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当前共找到 37368 篇文献，本页显示第 2201 - 2220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2201 | 2026-02-15 |
Altered MDC1 Interactions and Dysfunctional DNA Repair in Lobular Breast Cancer Confers Sensitivity to PARP Inhibition
2026-Jan-09, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1217
PMID:41512199
|
研究论文 | 本文研究了浸润性小叶乳腺癌中MDC1与ER的相互作用如何导致DNA修复功能失调，并揭示了PARP抑制剂在该癌症中的治疗潜力 | 发现ILC中MDC1与ER的特异性共调控导致了一种独特的“BRCA样”但非经典“BRCAness”的同源重组功能失调状态，并首次证明PARP抑制剂talazoparib在ILC模型中具有持久生长抑制效果 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏大规模临床样本验证；未详细探讨MDC1-ER相互作用的分子机制细节 | 探究浸润性小叶乳腺癌中MDC1如何调控ER活性及DNA修复功能，并评估PARP抑制剂的治疗潜力 | 浸润性小叶乳腺癌细胞、ILC异种移植模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 | 多个ILC细胞系及异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2202 | 2026-02-15 |
VISTA uncovers missing gene expression and spatial-induced information for spatial transcriptomic data analysis
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09479-6
PMID:41507434
|
研究论文 | 本文提出了一种名为VISTA的模型，通过整合单细胞RNA测序和亚细胞空间转录组学数据，预测空间转录组数据中未测量的基因表达 | VISTA结合了变分推断、几何深度学习和不确定性量化，首次实现了在空间转录组数据中准确预测未测量基因表达，并支持多种下游分析 | 未明确提及模型在处理高度异质性组织或大规模数据集时的具体限制 | 克服空间转录组技术基因覆盖有限的缺陷，提升空间转录组数据的解释性和应用价值 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推断, 几何深度学习 | 基因表达数据, 空间数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2203 | 2026-02-15 |
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.101475
PMID:41317903
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研究论文 | 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法，以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 | 通过伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据，揭示转录和翻译响应的时间差异，如即时转录组响应和延迟蛋白质组表达 | NA | 整合单细胞转录组和蛋白质组数据，构建全面的转录-翻译图谱，以理解缺氧应激下的细胞表型 | 单细胞样本（在缺氧条件下采集的纵向样本） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学（质谱分析） | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 2204 | 2026-02-15 |
TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, and CCT5: Predictive of Survival and Immunotherapy Resistance in Hepatocellular Carcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/1465989
PMID:41674779
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组分析，构建了一个基于衰老相关基因的预后模型，用于预测肝细胞癌患者的生存和免疫治疗反应 | 整合单细胞RNA测序和转录组数据，识别并验证了一个由八个基因（TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, CCT5）组成的衰老相关基因特征，该特征可作为预测HCC预后和免疫治疗耐药性的稳健工具 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，实验验证主要在细胞系中进行，缺乏体内模型或大规模前瞻性临床队列的验证 | 识别肝细胞癌中与衰老相关的基因特征，构建预后模型以预测患者生存和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞，特别是自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，qRT-PCR，CCK-8，伤口愈合实验，Transwell实验 | LASSO Cox回归风险模型 | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的样本，共识别了80,997个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2205 | 2026-02-15 |
Gut Microbiota-Derived Metabolites Regulate CASP3 and Neuroimmune Pathways in Multiple Sclerosis: An Integrative Multiomics Study
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3572399
PMID:41674923
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、机器学习和单细胞转录组分析，揭示了肠道菌群代谢物通过调节CASP3及神经免疫通路在多发性硬化症中的作用 | 首次将网络药理学、机器学习（SHAP方法）和单细胞转录组分析结合，识别出CASP3作为肠道菌群代谢物的核心靶点，并通过孟德尔随机化验证因果关系 | 研究结果需要进一步的实验验证来确认机制和转化潜力 | 探究肠道菌群代谢物在多发性硬化症发病机制中的作用，识别潜在治疗靶点 | 多发性硬化症相关的差异表达基因、肠道菌群代谢物及其靶点 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 网络药理学、机器学习、单细胞转录组分析、孟德尔随机化、分子对接 | 机器学习模型（未指定具体类型，但使用了SHAP方法） | 转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 2206 | 2026-02-15 |
Causal Association Between Plasma Proteins and Pericarditis: A Mendelian Randomization Study With Therapeutic Target Identification
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4659271
PMID:41674924
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了血浆蛋白与心包炎之间的因果关系，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次利用大规模血浆蛋白组GWAS数据，结合孟德尔随机化方法系统评估了血浆蛋白与心包炎的因果关联，并整合了单细胞RNA测序分析和分子对接技术来识别潜在治疗靶点和化合物 | 研究人群仅限于欧洲血统个体，可能限制了结果在其他人群中的普适性；孟德尔随机化分析依赖于遗传变异作为工具变量，可能存在残留混杂或水平多效性 | 评估血浆蛋白与心包炎之间的因果关系，并探索潜在的治疗靶点 | 35,559名欧洲血统个体的遗传和血浆蛋白数据，以及心包炎的遗传关联数据 | 生物信息学与遗传流行病学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接 | 逆方差加权中位数法、方差加权法、MR-Egger回归 | 遗传变异数据、血浆蛋白定量数据、单细胞基因表达数据 | 35,559名欧洲血统个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2207 | 2026-02-15 |
Development and validation of an interpretable machine learning model identify the lactylation-related protein SUSD3 as a prognostic and therapeutic biomarker for breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1701978
PMID:41676158
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个可解释的机器学习模型，用于识别乳酸化相关蛋白SUSD3作为乳腺癌的预后和治疗生物标志物 | 首次结合多种机器学习算法构建了与免疫细胞浸润、趋化因子表达和肿瘤突变负荷相关的乳酸化相关特征，并实验验证了枢纽基因SUSD3的作用 | NA | 探究乳酸化在乳腺癌发生发展中的作用，并开发用于预测恶性进展和免疫逃逸的风险模型 | 乳腺癌 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、空间转录组学 | 多种机器学习算法组合 | 基因组数据、转录组数据 | 来自公共数据库（TISCH、TCGA、GEO）的大量数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2208 | 2026-02-15 |
Integrated single-cell analysis with experimental validation reveals ANXA2 as a therapeutic target for ferroptosis in inflammatory bowel disease
2026, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/IQQX1658
PMID:41676267
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析与实验验证，揭示了ANXA2作为炎症性肠病中铁死亡的关键治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与实验验证，识别出ANXA2作为IBD中铁死亡的核心靶点，并验证其在体外和体内模型中的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类样本验证有限，且铁死亡机制在IBD中的具体通路仍需进一步探索 | 识别与炎症性肠病中铁死亡相关的潜在治疗靶点 | 炎症性肠病（IBD）患者和DSS诱导的IBD小鼠模型中的结肠组织细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR，Western blotting，流式细胞术，ELISA，免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据，蛋白质表达数据 | 28,974个细胞（来自GSE134809数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2209 | 2026-02-15 |
Utilisation of spatial methodologies for the investigation of the tumour microenvironment
2026, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.10.012
PMID:41688158
|
综述 | 本章节为研究人员提供了关于空间转录组学技术的实用指南，重点介绍了三种主流平台及其在肿瘤微环境研究中的应用 | 系统比较了Merscope、CosMx和Xenium三种前沿空间转录组学平台的原理与差异，并提供了从样本制备到数据分析的详细实验方案与实用技巧 | 作为技术指南章节，未报告新的实验数据或临床验证结果，主要基于现有技术和作者经验进行总结 | 为研究人员提供实施空间转录组学技术的实用指导，以促进肿瘤微环境表征和精准肿瘤学研究 | 肿瘤微环境中的空间组织特征，特别是巨噬细胞、细胞毒性T淋巴细胞等免疫细胞的分布与相互作用 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学、多重成像 | NA | 空间转录组数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Merscope, CosMx, Xenium | 三种主流空间转录组学分析平台 |
| 2210 | 2026-02-15 |
Repeated Dextran Sulfate Sodium Exposure Elicits Distinct Immune Responses Reflecting Human Ulcerative Colitis
2025-Dec-24, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101714
PMID:41453640
|
研究论文 | 本研究通过比较单次与重复DSS暴露诱导的小鼠结肠炎模型，评估其与人类溃疡性结肠炎的免疫反应相似性 | 首次系统比较单次与重复DSS暴露模型在免疫细胞转录程序、微生物组变化及与人类疾病对齐度方面的差异，揭示重复暴露模型更贴近人类UC的免疫特征 | 研究基于小鼠模型，与人类疾病存在物种差异；未涉及长期重复暴露（超过2个周期）的影响 | 评估不同DSS暴露方案作为溃疡性结肠炎实验模型的适用性，并识别与人类疾病相关的免疫亚型 | DSS诱导的小鼠结肠炎模型及人类溃疡性结肠炎免疫特征 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 组织病理学、流式细胞术、单细胞RNA测序、16S rRNA分析 | NA | 图像、文本（转录组数据）、微生物组数据 | 未明确样本数量，使用小鼠模型进行单次与重复DSS暴露比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2211 | 2026-02-15 |
Bronchial epithelial transcriptome reveals dysregulated interferon and inflammatory responses to rhinovirus in exacerbation-prone pediatric asthma
2025-Dec-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197711
PMID:41217821
|
研究论文 | 本研究通过器官型支气管上皮细胞培养，结合bulk和单细胞转录组学及靶向蛋白分析，揭示了易加重型儿童哮喘患者对鼻病毒感染的过度干扰素和炎症反应机制 | 首次在易加重型儿童哮喘患者中，通过单细胞转录组学揭示了细胞类型特异性（特别是非纤毛细胞）对鼻病毒感染的过度反应，并发现基线干扰素刺激基因表达降低是易感性的可调节因果决定因素 | 研究基于体外器官型培养模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本量可能有限；未涉及长期临床结局验证 | 探究易加重型儿童哮喘患者对鼻病毒感染易感性的宿主因素和分子机制 | 来自特征明确的哮喘儿童和健康儿童的器官型支气管上皮细胞培养物 | 数字病理学 | 哮喘 | bulk转录组学, 单细胞转录组学, 靶向蛋白分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 来自哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮细胞培养物（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2212 | 2026-02-15 |
Targeting the pentose phosphate pathway mitigates graft-versus-host disease by rewiring alloreactive T cell metabolism
2025-Dec-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.192774
PMID:41355795
|
研究论文 | 本研究揭示了戊糖磷酸途径在急性移植物抗宿主病中的作用，并发现靶向该途径的关键酶6PGD可减轻疾病严重程度，同时保留抗肿瘤效应 | 首次阐明戊糖磷酸途径在调控同种异体反应性T细胞代谢和功能中的关键作用，并确定6PGD为减轻aGvHD同时保留GvT效应的潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；长期抑制PPP的潜在副作用尚未明确 | 探索葡萄糖代谢下游途径在急性移植物抗宿主病中的作用，寻找特异性治疗靶点 | 同种异体反应性T细胞 | 单细胞组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2213 | 2026-02-15 |
Integrating multi-omics data to resolve patterns of ion channel regulation in melanoma and predict tumor treatment response
2025-Dec-05, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01866-x
PMID:41348242
|
研究论文 | 本研究整合单细胞空间转录组和多组学数据，分析皮肤黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式，并构建评分系统以预测肿瘤治疗反应 | 首次在皮肤黑色素瘤中系统评估离子通道相关基因的调控模式，结合单细胞空间转录组数据揭示其与肿瘤微环境细胞浸润特征的关联，并构建了可量化的ICRG评分系统 | 研究基于现有数据进行分析，需要进一步实验验证ICRG基因的具体功能机制 | 解析皮肤黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式，并预测肿瘤治疗反应 | 皮肤黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞空间转录组学，多组学数据分析 | SCENIC分析，伪时间分析 | 转录组数据，空间转录组数据，多组学数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 2214 | 2026-02-15 |
Spatial transcriptomics iterative hierarchical clustering (stIHC): A novel method for identifying spatial gene co-expression modules
2025-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70011
PMID:41674714
|
研究论文 | 本文提出了一种名为空间转录组学迭代层次聚类（stIHC）的新方法，用于识别空间基因共表达模块 | stIHC方法能够检测稀有或独特的空间表达模式，优于现有方法如SPARK、SPARK-X、MERINGUE和SpatialDE | NA | 开发一种新方法以改进空间转录组学数据中空间可变基因的聚类分析 | 空间转录组学数据中的空间可变基因 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 迭代层次聚类 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium, 10x Xenium, Spatial Transcriptomics |
| 2215 | 2026-02-15 |
Cell lineage tracing: Methods, applications, and challenges
2025-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70006
PMID:41674713
|
综述 | 本文综述了细胞谱系追踪的实验和计算方法，强调了它们的优势、局限性和协同作用 | 整合了从早期标记技术到现代CRISPR-Cas9条形码等遗传工具的实验方法，以及用于分析单细胞测序等高维数据的计算方法，并讨论了人工智能增强的未来发展方向 | 存在准确性、分辨率、多组学整合和可扩展性方面的挑战 | 理解细胞命运和谱系关系，应用于发育生物学、组织再生和疾病进展研究 | 细胞谱系追踪技术 | NA | NA | CRISPR-Cas9条形码，单细胞测序，多组学技术 | NA | 高维数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2216 | 2026-02-15 |
A perspective on developing foundation models for analyzing spatial transcriptomic data
2025-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70010
PMID:41674716
|
观点文章 | 本文探讨了开发用于分析空间转录组数据的基石模型的必要性、当前进展、潜在任务及未来方向 | 首次系统性地从视角角度审视开发空间转录组基石模型的需求、机遇与挑战，并强调其在提升研究效率、促进新生物学发现和提供用户友好访问方面的潜力 | 作为观点性文章，未提供具体实验数据或模型验证，主要基于理论讨论和前瞻性分析 | 探讨开发用于空间转录组数据分析的基石模型的可行性、任务应用及未来发展方向 | 空间转录组数据及其分析模型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 基石模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2217 | 2026-02-15 |
Stigmasterol attenuates atherosclerosis by inhibiting inflammatory signaling and foam cell formation
2025-Dec, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70056
PMID:41676448
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研究论文 | 本研究揭示了植物甾醇中的豆甾醇通过抑制炎症信号和泡沫细胞形成来减轻动脉粥样硬化 | 首次结合单细胞RNA测序和功能实验，阐明了豆甾醇通过调节泡沫细胞多样性和炎症发挥血管保护作用的机制，特别是其对CD86巨噬细胞极化和平滑肌细胞向巨噬样泡沫细胞转分化的抑制作用 | 研究主要在ApoE敲除小鼠模型中进行，人体内的效果和转化潜力尚需进一步验证 | 探究植物甾醇（特别是豆甾醇）对动脉粥样硬化中泡沫细胞形成、炎症反应和脂质代谢的影响及其分子机制 | ApoE敲除小鼠的主动脉组织、巨噬细胞、平滑肌细胞及其衍生的泡沫细胞 | 单细胞组学与心血管疾病研究 | 心血管疾病（动脉粥样硬化） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能测定 | NA | 单细胞转录组数据，功能实验数据 | ApoE敲除小鼠主动脉组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2218 | 2026-02-15 |
A TLR4-dependent fibroblast-monocyte axis in tumor-draining lymph nodes contributes to metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.015
PMID:40957419
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研究论文 | 本文探讨了三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结内细胞网络的重组，揭示了TLR4依赖的成纤维细胞-单核细胞轴在促进免疫逃逸和转移中的作用 | 发现TLR4配体通过诱导FRC表达CCL2和CCL7，促进单核细胞归巢至TDLN，形成免疫抑制微环境，并证明局部TLR4抑制联合αPD-1疗法可减少转移 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且TLR4抑制疗法的长期安全性和临床转化需进一步评估 | 研究三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结的细胞网络重组及其在免疫逃逸和转移中的作用机制 | 三阴性乳腺癌小鼠模型及人类TNBC TDLN样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2219 | 2026-02-15 |
The impact of asymmetrical gene expression on the development of spike morphology in Triticum aestivum
2025-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70047
PMID:41674570
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组图谱探索了小麦穗发育过程中不对称基因三重表达对产量性状调控的影响 | 首次在小麦穗双棱期构建了单细胞转录组图谱，揭示了10种不同细胞类型及1410个基因的表达模式，并发现不对称基因三重表达是细胞分化的关键因素 | 研究仅基于一个普通小麦品种（济麦22）的5989个细胞，样本代表性有限，且分子调控机制仍需进一步验证 | 探究小麦穗发育的分子调控机制及其对产量性状的影响 | 普通小麦品种济麦22的双棱期穗细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 5989个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2220 | 2026-02-15 |
Microbiota humanization drives human-like metabolic and immune transcriptomic shifts in pigs
2025-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70034
PMID:41674575
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研究论文 | 本研究通过将人类粪便微生物群移植到抗生素处理的猪体内，建立了肠道微生物群人源化猪模型，并系统评估了其微生物组成、血清代谢物和免疫细胞谱的变化 | 首次在猪模型中通过人类粪便微生物群移植，实现了肠道微生物群、血清代谢谱和免疫细胞转录组向人类特征的系统性转变，为研究宿主-微生物群相互作用提供了一个强大的大型动物平台 | 研究未详细探讨微生物群人源化对猪器官移植排斥反应的具体影响，也未评估长期移植效果的稳定性 | 研究人类微生物群移植对猪的肠道微生物组成、代谢表型和免疫系统的影响，以推动异种移植和微生物组疗法的发展 | 肠道微生物群人源化猪模型 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、准靶向代谢组学、单细胞转录组测序 | NA | 宏基因组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |