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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2181 | 2026-06-04 |
A temporal and spatial atlas of adaptive immune responses in the lymph node following viral infection
2026-Feb-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504742123
PMID:41587309
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研究论文 | 提出AIR-SPACE方法,结合高分辨率空间转录组学与配对长读长测序,构建病毒感染后淋巴结适应性免疫应答的时空图谱 | 同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库在其天然空间背景下的状态,揭示感染早期干扰素-γ产生的异质性激活生态位,以及抗体产生浆细胞通过生发中心暗区分化和迁出的新证据 | 该研究仅在鼠后膝窝淋巴结中对牛痘病毒感染进行分析,可能需在其他模型或人类样本中验证普遍性 | 理解病毒感染后淋巴结中适应性免疫细胞的空间组织和动态过程 | 小鼠后膝窝淋巴结(在牛痘病毒足垫感染后的五个时间点) | 数字病理学 | 病毒感染 | 空间转录组学, 长读长测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫受体库测序数据 | 多个小鼠后膝窝淋巴结,在感染后五个时间点采集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2182 | 2026-06-04 |
GCSH promotes colorectal cancer progression by inhibiting Cuproptosis through the PI3K/AKT-FDX1 axis
2026-Jan-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01808-6
PMID:41591502
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研究论文 | GCSH通过PI3K/AKT-FDX1轴抑制铜凋亡促进结直肠癌进展 | 首次发现GCSH是铜凋亡的新型调节因子,并揭示其通过PI3K/AKT-GCSH/FDX1轴抑制铜凋亡以促进结直肠癌进展的机制 | 文章摘要未明确提及局限性 | 探究GCSH在结直肠癌中的作用及其对铜凋亡的调控机制 | 结直肠癌组织、血液样本及结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | TCGA数据集689例,4个独立GEO数据集共709例,以及临床组织、血液样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2183 | 2026-06-04 |
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03954-x
PMID:41593779
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研究论文 | 介绍SCITO-seq2,一种超高通量单细胞转录组与表位测序技术 | 结合探针基础RNA检测与超高通量蛋白分析,共享池条形码策略确保多液滴分子图谱精准匹配 | 未在摘要中明确提及 | 开发可扩展、高效、经济的下一代单细胞多组学工作流程 | 自身免疫疾病患者样本,包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,表位测序 | NA | 单细胞转录组及蛋白数据 | 超过100,000个细胞 | NA | 单细胞多组学 | SCITO-seq2 | SCITO-seq2技术,整合探针RNA检测和超高通量蛋白分析,使用共享池条形码策略 |
| 2184 | 2026-06-04 |
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-03902-2
PMID:41593799
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研究论文 | 通过单细胞和转录组分析解析骨肉瘤基质细胞相互作用,发现CDKN2A和MMP14作为新型诊断和治疗生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和转录组数据,利用高维WGCNA和CellChat分析解析骨肉瘤基质细胞网络,并筛选出CDKN2A和MMP14作为潜在诊断和治疗靶点,同时预测白藜芦醇能稳定结合MMP14 | 依赖公开数据集,缺乏大规模临床样本验证;体外实验限于细胞系,未进行体内动物模型验证 | 揭示骨肉瘤基质细胞相互作用网络,识别新型诊断标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤基质细胞、巨噬细胞等其他细胞亚群 | 机器学习和数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | Seurat, CellChat, hdWGCNA, DESeq2 | 单细胞转录组数据、转录组数据 | 公开数据集的样本量未具体说明,但包含来自GEO的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2185 | 2026-06-04 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
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研究论文 | 研究发现乳腺癌细胞通过外泌体传递RAB10至巨噬细胞,结合IFNAR1抑制JAK1/STAT1通路,阻碍M1极化并促进M2极化,从而促进肿瘤免疫逃逸 | 首次揭示外泌体RAB10通过结合IFNAR1抑制JAK1/STAT1通路调控巨噬细胞极化的新机制,并发现联合靶向RAB10与PD-L1可协同抑制肿瘤生长 | 未提及 | 探究外泌体RAB10对巨噬细胞极化和肿瘤生长的影响及机制 | 乳腺癌细胞系、巨噬细胞、单细胞RNA测序数据、荷瘤小鼠模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 乳腺癌细胞系及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2186 | 2026-06-04 |
Analysis of cranial tenocyte heterogeneity reveals a role for Wnt signaling in tendon attachments
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205047
PMID:41582829
|
研究论文 | 通过斑马鱼胚胎头部结缔组织的单细胞RNA测序,揭示肌腱细胞和韧带细胞在发育过程中的异质性,并发现Wnt信号在肌腱附着中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出发育中肌腱细胞和韧带细胞的不同亚群,揭示了肌腱细胞在空间和功能上的异质性,并明确了经典Wnt信号通路在肌腱附着模式形成中的新作用 | 主要基于斑马鱼模型,可能无法完全代表人类肌腱发育;仅聚焦于胚胎阶段,未涉及成年或老化过程 | 探究肌腱和韧带发育过程中细胞异质性的遗传机制,以及Wnt信号在肌腱附着中的作用 | 斑马鱼胚胎头部的结缔组织,包括发育中的肌腱细胞和韧带细胞 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤及年龄相关退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎头部结缔组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2187 | 2026-06-04 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Cervical Cancer Cell Lines Before and After Chemoradiotherapy
2026-Jan-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020115
PMID:41597190
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析宫颈癌细胞系在放化疗前后的转录组景观,揭示化疗耐药机制 | 首次建立来自同一宫颈癌患者在放疗前后的等基因原代细胞系对(AdMer35和AdMer43),并进行单细胞转录组比较分析,揭示了多层面细胞适应性在化疗耐药中的作用 | 仅基于一对患者来源的细胞系,样本量有限,需在更多样本和临床队列中验证 | 阐明宫颈癌化疗耐药的细胞和分子机制 | 一对等基因的原代宫颈癌细胞系(AdMer35和AdMer43),分别来自同一鳞状细胞癌患者放疗前后的组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 一对细胞系(AdMer35和AdMer43),来自一名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2188 | 2026-06-04 |
IPO9 Promotes Ovarian Cancer Progression by Suppressing HMOX1-Dependent Ferroptosis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8545131
PMID:41584724
|
研究论文 | 该研究整合多组学数据,发现MALAT1上皮细胞是卵巢癌核心细胞亚群,并揭示IPO9通过抑制HMOX1依赖性铁死亡促进肿瘤进展 | 首次将单细胞RNA测序、scPagwas、BayesPrism和WGCNA相结合,鉴定出MALAT1上皮细胞作为卵巢癌免疫抑制的关键驱动亚群,并发现IPO9作为治疗靶点调控铁死亡机制 | 未说明具体限制 | 探索卵巢癌的新型治疗靶点及免疫微环境动态 | 卵巢癌细胞、MALAT1上皮细胞亚群、IPO9基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 基因表达数据, 突变数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2189 | 2026-06-04 |
Tissue-resident macrophage and dendritic cells drive type I IFN immunity to enteroviruses in the liver
2026-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013891
PMID:41592119
|
研究论文 | 该研究结合小鼠模型和单细胞RNA测序揭示了库普弗细胞和树突状细胞在肝脏中驱动I型干扰素免疫应答以抵抗埃可病毒感染的细胞类型特异性机制 | 首次利用单细胞RNA测序在体内模型中准确定位了埃可病毒感染的肝细胞类型,并揭示了库普弗细胞和树突状细胞是早期I型干扰素应答的主要驱动者,而非肝细胞自身 | 该研究主要在转基因小鼠模型中进行,可能不完全反映人类新生儿的免疫反应;另外,I型干扰素对肝细胞的保护作用机制尚需进一步验证 | 阐明在埃可病毒感染肝脏过程中,不同类型固有免疫细胞对I型和III型干扰素抗病毒信号启动的相对贡献 | 表达人类新生儿Fc受体(hFcRn)且缺乏Ifnar1、Ifnlr1或两者的小鼠模型,以及肝细胞特异性Ifnar1基因敲除小鼠 | NA | 埃可病毒感染相关肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种基因敲除小鼠模型(具体样本量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2190 | 2026-06-04 |
The role of 5-methylcytosine regulator-related genes in diagnostic and immune regulatory functions in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1636323
PMID:41583468
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研究论文 | 研究5-甲基胞嘧啶调控相关基因在动脉粥样硬化诊断和免疫调节中的作用 | 首次系统分析m5C修饰及其调控基因在AS中的诊断和免疫调控功能,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证NSUN3在巨噬细胞功能中的关键作用 | 研究主要基于公开微阵列数据集,样本量有限且缺乏大规模临床验证;ceRNA网络仅通过数据库预测,未进行实验验证 | 探究m5C修饰和相关基因在动脉粥样硬化诊断和免疫调节中的功能 | 动脉粥样硬化患者样本和THP-1巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,实时定量PCR,RNA干扰 | LASSO逻辑回归模型,WGCNA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 四个GEO数据集(GSE90074、GSE27034、GSE59421、GSE159677) | NA | 转录组测序 | NA | 来自GEO数据库的微阵列平台相关数据 |
| 2191 | 2026-06-03 |
MOTS-c, a mitochondrial-derived peptide, ameliorates lysosomal membrane permeability and improves survival of soft tissue transplantation
2026-Jun-02, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2677180
PMID:42153537
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研究论文 | 本研究发现线粒体衍生肽MOTS-c通过抑制PLA2G4A磷酸化,减少溶酶体膜通透性,改善缺血皮瓣的存活 | 首次揭示MOTS-c通过MAPK1-MAPK3-NFKB信号级联调控PLA2G4A-LMP轴,促进自噬并减少内皮细胞焦亡,从而改善组织移植生存率 | 未明确MOTS-c在其他缺血组织模型中的效果以及长期治疗效果 | 研究MOTS-c在缺血皮瓣中的保护作用及其分子机制 | 缺血皮瓣模型和人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 缺血性坏死 | RNA-seq, Western blotting, ELISA, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 2192 | 2026-06-03 |
Ferroptosis promotes aortic stenosis through 5-lipoxygenase
2026-Jun-02, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehag397
PMID:42227114
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研究论文 | 铁死亡通过5-脂氧合酶促进主动脉瓣狭窄的机制研究 | 首次鉴定ALOX5-ACSL4轴为钙化性主动脉瓣疾病中铁死亡的关键介质,并验证其作为临床干预靶点的转化潜力 | 未说明具体局限性 | 探索铁死亡在钙化性主动脉瓣疾病中的通路机制并验证其临床转化相关性 | 人类主动脉瓣组织样本、手术患者的瓣膜间质细胞、小鼠模型(阿霉素诱导铁死亡模型和钢丝损伤模型) | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据、图像数据 | 212个手术患者主动脉瓣、4874名SCAPIS参与者、273550名UK Biobank参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2193 | 2026-06-03 |
Myeloid Piezo1 Drives Cardiac Repair Through Orai1-Rac1-Dependent Efferocytosis
2026-Jun-02, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.328012
PMID:42227117
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研究论文 | 研究揭示了髓系细胞中Piezo1通道通过Orai1-Rac1依赖性胞葬作用驱动心脏修复的机制 | 首次发现Piezo1-Orai1-Rac1信号轴在心肌梗死后巨噬细胞胞葬作用和溶酶体成熟中的调控作用 | 未提及具体限制 | 探究髓系特异性Piezo1通道在心肌梗死后心脏修复中的作用及其分子机制 | 小鼠心肌梗死模型及骨髓来源巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 实时聚合酶链反应, 膜片钳, Western blot, 细胞转染, 巨噬细胞-心肌细胞共培养 | NA | 图像, 文本 | 小鼠心肌梗死模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 2194 | 2026-06-03 |
Piecing Together the Alveolar-Capillary Unit: Arterial - Venous Capillary Polarization
2026-Jun-02, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00101.2026
PMID:42227649
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综述 | 总结肺毛细血管内皮细胞的异质性,强调动静脉极化和CAP1群体中的修复性祖细胞 | 首次系统阐述肺毛细血管床的动静脉极化现象,并识别CAP1群体中具有增强血管生成潜能的多个转录特征性EC亚群 | 文章为综述性质,未提供原始实验数据;对新兴技术如EC富集、转录组学和表观基因组分析的解析仍受限于单细胞分辨率 | 深入理解肺毛细血管内皮细胞多样性和谱系动力学,为促进血管稳定性和再生性血管生成的靶向治疗提供基础 | 肺毛细血管内皮细胞(ECs),包括CAP1和CAP2群体 | 数字病理学 | 慢性肺疾病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、EC富集策略、转录组学和表观基因组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2195 | 2026-06-03 |
The role of cellular senescence in immune-metabolic features and prognosis of ovarian cancer: an integrated analysis based on single-cell sequencing and multi-omics data
2026-Jun-02, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-026-02343-3
PMID:42228240
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研究论文 | 整合单细胞测序和多组学数据,分析细胞衰老在卵巢癌免疫代谢特征及预后中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和多组学数据整合分析,系统揭示卵巢癌中衰老相关基因(SAGs)在肿瘤异质性、微环境免疫代谢及铂类药物反应中的作用,并构建了具有预后价值的八基因风险模型 | 基于公开数据库分析,缺乏额外的实验和临床验证 | 阐明衰老相关基因在卵巢癌异质性、预后及治疗相关特征中的角色 | 卵巢癌患者的肿瘤组织样本(包括TCGA和GEO数据集及单细胞测序数据) | 生物信息学, 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 多组学整合分析 | 共识聚类, 风险模型(八基因衰老相关风险模型) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据集中的卵巢癌患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2196 | 2026-06-03 |
Olfactory epithelium regeneration and homeostasis: cellular and molecular mechanisms and novel methodological advances
2026-Jun-02, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-026-00292-y
PMID:42228282
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综述 | 综述了嗅上皮再生与稳态维持的细胞和分子机制,以及新兴技术进展 | 整合最新单细胞转录组学、空间转录组学和类器官模型的研究成果,揭示了先前未知的细胞状态、分化路径和细胞间通讯 | 未提及具体局限性信息 | 总结支持嗅上皮再生的分子和细胞机制,突出推进理解该过程的新兴技术 | 嗅上皮中的水平基底细胞和球状基底细胞 | 数字病理学 | 嗅觉功能障碍 | 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官模型 | NA | 转录组数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2197 | 2026-06-03 |
OGFRL1 Deficiency Causes Chronic Recurrent Multifocal Osteomyelitis Via Pathologic Osteoclastogenesis, With Therapeutic Response to Tumor Necrosis Factor Inhibitor
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70057
PMID:41568604
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研究论文 | 本研究验证了OGFRL1功能缺失变异在慢性复发性多灶性骨髓炎(CRMO)患者中的作用,并探讨其致病机制 | 首次发现OGFRL1缺陷是CRMO的新病因,揭示OGFRL1在抑制炎症反应中的先前未被认识的作用 | NA | 验证OGFRL1功能缺失变异在CRMO发病中的作用并研究其机制 | CRMO患者、Ogfrl1基因敲除小鼠 | 机器学习 | 慢性复发性多灶性骨髓炎 | 全外显子测序、Sanger测序、定量PCR、ELISA、流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、基因表达数据 | 1例CRMO患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2198 | 2026-06-03 |
CCL3+ Neutrophil Signature Predicts Response to Neoadjuvant Toripalimab plus Chemotherapy in Patients with Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma: A Phase II Trial
2026-Jun-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-4096
PMID:41817286
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和大量RNA测序,发现CCL3+中性粒细胞特征可作为预测下咽鳞状细胞癌患者对新辅助特瑞普利单抗联合化疗反应的生物标志物 | 首次提出Neu_CCL3基因特征作为预测下咽鳞状细胞癌新辅助免疫治疗反应的强独立生物标志物,其预测效能显著优于PD-L1 CPS评分 | 单中心、单臂II期试验设计;验证样本量有限(60例);机制验证仅通过免疫组化和测序,缺乏更深入的实验验证 | 寻找可预测下咽鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应的生物标志物 | 可切除局部晚期下咽鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 下咽鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序, 免疫组织化学 | 无 | 基因表达数据 | 70例患者(其中13例进行单细胞RNA测序,60例进行验证) | NA | 单细胞RNA测序, 大量RNA测序 | NA | NA |
| 2199 | 2026-06-03 |
Defective HNF1A hinders GLI3 processing favoring duodenal versus pancreatic fate, thus leading to intestinal elongation in vivo
2026-Jun-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353153.125
PMID:41887801
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研究论文 | 揭示HNF1A缺陷通过影响GLI3加工促进十二指肠而非胰腺命运,导致体内肠道延长 | 发现Hnf1a与Hedgehog信号之间的新型自调节回路,并阐明其通过调控GLI3加工影响后前肠细胞谱系分离 | 未提及具体局限性 | 阐明Hedgehog信号在后前肠谱系分离中的分子机制 | 人诱导多能干细胞和小鼠转基因模型 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 显微镜检查, 生理学分析, 遗传细胞示踪 | NA | 转录组数据, 图像 | 人诱导多能干细胞分化样本和小鼠转基因模型样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2200 | 2026-06-03 |
Podoplanin-defined tumour plasticity and CCR7-mediated lymphatic metastasis in triple-negative breast cancer
2026-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03402-4
PMID:41957138
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研究论文 | 研究Podoplanin(PDPN)定义的三阴性乳腺癌肿瘤可塑性与CCR7介导的淋巴转移的关系 | 发现PDPN定义的肿瘤细胞间充质转变是CCR7驱动淋巴转移和肿瘤进展的必要条件,且缺氧可促进这一过程,揭示了肿瘤可塑性与CCR7在淋巴扩散中的协同作用 | NA | 探讨PDPN定义的肿瘤可塑性如何与CCR7相互作用促进三阴性乳腺癌淋巴转移 | 三阴性乳腺癌小鼠模型、细胞系及原发性肿瘤样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括METABRIC乳腺癌队列及scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |