单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30093 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-07-25 |
Identification of lactylation-associated immune and metabolic regulators in bladder cancer via integrated bulk and single-cell transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1604758
PMID:40703521
|
研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞转录组数据，识别膀胱癌中与乳酸化相关的免疫和代谢调控因子 | 首次在膀胱癌中系统性地研究了乳酸化相关的基因及其在肿瘤进展中的作用，揭示了FASN和RUNX2在乳酸驱动的蛋白质乳酸化中的调控作用 | 研究主要基于转录组数据，缺乏体内实验验证 | 探索膀胱癌中乳酸化相关的免疫和代谢调控机制 | 膀胱癌细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | TCGA数据库中的膀胱癌样本及体外培养的膀胱癌细胞系 |
| 202 | 2025-07-25 |
Multi-Target Synergy Against Acute Lung Injury: Systems Pharmacology Decoding Dahuang-Huangqin Herb Pair's Therapeutic Mechanism
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S527378
PMID:40703642
|
research paper | 本研究通过综合网络药理学和多组学方法，探讨了大黄-黄芩药对（DH-HQ）治疗急性肺损伤（ALI）的机制 | 结合网络药理学和多组学方法，首次系统解码DH-HQ药对的多靶点协同作用机制，并通过多模态验证确定关键诊断枢纽基因 | 临床应用仍需药效学优化 | 揭示大黄-黄芩药对治疗急性肺损伤的多靶点协同作用机制 | 大黄-黄芩药对（DH-HQ）及其活性成分与急性肺损伤（ALI）的相互作用 | 系统药理学 | 急性肺损伤 | 网络药理学、多组学分析（转录组学、单细胞RNA测序）、分子对接、孟德尔随机化 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、分子对接数据 | 207种DH-HQ活性成分和93个ALI相关治疗靶点 |
| 203 | 2025-07-25 |
A comprehensive characterization of metabolic signatures-hypoxia, glycolysis, and lactylation-in non-healing diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1593390
PMID:40703704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，全面分析了糖尿病足溃疡中的代谢特征，包括缺氧、糖酵解和乳酸化作用，并鉴定了潜在的诊断和治疗生物标志物 | 首次在糖尿病足溃疡中综合分析了缺氧、糖酵解和乳酸化作用的代谢特征，并通过机器学习方法鉴定了与代谢和免疫调节相关的生物标志物 | 研究主要基于RNA测序数据，缺乏蛋白质水平的验证，且样本来源可能有限 | 探究糖尿病足溃疡中代谢失调的分子机制，并寻找潜在的诊断和治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者的组织样本 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq), KEGG/GO富集分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | LASSO, 支持向量机(SVM), 随机森林(Random Forest) | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，但使用了单细胞和批量RNA测序数据 |
| 204 | 2025-07-25 |
Multi-omics and AI-driven advances in miRNA-mediated hair follicle regulation in cashmere goats
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1635202
PMID:40703926
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综述 | 本文综述了miRNA在调控绒山羊毛囊发育和循环中的作用，以及多组学和AI技术在此领域的应用 | 整合了单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学方法，结合AI分析，揭示了miRNA在毛囊生物学中的新机制 | 未提及具体实验样本量或研究的地理局限性 | 探索miRNA在绒山羊毛囊发育和纤维性状调控中的作用，并开发相关应用 | 绒山羊的毛囊及相关细胞（角质形成细胞、真皮乳头细胞和毛囊干细胞） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学分析、AI分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、表观基因组数据 | NA |
| 205 | 2025-07-25 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Dec-19, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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review | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型，以及单细胞和空间转录组学在这些模型中的应用 | 结合最新的单细胞转录组学、多组学和空间转录组学研究，总结了这些模型中的主要发现 | 没有模型是完美的，这些模型仍存在局限性 | 研究阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的病因及潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病, 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据 | NA |
| 206 | 2025-07-25 |
NOVEL ACTIVE PROTEINS FOR SEPSIS PROGNOSIS REVEALED THROUGH ScRNA-seq AND QUANTITATIVE PROTEOMICS
2024-12-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002408
PMID:38888471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和定量蛋白质组学揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 首次结合scRNA-seq和定量蛋白质组学技术，识别出与脓毒症预后相关的活性蛋白，并揭示了不同患者群体的通路差异 | 样本量相对较小（脓毒症患者53例，对照16例），且仅分析了外周血样本 | 探索影响脓毒症预后的关键活性蛋白及其作用机制 | 脓毒症患者（NS=26，SV=27）和健康对照（Con=16）的外周血样本 | 生物医学研究 | 脓毒症 | scRNA-seq, DIA蛋白质组学, Viper算法 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 69例（53例脓毒症患者+16例对照） |
| 207 | 2025-07-25 |
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293
PMID:38996956
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示LRRc17介导的心脏成纤维细胞铁死亡在心肌梗死后心肌纤维化中的调节作用 | 首次发现LRRc17通过调节心脏成纤维细胞的铁死亡影响心肌梗死后纤维化的程度 | 研究仅基于GEO数据库中的两个数据集，样本量有限 | 阐明心肌梗死后纤维化的发病机制并寻找调节心室重构的治疗靶点 | 心脏成纤维细胞(CFs) | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、WGCNA、qRT-PCR、Western blotting | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE153485和GSE210159数据集 |
| 208 | 2025-07-25 |
IMPLICATIONS OF YWHAH GENE EXPRESSION IN THE EARLY DETECTION OF SEPSIS
2024-09-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002409
PMID:38904460
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研究论文 | 本研究探讨了YWHAH基因表达在脓毒症早期检测中的潜在作用 | 首次发现YWHAH基因表达在感染和脓毒症患者之间存在差异，为脓毒症的早期检测和治疗策略提供了新见解 | 研究主要基于公共单细胞转录组数据库和体外分析，需要进一步的临床验证 | 探索YWHAH基因表达与脓毒症早期检测的关联 | 感染个体和健康对照组的YWHAH基因表达 | 基因表达分析 | 脓毒症 | 实时聚合酶链反应（real-time PCR），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 公共单细胞转录组数据库中的样本 |
| 209 | 2025-07-25 |
TRANSCRIPTOMIC DIFFERENCES IN PERIPHERAL MONOCYTE POPULATIONS IN SEPTIC PATIENTS BASED ON OUTCOME
2024-08-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002379
PMID:38713581
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和通路分析，探讨了脓毒症患者外周单核细胞群体在转录组水平上的差异及其与临床结果的关系 | 首次在转录组水平上定义了脓毒症患者不同临床结果的免疫反应差异，特别是经典和非经典单核细胞的基因表达模式 | 研究样本量未明确说明，且未探讨其他免疫细胞类型的作用 | 阐明脓毒症患者不同临床结果的免疫学基础，寻找改善慢性危重病预后的治疗靶点 | 脓毒症患者的外周单核细胞群体 | 转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 210 | 2025-07-25 |
DIMINISHED EXPRESSION OF GLS IN CD4 + T CELLS SERVES AS A PROGNOSTIC INDICATOR ASSOCIATED WITH CUPROPTOSIS IN SEPTIC PATIENTS
2024-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002370
PMID:38662604
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研究论文 | 本研究探讨了与铜死亡相关的分子标志物在脓毒症患者中的表达及其对预后的影响 | 发现了与铜死亡相关的三个关键基因，并验证了GLS表达下降与O-GlcNAc水平降低的关系 | 铜与GLS变化之间的相关性需要进一步研究 | 探索脓毒症患者中与铜死亡相关的分子标志物，以帮助分层和改善预后 | 脓毒症患者的外周血样本和Jurkat细胞 | 分子生物学 | 脓毒症 | WGCNA、scRNA-seq、免疫印迹、流式细胞术、免疫荧光、CFSE分析 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 脓毒症患者的外周血样本和Jurkat细胞 |
| 211 | 2025-07-25 |
Antitumor efficacy and potential mechanism of FAP-targeted radioligand therapy combined with immune checkpoint blockade
2024-06-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01853-w
PMID:38825657
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研究论文 | 研究FAP靶向放射性配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及其潜在机制 | 首次展示了Ga/Lu标记的LNC1004在肿瘤模型中的摄取和保留增强，以及联合疗法在完全消除肿瘤和促进抗肿瘤免疫方面的效果 | 初步临床研究样本量有限，需要更大规模的临床试验验证 | 探索FAP靶向放射性配体疗法与免疫检查点阻断联合使用的抗肿瘤效果及机制 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植模型及难治性癌症患者 | 肿瘤学 | 癌症 | scRNA-seq, TCR测序 | NA | 基因表达数据、免疫组化数据 | 临床前研究使用小鼠模型，初步临床研究涉及难治性癌症患者 |
| 212 | 2025-07-25 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-05-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
|
综述 | 本文系统总结了巨噬细胞在心血管疾病调控机制中的多样表型和功能可塑性，以及单细胞测序技术带来的新视角 | 利用单细胞测序技术揭示了巨噬细胞的异质性、细胞间相互作用及治疗靶点的下游机制，为心血管疾病的治疗提供了新的视角 | 未具体提及样本量或实验设计的详细限制 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的分子机制及治疗靶点 | 巨噬细胞在心血管疾病（如冠心病、瓣膜病、心肌炎、心肌病、心力衰竭、动脉粥样硬化和动脉瘤）中的作用 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 213 | 2025-07-25 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-05-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
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研究论文 | 本研究探讨了靶向BCL9/BCL9L如何通过促进常规1型树突状细胞（cDC1）的激活和肿瘤浸润来增强抗原呈递 | 揭示了靶向BCL9/BCL9L通过XCL1-XCR1轴和NF-κB/IRF1信号通路增强cDC1激活和抗原呈递的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索BCL9/BCL9L在肿瘤抗原呈递中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 常规1型树突状细胞（cDC1）、BCL9/BCL9L蛋白、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组分析、基因敲除小鼠模型 | Bcl9/Bcl9l敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，使用基因敲除小鼠和野生型小鼠进行对比 |
| 214 | 2025-07-25 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-04-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
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综述 | 本文综述了导管原位癌（DCIS）向浸润性乳腺癌（IDC）进展的分子特征及其临床意义 | 系统总结了DCIS向IDC转变的关键信号通路、分子特征及肿瘤微环境变化，并探讨了单细胞测序、空间转录组学和人工智能等新技术在研究中的应用 | NA | 深入理解DCIS的生物学特性及其向IDC转变的分子机制，以促进更有效的临床管理 | 导管原位癌（DCIS）和浸润性导管癌（IDC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、人工智能 | NA | 分子数据、临床数据 | NA |
| 215 | 2025-07-25 |
Characterization of Immunosuppressive Myeloid Cells in Merkel Cell Carcinoma: Correlation with Resistance to PD-1 Pathway Blockade
2024-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-1957
PMID:37851052
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和多重免疫组化染色技术，探讨了默克尔细胞癌（MCC）中免疫抑制性髓系细胞的特征及其与PD-1通路阻断抵抗的相关性 | 首次在MCC中详细描述了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的免疫抑制特性及其与PD-1阻断治疗抵抗的关联 | 样本量相对较小（单细胞转录组学9例，免疫组化54例），且未明确验证TAMs与CD8 T细胞空间相互作用的临床意义 | 探究MCC中髓系细胞的免疫抑制特性及其对免疫治疗响应的影响 | 默克尔细胞癌患者肿瘤组织中的髓系细胞和CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 默克尔细胞癌 | 单细胞转录组学，多重免疫组化染色（multiplex IHC） | NA | 转录组数据，免疫组织化学图像数据 | 单细胞转录组学分析9例患者，免疫组化分析54例患者治疗前肿瘤样本 |
| 216 | 2024-08-07 |
Partners in Crime: Inferring Cell-to-cell Interactions in Kidney Allograft Rejection From Single-cell RNA Sequencing
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004763
PMID:37638872
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2025-07-25 |
Exploring the Immune-related Molecular Mechanisms Underlying the Comorbidity of Temporal Lobe Epilepsy and Major Depressive Disorder through Integrated Data Set Analysis
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
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研究论文 | 通过整合数据集分析探索颞叶癫痫和重度抑郁症共病的免疫相关分子机制 | 识别了TLE和MDD共有的关键基因及其免疫相关分子机制，并预测了潜在治疗药物 | 研究依赖于公开数据库的数据，未进行实验验证 | 探索TLE和MDD共病的分子机制及其在诊断和治疗中的应用 | 颞叶癫痫(TLE)和重度抑郁症(MDD)患者 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 基因表达分析、WGCNA、PPI网络构建、LASSO、随机森林、ROC曲线分析、免疫浸润分析、单细胞测序 | LASSO、随机森林(RF) | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的脑组织基因表达数据 |
| 218 | 2025-07-25 |
Differential gene expression analysis in single-cell RNA sequencing data
2017-Nov, Proceedings. IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine
DOI:10.1109/bibm.2017.8217650
PMID:40693108
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研究论文 | 本文提出了一种名为SigEMD的新方法，用于在单细胞RNA测序数据中精确高效地识别差异表达基因 | 结合逻辑回归模型和基于Earth Mover's Distance的非参数方法，并利用基因互作网络信息减少假阳性 | 未提及具体样本量或数据集的多样性限制 | 开发新方法以提高单细胞RNA测序数据中差异表达基因的检测精度 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | 逻辑回归模型, 非参数方法(Earth Mover's Distance) | 基因表达数据 | NA |
| 219 | 2025-07-24 |
Exploring the comorbidity mechanisms of ITGB2 in rheumatoid arthritis and membranous nephropathy through integrated bioinformatics analysis
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2536730
PMID:40697036
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析探索ITGB2在类风湿性关节炎和膜性肾病中的共病机制 | 首次识别ITGB2作为RA和MN的共同致病基因，并揭示其在M1巨噬细胞极化和B细胞成熟中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索类风湿性关节炎和膜性肾病的共同发病机制 | 类风湿性关节炎和膜性肾病患者 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎和膜性肾病 | RNA测序（bulk和单细胞）、随机森林算法、单样本基因集富集分析、分子对接 | 随机森林 | RNA测序数据 | NA |
| 220 | 2025-07-22 |
Bulk RNA sequencing combined with single-cell RNA sequencing analysis revealed the ferroptosis immune target of osteoarthritis synovial fibroblasts
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101587
PMID:40687616
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |