单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27271 篇文献，本页显示第 21981 - 22000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21981 | 2024-08-08 |
Single-Cell Regulatory Network Inference and Clustering Identifies Cell-Type Specific Expression Pattern of Transcription Factors in Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.676515
PMID:34955748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了成年小鼠坐骨神经中不同细胞类型的转录因子表达模式，并构建了细胞类型特异性的表达图谱 | 首次在单细胞水平上揭示了小鼠坐骨神经中不同细胞类型的转录因子表达模式，并创建了细胞类型特异性的表达图谱 | NA | 旨在识别复杂组织中的细胞类型，并进行大规模的细胞类型特异性基因表达分析 | 成年小鼠坐骨神经中的不同细胞类型及其转录因子表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 238个转录因子在9种不同细胞类型中表达 |
| 21982 | 2024-08-08 |
Retinal Organoids Long-Term Functional Characterization Using Two-Photon Fluorescence Lifetime and Hyperspectral Microscopy
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.796903
PMID:34955757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于双光子显微镜的活体成像技术，用于非侵入性地监测和表征视网膜类器官的长期发育 | 使用荧光寿命成像显微镜（FLIM）和超光谱成像技术监测视网膜类器官的代谢轨迹和分子结构变化 | 组织产物的异质性和主观组织选择降低了类器官实验的可重复性 | 提高类器官质量控制，监测视网膜类器官的长期发育 | 视网膜类器官的代谢和分子结构变化 | 数字病理学 | NA | 双光子显微镜，荧光寿命成像显微镜（FLIM），超光谱成像 | NA | 图像 | 多个细胞系和生产批次的视网膜类器官 |
| 21983 | 2024-08-08 |
Airway Basal Cells Mediate Hypoxia-Induced EMT by Increasing Ribosome Biogenesis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.783946
PMID:34955855
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研究论文 | 研究探讨了气道基底细胞在缺氧诱导的上皮间质转化（EMT）中的作用，特别是通过增加核糖体生物发生 | 首次揭示了气道基底细胞通过增强核糖体生物发生来介导缺氧诱导的EMT过程 | NA | 探究缺氧在气道上皮细胞中诱导EMT的机制 | 小鼠气管上皮细胞（MTECs）及其在缺氧条件下的反应 | NA | 呼吸系统疾病 | 流式细胞术，免疫荧光检测，实时荧光定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 21984 | 2024-08-08 |
Galectin-9/TIM-3 as a Key Regulator of Immune Response in Gliomas With Chromosome 1p/19q Codeletion
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.800928
PMID:34956239
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研究论文 | 本研究探讨了1p/19q共缺失的胶质瘤中Galectin-9/TIM-3作为免疫反应关键调节因子的生物学功能变化 | 发现1p/19q共缺失通过下调Galectin-9和TIM-3的表达水平，促进胶质瘤的抗肿瘤免疫反应 | NA | 揭示1p/19q共缺失胶质瘤中与免疫反应紧密相关的生物学功能变化 | 1p/19q共缺失的胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序, t-SNE算法, CIBERSORT分析 | NA | RNA序列数据, 单细胞测序数据 | 来自The Cancer Genome Atlas和中国胶质瘤基因组图谱数据库的胶质瘤患者临床病理和RNA测序数据 |
| 21985 | 2024-08-08 |
Hypoxia Contributes to Poor Prognosis in Primary IDH-wt GBM by Inducing Tumor Cells MES-Like Transformation Trend and Inhibiting Immune Cells Activity
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.782043
PMID:34956900
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研究论文 | 研究揭示了低氧环境对原发性IDH野生型胶质母细胞瘤患者肿瘤细胞和免疫细胞的影响 | 首次详细分析了低氧条件下肿瘤细胞的MES样转化趋势及对免疫细胞功能的抑制作用 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨低氧环境对原发性IDH野生型胶质母细胞瘤中肿瘤细胞和免疫细胞的影响 | 原发性IDH野生型胶质母细胞瘤患者的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 数据来自Gene Expression Omnibus (GEO) 和 The Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据库 |
| 21986 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed the Heterogeneity of Gonadal Primordial Germ Cells in Zebra Finch (Taeniopygia guttata)
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.791335
PMID:34957119
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了斑胸草雀生殖嵴原始生殖细胞的异质性 | 首次揭示了斑胸草雀原始生殖细胞的异质性，并发现了新的生物标志物 | NA | 评估斑胸草雀原始生殖细胞的异质性 | 斑胸草雀的原始生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从雄性和雌性斑胸草雀的胚胎生殖细胞中鉴定出20个细胞簇中的9种细胞类型 |
| 21987 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Rat Carotid Arteries Uncovers Potential Cellular Targets of Neointimal Hyperplasia
2021, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2021.751525
PMID:34957241
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对比正常和狭窄的颈动脉，揭示了新生内膜增生潜在的细胞靶点 | 发现了同时表达血管平滑肌细胞和成纤维细胞标记的过渡细胞类型，并验证了N-肉豆蔻酰转移酶1作为血管平滑肌细胞合成表型的标记物 | 提出的新靶基因如Cyp7a1和Cdk4需要在未来的研究中进行验证 | 探索新生内膜增生的潜在细胞靶点和机制 | 大鼠颈动脉的正常和狭窄状态 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠的左（对照）和右（球囊损伤）颈动脉 |
| 21988 | 2024-08-08 |
Different Glucose Metabolic Features According to Cancer and Immune Cells in the Tumor Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.769393
PMID:34966676
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研究论文 | 本文研究了肿瘤微环境中癌细胞与免疫细胞之间的葡萄糖代谢特征，并探讨了这些特征对肿瘤免疫状态的影响。 | 首次在单细胞水平上全面研究了肿瘤微环境中葡萄糖代谢特征，并发现GLUT可能是肿瘤免疫代谢状态的替代指标和免疫治疗辅助治疗的潜在靶点。 | NA | 探索肿瘤微环境中癌细胞与免疫细胞的葡萄糖代谢特征，以发现可行的代谢靶点。 | 肿瘤微环境中的癌细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括黑色素瘤、头颈癌和乳腺癌等多种人类癌症组织样本。 |
| 21989 | 2024-08-08 |
Identification of Subtypes and a Prognostic Gene Signature in Colon Cancer Using Cell Differentiation Trajectories
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.705537
PMID:34966734
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研究论文 | 本研究通过细胞分化轨迹分析，探索结直肠癌（CC）细胞的异质性，并构建基于CC分化相关基因（CDRG）的预后风险评分（RS）特征 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出两个具有不同分化状态的子集，并基于CDRG构建分子亚型和预后RS特征，能有效预测患者的临床结局和治疗反应 | NA | 探索结直肠癌细胞的分化轨迹及其临床意义，并构建基于CDRG的预后风险评分特征 | 结直肠癌细胞的分化轨迹和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练集使用The Cancer Genome Atlas数据，验证集使用GSE39582数据，涉及40个由YY1和EGR2调控的枢纽CDRG |
| 21990 | 2024-08-08 |
Identification of ZEB2 as an Immune-Associated Gene in Endometrial Carcinoma and Associated with Macrophage Infiltration by Bioinformatic Analysis
2021, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2021/4372373
PMID:34970423
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析了子宫内膜癌中的免疫细胞组成，并发现ZEB2基因在免疫细胞中的特异性表达及其与肿瘤纯度和巨噬细胞浸润的关联 | 首次揭示了ZEB2在子宫内膜癌免疫环境中的独特作用，并探讨了其作为免疫治疗靶点的潜力 | NA | 探讨ZEB2在子宫内膜癌免疫环境中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 子宫内膜癌中的免疫细胞及ZEB2基因的表达与功能 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组测序, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-UCEC的bulk RNA-seq数据和来自HPA数据库的免疫组织化学样本 |
| 21991 | 2024-08-08 |
Handling the Cellular Complex Systems in Alzheimer's Disease Through a Graph Mining Approach
2021, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-78775-2_16
PMID:34973018
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研究论文 | 本文通过图挖掘方法处理阿尔茨海默病中的细胞复杂系统，开发了一种针对单细胞RNA-seq实验的子通路分析方法，以识别潜在的扰动生物过程。 | 本文提出了一种新的子通路分析方法，用于处理单细胞RNA-seq数据，以减少假发现并识别与神经退行性变相关的扰动生物过程。 | NA | 旨在通过图挖掘方法揭示复杂人类疾病的病理机制，并改进诊断和治疗方法。 | 阿尔茨海默病中的细胞系统及其生物过程。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | 图挖掘 | RNA-seq数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 21992 | 2024-08-08 |
Low Expression of YTH Domain-Containing 1 Promotes Microglial M1 Polarization by Reducing the Stability of Sirtuin 1 mRNA
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.774305
PMID:34975410
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研究论文 | 本文研究了m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用，发现YTH域包含蛋白1（YTHDC1）的低表达通过降低Sirtuin 1 mRNA的稳定性促进小胶质细胞M1极化 | 首次揭示了YTHDC1在视网膜小胶质细胞炎症反应调节中的关键作用 | NA | 探讨m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用 | 视网膜小胶质细胞在葡萄膜炎中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠视网膜细胞 |
| 21993 | 2024-08-08 |
Quantifying Genomic Imprinting at Tissue and Cell Resolution in the Brain
2020-Sep-04, Epigenomes
IF:2.5Q3
DOI:10.3390/epigenomes4030021
PMID:34968292
|
综述 | 本文综述了在组织和细胞水平上量化基因组印记的方法，特别强调了检测亲本来源依赖性表达的方法及其在脑研究中的应用 | 介绍了单细胞多组学方法，这些方法结合了DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质构象等特征，有望深入理解个体脑细胞中的基因组印记 | NA | 旨在更好地理解印记基因的功能，特别是构建详细的亲本来源依赖性表达和相关表观遗传特征图谱 | 印记基因在正常和病理脑中的作用 | NA | 脑疾病 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21994 | 2024-08-08 |
Deciphering functional tumor states at single-cell resolution
2022-12-17, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021109221
PMID:34918370
|
综述 | 本文综述了通过单细胞测序方法识别肿瘤状态的不同研究，以及促进和维持这些功能状态及其转换的机制 | 讨论了肿瘤可塑性和转换状态的理解如何用于开发改善癌症治疗的新策略 | NA | 深入理解肿瘤功能异质性和揭示肿瘤脆弱性 | 肿瘤细胞的不同状态及其基因调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因调控网络 | NA |
| 21995 | 2024-08-08 |
Microglia activation, classification and microglia-mediated neuroinflammatory modulators in subarachnoid hemorrhage
2022-Jul, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.330589
PMID:34916410
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综述 | 本文综述了蛛网膜下腔出血中微胶质细胞激活、分类及其介导的神经炎症调节因子的研究进展 | 介绍了单细胞转录组学在微胶质细胞研究中的最新进展，并总结了基于转录组的微胶质细胞分类及其对微胶质细胞激活和神经炎症的启示 | NA | 旨在理解蛛网膜下腔出血后的疾病过程，特别是微胶质细胞激活的调节因子和促炎/抗炎细胞因子及趋化因子 | 微胶质细胞及其介导的神经炎症在蛛网膜下腔出血中的作用 | NA | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 21996 | 2024-08-08 |
Parallel Single-Cell Multiomics Analysis of Neonatal Skin Reveals the Transitional Fibroblast States that Restrict Differentiation into Distinct Fates
2022-07, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.11.032
PMID:34922949
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研究论文 | 本文通过并行多组学分析新生小鼠皮肤中的单细胞转座酶可及染色质测序和单细胞RNA测序，揭示了纤维母细胞群可以根据转录组特征分为乳头状和网状谱系，并探讨了染色质可及性与基因表达之间的关系。 | 本文首次通过单细胞转座酶可及染色质测序分析了新生纤维母细胞谱系标记，发现尽管纤维母细胞群具有谱系特异性的转录组特征，但所有纤维母细胞群中均存在可及染色质，这表明染色质可及性并不总是转化为基因表达。 | NA | 研究新生纤维母细胞的异质性及其在皮肤再生中的作用，特别是分子机制调控细胞状态和命运。 | 新生小鼠皮肤中的纤维母细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 新生小鼠皮肤样本 |
| 21997 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscapes of a rare human laryngeal chondrosarcoma
2022-Apr, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03883-1
PMID:34931260
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了一例罕见的人喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 首次系统研究了喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制，并通过单细胞测序技术揭示了肿瘤异质性和肿瘤微环境组成 | 仅基于一例病例进行研究，可能存在样本量不足的问题 | 探索喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 一例74岁男性患者的喉软骨肉瘤及其周围软骨组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 5455个单细胞 |
| 21998 | 2024-08-08 |
Early Tumor-Immune Microenvironmental Remodeling and Response to First-Line Fluoropyrimidine and Platinum Chemotherapy in Advanced Gastric Cancer
2022-04-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-0888
PMID:34933901
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研究论文 | 本文通过结合全外显子测序、批量RNA和单细胞转录组学，研究了HER2阳性和HER2阴性晚期胃癌患者在接受一线氟嘧啶和铂类化疗前后肿瘤免疫微环境的变化，并定义了与化疗反应相关的特征。 | 首次详细描述了化疗对肿瘤免疫微环境的具体影响，包括自然杀伤细胞的招募、肿瘤相关巨噬细胞的减少等，并提出了未来治疗策略的候选方法。 | 研究未观察到早期治疗采样中的显著基因组变化，且样本量未明确提及。 | 探讨标准化疗对肿瘤免疫微环境的影响，并识别与化疗反应相关的特征。 | HER2阳性和HER2阴性晚期胃癌患者。 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序, 批量RNA测序, 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA |
| 21999 | 2024-08-08 |
Allosteric inhibition of SHP2 uncovers aberrant TLR7 trafficking in aggravating psoriasis
2022-03-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202114455
PMID:34936223
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研究论文 | 研究揭示了SHP2在银屑病中的作用及其通过调节TLR7转运影响炎症的机制 | 首次发现SHP2通过调节TLR7的转运在银屑病中起关键作用，并验证了SHP2抑制剂SHP099的治疗潜力 | NA | 探究SHP2在银屑病中的作用及其分子机制 | SHP2在银屑病患者和模拟银屑病小鼠模型中的表达及作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括银屑病患者和模拟银屑病的小鼠模型 |
| 22000 | 2024-08-08 |
MACA: marker-based automatic cell-type annotation for single-cell expression data
2022-03-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab840
PMID:34935911
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MACA的新工具，用于自动注释单细胞转录组数据中的细胞类型 | MACA通过测试四种细胞类型评分方法和两个公共细胞标记数据库，在六个单细胞研究中表现出色，提高了注释的准确性和速度 | NA | 开发一种新的工具，用于提高单细胞转录组数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约29万个细胞 |