单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 22041 - 22060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22041 | 2024-08-08 |
Differential Survival and Therapy Benefit of Patients with Breast Cancer Are Characterized by Distinct Epithelial and Immune Cell Microenvironments
2022-Mar-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1442
PMID:34965952
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研究论文 | 本文研究了乳腺癌患者中不同微环境细胞对生存和治疗效果的影响 | 首次在乳腺癌患者中识别出非免疫细胞类型（如成纤维细胞、肌上皮细胞等）对生存和治疗效果的相关性 | NA | 探讨微环境细胞在乳腺癌患者生存和治疗效果中的作用 | 乳腺癌患者的微环境细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA序列数据 | 超过3,500个乳腺癌患者的原发性肿瘤样本 |
| 22042 | 2024-08-08 |
Per- and polyfluoroalkyl substances target and alter human prostate stem-progenitor cells
2022-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2021.114902
PMID:34968493
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研究论文 | 研究探讨了全氟和多氟烷基物质（PFAS）对人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs）的影响及其潜在机制 | 首次发现人类前列腺SPCs是PFAS的直接作用目标，并揭示了PFAS暴露导致的转录组和代谢组重编程，这可能增加前列腺癌的风险 | NA | 探究PFAS长期暴露与前列腺癌风险增加之间的潜在机制 | 人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了10 nM的PFOA或PFOS处理的人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs） |
| 22043 | 2024-08-08 |
Single cell transcriptomics in human osteoarthritis synovium and in silico deconvoluted bulk RNA sequencing
2022-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.12.007
PMID:34971754
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研究论文 | 本研究旨在揭示骨关节炎（OA）滑膜组织中不同细胞类型的异质性，并通过新颖的方法确定是否可以通过基因反卷积技术将批量RNA测序数据转化为模拟的单细胞RNA测序数据 | 本研究首次通过基因反卷积技术将批量RNA测序数据转化为模拟的单细胞RNA测序数据，并创建了针对关节炎的特异性签名矩阵，提高了预测性能 | NA | 揭示骨关节炎滑膜组织中细胞类型的异质性，并探索批量RNA测序数据反卷积的可行性 | 骨关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习工具CIBERSORTx | RNA测序数据 | 102,077个滑膜细胞，来自17名接受全膝关节置换术的患者 |
| 22044 | 2024-08-08 |
Fatal COVID-19 and Non-COVID-19 Acute Respiratory Distress Syndrome Is Associated with Incomplete Alveolar Type 1 Epithelial Cell Differentiation from the Transitional State without Fibrosis
2022-03, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2021.11.014
PMID:34973949
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研究论文 | 本文研究了急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中肺泡上皮细胞（AEC）的再生过程，特别是从过渡状态到肺泡上皮细胞1型（AEC1）的分化，以及这一过程与肺纤维化的关系。 | 首次揭示了在人类ARDS中，过渡细胞可以分化为AEC1而不伴随纤维化的现象，并探讨了这一过程与肺纤维化的潜在关联。 | 研究主要基于免疫染色和单细胞RNA测序，未涉及更深入的分子机制研究。 | 探讨ARDS中肺泡上皮细胞的再生机制及其与肺纤维化的关系。 | ARDS患者的肺组织，特别是肺泡上皮细胞的分化和过渡状态。 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 免疫染色，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22045 | 2024-08-08 |
Optical Cell Tagging for Spatially Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2022-02-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202113929
PMID:34970821
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研究论文 | 本文开发了一种名为OpTAG的新型化学平台，用于在空间解析的方式下将功能标签附着在细胞表面，从而实现空间解析的单细胞RNA测序（scRNA-seq）。 | OpTAG-seq方法的创新之处在于它能够提供细胞在多细胞样本中的位置信息，从而实现空间解析的scRNA-seq。 | NA | 研究目的是开发一种新的方法来克服单细胞RNA测序数据中缺乏细胞位置信息的问题。 | 研究对象是迁移性癌细胞中的空间定义转录程序。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22046 | 2024-08-08 |
Immunotherapy of cancer in single-cell RNA sequencing era: A precision medicine perspective
2022-Feb, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112558
PMID:34953396
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症免疫治疗中的应用 | 结合单细胞RNA测序技术，能够以单细胞分辨率评估肿瘤在免疫治疗药物作用下的机制 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗中的肿瘤异质性和微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录活性数据 | NA |
| 22047 | 2024-08-08 |
An integrated brain-specific network identifies genes associated with neuropathologic and clinical traits of Alzheimer's disease
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab522
PMID:34953465
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研究论文 | 本研究开发了一种基于阿尔茨海默病大脑基因网络的方法，用于预测与阿尔茨海默病相关的基因，并通过独立遗传、转录组、蛋白质组数据以及神经病理学和临床数据进行系统验证 | 构建的网络在预测阿尔茨海默病相关基因方面优于现有网络，并揭示了细胞类型特异性的早期病理关联 | NA | 旨在识别与阿尔茨海默病相关的风险基因 | 阿尔茨海默病的遗传风险基因 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 基因网络 | 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、神经病理学数据、临床数据 | 使用了来自Mount Sinai脑库研究、宗教秩序研究、记忆和衰老项目以及巴尔的摩衰老纵向研究的数据 |
| 22048 | 2024-08-08 |
Understanding of mouse and human bladder at single-cell resolution: integrated analysis of trajectory and cell-cell interactive networks based on multiple scRNA-seq datasets
2022-Jan, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13170
PMID:34951074
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，详细解析了小鼠和人类膀胱在单细胞水平上的轨迹和细胞间相互作用网络 | 创建了迄今为止最大的整合膀胱数据集，并发现了多种基因的伪时间模式以及细胞间信号传导的特定模式 | NA | 详细解析小鼠和人类膀胱在单细胞水平上的生物学特性 | 小鼠和人类膀胱的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共收集了超过50,000个细胞，包括16,688个小鼠膀胱细胞和22,080个人类膀胱细胞 |
| 22049 | 2024-08-08 |
Lineage recording in human cerebral organoids
2022-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01344-8
PMID:34969984
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研究论文 | 本文介绍了iTracer技术，一种结合报告条形码和可诱导的CRISPR-Cas9疤痕的谱系记录器，用于研究人脑类器官发育中的克隆性和谱系动态 | iTracer技术能够直接测量谱系关系，并兼容单细胞和空间转录组学 | NA | 探索脑类器官发育过程中的克隆性和谱系动态 | 人脑类器官 | 干细胞研究 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22050 | 2024-08-08 |
eNOS controls angiogenic sprouting and retinal neovascularization through the regulation of endothelial cell polarity
2021-Dec-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04042-y
PMID:34971428
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研究论文 | 本研究探讨了eNOS在血管新生过程中的作用，特别是在内皮细胞极性调控中的角色 | 首次详细阐述了eNOS通过调节内皮细胞极性影响血管新生和视网膜新生血管化的机制 | NA | 研究eNOS在血管新生和视网膜新生血管化中的作用 | 内皮细胞的极性和血管新生 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | eNOS敲除小鼠的视网膜内皮细胞 |
| 22051 | 2024-08-08 |
TREM2-independent oligodendrocyte, astrocyte, and T cell responses to tau and amyloid pathology in mouse models of Alzheimer disease
2021-12-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110158
PMID:34965428
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，广泛分析了三种不同阿尔茨海默病（AD）小鼠模型中的13种细胞类型，重点研究了微胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对tau和淀粉样病理的反应。 | 研究发现了少突胶质细胞在不同疾病模型中出现的两种不同的转录状态，并确定了它们的空间分布。此外，研究还探讨了Trem2缺失在合并病理背景下的影响。 | NA | 研究非神经元细胞在神经退行性疾病中的反应，以及这些反应如何影响疾病的发病机制和进展。 | 微胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对tau和淀粉样病理的反应。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种不同阿尔茨海默病小鼠模型中的13种细胞类型 |
| 22052 | 2024-08-08 |
Conjoint analysis of circulating tumor cells and solid tumors for exploring potential prognostic markers and constructing a robust novel predictive signature for breast cancer
2021-Dec-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02415-8
PMID:34953500
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研究论文 | 本研究通过分析循环肿瘤细胞和实体瘤的基因表达数据，探索乳腺癌的潜在预后标志物并构建一个新的预测模型 | 首次在分子水平上研究循环肿瘤细胞的异质性，并利用这些信息构建了一个18基因的风险评分模型，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和批量测序数据，可能存在样本量不足的问题 | 探索乳腺癌的潜在预后标志物并构建一个稳健的新预测模型 | 循环肿瘤细胞和实体瘤的基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 涉及乳腺癌患者的循环肿瘤细胞和实体瘤样本 |
| 22053 | 2024-08-08 |
Spatially Resolved Expression of Transposable Elements in Disease and Somatic Tissue with SpatialTE
2021-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413623
PMID:34948421
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialTE的工具，用于分析空间转录组学数据中的转座子表达，并展示了其在体细胞和疾病组织中的应用 | SpatialTE工具能够分析空间转录组学数据中的转座子表达，这是由于转座子的高度重复性质在以往的研究中未被充分探讨 | NA | 研究转座子在空间上的表达模式及其在基因调控中的作用 | 转座子在体细胞和疾病组织中的表达 | NA | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22054 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell sequencing of 5-hydroxymethylcytosine and genomic DNA using scH&G-seq
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101016
PMID:34950891
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研究论文 | 本文提供了一种单细胞5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA测序（scH&G-seq）的详细协议，用于同时量化单个细胞中的5hmC和基因组DNA，以在单细胞分裂分辨率下重建谱系树 | scH&G-seq技术能够同时量化单个细胞中的5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA，结合基因组变异数据，准确重建更大的谱系树 | NA | 开发一种新的单细胞测序技术，用于在单细胞分裂分辨率下重建细胞谱系 | 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）和基因组DNA | 基因组学 | NA | scH&G-seq | NA | DNA | 单个细胞 |
| 22055 | 2024-08-08 |
Profiling Glioblastoma Cases with an Expression of DCX, OLIG2 and NES
2021-Dec-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413217
PMID:34948016
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了17例胶质母细胞瘤中DCX、NES和OLIG2的表达模式 | 首次详细分析了DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并结合单细胞RNA测序数据进行了深入探讨 | 研究结果未能明确证明DCX参与胶质母细胞瘤细胞的迁移 | 探讨DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用 | 胶质母细胞瘤中的DCX、NES和OLIG2表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 17例胶质母细胞瘤样本 |
| 22056 | 2024-08-08 |
Immunotherapy for Hepatocellular Carcinoma: New Prospects for the Cancer Therapy
2021-Dec-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11121355
PMID:34947886
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综述 | 本文综述了肝细胞癌（HCC）的免疫治疗新进展，包括免疫检查点抑制剂、树突状细胞疫苗、溶瘤病毒等方法 | 介绍了单细胞RNA测序技术在识别免疫细胞群及其相互作用中的应用，以提高HCC患者对免疫治疗反应的可能性 | 目前免疫治疗策略在临床上尚未普遍引发强烈的抗肿瘤反应 | 探讨肿瘤浸润免疫细胞的种类及其在HCC发展中的作用，并讨论免疫治疗策略的最新进展 | 肝细胞癌及其免疫治疗 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22057 | 2024-08-08 |
Therapeutic Effect of IL-38 on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Cell Pathogenicity
2021-12-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.62.15.31
PMID:34967854
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素(IL)-38对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的影响及其潜在机制 | 首次揭示了IL-38通过重编程免疫细胞景观和减少Th17细胞致病性来治疗EAU的效果 | NA | 阐明IL-38对EAU的影响及其机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | NA | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 正常小鼠、EAU小鼠及IL-38治疗的小鼠的颈淋巴结 |
| 22058 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Developmental Relationships and Specific Markers of Mouse Periodontium Cellular Subsets
2021-Aug, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2021.679937
PMID:34966906
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠牙周组织细胞亚群的发育关系及特定标记物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了牙周组织细胞的异质性及其与牙囊细胞的关系，并鉴定了区分牙骨质细胞和牙槽骨成骨细胞的特定基因 | NA | 探讨牙周组织细胞的发育关系及其细胞间相互作用 | 小鼠牙周组织的细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括PTHrP-mCherry牙囊细胞（P6）和2.3kb Col1a1启动子驱动的GFP牙周细胞（P25） |
| 22059 | 2024-08-08 |
scGET: Predicting Cell Fate Transition During Early Embryonic Development by Single-cell Graph Entropy
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.11.008
PMID:34954425
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scGET的计算方法，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据探索基因间的关联，用于预测早期胚胎发育中的细胞命运转变 | scGET方法通过将基因表达数据转换为局部网络熵，利用单细胞图熵（SGE）值定量描述细胞群体间基因调控网络的稳定性和关键性，从而在单细胞水平上检测细胞命运或谱系承诺的关键信号 | NA | 研究目的是开发一种新的计算方法来预测早期胚胎发育中的细胞命运转变 | 研究对象是早期胚胎发育过程中的细胞命运转变 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 五个scRNA-seq数据集 |
| 22060 | 2024-08-08 |
GranatumX: A Community-engaging, Modularized, and Flexible Webtool for Single-cell Data Analysis
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.005
PMID:34973417
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研究论文 | 介绍了一种名为GranatumX的下一代软件环境，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | GranatumX允许生物学家在基于Web的图形环境中访问最新的scRNA-seq生物信息学方法，并为软件开发者提供了一个快速推广其工具的平台 | NA | 开发一个社区参与、模块化和灵活的Web工具，用于单细胞数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据分析 | NA |