单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30294 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-07-31 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
|
研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中cGAS和STING表达与新辅助化疗免疫疗法（NACI）疗效的相关性 | 首次揭示了cGAS和STING表达与NACI疗效的正相关性，并提出了它们作为预测生物标志物的潜力 | 样本量较小（仅38例患者），且为回顾性研究 | 探究cGAS和STING表达与HNSCC患者NACI疗效的关系 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | 基因表达数据、临床数据 | 38例HNSCC患者 |
| 202 | 2025-07-31 |
New insights into liver injury and regeneration from single-cell transcriptomics
2025, eGastroenterology
DOI:10.1136/egastro-2025-100202
PMID:40735115
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在急性肝损伤（ALI）和肝再生研究中的最新进展及其应用 | 揭示了肝损伤和再生过程中未被识别的细胞亚群，包括胎儿样和迁移性肝细胞、不同激活状态的肝星状细胞以及区域特异性的内皮细胞反应 | NA | 探讨单细胞转录组学在急性肝损伤和肝再生研究中的应用及其潜在治疗靶点 | 肝细胞、肝星状细胞、内皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 急性肝损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 203 | 2025-07-31 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了PM2.5对幼鼠肺部不同细胞类型的转录组影响 | 首次在幼鼠模型中利用scRNA-seq技术揭示了PM2.5对不同肺部细胞类型的特异性转录组改变 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步在人类样本中验证 | 探究PM2.5对儿童肺部健康的细胞特异性影响及其分子机制 | 幼鼠肺部细胞 | 生物医学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), GO和KEGG富集分析, 苏木精-伊红染色 | 幼鼠PM2.5气道暴露模型 | 基因表达数据, 组织病理学图像 | 未明确说明数量的幼鼠肺部样本 |
| 204 | 2025-07-31 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
|
research paper | 该研究通过分析扩张型心肌病（DCM）患者与健康对照中24个二硫键死亡相关基因（DiGs）的表达，构建了预测模型并验证了核心基因的作用 | 首次将二硫键死亡机制与DCM发病联系起来，并鉴定出ACTN4、MYH10、TLN1、DSTN和NCKAP1作为核心预测基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索二硫键死亡相关基因在扩张型心肌病中的作用机制及治疗靶点 | 扩张型心肌病患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM | 基因表达数据 | 多个GEO数据集中的DCM患者和健康对照样本 |
| 205 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2025-07-31 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
|
研究论文 | 本研究探讨了KLF5/PI3K/AKT轴作为克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的治疗靶点的潜力 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5在化疗耐药性中的作用，并提出了KLF5/PI3K/AKT轴作为新的治疗靶点 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索克服结直肠癌新辅助化疗耐药性的机制和潜在治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、InferCNV、差异表达基因分析、通路富集分析、细胞通讯分析、SCENIC、高通量药物筛选 | 动物模型 | RNA测序数据 | 结直肠癌患者样本(具体数量未提及)和动物模型 |
| 207 | 2025-07-31 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
|
研究论文 | 本文开发了一种湿实验室和计算框架，用于在同一组织切片上进行空间转录组学（ST）和空间蛋白质组学（SP）的整合分析 | 首次在同一组织切片上整合ST和SP分析，实现了RNA和蛋白质表达的单细胞水平比较 | 未提及样本量是否足够大以覆盖广泛的肿瘤异质性 | 开发一种整合空间多组学数据的方法，以更深入地理解肿瘤-免疫微环境 | 人类肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学（ST）、空间蛋白质组学（SP）、H&E染色 | Weave软件 | 空间多组学数据 | NA |
| 208 | 2025-07-31 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
|
研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的牛生长卵母细胞的收集和文库制备方案 | 提供了针对牛生长卵母细胞的详细scRNA-seq分析方案，有助于识别物种特异性转录特征和发育轨迹 | NA | 研究牛卵母细胞的基因表达和发育过程 | 牛生长卵母细胞 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 209 | 2025-07-30 |
Characteristics and significance of γδ T cells in colorectal cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2532231
PMID:40726078
|
研究论文 | 探讨γδ T细胞在结直肠癌中的特征及其预后意义 | 首次在两项独立队列中通过多重免疫组化和单细胞RNA测序分析γδ T细胞在结直肠癌中的分布特征及其与患者生存期的关联 | 研究结果在第二队列中的HR置信区间较宽(0.50-1.33)，可能影响统计效力 | 阐明γδ T细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本中的γδ T细胞和αβ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 1687例结直肠癌患者(两个队列) + 62例单细胞RNA测序样本 |
| 210 | 2025-07-30 |
Inhibition of FAK promotes pancreatic cancer immunotherapy by mediating CXCL10 secretion to enhance CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2539442
PMID:40726089
|
研究论文 | 本研究探讨了FAK在胰腺癌免疫治疗中的作用及其通过促进CXCL10分泌增强CD8+ T细胞浸润的机制 | 揭示了FAK在胰腺癌免疫抑制微环境中的具体作用及其抑制剂与免疫检查点抑制剂的协同抗肿瘤效应 | FAK在胰腺癌发展和进展中的具体作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制尚未完全阐明 | 探索FAK作为胰腺癌免疫治疗靶点的潜力及其调控肿瘤免疫微环境的机制 | 胰腺癌患者来源的类器官、免疫细胞、小鼠胰腺癌模型及双人源化模型 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞测序、患者来源类器官(PDO)与免疫细胞的共培养系统 | 小鼠胰腺癌模型、双人源化模型 | 单细胞测序数据、临床标本数据 | 未明确提及具体样本数量，涉及患者来源类器官、小鼠模型及临床标本 |
| 211 | 2025-07-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals altered immune and stromal landscape in primary and liver metastasis of gastric cancer
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102163
PMID:40727437
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胃癌原发灶和肝转移灶中免疫和基质细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上比较了胃癌原发灶和肝转移灶的肿瘤微环境差异，并识别出与肝转移相关的特定细胞类型 | 样本量相对较小（7例GC，5例LM），且为回顾性研究 | 鉴定与胃癌肝转移相关的基质细胞 | 胃癌组织、邻近正常组织、肝转移灶和健康肝组织 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, RNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 7例GC、2例NT、5例LM和3例HL组织样本，共计107,875个细胞 |
| 212 | 2025-07-30 |
B- and T cell receptor sequencing elucidates characteristics of lymphocyte depletion by ocrelizumab
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113068
PMID:40727939
|
研究论文 | 该研究通过分析B细胞和T细胞受体序列，揭示了ocrelizumab治疗对多发性硬化症患者淋巴细胞耗竭的特征 | 首次在ocrelizumab治疗背景下，对多发性硬化症患者的B细胞和T细胞受体库进行了全面分析，并发现了组织驻留记忆细胞的基因表达特征和初始治疗抵抗现象 | 样本量相对较小，未来需要更大规模的研究验证发现 | 阐明ocrelizumab治疗对多发性硬化症患者适应性免疫系统的影响 | 35名多发性硬化症患者、11名健康供体和14名接受natalizumab治疗的多发性硬化症患者 | 免疫学 | 多发性硬化症 | B细胞和T细胞受体测序、单细胞转录组学 | NA | 序列数据、转录组数据 | 35名MS患者(ocrelizumab治疗组)、11名健康供体、14名MS患者(natalizumab治疗组)、29名供体的脑脊液和血液样本 |
| 213 | 2025-07-30 |
From iPSCs to myotubes: Identifying potential biomarkers for human FSHD by single-cell transcriptomics
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70423
PMID:40726336
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2025-07-30 |
Unravelling the Role of PIEZO1 in Adipogenesis of Fibrogenic/Adipogenic Progenitors for Muscle Fat Infiltration After Rotator Cuff Tear
2025-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.70004
PMID:40726363
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研究论文 | 本研究探讨了机械环境变化如何影响肩袖撕裂后的肌肉脂肪浸润，并确定了PIEZO1在纤维/脂肪祖细胞脂肪生成中的作用 | 揭示了PIEZO1通过ERK/KLF4信号通路抑制脂肪生成的机制，并发现低强度脉冲超声(LIPUS)可通过上调PIEZO1表达减轻脂肪浸润 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床转化效果需进一步验证 | 探索肩袖撕裂后机械环境变化对肌肉脂肪浸润的影响机制及潜在治疗方法 | 人类和小鼠的纤维/脂肪祖细胞(FAPs) | 肌肉生物学 | 肩袖撕裂 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、实时定量PCR、Western blot | PIEZO1基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类和小鼠FAPs |
| 215 | 2025-07-30 |
Dose-escalation studies of mesenchymal stromal cell therapy for decompensated liver cirrhosis: phase Ia/Ib results and immune modulation insights
2025-Jul-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02318-4
PMID:40721581
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研究论文 | 该研究通过Ia/Ib期临床试验评估了间充质基质细胞(MSC)治疗失代偿性肝硬化(DLC)的安全性和耐受性，并探讨了其免疫调节效应 | 首次在人体中证实MSC治疗的剂量效应关系，并鉴定MX1单核细胞作为MSC免疫调节的关键介质 | 样本量相对较小，且为单臂研究设计 | 评估MSC治疗DLC的安全性和免疫调节机制 | 失代偿性肝硬化患者 | 细胞治疗 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序、飞行时间质谱细胞术 | NA | 临床数据、多组学数据 | Ia期4个剂量组，Ib期2个剂量组 |
| 216 | 2025-07-30 |
Interplay between Matrix Viscoelasticity and Integrin Engagement Modulates Cancer-Associated Fibroblast States
2025-Jul-29, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500389
PMID:40726283
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研究论文 | 本研究探讨了基质粘弹性和整合素结合如何调节癌症相关成纤维细胞（CAFs）的状态，首次在体外模型中展示了这种调控机制 | 首次展示了基质粘弹性和整合素结合如何共同调节CAFs的状态，并开发了可用于研究CAF功能和靶向治疗的新模型 | 研究仅在体外模型中进行，尚未在体内验证 | 理解CAFs亚群的功能并开发治疗策略 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 细胞生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学，藻酸盐水凝胶培养 | 体外CAF模型 | 转录组数据，形态学数据 | 患者来源的CAFs |
| 217 | 2025-07-30 |
Ligilactobacillus Murinus and Lactobacillus Johnsonii Suppress Macrophage Pyroptosis in Atherosclerosis through Butyrate-GPR109A-GSDMD Axis
2025-Jul-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501707
PMID:40726432
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研究论文 | 研究发现两种肠道益生菌Ligilactobacillus murinus和Lactobacillus johnsonii通过丁酸盐-GPR109A-GSDMD轴抑制动脉粥样硬化中的巨噬细胞焦亡 | 首次揭示了阿司匹林通过调节肠道菌群及其代谢产物丁酸盐来抑制动脉粥样硬化的机制 | 研究主要基于小鼠模型和人类队列，需要进一步验证在更广泛人群中的适用性 | 探索药物-微生物群-代谢物相互作用在动脉粥样硬化中的作用 | Ligilactobacillus murinus和Lactobacillus johnsonii两种肠道益生菌 | 微生物组学 | 心血管疾病 | 宏基因组学和代谢组学分析，单细胞测序 | NA | 微生物组数据，代谢组数据，单细胞测序数据 | 小鼠模型和人类队列 |
| 218 | 2025-07-30 |
NFATC3 enhances osteosarcoma progression by increasing PD-L1 and CXCL2 levels
2025-Jul-29, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02850-x
PMID:40728758
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研究论文 | 本研究探讨了NFATC3基因在骨肉瘤(OS)中的表达及其功能，揭示了NFATC3通过促进肿瘤细胞增殖和重塑免疫微环境来驱动OS的发展 | 首次发现NFATC3通过增加PD-L1和CXCL2的表达促进骨肉瘤进展，并揭示了其在肿瘤微环境中的作用机制 | 研究主要基于细胞系和体外实验，缺乏体内动物模型的验证 | 探究NFATC3在骨肉瘤进展中的作用及其分子机制 | 骨肉瘤细胞系(143B、SJSA、HOS、MG63、MNNG)和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | qRT-PCR、单细胞测序分析、肿瘤细胞与巨噬细胞共培养系统 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 多个骨肉瘤细胞系和测序数据集 |
| 219 | 2025-07-30 |
Refining the resolution of the yeast genotype-phenotype map using single-cell RNA-sequencing
2025-Jul-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.93906
PMID:40720279
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术提高酵母基因型-表型图谱的分辨率 | 通过大规模单细胞RNA测序数据整合到基因型-表型图谱中，揭示了表型变异与转录组变异之间的新关联 | 研究仅针对酵母细胞，可能不适用于其他生物系统 | 提高基因型-表型图谱的分辨率，理解转录组调控在性状变异中的作用 | 4489个F2分离株的18,233个酵母细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 表达数量性状位点(eQTL)定位 | NA | RNA测序数据 | 18,233个酵母细胞来自4,489个F2分离株 |
| 220 | 2025-07-30 |
Enhanced Media Optimize Bovine Myogenesis in 2D and 3D Models for Cultivated Meat Applications
2025-Jul-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413998
PMID:40720723
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研究论文 | 本研究通过多组学方法表征了牛肌肉祖细胞（MPCs）体外分化的分子景观，并探索了小分子对其的增强作用，从而在2D和3D培养模型中鉴定出优于传统方法的增强培养基 | 利用多组学技术和小分子调控，开发出能增强牛肌肉祖细胞分化的新型培养基，并在2D和3D培养模型中验证其效果 | 研究仅针对牛肌肉祖细胞，未涉及其他物种或细胞类型 | 开发可持续的体外肉类生产技术 | 牛肌肉祖细胞（MPCs） | 细胞培养与组织工程 | NA | 多组学分析（转录组学和蛋白质组学），单细胞转录组学 | 2D培养和3D骨骼肌构建体 | 分子数据（转录组和蛋白质组数据） | 未明确说明具体样本数量 |