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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2201 | 2025-10-06 |
Skin organoid transplantation promotes tissue repair with scarless in frostbite
2025-Apr-18, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae055
PMID:39363875
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研究论文 | 本研究通过构建皮肤类器官移植系统,探索其在冻伤修复中促进无疤痕愈合的作用机制 | 首次将hiPSC来源的皮肤类器官与明胶水凝胶结合用于冻伤治疗,并发现其通过调控整合素α5β1-FAK通路减少成纤维细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体进行验证 | 开发促进冻伤无疤痕愈合的新型治疗方法 | 冻伤小鼠模型、人类诱导多能干细胞来源的皮肤类器官 | 组织工程 | 冻伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2202 | 2025-10-06 |
Breaking new ground: Unraveling the USP1/ID3/E12/P21 axis in vascular calcification
2025-02, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.09.002
PMID:39326697
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了血管钙化中USP1/ID3/E12/P21轴的新调控机制 | 首次发现USP1/ID3/E12/P21调控轴在血管钙化中的关键作用,并识别ID3作为调节血管平滑肌细胞功能的核心基因 | NA | 解析血管钙化的细胞动力学和调控机制 | 血管平滑肌细胞、钙化动脉粥样硬化核心区及邻近区域 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2203 | 2025-10-06 |
FBXO2 as a switch guides a special fate of tumor clones evolving into a highly malignant transcriptional subtype in oral squamous cell carcinoma
2025-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02033-5
PMID:39487312
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了口腔鳞状细胞癌中FBXO2基因作为关键开关引导肿瘤克隆向高恶性转录亚型演化的机制 | 首次发现FBXO2基因作为关键调控开关,引导肿瘤克隆向高恶性转录亚型转化,并阐明其通过复杂网络调控肿瘤细胞功能亚型的机制 | 未明确FBXO2调控网络的具体分子通路和下游效应机制 | 解析口腔鳞状细胞癌中肿瘤克隆的动态演化特征和恶性进展机制 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤细胞及其克隆演化 | 单细胞测序分析 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2204 | 2025-10-06 |
Dysregulation of R-loop homeostasis shapes the immunosuppressive microenvironment and induces malignant progression in melanoma
2025-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02039-z
PMID:39487313
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研究论文 | 本研究通过建立R-loop评分模型,揭示了R-loop稳态失调在黑色素瘤恶性进展和免疫抑制微环境形成中的关键作用 | 首次建立了基于单细胞RNA测序数据的R-loop评分模型,并发现CENPA介导的R-loop分布变化在黑色素瘤进展中的新机制 | 研究主要基于测序数据和功能实验,需要进一步体内验证和临床转化研究 | 探索R-loop在黑色素瘤发展中的作用机制及其与免疫微环境的关联 | 黑色素瘤细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, DNA/RNA免疫沉淀测序 | 评分模型 | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2205 | 2025-10-06 |
Experimental Framework for Assessing Mouse Retinal Regeneration Through Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4087-6_8
PMID:39240520
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研究论文 | 本文提出了通过单细胞RNA测序评估小鼠视网膜再生的实验框架 | 开发了经过验证的小鼠视网膜细胞制备实验框架,用于单细胞RNA测序研究视网膜再生 | 研究主要基于小鼠模型,与人类视网膜再生可能存在物种差异 | 研究视网膜再生机制,特别是Müller胶质细胞来源的再生过程 | 小鼠视网膜细胞,特别是Müller胶质细胞 | 单细胞组学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2206 | 2025-10-06 |
Revealing Fibrosis Genes as Biomarkers of Ulcerative Colitis: A Bioinformatics Study Based on ScRNA and Bulk RNA Datasets
2025, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别与溃疡性结肠炎相关的成纤维细胞生物标志物 | 结合单细胞RNA和bulk RNA数据集,首次系统识别与溃疡性结肠炎成纤维细胞相关的诊断生物标志物 | 研究基于公共数据集,缺乏实验验证 | 发现溃疡性结肠炎的诊断生物标志物并预测TNFα抑制剂治疗反应 | 溃疡性结肠炎患者 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 随机森林,支持向量机,Xgboost,多层感知机,逻辑回归 | RNA测序数据 | 8个bulk RNA数据集和1个单细胞RNA数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
2207 | 2025-10-06 |
Apolipoprotein A1-encoding recombinant adenovirus remodels cholesterol metabolism in tumors and the tumor microenvironment to inhibit hepatocellular carcinoma
2025-01, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.10.003
PMID:39528003
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研究论文 | 本研究构建了编码载脂蛋白A1的溶瘤腺病毒Ad5-ApoA1,通过重塑肿瘤和肿瘤微环境中的胆固醇代谢来抑制肝细胞癌 | 首次将ApoA1基因与溶瘤腺病毒结合,通过促进胆固醇外流和调节免疫微环境增强抗肿瘤效果 | 在裸鼠模型中未显示治疗效果,实验模型存在局限性 | 开发新型溶瘤病毒疗法用于肝细胞癌治疗 | 肝细胞癌肿瘤模型和肿瘤微环境 | 肿瘤免疫治疗 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、转录组测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、流式细胞数据 | 裸鼠、健康免疫NCG小鼠、人源化免疫重建NCG小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
2208 | 2025-10-06 |
Spatial proteomics and transcriptomics of the maternal-fetal interface in placenta accreta spectrum
2024-12, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.09.004
PMID:39349165
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研究论文 | 本研究通过空间蛋白质组学和转录组学分析植入性胎盘谱系中母胎界面的分子特征 | 首次在植入性胎盘病例中整合空间转录组学和蛋白质组学分析,揭示滋养细胞深层侵袭的分子机制 | 样本量有限,研究结果需要更大规模验证 | 探究植入性胎盘谱系中母胎界面的分子改变机制 | 植入性胎盘患者的母胎界面组织 | 空间组学 | 胎盘疾病 | 免疫组织化学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 组织图像 | 植入性胎盘病例组织样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
2209 | 2025-10-06 |
Cell state transitions are decoupled from cell division during early embryo development
2024-Dec, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01546-0
PMID:39516639
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研究论文 | 本研究通过细胞周期阻滞实验证明斑马鱼胚胎发育中细胞分化与细胞分裂可解耦发生 | 首次在胚胎发育过程中系统证明细胞分裂对所有胚胎组织分化并非必需 | 研究仅针对斑马鱼早期胚胎发育阶段,未涉及其他物种或后期发育过程 | 探究细胞分裂在胚胎细胞分化过程中的作用机制 | 斑马鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2210 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Reveals Novel Immune Perturbations in Fibrotic Hypersensitivity Pneumonitis
2024-Nov-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202401-0078OC
PMID:38924775
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示纤维化过敏性肺炎中新型免疫紊乱机制 | 首次在单细胞水平发现FHP中GZM细胞毒性CD4和CD8 T细胞的增加,以及S100A和CCL3/CCL4经典单核细胞的异常 | 样本量有限,仅包含特定地区(美国和墨西哥)的患者 | 阐明纤维化过敏性肺炎的免疫异常机制 | 纤维化过敏性肺炎患者、特发性肺纤维化患者、非纤维化过敏性肺炎患者和健康对照者 | 单细胞转录组学 | 间质性肺病 | 单细胞5' RNA测序 | Seurat, DoRothEA-VIPER, Monocle3, Velocyto-scVelo-CellRank | 单细胞RNA测序数据 | 148名参与者(45名FHP患者,63名IPF患者,4名非纤维化HP患者,36名健康对照),共分析589,870个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞5' RNA测序 |
2211 | 2025-10-06 |
Intrahepatic IgA complex induces polarization of cancer-associated fibroblasts to matrix phenotypes in the tumor microenvironment of HCC
2024-Nov-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000772
PMID:38466639
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研究论文 | 本研究探讨了肝内IgA复合物在肝细胞癌肿瘤微环境中诱导癌症相关成纤维细胞向基质表型极化的机制 | 首次揭示IgA复合物通过CD71受体促进CAFs向恶性基质表型极化并削弱CD8+T细胞功能的新机制 | 样本量相对有限(50例HCC样本),且为体外实验验证 | 阐明IgA复合物在HCC肿瘤微环境中对癌症相关成纤维细胞的影响 | 肝细胞癌患者样本中的癌症相关成纤维细胞和CD8+T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,共培养实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 | 50例肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2212 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses identify an immunotherapy nonresponse-related fibroblast signature in gastric cancer
2024-11-01, Anti-cancer drugs
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/CAD.0000000000001651
PMID:39110142
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序分析,识别了胃癌中与免疫治疗无响应相关的成纤维细胞特征 | 首次构建了与免疫检查点抑制剂无响应相关的成纤维细胞基因特征,并发现该特征能预测胃癌患者对免疫治疗的反应 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索胃癌中免疫治疗无响应的决定因素,构建预测生物标志物 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
2213 | 2025-10-06 |
A tumorigenicity evaluation platform for cell therapies based on brain organoids
2024-10-29, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-024-00446-5
PMID:39472972
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研究论文 | 开发基于脑类器官的细胞疗法致瘤性评估平台 | 首次利用胶质母细胞瘤样类器官模型增强对潜在致瘤细胞的检测灵敏度 | 需要进一步验证该平台在更广泛细胞类型中的适用性 | 建立新型致瘤性评估方法以改进干细胞疗法的安全性监测 | 人多能干细胞来源的脑类器官和细胞治疗产品 | 干细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型(mDA细胞、hPSCs等)的体外和体内比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2214 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal diverging pathobiology and opportunities for precision targeting in scleroderma-associated versus idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.25.620225
PMID:39484590
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较硬皮病相关性与特发性肺动脉高压的病理差异 | 首次在单细胞水平揭示SSc-PAH与IPAH的分子病理差异,并识别出针对SSc-PAH的潜在精准治疗靶点 | 样本量较小(仅12例),需要临床验证识别出的治疗靶点 | 探究不同类型肺动脉高压的分子机制差异并寻找精准治疗机会 | 肺动脉高压患者的肺组织样本 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 12例(4例SSc-PAH,4例IPAH,4例供体对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium Flex平台 |
2215 | 2025-10-06 |
Endothelial pyroptosis-driven microglial activation in choroid plexus mediates neuronal apoptosis in hemorrhagic stroke rats
2024-10-15, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106695
PMID:39370051
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研究论文 | 本研究揭示了出血性中风后脉络丛中内皮细胞焦亡驱动小胶质细胞活化并通过Lcn2-SLC22A17通路介导神经元凋亡的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在出血性中风的三个关键时间点系统解析了细胞因子风暴的细胞来源和作用机制 | 研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证;干预措施VX-765的特异性需要进一步确认 | 阐明出血性中风后炎症反应的细胞来源和分子机制 | 出血性中风大鼠模型,重点关注脉络丛中的内皮细胞、小胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 出血性中风 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Luminex细胞因子检测 | 动物模型 | 基因表达数据, 空间定位数据, 细胞因子浓度数据 | 出血性中风大鼠模型在超急性期、急性期和亚急性期三个时间点 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2216 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveils the predictive value of IGF2BP3/SPHK1 signaling in cancer stem cells for prognosis and immunotherapeutic response in muscle-invasive bladder cancer
2024-Oct-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05685-8
PMID:39367493
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了IGF2BP3/SPHK1信号通路在肌肉浸润性膀胱癌干细胞中的预后和免疫治疗反应预测价值 | 首次发现IGF2BP3通过m6A依赖方式调控SPHK1表达,并揭示了IGF2BP3+SPHK1+膀胱癌细胞与耗竭CD8+T细胞的空间邻近关系 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探索肌肉浸润性膀胱癌中癌症干细胞与免疫治疗反应的关系 | 肌肉浸润性膀胱癌组织和患者来源的类器官 | 单细胞多组学分析 | 膀胱癌 | 单细胞质谱流式,RNA测序,甲基化RNA免疫沉淀测序,单核RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,CODEX多重成像 | NA | 单细胞数据,RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 38例MIBC组织(179,483个单细胞),25例MIBC组织(67,988个细胞),患者来源类器官 | NA | 单细胞质谱流式,单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,多重蛋白质成像 | NA | NA |
2217 | 2025-10-06 |
Constructing a disulfidptosis-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and weighted co-expression network analysis
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01968-z
PMID:38760515
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研究论文 | 基于单细胞测序和加权共表达网络分析构建肝细胞癌的二硫下垂症相关预后特征 | 首次将新发现的二硫下垂症细胞死亡机制与肝细胞癌预后模型相结合,通过单细胞和批量多组学数据分析构建预后特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索二硫下垂症相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征 | 肝细胞癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 加权共表达网络分析, 多组学测序 | COX回归, Lasso回归, 诺莫图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和GSE14520数据集中的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
2218 | 2025-10-06 |
Loss of AR-regulated AFF3 contributes to prostate cancer progression and reduces ferroptosis sensitivity by downregulating ACSL4 based on single-cell sequencing analysis
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01941-w
PMID:38478171
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研究论文 | 通过单细胞测序分析发现AR调控的AFF3基因在去势抵抗性前列腺癌中下调,并通过调控ACSL4影响铁死亡敏感性 | 首次揭示AFF3在前列腺癌中的抑癌作用及其通过调控ACSL4影响铁死亡敏感性的新机制 | 研究主要基于细胞系实验,需要进一步在动物模型和临床样本中验证 | 探索去势抵抗性前列腺癌耐药机制及新的治疗靶点 | 前列腺癌细胞系及单细胞测序数据 | 单细胞测序分析 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, GSVA, GSEA | NA | 单细胞测序数据, 批量细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2219 | 2025-10-06 |
Metabolic Heterogeneity and Potential Immunotherapeutic Responses Revealed by Single-Cell Transcriptomics of Breast Cancer
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01952-7
PMID:38578322
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示乳腺癌代谢异质性及其与免疫治疗反应的关系 | 首次在单细胞水平系统揭示乳腺癌代谢异质性特征及其与化疗耐药性的关联 | 样本量较小(14例患者),需更大规模研究验证 | 解析乳腺癌单细胞转录组异质性及其临床意义 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 14例乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2220 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the MIF/ACKR3 receptor-ligand interaction between neutrophils and nucleus pulposus cells in intervertebral disc degeneration
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.011
PMID:38823438
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞与髓核细胞通过MIF/ACKR3受体-配体相互作用促进椎间盘退变的机制 | 首次在椎间盘退变中发现表达MIF的ECMO中性粒细胞亚群及其通过MIF/ACKR3轴与效应NPCs的相互作用机制 | 样本量相对有限(5个对照和9个退变样本),需进一步验证临床治疗潜力 | 解析椎间盘退变微环境中中性粒细胞的异质性和功能 | 椎间盘组织和其中的中性粒细胞与髓核细胞 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 71520个单细胞,来自5个对照和9个退变椎间盘样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |