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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-06-05 |
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69346-8
PMID:41667485
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研究论文 | 提出了Seq-Scope-X技术,通过组织膨胀突破光学分辨率限制,实现了亚微米级空间转录组和蛋白质组分析 | 首次将组织膨胀与亚微米级空间测序结合,显著减少转录扩散效应并将空间特征密度提高一个数量级,同时兼容空间蛋白质组学分析 | 未详细说明组织膨胀对RNA完整性的潜在影响及不同组织类型的适用性差异 | 开发超越光学分辨率的超高通量空间组学技术以解析细胞微环境 | 小鼠肝脏、脑、结肠组织及人类扁桃体组织中的单细胞和空间亚细胞结构 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学,组织膨胀技术 | NA | 空间基因表达数据,空间蛋白标记数据 | 小鼠肝脏、脑、结肠组织样本及人类扁桃体组织样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 基于Seq-Scope平台的亚微米分辨率空间组学技术,结合组织膨胀实现超越光学分辨率的分析 |
| 202 | 2026-06-05 |
A single-cell transcriptomic dataset profiling traumatic brain injury and NeuroD1-based gene therapy in mice
2026-Feb-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06788-1
PMID:41667502
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据集分析了小鼠创伤性脑损伤及基于NeuroD1的基因治疗的效果 | 首次利用单细胞RNA测序揭示NeuroD1基因治疗在创伤性脑损伤中对细胞组成和星形胶质细胞亚型的显著影响,并阐明了其恢复线粒体和代谢功能、抑制异常突触和髓鞘化过程的分子机制 | 论文未明确说明局限性,但可能包括样本量较小、仅使用小鼠模型以及未完全阐明所有潜在机制 | 阐明创伤性脑损伤中基于NeuroD1的基因治疗的分子和细胞机制 | 小鼠创伤性脑损伤模型及NeuroD1基因治疗后的脑组织细胞 | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用皮质刺伤小鼠模型的创伤性脑损伤样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2026-06-05 |
Attention-guided enhanced deconvolution enables reference-free cell type estimation in spatial transcriptomics
2026-Feb-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39703-0
PMID:41667720
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研究论文 | 提出了一种注意力引导增强反卷积方法,用于空间转录组数据中无参考的细胞类型估计 | 结合概率建模与神经注意力架构,首次实现无需单细胞参考图谱即可自动确定细胞类型数量并完成空间反卷积 | 未说明的方法局限性信息(基于摘要) | 开发一种无需单细胞参考数据的空间转录组细胞类型反卷积方法 | 小鼠嗅球组织、人胰腺导管腺癌组织、人胸腺组织 | 计算机视觉, 机器学习 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | Performer网络, 注意力机制 | 空间基因表达数据 | 小鼠嗅球组织、人胰腺导管腺癌组织、人胸腺组织各一组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 204 | 2026-06-05 |
ICE: robust detection of cellular senescence from weak single-cell signatures using imputation-based marker refinement
2026-Feb-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03997-0
PMID:41668152
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研究论文 | 提出了一种基于插值的细胞衰老检测框架ICE,用于从弱单细胞信号中稳健识别衰老细胞 | 通过整合表达插值与标记物细化,克服了经典衰老标记物表达弱且非特异性的限制,实现了对单细胞RNA-seq数据中衰老细胞的准确检测 | 可能依赖于特定插值方法,且在异质性较高的组织中的表现有待进一步验证 | 开发一种能可靠检测单细胞RNA-seq数据中衰老细胞的计算方法 | 胰腺β细胞和阿尔茨海默病样本中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 计算框架(插值与标记物细化) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2026-06-05 |
Aerobic exercise facilitates p300 nuclear translocation via ADRB2-AMPKα signaling, leading to enhanced histone acetylation and mitigation of cognitive decline in APP/PS1 mice
2026-Feb-10, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-026-01983-z
PMID:41668187
|
研究论文 | 本研究揭示了有氧运动通过ADRB2-AMPKα信号通路促进p300核转位,增强组蛋白乙酰化,从而改善APP/PS1小鼠认知衰退的分子机制 | 首次揭示有氧运动通过ADRB2-AMPKα-p300轴调节表观遗传重塑,对抗阿尔茨海默病突触变性和认知下降的新机制 | 仅使用APP/PS1小鼠模型,缺乏人体组织样本验证;AMPKα抑制实验仅通过腹腔注射方式进行,可能无法完全模拟运动效果 | 阐明有氧运动通过表观遗传重塑改善阿尔茨海默病认知功能的分子机制 | 1511名NHANES队列参与者及APP/PS1转基因小鼠 | 机器学习, 数字病理 | 阿尔茨海默病, 老年病 | 单细胞RNA测序, 表观遗传学分析 | 孟德尔随机化模型, 小鼠行为学模型 | 转录组数据, 行为学数据 | 1511名人类受试者, 多只APP/PS1小鼠(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于分析运动后海马细胞转录组变化 |
| 206 | 2026-06-05 |
Spatial transcriptomics identifies differentiation, lipid metabolism, and retinoid pathway alterations in acne vulgaris
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198021
PMID:41657309
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示痤疮中分化、脂质代谢和维甲酸通路的变化 | 首次针对痤疮的不同亚型(炎性脓疱和非炎性粉刺)进行空间转录组分析,揭示了PPARG+过渡态基底细胞状态和AP-1/FABP5作为潜在治疗靶点 | 未提及明确局限 | 探究痤疮不同病变类型的基因表达、信号传导和皮脂腺参与的分子机制 | 健康、非病变、粉刺和脓疱痤疮皮肤样本 | 数字病理学 | 痤疮 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 人类痤疮皮肤样本及小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 定制面板靶向皮脂分化、脂质代谢和维甲酸信号通路基因 |
| 207 | 2026-06-05 |
Mouse skeletal muscle satellite cells co-opt the tenogenic gene Scleraxis to instruct regeneration
2026-Feb-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95854
PMID:41660703
|
研究论文 | 本研究揭示小鼠骨骼肌卫星细胞利用腱生成相关基因Scleraxis指导肌肉再生过程 | 首次证明腱生成相关转录因子Scx在成体肌肉干细胞中激活并功能性地调控肌肉再生,为肌肉再生与肌腱发育共享分子机制提供新视角 | 仅基于小鼠模型,尚需验证在人类肌肉再生中的保守性;未完全解析Scx在卫星细胞与其他细胞类型间的协同机制 | 探究腱生成相关基因Scleraxis在成体骨骼肌再生中的表达模式与功能作用 | 成年小鼠骨骼肌卫星细胞及其再生过程中的肌肉、肌腱组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、CUT&RUN | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 208 | 2026-06-05 |
DANST enables cell-type deconvolution in spatial transcriptomics using deep domain adversarial neural networks
2026-Feb-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09659-y
PMID:41663685
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研究论文 | DANST框架利用深度域对抗神经网络实现空间转录组学中的细胞类型反卷积 | 首次将深度域对抗神经网络应用于空间转录组学细胞类型反卷积,通过整合单细胞RNA测序与推断空间坐标构建伪空间数据,并利用变分自编码器和域对抗架构实现特征对齐与准确标签迁移 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够从混合基因表达数据中恢复细胞类型比例的空间转录组学反卷积框架 | 人类和小鼠数据集 | 机器学习 | 肿瘤微环境分析 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 深度域对抗神经网络, 变分自编码器 | 基因表达数据, 空间坐标 | 人类和小鼠数据集(未提供具体样本数量) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2026-06-05 |
Loss of mechanical stress induces synovitis, fibrosis and articular cartilage degeneration via distinct synovial cell subsets
2026-Feb-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39416-4
PMID:41663755
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研究论文 | 本研究揭示了机械应力缺失如何通过不同的滑膜细胞亚群导致滑膜炎、纤维化和关节软骨退化 | 利用最小机械应力小鼠模型首次阐明滑膜和软骨变化的时序机制,并识别出Lrrc15肌成纤维细胞和Mmp9巨噬细胞作为关键亚群 | 未说明具体限制 | 探究机械应力缺失导致关节功能障碍的分子机制 | 最小机械应力小鼠模型的关节组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, 组织学检查 | NA | 基因表达数据, 组织学图像 | 小鼠模型,具体样本数量未说明 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 用于bulk RNA-seq和scRNA-seq的测序平台 |
| 210 | 2026-06-05 |
A novel nanotherapeutic strategy: rescuing nucleus pulposus cells from fatty acid metabolic disorder and pyroptosis through ACOT13 by Chinese herbal formula nanoparticles
2026-Feb-08, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04104-y
PMID:41656235
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research paper | 通过单细胞测序和多组学分析,研究脂肪酸代谢在椎间盘退变中的作用,并开发基于中药方剂的纳米颗粒治疗策略 | 首次发现ACOT13通过抑制AMPK/ACC信号通路导致脂肪酸代谢紊乱和细胞焦亡,加速椎间盘退变;创新性利用中药方剂自组装纳米颗粒调控ACOT13功能 | 未提及 | 探索脂肪酸代谢在椎间盘退变中的新机制并开发基于中药纳米颗粒的逆转退变疗法 | 临床样本中的髓核细胞 | machine learning | 椎间盘退变 | 单细胞测序, 多组学分析, 分子动力学模拟 | NA | 序列数据, 临床样本数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 211 | 2026-06-05 |
Integrating multi-omics analysis identifies DNA damage-related gene CLSPN as a biomarker in gastric cancer
2026-Feb-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39387-6
PMID:41656416
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研究论文 | 通过多组学分析识别胃腺癌中DNA损伤相关基因CLSPN作为生物标志物 | 首次整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和免疫组化实验,系统筛选并验证CLSPN在胃腺癌中的诊断潜力,突出其细胞类型特异性表达 | 仍需在临床评估中进一步验证其在胃腺癌管理策略中的实际价值 | 探索DNA损伤相关基因与胃腺癌的关联,为其分子机制和潜在生物标志物提供见解 | 胃腺癌患者样本 | 机器学习、数字病理学 | 胃腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 多种机器学习方法(未具体指定) | 基因表达数据,单细胞表达数据,免疫组化图像 | NA | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2026-06-05 |
Spatial transcriptomics identifies IL-32 as a lipid droplet-associated cytokine linked to tubular injury in human diabetic kidney disease
2026-Feb-07, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02192-y
PMID:41653322
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术发现脂滴相关细胞因子IL-32与人糖尿病肾病肾小管损伤相关 | 首次将IL-32鉴定为脂滴相关细胞因子,并揭示其作为脂质代谢与炎症反应之间的分子桥梁在糖尿病肾病进展中的作用 | NA | 探究脂质积累与炎症信号在糖尿病肾病肾小管损伤中的分子联系 | 不同病理等级的糖尿病肾病患者肾活检样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学、数字空间分析、RNA scope、免疫荧光显微镜 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 14例不同病理等级的糖尿病肾病患者样本 | NA | 空间转录组学、单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 213 | 2026-06-05 |
Mitochondria-targeted nanozyme system for psoriasis treatment
2026-Feb-07, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04068-z
PMID:41652629
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研究论文 | 开发了一种多功能脂质体水凝胶纳米平台用于银屑病的靶向治疗,通过抗氧化和抗炎双重机制发挥作用 | 首次将线粒体靶向纳米酶与网络药理学、转录组学和单细胞测序技术相结合,揭示ROS/mTOR/HIF-1α轴在银屑病中性粒细胞调控中的关键作用 | 研究仅基于IMQ诱导的银屑病小鼠模型,尚需在人类临床样本中验证疗效 | 开发一种新型纳米治疗策略用于银屑病及相关慢性炎症性皮肤病的治疗 | 银屑病样皮肤炎症的机制及CMH@lip@Res-TCeO纳米平台的疗效 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 转录组学 | NA | 转录组数据 | IMQ诱导的银屑病样小鼠模型(具体样本数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2026-06-05 |
PTPN2 deficiency amplifies inflammatory signalling and impairs functional maturation of human stem cell-derived islets
2026-Feb-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04892-4
PMID:41654987
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研究论文 | 研究了PTPN2缺陷对人类干细胞衍生胰岛炎症信号放大和功能成熟的影响 | 首次揭示PTPN2在人类干细胞衍生胰岛分化过程中的动态表达及其对β细胞功能和成熟的关键作用 | 未提及具体局限性,但可能包括体内模型仅使用NOD-SCID小鼠、仅使用单一干细胞系等 | 探究PTPN2缺陷对干细胞衍生胰岛分化和功能的影响及其机制 | PTPN2缺陷的H1人类胚胎干细胞及其衍生的胰岛 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas12a基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自1型糖尿病器官捐赠者的β细胞样本、PTPN2缺陷H1-hESC衍生的胰岛、植入NOD-SCID小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 215 | 2026-06-05 |
Ex vivo long-term expansion of human hematopoietic stem and progenitor cells as a tool for modeling vector integration sites and clonality
2026-Feb-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07700-6
PMID:41654907
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研究论文 | 本研究利用小分子APU实现人类造血干祖细胞的离体长期扩增,以模拟载体整合位点及克隆性,用于基因治疗前的基因毒性评估 | 首次使用APU组合小分子实现人脐带血HSPCs的长期离体扩增和培养,结合整合位点分析动态追踪致突变性载体插入导致的克隆扩增,替代传统小鼠模型进行人类特异的基因毒性测试 | 离体模型与体内骨髓环境的克隆多样性尚有差异,且仅验证了脐带血来源的HSPCs,其他来源细胞(如骨髓或动员外周血)未提及 | 开发基于人类HSPCs的新型体外基因毒性检测方法,通过长期培养监测整合位点克隆性变化,预测插入突变风险 | 人脐带血来源的造血干祖细胞 | 数字病理学 | 遗传性疾病 | 慢病毒转导, 单细胞RNA测序, 整合位点分析, 异种移植 | NA | 基因表达数据, 整合位点序列数据 | 脐带血来源HSPCs(未明确定量),5周体外培养和1次异种移植(小鼠骨髓样本) | 10x Genomics, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, 10x Chromium | 单细胞RNA测序采用10x Chromium平台进行文库构建 |
| 216 | 2026-06-05 |
Azoospermia phenotype and scRNA-seq reveal hnRNPK as a factor essential for male germ cell development in mice
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag108
PMID:41665013
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研究论文 | 通过生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠模型结合多组学分析,发现hnRNPK是维持分化精原细胞正常发育的关键因子,揭示其在转录后水平调控雄性生殖细胞发育的机制 | 首次阐明hnRNPK在分化精原细胞中通过细胞质(与DAZL互作调控翻译起始)和细胞核(参与剪接)双重机制调控生殖细胞发育,填补了转录后调控在精子发生中的认识空白 | 当前信息未提及具体局限性,但基于模型可能包括:仅在小鼠模型验证、未探究人类患者中hnRNPK突变、多组学整合深度有限等 | 研究hnRNPK在雄性生殖细胞发育中的功能及分子机制 | 生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠模型的分化精原细胞 | 机器学习 | 无精症 | scRNA-seq, 多组学分析, 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 翻译效率数据, 剪接数据 | 成年生精细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠与对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2026-06-05 |
Tissue-Derived Extracellular Vesicles Define Diagnostic Biomarkers for Renal Cell Carcinoma
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70221
PMID:41656939
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研究论文 | 通过分析肾细胞癌组织来源的细胞外囊泡,鉴定出用于区分不同亚型的诊断生物标志物 | 首次系统解析了组织来源细胞外囊泡在肾细胞癌不同亚型中的差异化标志物,并利用尿液细胞外囊泡实现无创诊断,整合单细胞测序数据揭示了标志物的细胞来源 | 外部验证队列样本量可能有限,未提及标志物在临床中的前瞻性验证情况 | 评估组织来源细胞外囊泡作为肾细胞癌不同亚型鉴别诊断标志物的潜力 | 透明细胞肾细胞癌(低级别和高级别)、乳头状肾细胞癌、嫌色细胞肾细胞癌的肿瘤与正常组织及其对应的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 配对肿瘤和正常组织样本及其细胞外囊泡,外部验证队列涉及尿液细胞外囊泡样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2026-06-05 |
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signalling, in Aged Hippocampus
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70232
PMID:41656949
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研究论文 | 该研究探讨了鼻内给予人类诱导多能干细胞衍生的神经干细胞胞外囊泡对老年小鼠海马神经炎症的影响 | 首次证明鼻内给予hiPSC-NSC-EVs可通过miRNA抑制NLRP3和cGAS-STING信号通路,减轻老年海马神经炎症并改善认知功能 | NA | 评估鼻内给予hiPSC-NSC-EVs对中年晚期小鼠海马神经炎症的治疗效果及其机制 | 18月龄C57BL6/J小鼠(雄性和雌性) | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、胞外囊泡治疗 | NA | 基因表达数据 | 18月龄小鼠,接受两次鼻内给药后于20.5月龄分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序7天后进行转录组分析 |
| 219 | 2026-06-05 |
Integrative cross-tissue and spatially resolved single-cell profiling uncovers tumour-educated inflammatory remodelling of tissue-resident macrophage ecosystem with immunotherapeutic prognostic significance in pan-cancer
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70608
PMID:41655028
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研究论文 | 通过整合跨组织和空间分辨的单细胞图谱,揭示泛癌组织中组织驻留巨噬细胞受肿瘤教育后的炎症重塑及免疫治疗预后意义 | 首次构建跨组织单细胞图谱揭示组织驻留巨噬细胞在泛癌中的保守炎症表型,发现组织驻留巨噬细胞和单核细胞来源巨噬细胞在肿瘤微环境中趋同分化形成炎症表型,并开发具有临床转化潜力的预后生物标志物 | 未提及具体局限性,但研究主要依赖公共数据库,且验证样本类型有限 | 阐明组织驻留巨噬细胞在肿瘤微环境中的功能重编程机制及其对免疫治疗预后的影响 | 从五种恶性肿瘤中收集的139万单细胞转录组数据和2318个批量RNA-seq样本 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量RNA-seq数据 | 139万单细胞和2318个批量RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 220 | 2026-06-05 |
Regnase-1-mediated regulation of neutrophils modulates SARS-CoV-2 pneumonia
2026-Feb, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013969
PMID:41662396
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研究论文 | 本研究揭示了Regnase-1通过调控中性粒细胞功能影响SARS-CoV-2 MA10株感染抵抗力的机制 | 首次发现Regnase-1通过抑制Tsc22d3表达促进中性粒细胞干扰素反应,从而减弱对SARS-CoV-2感染抵抗力 | 基于小鼠模型,可能不完全代表人类SARS-CoV-2感染情况 | 探究Regnase-1在SARS-CoV-2感染中调节先天免疫反应的机制 | Regnase-1+/-杂合小鼠及其中性粒细胞 | 机器学习 | SARS-CoV-2肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Regnase-1+/-小鼠和野生型小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |