单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2201	2025-03-19	Dehydrodiisoeugenol targets the PLK1-p53 axis to inhibit breast cancer cell cycle 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1545498 PMID:40093330	研究论文	本研究探讨了中药高良姜中的脱氢二异丁香酚（DHIE）通过调控PLK1-p53信号轴抑制乳腺癌细胞周期的机制	首次筛选并验证了高良姜中的DHIE作为主要抗乳腺癌活性成分，并通过多组学分析揭示了其通过PLK1-p53信号轴抑制乳腺癌细胞周期的机制	DHIE在不同亚型乳腺癌细胞中对p53的调控机制及其与其他化疗药物联合使用的优势仍需进一步探索	探索高良姜中主要抗乳腺癌活性成分及其作用机制	乳腺癌细胞及小鼠模型	癌症研究	乳腺癌	LC-MS、WGCNA、网络药理学、分子对接、转录组测序分析、免疫浸润分析、单细胞测序、CCK-8、流式细胞术、Western blot	NA	分子数据、细胞数据、动物模型数据	NA
2202	2025-03-19	Current status and future perspectives of the diagnostic of plant bacterial pathogens 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1547974 PMID:40093602	综述	本文综述了植物细菌病原体诊断的现状和未来展望，从基于培养的策略发展到无培养检测	介绍了微拉曼光谱技术在单细胞水平上快速、无标记、非侵入性地鉴别存活但不可培养的病原体的创新应用	光谱学方法在检测先前未知的植物病原体方面仍显不足	探讨植物细菌病原体诊断技术的发展及其应用前景	植物细菌病原体	植物病理学	NA	微拉曼光谱技术、单细胞测序、合成生物学	NA	光谱数据	NA
2203	2025-03-19	From Gene to Intervention: NLRC4 and WIPI1 Regulate Septic Acute Lung Injury Through Autophagy 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S510691 PMID:40093959	研究论文	本研究探讨了NLRC4和WIPI1通过自噬调节脓毒症急性肺损伤（SALI）的分子机制	首次揭示了NLRC4和WIPI1在SALI中的关键作用，并通过自噬调节机制提供了新的治疗靶点	研究主要依赖于体外和动物模型，尚未在人类临床试验中验证	探索自噬在脓毒症急性肺损伤中的分子机制及其治疗潜力	脓毒症急性肺损伤（SALI）	分子生物学	脓毒症	流式细胞术、免疫荧光、qPCR、Western Blotting、siRNA	NA	基因表达数据、单细胞测序数据	两个微阵列数据集（GSE33118和GSE131761）和三个单细胞测序数据集（SCP43、SCP548和SCP2156）
2204	2025-03-19	The aggrephagy-related gene TUBA1B influences clinical outcomes in glioma patients by regulating the cell cycle 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1531465 PMID:40094001	研究论文	本研究探讨了与聚集自噬相关的基因TUBA1B如何通过调控细胞周期影响胶质瘤患者的临床结果	首次将TUBA1B基因与胶质瘤的聚集自噬亚型联系起来，并验证了其作为独立预后标志物的潜力	研究主要依赖于公共数据库的数据，缺乏多中心验证	阐明胶质瘤的潜在机制并识别新的生物标志物以改善治疗策略和预后模型	胶质瘤患者	数字病理学	胶质瘤	单细胞测序、qRT-PCR、体外功能实验、小鼠异种移植模型	机器学习、多变量Cox回归	基因表达数据、临床数据	来自TCGA、CGGA和GEO数据库的胶质瘤数据集
2205	2025-03-19	Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome 2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.12.626682 PMID:39713308	研究论文	本文研究了STAT3功能获得性突变（GOF）导致的CD8+ T细胞功能失调及其分子机制	揭示了STAT3 GOF通过改变嘌呤能信号通路导致CD8+ T细胞功能失调的新机制	研究主要基于STAT3 GOF患者和小鼠模型，可能不适用于其他类型的免疫失调疾病	探讨STAT3 GOF变异如何导致CD8+ T细胞功能失调及其分子机制	STAT3 GOF患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞	免疫学	自身免疫性疾病	高维免疫分析、单细胞RNA测序、功能评估	NA	基因表达数据、功能数据	STAT3 GOF患者和小鼠模型的CD8+ T细胞
2206	2025-03-19	Single-cell analysis reveals a unique microenvironment in peri-implantitis 2024-12, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.13982 PMID:38566468	研究论文	本研究通过单细胞分析揭示了种植体周围炎的独特微环境	首次通过单细胞RNA测序技术比较了种植体周围炎、牙周炎和健康个体的微环境差异，发现了种植体周围炎特有的免疫微环境特征	样本量有限，未进行长期随访研究	揭示种植体周围炎的独特微环境，为寻找新的治疗方法提供依据	种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的活检样本	数字病理学	牙周病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的活检样本
2207	2025-03-19	Single-cell profiling reveals a conserved role for hypoxia-inducible factor signaling during human craniotomy infection 2024-Nov-19, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101790 PMID:39426374	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类颅骨切开术感染期间的细胞和分子特征，特别是低氧诱导因子（HIF）信号的作用	首次在人类颅骨切开术感染中识别出粒细胞性髓系来源抑制细胞的主导地位，并通过单细胞转录组分析揭示了HIF信号在感染中的保守作用	研究为回顾性研究，可能受到样本选择和数据的限制	探索人类颅骨切开术感染的细胞和分子特征，寻找潜在的治疗靶点	人类颅骨切开术感染患者和小鼠模型	数字病理学	感染性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	超过2,500例颅骨切开术患者
2208	2025-03-19	Association between biological ageing and periodontitis: Evidence from a cross-sectional survey and multi-omics Mendelian randomization analysis 2024-10, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.14040 PMID:38956929	研究论文	本文通过横断面调查和多组学孟德尔随机化分析，探讨了生物老化与牙周炎之间的关系及其潜在因果关系	结合横断面数据、孟德尔随机化（MR）和多组学整合分析，首次揭示了生物老化与牙周炎之间的因果关系及其潜在分子机制	研究主要基于观察性数据，因果关系的确立仍需进一步实验验证	探讨生物老化与牙周炎之间的关系及其潜在因果关系	3189名NHANES数据参与者及大规模meta-牙周炎GWAS数据集	生物医学	牙周炎	多组学整合分析、孟德尔随机化（MR）、单细胞测序	多变量回归分析、两步MR中介分析	基因组数据、横断面调查数据	3189名NHANES数据参与者
2209	2025-03-19	SUV39H1 Preserves Cancer Stem Cell Chromatin State and Properties in Glioblastoma 2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.08.15.607856 PMID:39229036	研究论文	本文探讨了SUV39H1在胶质母细胞瘤（GBM）干细胞（GSCs）维持和肿瘤进展中的关键作用	首次揭示了SUV39H1在GSCs维持中的关键作用，并展示了通过抑制SUV39H1增强化疗效果的潜力	研究主要基于体外和动物模型，尚未在人体临床试验中验证	研究SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持和肿瘤进展中的作用	胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）	癌症研究	胶质母细胞瘤	RNA-seq, ATAC-seq	NA	基因表达数据，染色质可及性数据	患者来源的GSCs和正常脑组织样本
2210	2025-03-19	Deciphering the molecular landscape of human peripheral nerves: implications for diabetic peripheral neuropathy 2024-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.15.599167 PMID:38915676	研究论文	本文通过使用大量和空间RNA测序技术，研究了糖尿病周围神经病变（DPN）的分子机制，揭示了受影响神经的关键通路差异和免疫特征	首次在人类神经中揭示了感觉轴突mRNA运输的改变，并强调了其在周围神经退化中的潜在作用	研究样本主要来自糖尿病患者，可能限制了结果的普遍性	深入了解糖尿病周围神经病变的分子机制	从下肢截肢中恢复的胫神经和腓肠神经	数字病理学	糖尿病周围神经病变	bulk RNA测序, 空间转录组学	NA	RNA测序数据	主要来自糖尿病患者的下肢截肢样本
2211	2025-03-19	SCIPAC: quantitative estimation of cell-phenotype associations 2024-05-13, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-024-03263-1 PMID:38741183	研究论文	本文介绍了SCIPAC算法，该算法首次定量估计单细胞数据中每个细胞与表型（如癌症）之间的关联	SCIPAC是首个能够定量估计单细胞数据中每个细胞与表型之间关联的算法，并提供每个关联的p值	NA	开发一种算法来定量估计单细胞数据中细胞与表型之间的关联	单细胞RNA测序数据中的细胞	生物信息学	癌症	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	四个真实数据集（包括癌症和非癌症数据）
2212	2025-03-19	STRUCTURE-FUNCTION RELATIONSHIPS OF MUCOCILIARY CLEARANCE IN HUMAN AIRWAYS 2024-Apr-25, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4164522/v1 PMID:38746209	研究论文	本研究探讨了人类气道中组织水平结构与纤毛器官功能之间的复杂联系，特别是气道的形态组织及其在黏液纤毛清除中的作用	首次绘制了大鼠和人类气道树中纤毛和分泌细胞类型的分布图，并阐明了预测清除功能的气道上皮结构参数	对动物数据的依赖限制了对人类气道屏障功能的关键见解，并阻碍了与人类相关的气道疾病建模	理解气道上皮结构与清除功能之间的力学联系	人类和大鼠的气道	NA	慢性阻塞性肺病（COPD）和哮喘	单细胞转录组学	NA	NA	NA
2213	2025-03-19	IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics 2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.02.07.527394 PMID:38645082	研究论文	本文探讨了IQGAP2蛋白在调节血脑屏障免疫动态中的作用	揭示了IQGAP2在维持血脑屏障免疫特权中的关键作用，并发现其在阿尔茨海默病中的表达减少	研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，人类组织分析样本有限	研究IQGAP2如何影响免疫细胞通过血脑屏障的渗透	脑内皮细胞（BECs）、小鼠、斑马鱼和人类组织	生物医学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序、免疫组织学	NA	RNA测序数据、组织图像	小鼠、斑马鱼模型及人类组织样本
2214	2025-03-19	Single-cell RNA sequencing highlights the influence of innate and adaptive immune response mechanisms in psoriatic arthritis 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1490051 PMID:40084238	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了银屑病关节炎（PsA）患者与健康对照之间基因表达谱的差异，特别是区分了无皮肤银屑病的PsA患者和有皮肤银屑病的PsA患者	首次在单细胞水平上揭示了PsA患者与健康对照之间基因表达谱的差异，并探讨了这些差异与临床表型的关系	未发现无皮肤银屑病的PsA患者与有皮肤银屑病的PsA患者之间的差异表达基因	探索银屑病关节炎（PsA）患者与健康对照之间基因表达谱的差异，并描述PsA患者的转录模式	70名PsA患者和10名健康对照的外周血单核细胞（PBMCs）	生物信息学	银屑病关节炎	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	RNA测序数据	80个样本（70名PsA患者和10名健康对照）
2215	2025-03-19	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Features of Heterogeneity in the Murine Retinal Pigment Epithelium 2022-Sep-08, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms231810419 PMID:36142331	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠视网膜色素上皮（RPE）细胞的异质性分子特征	首次在小鼠RPE细胞中应用单细胞RNA测序技术，揭示了六种不同的细胞群体及其在RPE成熟过程中的基因表达变化	研究仅基于两只年轻成年雄性C57BL/6J小鼠的RPE细胞，样本量较小	评估RPE细胞的异质性，并识别影响RPE发育、维持、功能和疾病的细胞网络	小鼠视网膜色素上皮（RPE）细胞	生物信息学	眼科疾病	单细胞RNA测序	PCA, UMAP, K-means聚类	RNA测序数据	两只年轻成年雄性C57BL/6J小鼠的2667和2846个RPE细胞
2216	2025-03-19	Natural genetic variation determines microglia heterogeneity in wild-derived mouse models of Alzheimer's disease 2021-02-09, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2021.108739 PMID:33567283	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了不同遗传背景小鼠模型中小胶质细胞在阿尔茨海默病中的异质性	揭示了遗传多样性显著影响小胶质细胞在基础神经免疫功能和淀粉样变性反应中的特征和动态变化	研究结果主要基于小鼠模型，其可转化性到人类研究尚需进一步验证	探讨遗传变异如何影响阿尔茨海默病中小胶质细胞的异质性	C57BL/6J小鼠和野生衍生小鼠品系（WSB/EiJ、CAST/EiJ和PWK/PhJ）的小胶质细胞	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	C57BL/6J小鼠和三种野生衍生小鼠品系的小胶质细胞样本
2217	2025-03-18	Key genes linking gut microbiota, immune cells, and osteoporosis: A multi-omics approach 2025-May, Microbial pathogenesis IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.micpath.2025.107412 PMID:39993547	研究论文	本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和生物信息学分析，全面探讨了肠道微生物群、免疫细胞调节与骨质疏松症之间的因果关系	首次揭示了肠道微生物群通过免疫细胞调节与骨质疏松症之间的因果关系，并鉴定了USP6NL、SELENOT和TAF1A作为潜在的治疗靶点	研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制	探索肠道微生物群、免疫细胞调节与骨质疏松症之间的分子机制，以改进治疗方法	肠道微生物群、免疫细胞和骨质疏松症	生物信息学	骨质疏松症	孟德尔随机化、单细胞RNA测序、生物信息学分析	NA	基因表达数据	来自UK Biobank和芬兰队列的数据
2218	2025-03-18	Identification of DIO2 as a Molecular Therapeutic Target for Depression in Chronic Rhinosinusitis: A Comprehensive Bioinformatics and Experimental Study 2025-Mar-16, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11085-4 PMID:40089956	研究论文	本研究通过综合生物信息学和实验方法，识别了DIO2作为慢性鼻窦炎（CRS）与抑郁症共病的分子治疗靶点	首次通过机器学习和单细胞RNA测序技术，识别了CRS与抑郁症共病的共享枢纽基因，并验证了DIO2在CRS相关抑郁症中的关键作用	研究主要依赖于公共数据库的基因表达数据，实验验证仅限于动物模型，尚未在人类临床试验中得到验证	探索慢性鼻窦炎与抑郁症共病的分子机制，并识别潜在的治疗靶点	慢性鼻窦炎患者和抑郁症患者的基因表达数据	生物信息学	慢性鼻窦炎, 抑郁症	差异表达基因分析, 加权基因共表达网络分析, 单细胞RNA测序	随机森林, LASSO回归	基因表达数据	来自GEO数据库的基因表达数据集，具体样本数量未明确说明
2219	2025-03-18	CD105 blockade restores osimertinib sensitivity in drug-resistant EGFR-mutant non-small cell lung cancer 2025-Mar-12, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101237 PMID:40090182	研究论文	本研究探讨了CD105在EGFR突变非小细胞肺癌（NSCLC）中对EGFR靶向治疗耐药性的作用，并发现通过阻断CD105可以恢复对奥希替尼的敏感性	首次揭示了CD105在EGFR突变NSCLC中对奥希替尼耐药性的作用，并提出了通过阻断CD105恢复药物敏感性的新策略	研究主要基于细胞系和小鼠模型，尚未在临床患者中进行验证	研究CD105在EGFR突变NSCLC中对EGFR靶向治疗耐药性的作用	EGFR突变的非小细胞肺癌（NSCLC）	癌症研究	肺癌	成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、ATAC测序、SCENITH分析	NA	细胞系数据、小鼠模型数据	66个NSCLC肿瘤样本，其中44个具有EGFR突变
2220	2025-03-18	STAT3-orchestrated gene expression signatures and tumor microenvironment in esophageal squamous cell carcinoma uncovered by single-cell sequencing 2025-Mar-09, Biochimica et biophysica acta. General subjects DOI:10.1016/j.bbagen.2025.130791 PMID:40068710	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多组学分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）的分子机制和细胞动态变化	利用单细胞RNA测序技术揭示了ESCC中的主要细胞类型和转录组变化，并发现STAT3是ESCC的核心调控因子，负调控LHPP的表达	研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入分析	探索ESCC的分子机制和细胞动态变化	食管鳞状细胞癌（ESCC）	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	临床样本组织和ESCC细胞系