单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 28975 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
201 2025-06-21
Aging induces T cells with distinct transcriptomic profiles and functions in brain-associated tissues
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了衰老对脑相关组织中CD4和CD8 T细胞转录组和功能的影响 揭示了衰老诱导的CD153表达CD4+ T细胞在脑相关组织中的积累及其潜在保护作用 研究仅在小鼠模型中进行,人类相关性尚不明确 了解衰老对非淋巴组织中T细胞转录组和功能的影响 年轻和老年小鼠脑相关组织中的CD4+和CD8+ T细胞 免疫学 老年疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术 NA RNA测序数据, 流式细胞数据 年轻和老年小鼠的脑膜、脉络丛和海马体组织
202 2025-06-21
Role of ADME genes in breast cancer prognosis: an analysis of risk scoring models based on multi-omics data
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学数据分析ADME基因在乳腺癌预后中的作用,并构建了一个基于ADME相关基因的风险评分模型 首次结合多组学数据(包括批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组数据)分析ADME基因在乳腺癌预后中的作用,并构建了一个新的风险评分模型(ARPS) 研究结果需要在更大规模的临床队列中进行验证,且机制研究尚不充分 探讨ADME相关基因在乳腺癌预后中的作用及其在个性化治疗中的潜在应用 乳腺癌患者 生物信息学 乳腺癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组 Cox回归模型、stepAIC分析 多组学数据 TCGA-BRCA、METABRIC和GSE58812队列中的患者数据
203 2025-06-21
Current status, hotspots and frontiers of ion channel-related research in glioblastoma: a bibliometric analysis from 2005 to 2024
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 通过文献计量学方法分析2005年至2024年间胶质母细胞瘤离子通道相关研究的现状、热点和前沿 首次系统性地整合和可视化胶质母细胞瘤离子通道领域的知识结构和研究焦点,并识别出新兴研究方向如离子通道与肿瘤微环境的相互作用 研究仅基于Web of Science数据库的文献,可能遗漏其他数据库的重要研究 探索胶质母细胞瘤中离子通道的作用机制及其与肿瘤生物学过程的关系 胶质母细胞瘤及其相关离子通道 生物医学研究 胶质母细胞瘤 文献计量学分析、单细胞空间转录组学、纳米颗粒技术 NA 文献数据 764篇文章和234篇综述
204 2025-06-21
Identifying a prognostic signature for clear cell renal cell carcinoma: the convergence of single-cell and bulk sequencing with machine learning
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 通过单细胞和批量测序与机器学习的结合,构建了一个预测透明细胞肾细胞癌预后的机器学习相关特征(MLRS) 使用了一个新颖的计算框架构建MLRS,整合了10种机器学习方法,并在多个独立数据集中验证了其预测预后的能力 未提及具体的研究样本量限制或数据来源的局限性 预测透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的预后并筛选可能受益于免疫治疗的患者 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 机器学习 肾癌 单细胞RNA测序、qRT-PCR、CCK-8检测 机器学习(整合10种方法) 基因表达数据 NA
205 2025-06-21
Revealing Potential Therapeutic Targets in Gastric Cancer through Inflammation and Protein-Protein Interaction Hub Networks
2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 通过炎症和蛋白质-蛋白质相互作用中心网络揭示胃癌的潜在治疗靶点 发现了18个可作为胃癌靶向治疗的生物标志物,特别是SPP1-CD44配体-受体轴的新炎症信号通路 研究基于公共数据库的数据,未进行实验验证 探索胃癌的潜在治疗靶点和生物标志物 胃癌相关基因和免疫细胞 生物信息学 胃癌 RNA-seq, scRNA-seq NA 基因表达数据 四个bulk RNA-seq数据集和两个scRNA-seq数据集
206 2025-06-21
A Comprehensive Analysis of the Role of DSN1 in Pan-Cancer Prognosis and Immunotherapy
2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本文通过公共数据库分析了DSN1在多种癌症中的表达模式及其与预后的关系,并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 首次全面分析了DSN1在泛癌中的表达模式、预后价值及其与免疫治疗反应的相关性 研究主要基于公共数据库数据,缺乏实验验证 探索DSN1在癌症发生、发展和免疫治疗中的作用 多种癌症类型(如COAD、LUAD、UCEC等) 癌症基因组学 泛癌 mRNA测序、蛋白质组学、单细胞测序、基因集富集分析 生存分析模型 mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 多种癌症类型的公共数据库样本
207 2025-06-21
Circulating KLRG1+ long-lived effector memory T cells retain the flexibility to become tissue resident
2024-06-28, Science immunology IF:17.6Q1
research paper 该研究揭示了KLRG1+长寿命效应记忆T细胞在二次感染后能够进入非淋巴组织并形成驻留记忆细胞的灵活性 发现KLRG1+长寿命效应细胞(LLECs)尽管不能分化为其他循环记忆群体,但仍保留进入组织并建立驻留的能力 研究主要基于小鼠模型,人类中的类似机制尚需验证 探究KLRG1+记忆T细胞在二次感染后的分化潜能和组织驻留能力 KLRG1+ CD8 T细胞 免疫学 病毒感染 单细胞RNA测序 小鼠感染模型 基因表达数据 NA
208 2025-06-21
Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling
2024-Jun-19, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了谷氨酸能神经元活动通过Norrin/β-catenin信号通路对视网膜血管生成和血视网膜屏障成熟的影响 揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮Norrin/β-catenin信号通路来调控视网膜血管生成和血视网膜屏障成熟的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 研究谷氨酸能神经元活动对视网膜血管生成和血视网膜屏障成熟的调控机制 小鼠视网膜中的谷氨酸能神经元和血管系统 神经血管生物学 视网膜病变 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 体内遗传学研究, 功能验证 小鼠遗传模型(Vglut1和Gnat1视网膜) 基因表达数据, 功能实验数据 未明确说明小鼠数量
209 2025-06-21
Mutual information for detecting multi-class biomarkers when integrating multiple bulk or single-cell transcriptomic studies
2024-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 提出了一种名为MICA的统计框架,用于从信息论角度检测多个组学研究中的多类生物标志物 MICA框架能够检测多个组学研究中的多类生物标志物,并通过全局测试和事后分析提高检测的准确性和稳健性 现有方法主要针对两类别场景,MICA虽然解决了多类别问题,但在某些特定情况下可能仍需进一步优化 提高生物标志物检测的统计功效、准确性和稳健性 多类设计的组学研究(如多种疾病亚型、治疗、组织或细胞类型的样本) 生物信息学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组数据 四个小鼠代谢相关转录组研究组织和三个雌激素治疗表达谱来源
210 2025-06-21
leptin b and its regeneration enhancer illustrate the regenerative features of zebrafish hearts
2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists IF:2.0Q3
研究论文 该研究利用leptin b(lepb)及其组织再生增强子元素(TREE)解析了斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞的异质性 发现lepb可作为再生特异性标记物,用于区分损伤激活的内皮细胞,并揭示了lepb+内皮细胞作为信号中心与其他心脏细胞互动的促再生作用 研究局限于斑马鱼模型,未验证在高等哺乳动物中的保守性 解析心脏再生过程中的细胞异质性和分子机制 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞(内皮细胞、心外膜细胞等) 发育生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质可及性分析、转基因品系 NA 基因表达数据、表观遗传数据 未明确说明样本数量,使用斑马鱼心脏损伤模型
211 2025-06-21
BOTH THE INFECTION STATUS AND INFLAMMATORY MICROENVIRONMENT INDUCE TRANSCRIPTIONAL REMODELING IN MACROPHAGES IN MURINE LEISHMANIAL LESIONS
2023-05-01, The Journal of parasitology IF:1.0Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了感染利什曼原虫的巨噬细胞与未感染的旁观者巨噬细胞在转录水平上的差异,揭示了寄生虫和炎症微环境对巨噬细胞转录重塑的独立影响 首次在体内模型中区分了寄生虫感染和炎症微环境对巨噬细胞转录组的独立影响,并发现两者均能下调EIF2信号通路 研究仅限于小鼠利什曼病模型,人类样本中的适用性尚需验证 探究利什曼原虫感染和炎症微环境对巨噬细胞转录组的独立影响 感染利什曼原虫的小鼠皮肤巨噬细胞 免疫学 皮肤利什曼病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
212 2025-06-20
Predictive significance of MPT-driven necrosis-related genes signature in gastric cancer and their impact on the tumor microenvironment
2025-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
research paper 该研究探讨了MPT驱动的坏死相关基因(MPTDNRGs)在胃癌中的预测意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 首次揭示了MPTDNRGs在胃癌中的突变率和表达差异,并构建了一个预后风险模型,能够有效预测患者生存期和免疫治疗反应 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 研究MPT驱动的坏死相关基因在胃癌中的预测价值及其对肿瘤免疫微环境的影响 胃癌患者及其肿瘤组织样本 digital pathology gastric cancer RNA-seq, scRNA-seq LASSO regression RNA sequencing data 来自TCGA和GEO数据库的胃癌患者样本
213 2025-06-20
Circulating monocytes upregulate CD52 and sustain innate immune function in cirrhosis unless acute decompensation emerges
2025-Jul, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了肝硬化患者循环单核细胞的异质性及其功能变化,特别是CD52在单核细胞中的表达及其对免疫功能的影响 首次发现CD52在肝硬化患者单核细胞中的表达变化,并揭示了其在维持先天免疫功能中的作用及在急性失代偿期的功能丧失机制 研究主要基于体外实验,临床样本量有限,且未探讨CD52稳定化的具体治疗方法 解析肝硬化不同阶段循环单核细胞的异质性及功能变化,探索CD52在免疫抑制中的作用 健康人群及肝硬化患者的循环单核细胞 免疫学 肝硬化 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外功能实验 NA RNA测序数据、流式细胞数据 健康人群及肝硬化患者(补偿期和非急性失代偿期)的单核细胞样本
214 2025-06-20
scRNA-Seq and Bulk-Seq Identify Novel Markers Associated With Calcium Regulation and Immunomodulation in Acute Pancreatitis
2025-Jul-01, Pancreas IF:1.7Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,识别与急性胰腺炎钙调节和免疫调节相关的新标记物 构建了一个包含6个差异表达lncRNA、38个miRNA和215个差异表达mRNA的ceRNA网络,并识别出5个候选mRNA和5个候选lncRNA 未提及样本量及具体实验设计的局限性 深入理解急性胰腺炎的发病机制并识别新的潜在生物标记物 急性胰腺炎患者或模型中的RNA表达数据 生物信息学 急性胰腺炎 scRNA-seq, Bulk RNA-seq, qRT-PCR NA RNA-seq数据 NA
215 2025-06-20
The bone marrow NK-cell profile predicts MRD negativity in patients with multiple myeloma treated with daratumumab-based therapy
2025-Jun-19, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学、流式细胞术和功能实验,探讨了多发性骨髓瘤患者骨髓中NK细胞的特征及其与治疗效果的关系 揭示了骨髓中CD16+ NK细胞比例与达雷妥尤单抗治疗效果的相关性,为多发性骨髓瘤免疫治疗提供了新的生物标志物 研究样本来自特定临床试验(CASSIOPEIA),结果可能不适用于其他治疗方案 探究骨髓NK细胞特征对多发性骨髓瘤免疫治疗效果的影响 多发性骨髓瘤患者 肿瘤免疫学 多发性骨髓瘤 单细胞转录组学, 流式细胞术, 功能实验 NA 转录组数据, 流式细胞数据 CASSIOPEIA临床试验中的患者样本
216 2025-06-20
Elevated 5-HTR7 deteriorates dysregulated megakaryocytopoiesis in immune thrombocytopenic purpura via up-regulating the PKA/Orai1/ERK1/2 pathway
2025-Jun-19, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了5-HTR7在免疫性血小板减少性紫癜(ITP)中对巨核细胞成熟的影响及其机制 首次揭示了5-HTR7通过PKA/Orai1/ERK1/2通路调控巨核细胞成熟的分子机制,并证实其作为ITP潜在治疗靶点的可能性 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证治疗效果 阐明ITP中巨核细胞成熟障碍的分子机制并寻找潜在治疗靶点 免疫性血小板减少性紫癜(ITP)患者和小鼠模型中的巨核细胞 血液病学 免疫性血小板减少性紫癜 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blot、共聚焦显微镜 NA 细胞生物学数据、基因表达数据 ITP患者和健康对照的巨核细胞样本,以及ITP小鼠模型
217 2025-06-20
T Cells Expressing Ras Homolog Family Member a Display Enhanced Cytotoxicity but are Reduced in Lupus Peripheral Blood
2025-Jun-19, Immunological investigations IF:2.9Q3
research paper 本研究探讨了系统性红斑狼疮(SLE)患者T细胞亚群中Ras同源家族成员A(RhoA)的表达及其临床相关性 发现RhoA+ T细胞具有增强的细胞毒性潜力,并可能作为SLE早期免疫学标志物 样本量较小,且仅针对新诊断的SLE患者 探索RhoA在SLE患者T细胞亚群中的表达及其临床意义 系统性红斑狼疮(SLE)患者和健康对照者的外周血样本 免疫学 系统性红斑狼疮 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、受试者工作特征(ROC)曲线分析 NA 外周血样本、scRNA-seq数据 新诊断的SLE患者和年龄性别匹配的健康对照者
218 2025-06-20
FLASH Irradiation Modulates Immune Responses and Accelerates Lung Recovery: A Single-Cell Perspective
2025-Jun-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了FLASH-RT与传统剂量率放射治疗在早期辐射诱导肺损伤中的免疫和细胞反应 首次从单细胞角度揭示了FLASH-RT在调节免疫反应和促进肺组织修复方面的独特机制 研究仅关注了照射后一周内的早期反应,长期效果尚不明确 探究FLASH-RT与传统放射治疗在辐射诱导肺损伤中免疫调节机制的差异 辐射诱导肺损伤过程中的免疫细胞和肺组织细胞 放射治疗 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 未明确说明样本数量,但使用了单细胞分辨率的数据
219 2025-06-20
A Study of Skeletal Stem Cell Dynamics and Its Potential Applications in the Design of a Titanium Implant for Senile Osteoporosis
2025-Jun-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合大鼠单细胞转录组学和人类血清转录组数据,研究骨骼干细胞(SSCs)在衰老过程中的动态变化,并设计了一种针对老年骨质疏松症(A-OP)的钛植入物 利用多组学数据驱动植入物设计,通过逆转MSC衰老和改变其分化方向来打破A-OP的病理循环 研究主要基于大鼠和人类血清数据,尚未在人体中进行临床验证 开发一种针对老年骨质疏松症的靶向钛植入物 骨骼干细胞(SSCs)在衰老过程中的动态变化 生物材料 老年骨质疏松症 单细胞转录组学,转录组分析 NA 转录组数据 NA
220 2025-06-20
Bioactive siRNA-Based Liposomes Promoted Tendon-Bone Healing in Osteoporotic Mice by Recovering the Stemness of CD248+ TSPCs
2025-Jun-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了CD248在调节肌腱干细胞/祖细胞(TSPCs)干性中的作用,并评估了si-CD248负载脂质体在骨质疏松条件下促进腱骨愈合的治疗潜力 首次揭示了CD248在骨质疏松性腱骨愈合中的负调控作用,并开发了si-CD248负载脂质体作为新型治疗策略 研究仅在骨质疏松小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 探究骨质疏松条件下腱骨愈合障碍的分子机制并开发新型治疗方法 骨质疏松小鼠模型中的肌腱干细胞/祖细胞(TSPCs) 生物医学工程 骨质疏松症 单细胞RNA测序(scRNA-seq),siRNA干扰技术 动物模型(小鼠) 基因表达数据,组织学数据 骨质疏松小鼠模型(具体数量未明确说明)
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