单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 22121 - 22140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22121 | 2024-08-08 |
Mechanisms of Progression and Heterogeneity in Multiple Nodules of Lung Adenocarcinoma
2021-06, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100082
PMID:34927899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了五名多结节型肺腺癌患者的肿瘤和正常组织，深入探讨了肺腺癌亚型的异质性和演化机制 | 本研究首次在单细胞水平上对肺腺癌的异质性和演化进行了全面的基因表达分析，揭示了免疫微环境在肺腺癌发展过程中的变化 | NA | 探索肺腺癌亚型异质性和演化的相关因素 | 多结节型肺腺癌患者的肿瘤和正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五名多结节型肺腺癌患者 |
| 22122 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Methodologies: From Transcriptome to Multi-Dimensional Measurement
2021-06, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100111
PMID:34927917
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术及其在多维度测量中的应用 | 介绍了单细胞转录组测序技术在多维度（基因组、表观基因组、转录组、空间和时间维度）的综合分析方法 | 目前仅在转录组水平或一维测量上存在局限性 | 深入理解细胞多样性、疾病过程和多细胞生物的组织结构 | 单细胞及其在生物系统中的分子特征和发展轨迹 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22123 | 2024-08-08 |
The Immune Barrier of Porcine Uterine Mucosa Differs Dramatically at Proliferative and Secretory Phases and Could Be Positively Modulated by Colonizing Microbiota
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.750808
PMID:34917075
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了猪子宫内膜在增殖期和分泌期的黏膜免疫差异，并探讨了定植微生物对其的正向调节作用 | 首次揭示了猪子宫内膜在不同生理阶段黏膜免疫的显著变化及其与定植微生物的相互作用 | NA | 探究猪子宫内膜在不同生理阶段的黏膜免疫变化及其分子调控机制 | 猪子宫内膜在增殖期和分泌期的黏膜免疫 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22124 | 2024-08-08 |
Imaging of Glioblastoma Tumor-Associated Myeloid Cells Using Nanobodies Targeting Signal Regulatory Protein Alpha
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.777524
PMID:34917090
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研究论文 | 本研究使用针对信号调节蛋白α（SIRPα）的纳米抗体来成像胶质母细胞瘤（GBM）中的肿瘤相关髓系细胞 | 首次使用针对SIRPα的纳米抗体在无血脑屏障渗透的情况下，非侵入性地成像GBM肿瘤中的髓系细胞 | 纳米抗体在GL261脑肿瘤中的渗透性较低 | 探索使用SIRPα靶向纳米抗体非侵入性地成像GBM肿瘤中髓系细胞的可行性 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关髓系细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CITE-Seq | NA | 图像 | 包括人GBM样本和GL261肿瘤小鼠模型 |
| 22125 | 2024-08-08 |
A Novel Single-Cell RNA Sequencing Data Feature Extraction Method Based on Gene Function Analysis and Its Applications in Glioma Study
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.797057
PMID:34917514
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因功能分析的单细胞RNA测序数据特征提取方法FEGFS，并应用于胶质瘤研究 | FEGFS方法利用已知的基因功能，通过基因本体论（GO）术语推导功能基因集，并通过语义相似性分析和基因重复率降低来减少冗余，然后应用核主成分分析在每个非冗余功能基因集上选择特征，并将这些特征组合用于后续的聚类分析 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据特征提取方法，并评估其在胶质瘤研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据和胶质瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 核主成分分析 | 基因数据 | 六个真实的单细胞RNA测序数据集，包括Pollen、Goolam、Klein和Zeisel等 |
| 22126 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Heterogeneity in Gene Regulatory Networks in Colorectal Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.765578
PMID:34917613
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据全面分析了结直肠癌患者的共识分子亚型（CMS），并探讨了基因调控网络的异质性及其关键调控因子 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了结直肠癌中不同CMS的基因调控网络异质性，并识别了关键的转录因子 | NA | 阐明结直肠癌中基因调控网络的异质性并识别关键调控因子 | 结直肠癌患者的共识分子亚型（CMS）及其基因调控网络 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22127 | 2024-08-08 |
Microglia Impede Oligodendrocyte Generation in Aged Brain
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S338242
PMID:34924766
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研究论文 | 本文研究了衰老大脑中少突胶质细胞的异质性及其在髓鞘丢失中的作用机制 | 首次揭示了衰老大脑中活化的微胶质细胞通过释放炎症因子抑制少突胶质前体细胞分化的机制，并提出了Stat1作为潜在的治疗靶点 | NA | 全面描绘年轻和老年小鼠中少突胶质细胞的异质性，并揭示衰老过程中髓鞘丢失的潜在机制 | 年轻和老年小鼠及人类的少突胶质细胞及其前体细胞 | 神经科学 | NA | 扩散张量成像、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因序列 | 年轻和老年小鼠及人类样本 |
| 22128 | 2024-08-08 |
The Clinical Significance and Potential Molecular Mechanism of Upregulated CDC28 Protein Kinase Regulatory Subunit 1B in Osteosarcoma
2021, Journal of oncology
DOI:10.1155/2021/7228584
PMID:34925510
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研究论文 | 本研究探讨了CDC28蛋白激酶调节亚基1B（CKS1B）在骨肉瘤（OS）中的临床意义和潜在分子机制 | 首次提供了CKS1B在骨肉瘤中上调的充分证据，并探讨了其在骨肉瘤进展中的作用 | 临床病理和预后分析未显示出显著意义 | 探讨CKS1B在骨肉瘤中的表达及其对患者临床病理特征和生存率的影响 | 骨肉瘤（OS）和非肿瘤组织样本 | NA | 骨肉瘤 | 免疫组织化学（IHC），组织微阵列，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本，细胞系 | 197个骨肉瘤样本和83个非肿瘤样本 |
| 22129 | 2024-08-08 |
A Deep-Learning Pipeline for TSS Coverage Imputation From Shallow Cell-Free DNA Sequencing
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.684238
PMID:34926480
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research paper | 本文介绍了一种用于从浅层游离DNA测序中进行转录起始位点（TSS）覆盖率推算的深度学习流程 | 提出的Autoencoder of cfDNA TSS（AECT）覆盖率推算方法在TSS覆盖率准确性和捕捉潜在生物特征方面优于现有的单细胞测序推算算法 | NA | 开发一种高准确性且成本适中的非侵入性筛查方法 | 游离DNA（cfDNA）的转录起始位点（TSS）覆盖率 | machine learning | breast cancer, rectal cancer | NA | Autoencoder | DNA sequencing data | NA |
| 22130 | 2024-08-08 |
MCC Regulator of WNT Signaling Pathway (MCC) Is a Podocyte Essential Gene
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.777563
PMID:34926519
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术检测了小鼠足细胞中WNT信号通路调节因子MCC的表达，并证实了MCC对足细胞的重要性 | 首次证实MCC是足细胞的关键基因，并通过RNA测序和生物信息学分析揭示了MCC在足细胞中的作用机制 | 未发现MCC下调对细胞周期和β-catenin信号活性的显著影响，可能存在其他未检测到的机制 | 探讨MCC在足细胞中的作用及其对足细胞疾病的影响 | 小鼠和人类足细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类足细胞样本 |
| 22131 | 2024-08-08 |
FaDA: A web application for regular laboratory data analyses
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0261083
PMID:34928943
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为FaDA的基于网络的应用程序，用于非计算科学家进行常规实验室数据分析 | FaDA提供了一个免费的、直观的界面，使没有生物信息学技能的生物学家能够轻松快速地进行常见的实验室数据分析 | NA | 开发一个通用的网络工具，用于非计算科学家进行常规实验室数据分析 | 常规实验室数据分析工具 | 生物信息学 | NA | R Shiny包 | NA | 实验室数据 | NA |
| 22132 | 2024-08-08 |
Intra-Tumoral Expression of SLC7A11 Is Associated with Immune Microenvironment, Drug Resistance, and Prognosis in Cancers: A Pan-Cancer Analysis
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.770857
PMID:34938318
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研究论文 | 本文通过泛癌分析研究了肿瘤内SLC7A11表达与免疫微环境、药物抗性和癌症预后的关系。 | 首次系统阐述了SLC7A11在多种癌症中的表达及其对患者生存和免疫治疗反应的影响。 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证。 | 探讨SLC7A11在癌症中的表达与患者生存和免疫治疗反应的关系。 | SLC7A11在多种癌症中的表达及其生物学功能。 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序, CRISPR, RNAi | NA | 基因表达数据 | 25/27种癌症类型，多种胰腺癌细胞系 |
| 22133 | 2024-08-08 |
CREM Is Correlated With Immune-Suppressive Microenvironment and Predicts Poor Prognosis in Gastric Adenocarcinoma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.697748
PMID:34938728
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法探讨了转录抑制因子cAMP反应元件调节因子（CREM）在胃腺癌（GAC）中的作用 | 发现CREM的高表达与GAC中的T细胞耗竭和M2极化相关，表明CREM可能作为GAC的预后生物标志物 | NA | 探索CREM在胃腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 胃腺癌（GAC）中的CREM表达及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学方法，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22134 | 2024-08-08 |
Inflammatory Cells Accelerated Carotid Artery Calcification via MMP9: Evidences From Single-Cell Analysis
2021, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2021.766613
PMID:34938784
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了炎症细胞通过MMP9加速颈动脉钙化的机制 | 首次揭示了炎症巨噬细胞样VSMCs亚群的存在，并确定了MMP9在VSMCs表型转化中的重要作用 | NA | 研究血管平滑肌细胞在钙化早期的转化过程及其机制 | 颈动脉钙化核心及间质组织的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 22135 | 2024-08-08 |
Interleukin-23 receptor expressing γδ T cells locally promote early atherosclerotic lesion formation and plaque necrosis in mice
2022-11-10, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab359
PMID:34897380
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研究论文 | 研究探讨了白细胞介素-23受体（IL-23R）在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化早期病变形成和斑块坏死中的作用。 | 首次详细研究了IL-23R在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化中的具体作用。 | 研究主要在老鼠模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 研究IL-23R在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化中的作用，探索其作为治疗靶点的可能性。 | 主要研究对象为表达IL-23R的γδ T细胞和动脉粥样硬化病变。 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 使用了Ldlr-/-Il23rgfp/+和Ldlr-/-Tcrδ-/-两种基因改造的小鼠模型 |
| 22136 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing predicts motility networks in purified human gastric interstitial cells of Cajal
2022-07, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.14303
PMID:34913225
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人类胃间质Cajal细胞的运动网络 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究了人类胃间质Cajal细胞的分子网络，为胃肠动力障碍的治疗提供了新的分子见解和假设 | NA | 探索控制人类胃间质Cajal细胞生物学的分子网络，为胃肠动力障碍的靶向治疗提供新的框架 | 人类胃间质Cajal细胞 | 数字病理学 | 胃肠动力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用KIT+ CD45- CD11B- 初级人类胃间质Cajal细胞进行了一系列表征实验 |
| 22137 | 2024-08-08 |
3D collagen matrices modulate the transcriptional trajectory of bone marrow hematopoietic progenitors into macrophage lineage commitment
2022-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.08.032
PMID:34901544
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研究论文 | 研究使用3D胶原蛋白水凝胶和胶原蛋白-海藻酸盐水凝胶来探讨造血祖细胞的行为，并揭示了3D微环境中造血祖细胞向巨噬细胞分化的转录轨迹 | 首次揭示了3D胶原蛋白水凝胶中造血祖细胞向巨噬细胞分化的独特成熟轨迹，并展示了3D巨噬细胞与其他造血群集之间基于配体-修复相互作用的增强交流 | NA | 探究外基质提供的物理信号对骨髓中造血干细胞和祖细胞命运决定的影响 | 造血祖细胞及其在3D胶原蛋白水凝胶中的行为 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 从二维和三维水凝胶中随机选择的细胞 |
| 22138 | 2024-08-08 |
Unravelling glioblastoma heterogeneity by means of single-cell RNA sequencing
2022-02-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2021.12.008
PMID:34902524
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了胶质母细胞瘤的异质性，并构建了一个更强大的统一知识库 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤的隐藏组成，包括患者间异质性、肿瘤内组织、癌症干细胞多样性、克隆马赛克现象和肿瘤微环境 | NA | 深入理解塑造胶质母细胞瘤病理生物学的多样性 | 胶质母细胞瘤的异质性 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及多个患者和肿瘤样本 |
| 22139 | 2024-08-08 |
scShaper: an ensemble method for fast and accurate linear trajectory inference from single-cell RNA-seq data
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab831
PMID:34888622
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研究论文 | 本文介绍了scShaper，一种用于单细胞RNA测序数据快速准确线性轨迹推断的集成方法 | scShaper通过集成方法生成基于一组离散伪时间的连续平滑伪时间，能够推断多种三角函数轨迹，包括常用主曲线方法失败的轨迹 | NA | 开发更准确、更具泛化能力的细胞分化动态过程轨迹推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞轨迹推断 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成方法 | RNA测序数据 | 多种三角函数轨迹数据 |
| 22140 | 2024-08-08 |
On the relation between input and output distributions of scRNA-seq experiments
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab841
PMID:34908126
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序实验中输入和输出分布之间的关系 | 提出了一个包含PCR扩增和测序的单细胞RNA测序模型，并推导了给定输入分布的输出分布的概率分布函数 | NA | 研究单细胞RNA测序中的技术噪声如何影响观察到的分布与细胞内分布之间的关系 | 单细胞RNA测序实验中的RNA拷贝数分布 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |