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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2181 | 2025-10-06 |
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Jan-09, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-024-00980-x
PMID:39789293
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综述 | 本文总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用与发现 | 首次系统总结空间转录组技术在透明细胞肾癌中的研究发现,揭示肿瘤微环境的空间异质性特征 | 目前仅针对透明细胞肾癌这一亚型进行研究,缺乏其他肾癌亚型的空间转录组数据 | 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的应用价值 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2182 | 2025-10-06 |
Contributions of T Cell Signaling for Wound Healing
2024-11-14, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irae151
PMID:39110034
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光成像技术揭示了T细胞在伤口愈合过程中的信号传导特征 | 首次在伤口愈合过程中发现并验证了耗竭T细胞的存在,并揭示了不同T细胞亚群具有独特的信号传导特征 | 耗竭T细胞在伤口愈合中的分子机制和具体作用需要未来更深入的研究 | 探索T细胞在伤口愈合过程中的信号传导作用 | 伤口愈合过程中的T细胞亚群 | 免疫学 | 伤口愈合 | scRNA-seq, 免疫荧光成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2183 | 2025-10-06 |
The unveiled mosaic of intra-tumor heterogeneity in ovarian cancer through spatial transcriptomic technologies: A systematic review
2024-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.08.001
PMID:39111726
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系统综述 | 通过空间转录组技术揭示卵巢癌肿瘤内异质性的系统综述 | 系统整合空间转录组技术在卵巢癌研究中的应用,强调空间背景对理解肿瘤异质性和微环境的重要性 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 探讨空间转录组技术在卵巢癌肿瘤内异质性和肿瘤微环境研究中的应用价值 | 卵巢癌肿瘤组织及其微环境 | 数字病理 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2184 | 2025-10-06 |
Perivascular NOTCH3+ Stem Cells Drive Meningioma Tumorigenesis and Resistance to Radiotherapy
2024-Oct-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1459
PMID:38742767
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研究论文 | 本研究揭示了血管周围NOTCH3+干细胞在脑膜瘤发生和放疗抵抗中的关键作用 | 首次发现血管周围NOTCH3+干细胞在人类、犬类和鼠类脑膜瘤中保守存在,并驱动肿瘤发生和放疗抵抗 | NA | 探索脑膜瘤发生和放疗抵抗的细胞类型及信号机制 | 人类、犬类和鼠类脑膜瘤模型 | 肿瘤生物学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、成像技术 | 基因工程小鼠模型、异种移植模型 | 基因表达数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2185 | 2025-10-06 |
DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013
PMID:38823437
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研究论文 | 本研究探讨树突状细胞来源的CXCL10通过激活细胞毒性T淋巴细胞抑制卵巢癌的机制 | 首次揭示CXCL10在卵巢癌微环境中作为树突状细胞与细胞毒性T淋巴细胞相互作用的关键调节因子 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床验证 | 阐明树突状细胞及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中的作用机制 | 卵巢癌微环境中的树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 免疫浸润分析, 体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2186 | 2025-10-06 |
WITHDRAWN: Single-cell RNA Sequencing Revealing that MMP12+ Macrophages are Associated with Cancer Liver Metastasis
2024-09-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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撤稿文章 | 该文章因作者要求已被出版商撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2187 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA sequencing of endothelial cells and proteomics to unravel the role of ICAM1-PTGS2 communication in apical periodontitis: A laboratory investigation
2024-09, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14080
PMID:38713190
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术,揭示了内皮细胞在慢性根尖周炎中的多样性及ICAM1-PTGS2通讯在铁死亡中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析慢性根尖周炎中内皮细胞亚群多样性,并发现ICAM1通过调控PTGS2影响铁死亡的新机制 | 样本量较小(5个CAP样本),主要基于体外细胞实验验证,需要更多临床样本进一步确认 | 探究慢性根尖周炎中内皮细胞多样性及ICAM1-PTGS2通讯在疾病发生发展中的作用机制 | 慢性根尖周炎患者组织样本、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、THP-1来源的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 实时PCR, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 基因表达数据 | 5个慢性根尖周炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2188 | 2025-10-06 |
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种通过吸入干细胞外泌体治疗心肌梗死的无创方法 | 首次报道通过吸入方式递送干细胞外泌体的无创治疗方法,并发现内皮细胞CD36在心脏修复中的新机制 | 研究主要基于动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发心肌梗死后心脏修复的无创治疗方法 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,心脏磁共振成像,超声心动图 | NA | 基因表达数据,影像数据,组织学数据 | 小鼠和猪的心肌梗死模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2189 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic map of the developing Atoh1 lineage identifies neural fate decisions and neuronal diversity in the hindbrain
2024-08-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.007
PMID:39106860
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序绘制发育中小鼠后脑Atoh1谱系的转录图谱,揭示神经命运决定和神经元多样性 | 首次在单细胞分辨率下揭示Atoh1谱系神经元的转录程序,发现增殖性单极刷细胞前体群 | 研究仅限于小鼠模型,人类相关性的验证需要进一步研究 | 解析Atoh1谱系神经元的命运决定机制和多样性 | 发育中小鼠后脑Atoh1谱系神经元 | 单细胞生物学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,ATOH1 DNA结合分析 | NA | 单细胞转录组数据,DNA结合数据 | 小鼠后脑Atoh1谱系神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2190 | 2025-10-06 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07187-5
PMID:38509377
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研究论文 | 本研究鉴定了一种表观遗传控制的记忆性星形胶质细胞亚群,该细胞在再次刺激时表现出加剧的促炎反应 | 首次发现星形胶质细胞具有表观遗传记忆能力,并阐明ACLY-p300代谢表观遗传轴在此过程中的调控机制 | 人类星形胶质细胞研究仅限于体外实验,需要更多体内验证 | 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性及其在神经系统疾病中的作用机制 | 星形胶质细胞,实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型,多发性硬化症 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, FICSEQ, 体内CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因组学数据,表观遗传学数据,转录组数据 | EAE急性和慢性模型,人类星形胶质细胞体外培养 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
2191 | 2025-10-06 |
deMULTIplex2: robust sample demultiplexing for scRNA-seq
2024-01-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03177-y
PMID:38291503
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序的鲁棒样本解复用算法deMULTIplex2 | 基于条形码交叉污染的机制模型,采用广义线性模型和期望最大化算法概率性确定细胞样本身份 | NA | 解决单细胞RNA测序中样本解复用的技术挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型, 期望最大化算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2192 | 2025-10-06 |
Heat Inactivation of Nipah Virus for Downstream Single-Cell RNA Sequencing Does Not Interfere with Sample Quality
2024-01-09, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13010062
PMID:38251369
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研究论文 | 本研究验证了热灭活步骤对尼帕病毒样本进行单细胞RNA测序的适用性,确认不影响样本质量 | 首次证明在单细胞RNA测序流程中加入热灭活步骤可有效灭活BSL-4级病原体尼帕病毒,且不影响测序质量 | 研究仅针对尼帕病毒和特定商业平台,未测试其他BSL-4病原体或平台 | 开发适用于BSL-4病原体样本的安全单细胞RNA测序流程 | 尼帕病毒感染的细胞样本 | 单细胞测序 | 病毒传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 微流控分区单细胞RNA测序平台 | 商业可用的微流控分区单细胞RNA测序平台 |
2193 | 2025-10-06 |
Microfluidics-free single-cell genomics with templated emulsification
2023-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01685-z
PMID:36879006
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研究论文 | 开发了一种无需微流控设备的单细胞基因组学方法 | 基于颗粒模板乳化的单细胞封装和条形码技术,仅需涡旋混合器即可实现均匀液滴乳化 | NA | 开发更简单灵活的单细胞测序方法 | 小鼠-人类混合细胞、人类乳腺组织细胞、混合表型急性白血病细胞 | 单细胞基因组学 | 急性白血病、乳腺癌 | 单细胞RNA测序、多组学测量 | NA | 转录组数据、多组学数据 | 数千个样本或数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞多组学 | PIP-seq | 颗粒模板即时分区测序,兼容微孔板和大体积锥形管等多种乳化格式 |
2194 | 2025-10-06 |
Excess pancreatic elastase alters acinar-β cell communication by impairing the mechano-signaling and the PAR2 pathways
2023-07-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.05.007
PMID:37339634
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研究论文 | 本研究探讨胰腺弹性蛋白酶通过损害机械信号传导和PAR2通路调控胰岛β细胞存活的新机制 | 首次发现胰腺弹性蛋白酶在2型糖尿病患者中上调并通过PAR2和机械信号通路负调控β细胞存活 | 研究主要基于体外和动物模型,需要进一步验证在人体中的治疗效果 | 探索胰腺弹性蛋白酶在糖尿病发病机制中的作用及潜在治疗策略 | 人类和啮齿类动物的胰岛β细胞及胰腺腺泡细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 高通量筛选、磷酸化抗体微阵列、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 2型糖尿病患者和胰岛素抵抗小鼠的胰腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2195 | 2025-10-06 |
deMULTIplex2: robust sample demultiplexing for scRNA-seq
2023-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.536275
PMID:37090649
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的鲁棒样本解复用算法deMULTIplex2 | 基于标签交叉污染物理机制构建统计模型,使用广义线性模型和期望最大化算法概率推断细胞样本身份 | NA | 解决大规模、样本细胞数不平衡和噪声数据中的单细胞样本解复用问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞样本标签 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型, 期望最大化算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2196 | 2025-10-06 |
Cisplatin Neurotoxicity Targets Specific Subpopulations and K+ Channels in Tyrosine-Hydroxylase Positive Dorsal Root Ganglia Neurons
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.853035
PMID:35586548
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研究论文 | 本研究揭示顺铂通过靶向酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元中的特定亚群和K+通道导致神经毒性 | 首次在单细胞水平揭示顺铂神经毒性的特异性细胞靶点,发现K2P18.1钾通道在其中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本验证;维生素E的保护作用有限 | 探究顺铂化疗引起的外周神经病变的细胞机制 | 小鼠酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 | 神经科学 | 化疗引起的周围神经病变 | 单细胞转录组测序,电生理分析 | NA | 转录组数据,电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2197 | 2025-10-06 |
Cell type hierarchy reconstruction via reconciliation of multi-resolution cluster tree
2021-09-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab481
PMID:34125905
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研究论文 | 开发了一种名为MRtree的算法,用于从单细胞RNA测序数据构建细胞类型层次结构 | 提出了一种高度灵活的树构建算法,能够从多个分辨率的平面聚类结果生成聚类层次结构 | 需要依赖现有的平面聚类算法,可能受到这些算法固有局限性的影响 | 解决单细胞RNA测序数据分析中分辨率参数选择困难和细胞簇演化特征难以比较的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 树构建算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2198 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Profound Alterations in Mechanosensitive Dorsal Root Ganglion Neurons with Vitamin E Deficiency
2019-Nov-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2019.10.064
PMID:31733517
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示维生素E缺乏对背根神经节机械敏感性神经元的分子特征和功能特性的深刻影响 | 发现维生素E缺乏主要影响机械敏感性TH+神经元而非预期的本体感觉神经元,揭示了电压门控钙钾通道上调的新机制 | 研究使用Ttpa基因敲除小鼠模型,在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 研究维生素E缺乏对背根神经节神经元分子特征和功能特性的影响 | 背根神经节神经元,特别是酪氨酸羟化酶阳性(TH+)的机械敏感性神经元 | 单细胞测序 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Ttpa基因敲除小鼠的背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2199 | 2025-10-06 |
NanoCRISPR-assisted biomimetic tissue-equivalent patch regenerates the intervertebral disc by inhibiting endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Nov, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 开发了一种纳米CRISPR辅助的仿生组织等效补片,通过抑制内皮-间质转化来促进椎间盘再生 | 首次将纳米CRISPR系统与仿生纳米纤维支架结合,靶向消除VEGF介导的血管生成因子,同时复制天然纤维环的层次结构 | NA | 开发能够同时解决纤维环物理缺损和血管生成障碍的椎间盘再生策略 | 椎间盘纤维环组织 | 组织工程 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2200 | 2025-10-06 |
Deciphering the regulatory networks of human male germline development from embryo to adulthood
2025-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167918
PMID:40409516
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研究论文 | 构建了从胚胎到成年的人类男性生殖细胞发育图谱,揭示了调控网络重配置和关键信号通路 | 首次整合从6周胚胎到老年男性的92,488个睾丸细胞,构建了全面的人类男性生殖细胞发育图谱 | 研究主要基于单细胞转录组数据,需要进一步功能验证 | 解析人类男性生殖细胞从胚胎到成年的发育调控网络 | 人类睾丸细胞,包括从胚胎期到老年期的生殖细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 92,488个睾丸细胞,涵盖从6周胚胎到老年男性 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |