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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2201 - 2220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2201 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses identify an immunotherapy nonresponse-related fibroblast signature in gastric cancer
2024-11-01, Anti-cancer drugs
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/CAD.0000000000001651
PMID:39110142
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序分析，识别了胃癌中与免疫治疗无响应相关的成纤维细胞特征 | 首次构建了与免疫检查点抑制剂无响应相关的成纤维细胞基因特征，并发现该特征能预测胃癌患者对免疫治疗的反应 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索胃癌中免疫治疗无响应的决定因素，构建预测生物标志物 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2202 | 2025-10-06 |
A tumorigenicity evaluation platform for cell therapies based on brain organoids
2024-10-29, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-024-00446-5
PMID:39472972
|
研究论文 | 开发基于脑类器官的细胞疗法致瘤性评估平台 | 首次利用胶质母细胞瘤样类器官模型增强对潜在致瘤细胞的检测灵敏度 | 需要进一步验证该平台在更广泛细胞类型中的适用性 | 建立新型致瘤性评估方法以改进干细胞疗法的安全性监测 | 人多能干细胞来源的脑类器官和细胞治疗产品 | 干细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型（mDA细胞、hPSCs等）的体外和体内比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2203 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal diverging pathobiology and opportunities for precision targeting in scleroderma-associated versus idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.25.620225
PMID:39484590
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学比较硬皮病相关性与特发性肺动脉高压的病理差异 | 首次在单细胞水平揭示SSc-PAH与IPAH的分子病理差异，并识别出针对SSc-PAH的潜在精准治疗靶点 | 样本量较小（仅12例），需要临床验证识别出的治疗靶点 | 探究不同类型肺动脉高压的分子机制差异并寻找精准治疗机会 | 肺动脉高压患者的肺组织样本 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 12例（4例SSc-PAH，4例IPAH，4例供体对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium Flex平台 |
| 2204 | 2025-10-06 |
Endothelial pyroptosis-driven microglial activation in choroid plexus mediates neuronal apoptosis in hemorrhagic stroke rats
2024-10-15, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106695
PMID:39370051
|
研究论文 | 本研究揭示了出血性中风后脉络丛中内皮细胞焦亡驱动小胶质细胞活化并通过Lcn2-SLC22A17通路介导神经元凋亡的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，在出血性中风的三个关键时间点系统解析了细胞因子风暴的细胞来源和作用机制 | 研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证；干预措施VX-765的特异性需要进一步确认 | 阐明出血性中风后炎症反应的细胞来源和分子机制 | 出血性中风大鼠模型，重点关注脉络丛中的内皮细胞、小胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 出血性中风 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Luminex细胞因子检测 | 动物模型 | 基因表达数据, 空间定位数据, 细胞因子浓度数据 | 出血性中风大鼠模型在超急性期、急性期和亚急性期三个时间点 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2205 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveils the predictive value of IGF2BP3/SPHK1 signaling in cancer stem cells for prognosis and immunotherapeutic response in muscle-invasive bladder cancer
2024-Oct-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05685-8
PMID:39367493
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了IGF2BP3/SPHK1信号通路在肌肉浸润性膀胱癌干细胞中的预后和免疫治疗反应预测价值 | 首次发现IGF2BP3通过m6A依赖方式调控SPHK1表达，并揭示了IGF2BP3+SPHK1+膀胱癌细胞与耗竭CD8+T细胞的空间邻近关系 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探索肌肉浸润性膀胱癌中癌症干细胞与免疫治疗反应的关系 | 肌肉浸润性膀胱癌组织和患者来源的类器官 | 单细胞多组学分析 | 膀胱癌 | 单细胞质谱流式,RNA测序,甲基化RNA免疫沉淀测序,单核RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,CODEX多重成像 | NA | 单细胞数据,RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 38例MIBC组织(179,483个单细胞),25例MIBC组织(67,988个细胞),患者来源类器官 | NA | 单细胞质谱流式,单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,多重蛋白质成像 | NA | NA |
| 2206 | 2025-10-06 |
Constructing a disulfidptosis-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and weighted co-expression network analysis
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01968-z
PMID:38760515
|
研究论文 | 基于单细胞测序和加权共表达网络分析构建肝细胞癌的二硫下垂症相关预后特征 | 首次将新发现的二硫下垂症细胞死亡机制与肝细胞癌预后模型相结合，通过单细胞和批量多组学数据分析构建预后特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索二硫下垂症相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征 | 肝细胞癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 加权共表达网络分析, 多组学测序 | COX回归, Lasso回归, 诺莫图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和GSE14520数据集中的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2207 | 2025-10-06 |
Loss of AR-regulated AFF3 contributes to prostate cancer progression and reduces ferroptosis sensitivity by downregulating ACSL4 based on single-cell sequencing analysis
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01941-w
PMID:38478171
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析发现AR调控的AFF3基因在去势抵抗性前列腺癌中下调，并通过调控ACSL4影响铁死亡敏感性 | 首次揭示AFF3在前列腺癌中的抑癌作用及其通过调控ACSL4影响铁死亡敏感性的新机制 | 研究主要基于细胞系实验，需要进一步在动物模型和临床样本中验证 | 探索去势抵抗性前列腺癌耐药机制及新的治疗靶点 | 前列腺癌细胞系及单细胞测序数据 | 单细胞测序分析 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, GSVA, GSEA | NA | 单细胞测序数据, 批量细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2208 | 2025-10-06 |
Metabolic Heterogeneity and Potential Immunotherapeutic Responses Revealed by Single-Cell Transcriptomics of Breast Cancer
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01952-7
PMID:38578322
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示乳腺癌代谢异质性及其与免疫治疗反应的关系 | 首次在单细胞水平系统揭示乳腺癌代谢异质性特征及其与化疗耐药性的关联 | 样本量较小（14例患者），需更大规模研究验证 | 解析乳腺癌单细胞转录组异质性及其临床意义 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 14例乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2209 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the MIF/ACKR3 receptor-ligand interaction between neutrophils and nucleus pulposus cells in intervertebral disc degeneration
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.011
PMID:38823438
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞与髓核细胞通过MIF/ACKR3受体-配体相互作用促进椎间盘退变的机制 | 首次在椎间盘退变中发现表达MIF的ECMO中性粒细胞亚群及其通过MIF/ACKR3轴与效应NPCs的相互作用机制 | 样本量相对有限（5个对照和9个退变样本），需进一步验证临床治疗潜力 | 解析椎间盘退变微环境中中性粒细胞的异质性和功能 | 椎间盘组织和其中的中性粒细胞与髓核细胞 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 71520个单细胞，来自5个对照和9个退变椎间盘样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2210 | 2025-10-06 |
Potential applications of dual haptoglobin expression in the reclassification and treatment of hepatocellular carcinoma
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.008
PMID:38815898
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示HP基因在肝细胞癌恶性细胞亚群中的关键作用及其通过C3/C3AR1轴促进Th1型免疫应答的机制 | 首次发现HP基因在HCC恶性细胞中的双重表达模式，并建立基于HP和C3表达的Th1反应重分类基因集及四种新辅助治疗预测模型 | 研究主要基于转录组数据分析，需要进一步实验验证HP基因的具体作用机制 | 探索HP基因在肝细胞癌重新分类和治疗中的潜在应用价值 | 肝细胞癌恶性细胞亚群和T细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 基因表达分析模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2211 | 2025-10-06 |
Hsp90aa1/JUN/Ccl2 regulatory axis mediates migration and differentiation of NSPCs, promoting the onset and progression of early post-ischemic stroke epilepsy
2024-10-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106635
PMID:39128813
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和生物信息学分析揭示了Hsp90aa1/JUN/Ccl2调控轴在神经干/祖细胞迁移和分化中的作用，及其对缺血性卒中后早期癫痫发生发展的影响 | 首次发现Hsp90aa1/JUN/Ccl2调控轴在调节神经干/祖细胞迁移和分化中的关键作用，并阐明其在缺血性卒中后早期癫痫发病机制中的功能 | NA | 探究缺血性卒中后早期癫痫的发病机制，特别是神经干/祖细胞在疾病过程中的调控机制 | 神经干/祖细胞（NSPCs） | 生物信息学 | 缺血性卒中后癫痫 | 单细胞转录组测序，生物信息学分析，体外实验，体内实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2212 | 2025-10-06 |
Hyperedge Representations with Hypergraph Wavelets: Applications to Spatial Transcriptomics
2024-Sep-14, ArXiv
PMID:39314512
|
研究论文 | 本文提出了一种基于超图小波的超边表示方法，并将其应用于空间转录组学数据分析 | 引入了超图扩散小波概念，并展示了其在谱和空间特性方面的优势 | NA | 开发能够捕捉多对象间高阶关系的表示方法，应用于生物医学发现 | 空间转录组学数据中的疾病相关细胞生态位 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 超图小波 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2213 | 2025-10-06 |
Bin2cell reconstructs cells from high resolution Visium HD data
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae546
PMID:39250728
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研究论文 | 开发了一种从高分辨率Visium HD数据重建细胞的方法Bin2cell | 首个利用形态学图像分割和基因表达信息从2微米分辨率数据重建细胞的工具 | NA | 解决Visium HD平台捕获区域聚合成单细胞的挑战 | 小鼠大脑和人类结直肠癌数据 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据,形态学图像 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD, 2微米和8微米分辨率 |
| 2214 | 2025-10-06 |
Scywalker: scalable end-to-end data analysis workflow for long-read single-cell transcriptome sequencing
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae549
PMID:39254601
|
研究论文 | 开发了一个名为scywalker的可扩展端到端数据分析工作流，用于处理长读长单细胞转录组测序数据 | 开发了新颖的可扩展细胞条形码解复用和单细胞异构体识别与定量方法，并将这些整合到一个易于部署的软件包中 | NA | 解决现有纳米孔单细胞数据分析工具在处理当前数据规模时的严重限制 | 人类大脑、拟南芥叶片和混合细胞系的长读长单细胞转录组测序数据 | 生物信息学 | NA | 长读长单细胞转录组测序，纳米孔测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，FASTQ格式序列数据 | NA | Oxford Nanopore | 单细胞RNA-seq，长读长测序 | NA | 纳米孔长读长单细胞转录组测序 |
| 2215 | 2025-10-06 |
Combined deletion of Mct8 and Dio2 impairs SVZ neurogliogenesis and olfactory function in adult mice
2024-09, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106572
PMID:38901782
|
研究论文 | 本研究通过Mct8/Dio2双敲除小鼠模型揭示了甲状腺激素转运蛋白MCT8和活化酶DIO2在调控成年小鼠脑室下区神经胶质生成中的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示MCT8和DIO2协同调控成年神经干细胞命运决定和嗅觉功能的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究甲状腺激素可用性调节因子对成年神经发生和胶质发生的影响 | Mct8/Dio2双敲除成年小鼠的脑室下区神经干细胞及其衍生细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2216 | 2025-10-06 |
Expansion of effector regulatory T cells in steroid responders of severe alcohol-associated hepatitis
2024-Sep-01, Liver transplantation : official publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society
IF:4.7Q1
DOI:10.1097/LVT.0000000000000378
PMID:38809243
|
研究论文 | 本研究探讨效应调节性T细胞在严重酒精性肝炎患者对类固醇治疗反应中的作用机制 | 首次揭示类固醇治疗有效者体内效应调节性T细胞扩增现象及其与临床预后的相关性 | 样本量较小（n=47），单细胞RNA测序仅针对单个病例 | 阐明效应调节性T细胞在酒精性肝炎类固醇治疗反应中的作用机制 | 47例酒精性肝炎患者（18例重症接受类固醇治疗，29例轻症未治疗） | 免疫学 | 酒精性肝炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 临床数据 | 47例患者，采集基线和治疗7天后配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2217 | 2025-10-06 |
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51649-3
PMID:39218971
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研究论文 | 提出一种基于混合效应模型的单细胞RNA-seq数据分析工具scDist，用于稳健识别疾病条件下的扰动细胞类型 | 开发了基于混合效应模型的统计严谨计算方法，能有效减少个体间和队列间变异导致的假阳性发现 | NA | 开发稳健识别单细胞RNA-seq数据中扰动细胞类型的计算方法 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 生物信息学 | COVID-19, 免疫治疗相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2218 | 2025-10-06 |
Hydrogel biomaterials that stiffen and soften on demand reveal that skeletal muscle stem cells harbor a mechanical memory
2024-Aug-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406787121
PMID:39163337
|
研究论文 | 本研究利用可光控软硬变化的动态水凝胶生物材料，揭示了骨骼肌干细胞具有对基质硬度的机械记忆 | 首次开发可动态调控硬度的水凝胶材料，并发现肌干细胞在培养早期形成对基质硬度的持久记忆 | 研究主要基于体外实验，体内验证尚需进一步研究 | 探究肌干细胞是否具有机械记忆特性及其分子机制 | 骨骼肌干细胞 | 组织工程 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，药理学抑制 | NA | 基因表达数据，细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2219 | 2025-10-06 |
PanIN and CAF transitions in pancreatic carcinogenesis revealed with spatial data integration
2024-Aug-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.07.001
PMID:39116880
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研究论文 | 本研究开发了一种整合成像、空间转录组学和单细胞RNA测序的新流程，用于表征胰腺癌发生过程中的肿瘤细胞状态转变 | 开发了半监督学习框架整合空间多组学数据，首次在人类FFPE样本中实现了PanIN病变的单细胞水平特征分析 | 基于FFPE样本的严格诊断限制了在微环境中对人类PanIN的单细胞表征 | 解析胰腺癌发生过程中的细胞状态转变和肿瘤微环境动态变化 | 胰腺上皮内瘤变(PanIN)病变和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 成像蛋白质组学 | 半监督学习框架 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | 匹配的低级别和高级别PanIN病变队列 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | 全转录组FFPE空间转录组学 |
| 2220 | 2025-10-06 |
Breaking barriers: improving time and space resolution of arbuscular mycorrhizal symbiosis with single-cell sequencing approaches
2024-08-17, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00501-1
PMID:39154166
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综述 | 本文探讨如何利用单细胞测序技术提高丛枝菌根共生研究的时间和空间分辨率 | 首次系统评述单细胞RNA测序技术在植物-微生物互作研究中的应用潜力，特别是针对丛枝菌根共生这一复杂生物学过程 | 目前植物-微生物互作的单细胞研究数量有限，且单细胞分析会损失空间信息，需要与空间转录组学技术整合 | 提高丛枝菌根共生研究的分辨率，深入理解其时空发育动态 | 丛枝菌根共生体系中的植物细胞和真菌细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 激光显微切割 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |