单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-05-31	Proteomic signatures improve risk prediction for common and rare diseases 2024-Sep, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03142-z PMID:39039249	research paper	该研究通过整合约3000种血浆蛋白的测量数据与临床信息，开发了稀疏预测模型，用于预测218种常见和罕见疾病的10年发病率	研究发现，仅包含5至20种蛋白质的稀疏模型在预测性能上优于仅基于基本临床信息的模型，甚至优于结合临床检测数据的模型	研究样本主要来自英国生物银行，可能限制了结果的普遍性	提高对常见和罕见疾病发病风险的预测准确性	41,931名来自英国生物银行药物蛋白质组学项目的个体	生物医学	多种常见和罕见疾病	血浆蛋白质组学测量、单细胞RNA测序	稀疏预测模型	蛋白质组数据、临床数据	41,931名个体，涉及81-6,038个病例
202	2025-05-31	Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation 2024-Sep, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07797-z PMID:39112713	research paper	该研究探讨了致癌RAS剂量对衰老状态和肿瘤起始的影响，揭示了RAS剂量驱动的非线性连续表型	开发了致癌RAS剂量递增模型，揭示了RAS剂量驱动的非线性连续表型，并鉴定了两种不同的肿瘤类型	研究主要基于肝细胞模型，可能不适用于其他细胞类型或癌症类型	探究致癌RAS剂量对衰老状态和肿瘤起始的影响	肝细胞和肝癌	肿瘤生物学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
203	2025-05-31	Chronic social defeat stress induces meningeal neutrophilia via type I interferon signaling 2024-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.08.30.610447 PMID:39257811	research paper	研究慢性社交挫败压力通过I型干扰素信号传导诱导脑膜中性粒细胞增多的机制	首次发现慢性压力通过I型干扰素信号传导导致脑膜中性粒细胞增多，并揭示了其在压力相关行为症状中的作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究慢性压力如何通过免疫机制影响行为症状	小鼠模型中的脑膜免疫反应	免疫学	压力相关疾病	流式细胞术、免疫组织化学、全组织透明化、单细胞测序	小鼠慢性社交挫败(CSD)模型	细胞计数数据、转录组数据	未明确说明小鼠数量
204	2025-05-31	Morphine-responsive neurons that regulate mechanical antinociception 2024-08-30, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.ado6593 PMID:39208104	研究论文	通过单细胞转录组学和对吗啡响应神经元的操控，研究揭示了调控小鼠机械性伤害感受的神经元群体及其作用机制	发现了一个特定的RVM-脊髓回路，该回路通过BDNF/TrkB依赖机制和抑制性脊髓galanin阳性神经元的激活来调节机械性伤害感受，从而赋予吗啡抗伤害感受的特性	研究仅针对小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探索阿片类药物镇痛作用的神经解剖学基础	小鼠的rostral ventromedial medulla (RVM)神经元	神经科学	疼痛管理	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
205	2025-05-31	Type I Interferonopathy among Non-Elderly Female Patients with Post-Acute Sequelae of COVID-19 2024-08-28, Viruses DOI:10.3390/v16091369 PMID:39339845	研究论文	本研究探讨了非老年女性COVID-19后急性后遗症(PASC)患者中I型干扰素病的免疫机制	发现了一种与不受控的IFN-I信号激活相关的CD14STAT2单核细胞亚群，揭示了非老年女性PASC患者中可能的I型干扰素病	研究样本来自公开数据库，可能缺乏临床验证	探索非老年女性PASC患者的免疫机制	非老年女性PASC患者、急性SARS-CoV-2感染患者及健康对照	免疫学	COVID-19后遗症	单细胞转录组分析	NA	基因表达数据	来自Gene Expression Omnibus数据库的样本(具体数量未明确说明)
206	2025-05-31	A single-cell atlas of the miracidium larva of Schistosoma mansoni reveals cell types, developmental pathways, and tissue architecture 2024-Aug-27, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.95628 PMID:39190022	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术构建了曼氏血吸虫毛蚴幼虫阶段的全身体细胞图谱，揭示了其细胞类型、发育途径和组织结构	首次在单细胞水平上解析了曼氏血吸虫毛蚴幼虫的细胞组成，发现了两类具有性别偏好的干细胞群及其发育轨迹	研究仅聚焦于毛蚴幼虫阶段，未涵盖寄生虫完整生命周期	在细胞和分子水平上理解曼氏血吸虫毛蚴幼虫的生物学特性	曼氏血吸虫毛蚴幼虫阶段的约365个细胞	单细胞生物学	血吸虫病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、原位杂交	NA	单细胞转录组数据	约365个单细胞
207	2025-05-31	Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-associated platelet bias are evolutionarily conserved 2024-08-23, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk3469 PMID:39178276	研究论文	该研究通过高通量单细胞RNA测序技术，揭示了人类造血干细胞（HSCs）在功能和转录水平上的谱系偏向性，特别是血小板偏向性HSCs的存在及其随年龄增长的变化	首次在人类造血干细胞中证实了谱系偏向性的存在，并揭示了血小板偏向性HSCs随年龄增长的比例和转录水平的变化	研究主要基于小鼠异种移植模型，可能不完全反映人类体内HSCs的真实情况	探究人类造血干细胞的异质性及其与年龄相关的血小板偏向性	人类骨髓造血干细胞	生物医学	血液系统疾病	高通量单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	年轻和年老人类骨髓造血干细胞
208	2025-05-31	Multimodal analysis unveils tumor microenvironment heterogeneity linked to immune activity and evasion 2024-Aug-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.110529 PMID:39161957	研究论文	通过多模态分析揭示与免疫活性和逃逸相关的肿瘤微环境异质性	提出了一种名为iHet的特征，用于表征肿瘤微环境的主要异质性来源，并证明其在多种癌症中保守且与抗肿瘤免疫相关	研究主要基于转录组学数据，可能未涵盖肿瘤微环境的所有方面	探索肿瘤微环境异质性及其与免疫治疗反应的关系	肺癌及其他癌症的肿瘤微环境	肿瘤免疫学	肺癌	转录组学分析、单细胞转录组学、空间转录组学	系统生物学方法	转录组数据	NA
209	2025-05-31	PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells 2024-Aug-13, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4863813/v1 PMID:39184105	研究论文	本文介绍了一种名为PURE-seq的新技术，用于高效测序稀有细胞，并应用于小鼠长期造血干细胞的研究	开发了PURE-seq技术，能够直接从FACS加载细胞到PIP-seq反应中，减少细胞损失并高效捕获稀有细胞	NA	研究造血衰老过程中小鼠长期造血干细胞的转录组及其调控机制	小鼠长期造血干细胞	单细胞转录组学	衰老相关疾病	PURE-seq, 单细胞转录组测序	NA	单细胞转录组数据	稀有细胞捕获效率为百万分之一，60分钟分选可捕获数十个细胞
210	2025-05-31	High-dimensional single-cell analysis of human natural killer cell heterogeneity 2024-Aug, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-024-01883-0 PMID:38956378	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术解析了人类自然杀伤（NK）细胞的异质性，并鉴定了三个主要亚群及其六个亚组	首次使用单细胞RNA测序和CITE-seq技术全面解析NK细胞的异质性，并提出了标准化的术语以促进未来研究的一致性和可比性	研究主要基于健康人血液样本，对于其他组织或疾病状态下的NK细胞异质性分析可能不够全面	解析人类自然杀伤（NK）细胞的异质性及其分子特征	健康人血液中的NK细胞，以及肺、扁桃体和上皮内淋巴细胞中的NK细胞	免疫学	NA	scRNA-seq, CITE-seq	NA	单细胞转录组数据	健康人血液样本及22种肿瘤类型的样本
211	2025-05-31	Characterisation of HBV and co-infection with HDV and HIV through spatial transcriptomics 2024-Aug, eGastroenterology DOI:10.1136/egastro-2024-100067 PMID:39149129	研究论文	本研究利用空间转录组学技术探索慢性乙型肝炎（CHB）及与丁型肝炎病毒（HDV）和HIV共感染的肝内生物学过程	首次应用NanoString GeoMx数字空间分析平台研究HBV与HDV或HIV共感染患者的肝内转录景观和细胞组成	样本量较小（仅3例未接受治疗的患者），可能限制结果的普遍性	评估空间转录组学方法在解析HBV及共感染患者肝内转录组特征、细胞组成和生物学通路中的应用价值	慢性HBV感染患者（包括HDV或HIV共感染）的肝活检样本	数字病理学	乙型肝炎	空间转录组学（NanoString GeoMx数字空间分析平台）	加权基因共表达网络分析	空间转录组数据	3例未接受治疗的慢性HBV和HDV或HIV共感染患者的FFPE肝活检样本
212	2025-05-31	The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on SARS-CoV-2 Disease, Viral Dynamics, and Antiviral Immune Response in a Nonhuman Primate Model of Coinfection 2024-07-21, Viruses DOI:10.3390/v16071173 PMID:39066335	研究论文	本研究探讨了SIV诱导的免疫缺陷对SARS-CoV-2疾病、病毒动态和抗病毒免疫反应的影响	首次在受控环境中直接评估HIV相关免疫缺陷对COVID-19疾病和病毒持续性的影响	样本量较小（仅两只猪尾猕猴），可能影响结果的普遍性	评估免疫缺陷对SARS-CoV-2感染的影响	慢性感染SIVmac239的猪尾猕猴	病毒学	HIV/AIDS和COVID-19	单细胞RNA测序	非人灵长类动物模型	生物样本数据和测序数据	两只SIV感染的猪尾猕猴和SIV未感染的对照猕猴
213	2025-05-31	Differential regulation by CD47 and thrombospondin-1 of extramedullary erythropoiesis in mouse spleen 2024-Jul-09, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.92679 PMID:38979889	research paper	该研究探讨了CD47和thrombospondin-1在小鼠脾脏髓外造血中的差异调节作用	揭示了CD47和thrombospondin-1信号通路在调节脾脏髓外造血中的不同作用，特别是对早期和晚期红细胞生成的影响	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他动物的验证	研究CD47和thrombospondin-1在脾脏髓外造血中的调控机制	小鼠脾脏中的造血细胞	NA	NA	单细胞转录组分析和流式细胞术	NA	基因表达数据和细胞标记数据	小鼠脾脏细胞
214	2025-05-31	Single-cell analysis reveals lasting immunological consequences of influenza infection and respiratory immunization in the pig lung 2024-Jul, PLoS pathogens IF:5.5Q1 DOI:10.1371/journal.ppat.1011910 PMID:39024231	研究论文	通过单细胞RNA测序和流式细胞术，研究了猪肺部在H1N1pdm09感染或呼吸道免疫后的持久免疫学变化	首次在猪模型中利用scRNA-seq和流式细胞术详细描述了流感感染和呼吸道免疫后的持久免疫学影响，特别是IL-1β对Treg细胞功能的影响以及IFI6的上调对病毒复制的抑制作用	研究仅关注了感染或免疫后21天的免疫反应，未探讨更长期的影响	探究流感感染和呼吸道免疫对猪肺部免疫细胞的持久影响	猪肺部的白细胞亚群	免疫学	流感	scRNA-seq, 流式细胞术	NA	RNA测序数据, 流式细胞数据	猪的支气管肺泡灌洗液（BAL）细胞
215	2025-05-31	Network-based prioritization and validation of regulators of vascular smooth muscle cell proliferation in disease 2024-06, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1 DOI:10.1038/s44161-024-00474-4 PMID:39215134	research paper	通过单细胞转录组学和表观遗传分析重建基因调控网络，阐明血管平滑肌细胞增殖的分子决定因素	发现了RUNX1和TIMP1等先前未被识别的增殖调控因子，并揭示了TIMP1通过CD74介导的STAT3信号反馈促进VSMC增殖的机制	研究主要基于体外实验和计算分析，需要进一步的体内实验验证	阐明血管平滑肌细胞增殖的分子机制及其在血管疾病中的作用	血管平滑肌细胞(VSMC)	生物医学	心血管疾病	单细胞转录组学, 表观遗传分析	基因调控网络	转录组数据, 表观遗传数据	NA
216	2025-05-31	Single cell RNA sequencing of human FAPs reveals different functional stages in Duchenne muscular dystrophy 2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2024.1399319 PMID:39045456	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究人类FAPs在杜氏肌营养不良症中的不同功能状态	首次使用单细胞RNA测序技术揭示DMD患者与健康对照组FAPs的转录组差异，并识别出不同的FAPs亚群及其功能特征	样本量相对较小（n=9验证样本），且仅聚焦于FAPs细胞，未全面研究其他细胞类型在DMD中的作用	探究杜氏肌营养不良症中FAPs的分子调控机制及其在肌肉退化和再生中的作用	人类纤维脂肪前体细胞（FAPs）	单细胞组学	杜氏肌营养不良症	单细胞RNA测序（scRNAseq），10X Genomics，Illumina，qPCR	Seurat分析	单细胞转录组数据	未明确总测序样本数，验证样本n=9
217	2025-05-30	Landscape of spatial disruption of homeostasis in the middle temporal gyrus of epileptic patients 2025-Aug-01, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2025.149688 PMID:40350141	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）技术，探讨癫痫患者中颞回（MTG）的细胞和空间稳态破坏	结合单细胞和空间转录组数据，揭示了癫痫患者中颞回的细胞层特异性基因表达模式和空间动态变化，并识别了与空间稳态破坏相关的关键基因	NA	阐明癫痫患者中颞回的细胞和空间稳态破坏机制	癫痫患者的中颞回（MTG）组织	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）	空间转移张量（STT）算法	基因表达数据、空间转录组数据	NA
218	2025-05-30	Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms 2025-Jul-01, Current opinion in pulmonary medicine IF:2.8Q2 DOI:10.1097/MCP.0000000000001175 PMID:40265506	review	本文综述了免疫检查点抑制剂（ICI）相关肺炎的诊断、风险因素和治疗策略，特别关注其潜在的病理生理机制	通过单细胞RNA测序和生物标志物（如自身抗体）的鉴定，增强了对ICI相关肺炎的理解，揭示了细胞介导和体液机制在病理生理中的作用	尽管皮质类固醇是治疗的一线药物，但类固醇难治性肺炎仍然常见且死亡率高	提供ICI相关肺炎的最新研究进展，以指导靶向治疗和未来研究方向	免疫检查点抑制剂（ICI）相关肺炎	NA	lung cancer	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
219	2025-05-30	Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients 2025-Jun, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-025-03011-7 PMID:40211026	研究论文	本研究构建了一个多维策略，用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后	通过整合基因组特征和肿瘤免疫微环境分析，开发了一个新的预测模型（EM-CXCL10），其预测性能优于传统的肿瘤突变负荷（TMB）和突变评分	样本量较小（60例患者），且仅部分患者接受了基因测序和细胞因子测试	预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后	晚期胆道癌患者	肿瘤免疫学	胆道癌	520基因面板测序、多重循环细胞因子测试、单细胞转录组数据分析	LASSO算法、Cox回归模型	基因组数据、转录组数据、临床数据	60例晚期胆道癌患者（其中30例进行基因测序，50例进行细胞因子测试）
220	2025-05-30	Identification and regulation of EMT cells in vivo by laser stimulation 2025-Jun, APL bioengineering IF:6.6Q1 DOI:10.1063/5.0268350 PMID:40438388	研究论文	本研究通过激光刺激方法探讨PLCG2在上皮-间质转化（EMT）细胞中的作用及其调控机制	首次使用飞秒激光扫描光刺激方法激活细胞内钙信号并诱导PLCG2上调，以研究其在EMT和肿瘤发展中的直接作用	PLCG2抑制剂对转移性细胞无明显影响，其具体机制尚不明确	探究PLCG2是否作为EMT的直接驱动因子及其在肿瘤发展中的作用	前列腺癌PC3细胞及EMT细胞	肿瘤生物学	前列腺癌	飞秒激光扫描光刺激、单细胞RNA测序	皮下肿瘤模型	RNA测序数据	NA