单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-05 |
Data-driven discovery of cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.09.627436
PMID:39713353
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研究论文 | 本研究开发了一种基于细胞类型特异性网络的阿尔茨海默病联合疗法发现方法 | 首次将单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录整合，开发细胞类型特异性多靶点药物发现策略 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 开发针对阿尔茨海默病的细胞类型导向联合疗法 | 阿尔茨海默病小鼠模型、神经元和胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、临床记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2025-10-05 |
Inflammation-induced epigenetic imprinting regulates intestinal stem cells
2024-Oct-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.006
PMID:39232559
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研究论文 | 本研究揭示了炎症通过代谢重编程诱导肠道干细胞表观遗传印记并影响其再生能力的机制 | 首次发现炎症暴露导致Lgr5肠道干细胞发生琥珀酸积累驱动的表观遗传重编程，并证明这种改变具有持久性 | 研究主要基于急性胃肠道移植物抗宿主病模型，其他炎症模型的普适性需要进一步验证 | 探究炎症暴露对肠道干细胞的适应性影响及其持久性效应 | Lgr5肠道干细胞 | 表观遗传学 | 胃肠道移植物抗宿主病 | 单细胞转录组测序, 表观基因组分析, 代谢分析, 类器官培养, 体内移植 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2025-10-05 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 评估Element Biosciences的亲和性测序技术在单细胞RNA-seq中准确测序通过同聚物区域的能力及其对多聚腺苷酸化位点分析的影响 | 首次系统评估亲和性测序技术对单细胞RNA-seq中同聚物区域的测序准确性，并开发了改进的接头修剪和比对流程 | 与单端比对相比，配对端比对并未持续提高读段映射率，且未排除其他新兴平台可能具有类似性能 | 改进单细胞RNA-seq文库的表征方法，特别是多聚腺苷酸化位点的精确分析 | 单细胞RNA-seq文库 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 亲和性测序 | NA | DNA测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti亲和性测序平台，标准单细胞RNA-seq协议 |
| 204 | 2025-10-05 |
Mutual information for detecting multi-class biomarkers when integrating multiple bulk or single-cell transcriptomic studies
2024-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.11.598484
PMID:38915481
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研究论文 | 提出一种基于互信息的统计框架MICA，用于在整合多个转录组研究时检测多类别生物标志物 | 首次从信息论角度提出能够处理多类别设计的生物标志物检测方法，突破了现有方法仅限于两类别场景的限制 | NA | 开发一种能够整合多个组学研究并检测具有一致多类别表达模式的生物标志物的统计方法 | 转录组数据中的生物标志物 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 互信息统计框架 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2025-10-05 |
Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma and ganglioglioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations
2025-Nov, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.70023
PMID:40588233
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和细胞因子分析研究儿童低级别胶质瘤和神经节胶质瘤的肿瘤微环境特征 | 首次采用多组学方法揭示不同BRAF突变类型肿瘤的免疫微环境差异 | 需要进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用的机制 | 深入理解儿童低级别胶质瘤生物学特征以开发更有效的治疗方法 | 毛细胞星形细胞瘤(PA)和神经节胶质瘤(GG) | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子分析 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 206 | 2025-10-05 |
Prognostic model for predicting recurrence-free survival in hepatocellular carcinoma using integrated analysis of single-cell RNA-sequencing and bulk RNA-sequencing
2025-Nov, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2025.15283
PMID:41040911
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，构建了预测肝细胞癌患者无复发生存期的预后模型 | 首次整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据构建肝细胞癌预后模型，识别出6个与无复发生存相关的关键基因 | 未明确说明样本来源和具体数量，缺乏多中心验证 | 开发可靠的肝细胞癌复发预测模型以满足临床需求 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR | LASSO Cox惩罚回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2025-10-05 |
Single Cell and Spatial Transcriptomics Define a Proinflammatory and Profibrotic Niche After Kidney Injury
2025-Oct-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503691
PMID:41042124
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组技术揭示肾损伤后促炎促纤维化微环境的形成机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组技术系统描绘纤维化肾脏中细胞异质性、空间组织和分子相互作用，发现TNC富集的促炎促纤维化微环境通过TLR4/NF-κB信号通路激活巨噬细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾脏疾病中的适用性需进一步验证 | 探究肾损伤后纤维化微环境的形成机制及其在慢性肾脏病发展中的作用 | 小鼠肾脏组织（正常与纤维化模型）和骨髓来源巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组技术，骨髓移植，基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 正常和纤维化小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2025-10-05 |
Integration of Elemental Imaging and Spatial Transcriptomic Profiling for Proof-of-Concept Metals-Based Pathway Analysis of Colon Tumor Microenvironment
2025-Oct-03, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf034
PMID:41042257
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研究论文 | 本研究开发了一种整合元素成像和空间转录组学的多模态工作流程，用于分析结肠肿瘤微环境中金属依赖性信号通路 | 首次将元素成像与空间转录组学整合，实现组织范围内金属-基因相互作用的全面探索 | 仅基于单个样本的初步观察，需要更大患者队列验证 | 探索肿瘤微环境中金属丰度与基因表达的相互作用机制 | 结直肠癌肿瘤组织 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 元素成像，空间转录组学，多模态整合分析 | 空间相关分析 | 元素成像数据，基因表达数据，细胞组成数据，组织病理学特征 | 1例结直肠癌肿瘤样本 | NA | 元素成像，空间转录组学 | NA | NA |
| 209 | 2025-10-05 |
Lung epithelial injury impairs early host immune responses to Mycobacterium tuberculosis
2025-Oct-03, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02106-4
PMID:41042276
|
研究论文 | 本研究通过建立肺上皮损伤与结核分枝杆菌感染的小鼠模型，探索上皮屏障受损对宿主免疫反应的影响 | 首次结合萘诱导的肺上皮损伤与结核分枝杆菌感染模型，通过单细胞RNA测序揭示上皮完整性对早期免疫反应的关键作用 | 研究基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究肺上皮损伤如何改变宿主对结核分枝杆菌的免疫防御机制 | 小鼠肺组织细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，体外刺激实验 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-10-05 |
scRNA-seq deciphers molecular mechanisms of endocrine disruptor 4-nonylphenol impairing spermatogenesis in mice
2025-Oct-03, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10095-7
PMID:41042295
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示环境内分泌干扰物4-壬基酚损害小鼠精子发生的分子机制 | 首次报道了青春期小鼠暴露于NP后睾丸单细胞的转录组特征，并发现NECTIN3-NECTIN2等受体-配体相互作用在生殖细胞间的通讯改变 | 研究仅使用小鼠模型，样本量有限，未涉及人类样本验证 | 阐明NP暴露对睾丸细胞的毒性作用机制 | 青春期小鼠睾丸细胞 | 单细胞生物学 | 男性生殖功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 空白对照组和NP暴露组（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 211 | 2025-10-05 |
Renal denervation alleviates neuroinflammation by suppressing the microglial Ifi27l2a/cGAS-STING signaling axis
2025-Oct-03, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02103-7
PMID:41042329
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研究论文 | 本研究揭示肾脏去神经术通过抑制小胶质细胞Ifi27l2a/cGAS-STING信号轴缓解神经炎症的机制 | 首次发现Ifi27l2a作为肾脏去神经术与神经炎症缓解之间的关键分子连接，并阐明其通过调控cGAS-STING通路发挥作用 | 机制研究主要基于细胞实验，需要更多体内实验验证；研究样本量未明确说明 | 探究肾脏去神经术治疗顽固性高血压的抗高血压作用机制 | 小胶质细胞、BV2小胶质细胞系、单细胞RNA测序数据集 | 神经科学 | 高血压 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低、体内实验、体外验证 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2025-10-05 |
Microfluidic Device Type Improves Heart mRNA Delivery In Vivo
2025-Oct-02, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.5c02612
PMID:41037471
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研究论文 | 本研究通过改变脂质纳米颗粒的制备工艺，显著提高了心脏mRNA递送效率 | 发现使用鲱鱼骨混合器制备的LNP比传统分叉混合器制备的LNP心脏递送效率提高2倍，且无需改变LNP化学组成或添加靶向配体 | 研究仅在小鼠动脉粥样硬化模型中验证，尚未在更大动物模型或人类中测试 | 提高脂质纳米颗粒对非肝脏组织的mRNA递送效率 | 脂质纳米颗粒(LNP)和心脏组织 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠动脉粥样硬化模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 213 | 2025-10-05 |
Platelet activation plays a pro-inflammatory role in myasthenia gravis
2025-Oct-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63750-2
PMID:41038808
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研究论文 | 本研究通过分析重症肌无力患者的血小板转录组特征，揭示了血小板活化在疾病中的促炎作用 | 首次在AChR+免疫治疗初治重症肌无力患者中，结合bulk和单细胞RNA测序技术系统分析血小板转录组特征及其与免疫系统的相互作用 | 样本量相对有限，主要关注AChR+亚型患者 | 探讨血小板活化在重症肌无力发病机制中的作用 | AChR+免疫治疗初治重症肌无力患者 | 免疫学 | 重症肌无力 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量（nMG患者） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2025-10-05 |
Crotonate enhances intestinal regeneration after injury via HBO1-mediated H3K14 crotonylation
2025-Oct-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63869-2
PMID:41038843
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研究论文 | 本研究揭示了克罗托酸通过HBO1介导的H3K14克罗托酰化促进肠道损伤后再生修复的机制 | 首次发现克罗托酸和H3K14cr在再生隐窝中增加，并证明HBO1介导的H3K14cr在肠道再生中的关键作用 | 未明确说明样本量大小和研究局限性 | 探究组蛋白克罗托酰化特别是H3K14cr在肠道再生中的作用机制 | 肠道上皮细胞、Lgr5肠道干细胞、再生隐窝 | 分子生物学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 215 | 2025-10-05 |
Benchmarking scRNA-seq copy number variation callers
2025-Oct-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62359-9
PMID:41038850
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研究论文 | 本研究对六种单细胞RNA测序拷贝数变异检测工具进行了系统性评估 | 首次对单细胞RNA测序CNV检测方法进行独立基准测试，并开发了用于新数据集方法选择的基准测试流程 | 性能受数据集特定因素影响，包括数据集大小、CNV数量和类型以及参考数据集选择 | 评估单细胞RNA测序CNV检测方法的准确性和性能 | 六种流行的单细胞RNA测序CNV检测计算方法 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 21个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序数据集 |
| 216 | 2025-10-05 |
Androgen receptor interacts with c-Myc to regulate macrophage-osteoclast axis and drive bone metastasis in triple negative breast cancer
2025-Oct-02, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03202-2
PMID:41039017
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研究论文 | 本研究揭示雄激素受体与c-Myc相互作用通过调控巨噬细胞-破骨细胞轴驱动三阴性乳腺癌骨转移的机制 | 首次发现AR与c-Myc相互作用调控巨噬细胞向破骨细胞分化，阐明TNBC骨转移的分子机制 | 主要依赖小鼠模型和回顾性数据分析，缺乏临床前瞻性验证 | 探索三阴性乳腺癌骨转移的器官特异性机制 | 三阴性乳腺癌细胞、巨噬细胞、破骨细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, CUT&TAG测序, 免疫共沉淀, 破骨细胞分化实验 | 小鼠模型 | 基因组数据, 蛋白质相互作用数据 | 公共数据库回顾性数据及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, CUT&TAG测序 | NA | NA |
| 217 | 2025-10-05 |
Identification and expression analysis of papain-like cysteine proteases gene family and response to B. cinerea stress in F. vesca
2025-Oct-02, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-07291-2
PMID:41039302
|
研究论文 | 本研究通过系统分析森林草莓中木瓜样半胱氨酸蛋白酶基因家族，揭示了其在灰葡萄孢菌胁迫响应中的功能 | 首次在森林草莓中系统鉴定PLCP基因家族，结合单细胞转录组和双转录组分析揭示了该基因家族在病原菌胁迫下的细胞类型特异性表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析和表达验证，缺乏直接的基因功能验证实验 | 探究森林草莓PLCP基因家族在生物胁迫响应中的功能 | 森林草莓(Fragaria vesca)的PLCP基因家族 | 植物分子生物学 | 植物真菌病害 | 系统发育分析,染色体定位,Ka/Ks分析,顺式元件分析,单细胞转录组测序,双转录组测序,RT-qPCR,瞬时表达实验 | NA | 基因组数据,转录组数据,基因表达数据 | 44个FvPLCP基因 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 218 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing and mass spectrometry imaging reveal the multicellular compartmentalization map of plant triterpenes: A ginsenoside in Panax ginseng example
2025-Oct, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70198
PMID:40626415
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和质谱成像技术揭示了人参中三萜类化合物人参皂苷的多细胞区室化分布图谱 | 首次报道植物三萜类化合物的生物合成多细胞定位图谱，构建了人参皂苷的多细胞区室化分布图 | 仅以人参皂苷为例研究植物三萜类化合物，未涵盖其他三萜类化合物 | 揭示植物三萜类化合物的多细胞区室化分布规律 | 人参（Panax ginseng）组织中的三萜类化合物人参皂苷 | 植物代谢组学 | NA | 单细胞测序，质谱成像 | 伪时间分析 | 单细胞基因表达数据，空间代谢物分布图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间代谢组学 | NA | NA |
| 219 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcription Reveals the Fibroblast Heterogeneity and Neural Cells' Significance in Desmoid Fibromatosis
2025-Oct, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70160
PMID:40706632
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示硬纤维瘤中成纤维细胞的异质性及神经细胞在肿瘤微环境中的重要作用 | 首次揭示硬纤维瘤中成纤维细胞的异质性，鉴定出特异性标志物ADAM12和转录因子CREB3L1，发现神经细胞在维持促纤维化微环境中的关键作用 | NA | 揭示硬纤维瘤的细胞特征和肿瘤微环境组成 | 硬纤维瘤组织，并与瘢痕疙瘩成纤维细胞和正常成纤维细胞进行对比 | 单细胞测序 | 硬纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用公共数据集GSE163973，包含硬纤维瘤、瘢痕疙瘩成纤维细胞和正常成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 220 | 2025-10-05 |
Pan-Cancer Analyses Refine the Single-Cell Portrait of Tumor-Infiltrating Dendritic Cells
2025-Oct-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3595
PMID:40742316
|
研究论文 | 通过整合33种癌症类型的单细胞RNA测序数据，建立了人类树突状细胞的全面蓝图 | 发现了肿瘤浸润的罕见树突状细胞亚群，揭示了LAMP3+ DCs的多重细胞起源与功能潜力 | NA | 探索肿瘤微环境中树突状细胞的异质性，为基于DC的免疫疗法开发提供见解 | 肿瘤浸润树突状细胞 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 2500多个样本，涵盖33种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |