and Stolon Tips Revealed by Single-Cell Transcriptome Analysis 2025-Mar-17, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15459 PMID:40095217	研究论文	本文通过单细胞转录组分析揭示了马铃薯茎尖和匍匐茎尖的细胞命运决定	首次对马铃薯茎尖和匍匐茎尖进行单细胞RNA测序，揭示了23个不同的细胞簇及其特异性基因表达模式	未提及具体局限性	研究马铃薯茎尖和匍匐茎尖的转录差异及其细胞命运决定机制	马铃薯茎尖和匍匐茎尖的细胞	植物生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未提及具体样本数量
2219	2025-03-19	A Gremlin 1-expressing splenic niche cell population restrains chronic myeloid leukemia by antagonizing the BMP pathway 2025-Mar-17, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-025-00933-2 PMID:40097655	研究论文	本文探讨了脾脏在白血病发病机制中的关键作用，特别是Gremlin 1表达的脾脏微环境细胞群通过拮抗BMP通路抑制慢性髓性白血病（CML）的进展	揭示了Gremlin 1及其表达的脾脏微环境细胞群在抑制CML中的新机制，这是首次发现脾脏通过这种方式对抗白血病	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证尚不充分	研究脾脏微环境在慢性髓性白血病中的作用机制	小鼠模型和人类样本中的脾脏微环境细胞群	生物医学	慢性髓性白血病	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	小鼠模型和人类样本
2220	2025-03-19	Single-cell atlas of the pregnant equine endometrium before and after implantation† 2025-Mar-16, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioaf004 PMID:39756438	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了马在胚胎植入前后的子宫内膜细胞的转录组和细胞亚群	发现了马子宫内膜中新的免疫细胞亚群，如常驻先天淋巴细胞和黏膜相关不变T细胞，并揭示了子宫内膜自然杀伤细胞（eNK）在胚胎植入期间的重要作用	研究仅关注了马这一物种，未与其他物种进行广泛比较，且样本量相对较小	确定和比较马在胚胎植入前后的子宫内膜细胞的转录组和细胞亚群	马的子宫内膜细胞	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	近97,000个子宫内膜细胞