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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-04-18 |
Protocol for isolating stromal cells from lymphoid tissue for performing scRNA-seq
2026-Apr-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104501
PMID:41989919
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研究论文 | 本文介绍了一种从淋巴组织中分离成纤维细胞以进行单细胞RNA测序分析的实验方案 | 针对淋巴组织中占比不足2%的基质细胞,提供了一种技术难度较高的分离和纯化方法,并详细描述了从淋巴结解剖到磁珠分离的全过程 | 方案主要针对淋巴组织,虽然可扩展至其他组织如肿瘤,但具体应用可能需要进一步优化 | 开发一种用于单细胞RNA测序分析的淋巴组织基质细胞分离纯化方案 | 淋巴组织中的成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2026-04-18 |
Integrative multi‑omics and experimental validation reveal that Duhuo Jisheng Decoction alleviates IVDD by inhibiting MAPK signaling‑mediated inflammation, apoptosis, and mitochondrial dysfunction
2026-Apr-15, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103535
PMID:41990698
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证,揭示了独活寄生汤通过抑制MAPK信号通路介导的炎症、细胞凋亡和线粒体功能障碍来缓解椎间盘退变 | 首次结合转录组学、单细胞RNA测序和网络药理学,系统阐明了独活寄生汤治疗椎间盘退变的具体分子机制,特别是通过p38MAPK信号通路调控线粒体自噬的新颖作用轴 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未进行人体临床试验验证,且中药复方成分复杂,具体活性成分的体内代谢和作用途径仍需进一步探究 | 探究独活寄生汤治疗椎间盘退变的活性成分和分子机制 | 椎间盘退变模型大鼠和脂多糖诱导的退变髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 转录组学分析、单细胞RNA测序、网络药理学、CCK-8细胞增殖检测、免疫印迹、组织染色 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 未明确具体样本数量,但包括大鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2026-04-18 |
Single-cell profiling of T/NK cell glycosylation and interaction networks during liver cirrhosis
2026-Apr-15, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.dld.2026.02.019
PMID:41991450
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和糖基化分析,探索了肝硬化中T/NK细胞的糖基化变化及其在免疫失调中的作用 | 首次整合单细胞转录组学和糖基化分析,系统揭示了肝硬化中T/NK细胞的糖基化模式变化及其与细胞互作网络的关联 | 研究样本可能有限,且糖基化变化的直接功能验证不足 | 阐明肝硬化中T/NK细胞糖基化在免疫失调和纤维化进展中的机制 | 肝硬化与健康肝组织中的T/NK细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞转录组学,糖基化分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据,糖基化数据 | 肝硬化与健康肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2026-04-18 |
Amoeboid-mesenchymal transition and the proteolytic control of cancer invasion plasticity
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2520717123
PMID:41961858
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研究论文 | 本文通过癌症球体-3D基质模型、单细胞RNA测序和人体组织外植体,揭示了控制间充质与阿米巴样侵袭的机制,并强调了膜锚定胶原酶MMP14在维持细胞核完整性和体内侵袭活性中的关键作用 | 挑战了当前关于阿米巴样侵袭独立于细胞外基质蛋白水解的教条,发现间充质和阿米巴样侵袭程序均涉及主动隧道形成和基质降解金属蛋白酶的表达,并首次证明MMP14的缺失会导致核膜和DNA损伤 | 研究主要基于体外模型(癌症球体-3D基质模型、人体组织外植体),体内验证虽通过空间转录组和免疫组化分析支持,但直接体内功能实验有限 | 探究控制癌症细胞间充质与阿米巴样侵袭表型转换的分子机制,特别是蛋白水解酶在侵袭可塑性中的作用 | 恶性癌症细胞(在乳腺癌背景下重点研究) | 癌症生物学与细胞侵袭 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组学, CRISPR/Cas9基因编辑, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 (RNA-seq, 空间转录组), 图像数据 (组织学) | NA (涉及癌症球体模型、人体乳腺癌组织外植体及人类乳腺癌样本分析) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 205 | 2026-04-18 |
Single-cell insights: Mosquito Toll activation enhances granulocyte differentiation and immune surveillance via Notch suppression
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2531951123
PMID:41941624
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了蚊子Toll等先天免疫信号通路如何调控血细胞分化和功能,揭示了新的血细胞亚群及其在免疫监视中的作用 | 首次在蚊子中利用单细胞转录组学鉴定出oenocytoid和granulocyte亚群,并发现Toll和JNK激活通过抑制Notch信号促进粒细胞终末分化,增强免疫监视 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源单一,未涵盖不同蚊子品系或感染状态 | 探究蚊子先天免疫信号通路对血细胞分化和功能的调控机制 | 蚊子血细胞(免疫细胞) | 单细胞转录组学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 37,529个血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 206 | 2026-04-18 |
Spatial multiomics profiling reveals ZFP36-mediated immunometabolic reprogramming in bladder cancer
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505125123
PMID:41950100
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研究论文 | 本研究通过空间代谢组学和空间转录组学技术,系统描绘了膀胱癌的代谢和转录景观,揭示了肿瘤异质性和免疫相关代谢重编程,并识别ZFP36作为潜在免疫治疗靶点 | 采用空间多组学整合分析,首次在膀胱癌中系统可视化代谢与转录异质性,并发现ZFP36通过调控关键免疫调节因子mRNA降解抑制T细胞功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和空间组学数据,人类样本验证和临床转化仍需进一步探索 | 揭示膀胱癌的免疫代谢重编程机制并寻找新的免疫治疗靶点 | 膀胱癌组织样本、ZFP36基因敲除小鼠模型、T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间代谢组学、空间转录组学、基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 空间代谢组数据、空间转录组数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间代谢组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 207 | 2026-04-18 |
Sphingosine-1-Phosphate-derived 2-Hexadecenal is a central mediator of ocular neovascularization by inhibiting Sphingosine-1-Phosphate receptor 5
2026-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71792-3
PMID:41980976
|
研究论文 | 本文揭示了S1P代谢产物2-HD通过抑制S1PR5破坏铁稳态并诱导铁死亡,从而在视网膜血管异常中发挥关键作用 | 首次发现S1P衍生的2-HD在血管功能中的作用,并揭示其通过直接与S1PR5相互作用诱导铁死亡的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型和体外分析,人类样本验证有限,且未深入探讨其他S1PRs在过程中的潜在作用 | 探究S1P代谢产物2-HD在血管生成和视网膜血管疾病中的功能及机制 | 斑马鱼视网膜血管、人类新生血管视网膜样本 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 多组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 208 | 2026-04-18 |
The topographical distribution of spermatogonial subpopulations during the cycle of seminiferous epithelium in Macaca Fascicularis
2026-Apr-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioag018
PMID:41562564
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研究论文 | 本研究利用免疫组织化学染色和定量分析,探索了食蟹猴睾丸生精上皮中不同精原细胞亚群的空间分布及其与生精上皮周期的关系 | 首次在灵长类动物中描述了不同精原细胞亚群(PIWIL4+、GFRA1+、NANOS3+、KIT+)在生精上皮基底室中的拓扑定位及其阶段依赖性分布模式 | 研究仅基于食蟹猴的固定样本进行免疫组化分析,未涉及动态活体观察或分子机制深入探索 | 解析灵长类动物精原干细胞亚群的空间分布规律及其与生精微环境的动态关系 | 食蟹猴睾丸生精上皮中的精原细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 免疫组织化学染色、单细胞RNA测序(引用先前研究) | NA | 组织切片图像 | 食蟹猴Bouin固定睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2026-04-18 |
Mapping the zygote-to-adult developmental cell phylogeny in Arabidopsis thaliana reveals a three-cell rule of branching
2026-Apr-13, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-026-02264-1
PMID:41975122
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研究论文 | 本研究开发了e-SMALT系统,结合单细胞RNA测序技术,在拟南芥中绘制了从合子到成体的发育细胞谱系树,揭示了分支形成的三细胞规则 | 开发了e-SMALT系统,首次在拟南芥中实现了高分辨率、高统计置信度的合子到成体细胞谱系追踪,并发现了分支器官形成的三细胞规则 | 研究仅基于两个拟南芥个体,样本量较小,且技术应用可能受限于特定植物物种 | 旨在绘制复杂多细胞生物从合子到成体的发育细胞谱系树,以理解植物器官形成的细胞基础 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)的发育细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个拟南芥个体,数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 210 | 2026-04-18 |
Scalable genotyping in fixed transcriptomes resolves clonal heterogeneity via single-cell sequencing
2026-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.11.717967
PMID:41993258
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GIFT的新型单细胞测序技术,用于同时检测数百个靶向遗传变异和全转录组谱 | GIFT技术通过设计合理的间隙填充反应,在相邻单链DNA探针之间进行,对原生转录本序列进行条形码标记,实现了高特异性的靶向突变检测 | NA | 解决在固定转录组中大规模链接转录状态与体细胞突变的技术限制 | 骨髓增生性肿瘤患者的单细胞 | 单细胞测序 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞转录组学,靶向遗传变异检测 | NA | 单细胞转录组数据,遗传变异数据 | 超过700,000个细胞,来自35名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq,靶向突变检测 | NA | NA |
| 211 | 2026-04-18 |
Loss of MITF activity leads to emergent cell states from the melanocyte stem cell lineage
2026-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.23.695681
PMID:41993564
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼黑色素干细胞模型,探讨了转录因子MITF在胚胎发育中保护干细胞命运及其在成年后色素克隆形成中的作用 | 首次结合活体成像、单细胞转录组学和谱系追踪技术,揭示了MITF缺失导致黑色素干细胞在胚胎期出现异常扩增和新型转录细胞状态 | 研究主要基于斑马鱼模型,对人类疾病(如黑色素瘤)的直接应用仍需进一步验证 | 探究MITF在黑色素干细胞谱系维持和再生过程中的功能机制 | 斑马鱼的黑色素干细胞及其胚胎至幼体阶段的发育过程 | 发育生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2026-04-18 |
Disrupted glial-mediated synaptic refinement in Fragile X syndrome
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717772
PMID:41993264
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研究论文 | 本研究揭示了脆性X综合征(FXS)中神经胶质细胞介导的突触修剪功能受损是疾病早期发病机制的关键特征 | 首次在FXS模型小鼠中应用多组学框架,结合单细胞转录组学、计算建模和脂质组学分析,系统揭示了小胶质细胞、星形胶质细胞和神经元在突触修剪中的协同改变,并发现了EphA和信号素介导的通路增强以及相关脂质物种的减少 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类FXS中的直接适用性仍需验证;研究聚焦于出生后第7天的特定时间窗和视网膜膝状体通路,其他发育阶段或脑区的普遍性有待进一步探索 | 探究脆性X综合征中神经胶质细胞在神经环路发育和突触修剪中的作用机制 | Fmr1基因敲除小鼠(FXS模型小鼠)的视网膜膝状体通路,重点关注小胶质细胞、星形胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 脆性X综合征 | 单细胞转录组学、计算建模、脂质组学分析、神经胶质吞噬实验 | Fmr1基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、脂质组数据、图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用FXS模型小鼠在出生后第7天(突触重塑关键期)的组织 | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2026-04-18 |
Whole-organism spatial transcriptomics at single-cell resolution in C. elegans
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.09.717568
PMID:41993495
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研究论文 | 本文开发了一种适用于秀丽隐杆线虫全生物体的单细胞分辨率空间转录组学方法,通过单分子荧光原位杂交技术实现多基因表达的空间分析 | 提出了一种单分子荧光原位杂交工作流程,能够在整个线虫中实现单细胞分辨率的多重成像,最多可分析40个基因并保留空间背景 | 该方法在每轮杂交中仅使用两个荧光通道,可能限制了更高通量的基因分析能力 | 开发一种适用于全生物体的空间转录组学方法,以在单细胞分辨率下分析基因表达和细胞身份 | 秀丽隐杆线虫(C. elegans) | 空间转录组学 | NA | 单分子荧光原位杂交(smFISH) | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 214 | 2026-04-18 |
Single-cell analysis of the human immune system reveals sex-specific dynamics of immunosenescence
2026-Apr-10, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01099-x
PMID:41963713
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,揭示了人类免疫系统衰老过程中性别特异性的动态变化 | 首次在单细胞水平上系统比较了成年男性和女性免疫衰老的差异,发现了性别特异性的免疫细胞组成和转录变化 | 研究仅基于外周血单核细胞,未涉及其他组织或器官的免疫细胞;样本主要来自成年人,缺乏儿童和青少年数据 | 探究生物性别如何影响免疫衰老的细胞水平变化 | 982名成年男性和女性的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 免疫衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 982名捐赠者(包括男性和女性) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2026-04-18 |
Transcriptional and spatial profiling of fibroblasts from human lungs highlights CTHRC1+ cells as fibrogenic signaling hubs in fibrosis
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.08.717092
PMID:41993306
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了人肺成纤维细胞的转录异质性,并识别出CTHRC1+细胞作为肺纤维化中的关键促纤维化信号枢纽 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统描绘了肺成纤维细胞在特发性肺纤维化中的异质性,并发现CTHRC1+亚型是促纤维化的核心细胞群,且在体外培养中会丢失 | 体外培养条件可能导致成纤维细胞失去其天然功能特征,限制了疾病研究的准确性 | 研究肺成纤维细胞在特发性肺纤维化中的转录异质性和空间分布,以揭示其致病机制 | 人肺组织样本,包括特发性肺纤维化患者和年龄匹配的健康供体,以及体外培养的成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 特发性肺纤维化患者和健康供体的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 216 | 2026-04-18 |
Dysregulation of Hippo Signaling Pathway as a Convergent Mechanism Underlying Choroid Plexus Defects in Bipolar Disorder
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717745
PMID:41993308
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研究论文 | 本研究通过类器官模型和影像学分析,揭示了双相情感障碍中脉络丛异常扩张及其与Hippo信号通路失调的关联 | 首次结合人类皮层类器官、脉络丛类器官和结构MRI数据,识别出双相情感障碍中脉络丛的异常扩张,并发现Hippo信号通路早期过度激活是驱动这一过程的收敛机制 | 研究主要基于类器官模型和影像学数据,体内功能验证和临床转化应用仍需进一步探索 | 探究双相情感障碍中脉络丛缺陷的分子机制和发育起源 | 双相情感障碍患者的类器官模型、结构MRI扫描数据以及健康对照个体 | 数字病理学 | 双相情感障碍 | 单细胞转录组学、全基因组分析、全基因组关联研究、结构磁共振成像 | 类器官模型 | 转录组数据、影像数据、遗传数据 | 涉及双相情感障碍个体和健康对照个体的类器官及sMRI扫描样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2026-04-18 |
KRAS inhibition is an effective therapy for appendiceal adenocarcinoma
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717107
PMID:41993359
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研究论文 | 本研究评估了KRAS抑制剂在阑尾腺癌(AA)中的疗效,通过体外类器官和体内PDX模型以及临床患者数据,证实了KRAS抑制能有效抑制肿瘤生长并重塑肿瘤微环境 | 首次在阑尾腺癌中系统评估KRAS G12D特异性抑制剂(MRTX1133)和泛KRAS抑制剂(RMC-6236)的疗效,并揭示了EMT和TGF-β通路可能介导耐药性,同时发现KRAS抑制能激活先天免疫反应 | 研究样本量较小(仅6例临床患者),且主要基于临床前模型,需要更大规模的临床试验验证 | 评估KRAS抑制剂作为阑尾腺癌治疗靶点的有效性和机制 | 阑尾腺癌(AA)的KRAS突变类器官、PDX模型以及临床患者 | 肿瘤学 | 阑尾腺癌 | 多组学分析、scRNA-seq、GSEA | 类器官模型、PDX模型 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | 6例临床患者,多个PDX和类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2026-04-18 |
SCOPE: Localizing fate-decision states and their regulatory drivers in single-cell differentiation
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717037
PMID:41993275
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研究论文 | 本研究提出了一个名为SCOPE的半监督保形预测框架,用于从高维单细胞测序数据中精确定位细胞命运决定状态及其调控驱动因子 | 通过保形推理将高维单细胞测量转化为严格的、离散的未来命运预测集,首次提供了在生物学窗口内定位多能祖细胞命运决定的统计基础方法 | 未明确说明方法在非造血系统或更复杂发育系统中的普适性限制,以及计算资源需求 | 精确定位细胞分化过程中的命运决定状态(分支点)并识别其调控驱动因子,特别是表观遗传预兆现象 | 小鼠造血系统、人类造血数据集、人类视网膜发生过程中的单细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞多组学测序 | 半监督保形预测(SCOPE) | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 219 | 2026-04-18 |
Local IFNγ signaling contributes to the regenerative decline of aged alveolar progenitor cells
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716929
PMID:41993319
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研究论文 | 本研究揭示了衰老肺脏中局部IFNγ信号通过抑制肺泡II型细胞的再生功能,导致肺脏修复能力下降的机制 | 首次发现衰老肺脏中三级淋巴结构内的IFNγ+ CD8+ T细胞通过局部IFNγ信号通路主动抑制肺泡祖细胞的再生能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类衰老肺脏中该机制的直接证据尚需进一步验证 | 探究衰老肺脏再生功能下降的分子机制 | 衰老小鼠的肺泡II型细胞及肺脏微环境 | 单细胞生物学 | 老年性疾病 | 单细胞测序, 类器官培养 | 小鼠衰老模型 | 单细胞转录组数据, 类器官表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2026-04-18 |
Locat: Joint enrichment and depletion testing identifies localized marker genes in single-cell transcriptomics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.716370
PMID:41993378
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Locat的框架,用于在单细胞转录组数据中识别高度特异性的局部化标记基因,通过联合测试基因表达在细胞嵌入中的集中和耗竭 | Locat框架创新性地结合了基因表达在紧凑区域的集中性和外部区域的耗竭性测试,超越了传统方法仅关注富集性的局限 | NA | 开发一种方法以识别单细胞转录组数据中高度特异性的局部化标记基因 | 单细胞转录组数据中的标记基因 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | 加权高斯混合模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |