单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-05-02	Single-cell transcriptomic analysis reveals distinct plasma cell populations in chronic thromboembolic pulmonary hypertension 2025-May, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH IF:5.5Q1 DOI:10.1016/j.jtha.2025.02.010 PMID:39965671	research paper	通过单细胞转录组分析揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）中浆细胞的不同群体	识别了CTEPH中浆细胞的改变表型和分化模式，发现了新的浆细胞亚群（AHNAK和IGLC3）	样本量相对较小（5例CTEPH患者和6例正常肺动脉），且仅关注了浆细胞	研究CTEPH中浆细胞的表型和分化模式	CTEPH患者的肺动脉组织和血清免疫球蛋白	单细胞转录组学	慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和蛋白电泳	NA	RNA测序数据和蛋白质数据	5例CTEPH患者和6例正常肺动脉组织，273例CTEPH患者、259例IPAH患者和251例健康对照的血清样本
202	2025-05-02	Micro-region transcriptomics profiling of cerebral organoids using a capillary-based microdissection system 2025-May-01, Analytical methods : advancing methods and applications IF:2.7Q1 DOI:10.1039/d5ay00277j PMID:40211824	研究论文	本文介绍了一种基于毛细管的组织微切割系统（CMS），用于高效获取培养的脑类器官中的微区域（mROIs）进行mRNA测序（CMS-seq），以研究空间转录组学	开发了一种新型的毛细管组织微切割系统（CMS），能够高效获取脑类器官中的微区域（mROIs）进行mRNA测序，并构建了mROIs的细胞类型空间注释图	未提及样本量是否足够大，以及该方法在其他类型组织中的适用性	研究脑类器官中细胞命运的空间转录组学	培养的脑类器官中的微区域（mROIs）	空间转录组学	NA	mRNA测序（CMS-seq），基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析	NA	mRNA测序数据	未明确提及具体样本量，但涉及20天和60天的脑类器官样本
203	2025-05-02	Microglia-driven inflammation induces progressive tauopathies and synucleinopathies 2025-May-01, Experimental & molecular medicine DOI:10.1038/s12276-025-01450-z PMID:40307569	research paper	该研究探讨了小胶质细胞驱动的炎症如何引发和传播神经退行性疾病中的蛋白质病变	首次证明小胶质细胞驱动的炎症可以独立触发神经退行性疾病的全部病理特征，并且这些病理变化可以扩散到更大的脑区	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究小胶质细胞驱动的炎症在神经退行性疾病中的作用	小胶质细胞、tau蛋白、α-突触核蛋白	神经科学	阿尔茨海默病、帕金森病	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据、行为数据	未明确说明小鼠数量
204	2025-05-02	Progressive accumulation of circulating CD27-CD28- effector/memory CD8+ T cells in patients with lung cancer blunts responses to immune checkpoint inhibitor therapy 2025-May-01, Experimental & molecular medicine DOI:10.1038/s12276-025-01448-7 PMID:40307573	research paper	该研究揭示了肺癌患者外周血CD8 T细胞亚群的改变及其对免疫检查点抑制剂治疗反应的影响	首次系统性地描述了肺癌患者外周血CD8 T细胞亚群的组成变化及其与免疫治疗反应的关系	研究样本量有限(224例)，且机制研究不够深入	探究肺癌如何系统性影响CD8 T细胞区室及其临床意义	肺癌患者的CD8 T细胞	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	224名肺癌患者
205	2025-05-02	Inborn errors of immunity underlie clonal T cell expansions in large granular lymphocyte leukemia 2025-May-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI184431 PMID:40309770	research paper	该研究揭示了先天性免疫缺陷（IEI）在T细胞大颗粒淋巴细胞白血病（T-LGLL）中克隆性T细胞扩增的基础作用	首次发现T-LGLL患者的克隆性T细胞扩增可能与先天性免疫缺陷相关，并揭示了IEI变异与T细胞淋巴驱动基因突变的相互作用	样本量相对有限（92例患者），且主要基于欧洲人群	探究T-LGLL发病机制中免疫缺陷的作用	T细胞大颗粒淋巴细胞白血病（T-LGLL）患者	血液肿瘤学	白血病	全外显子测序、单细胞RNA测序、TCR测序	NA	基因组数据、转录组数据	92例T-LGLL患者（来自271例队列）
206	2025-05-02	CXCL12+ fibroblastic reticular cells in lymph nodes facilitate immune tolerance by regulating T cell-mediated alloimmunity 2025-May-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI182709 PMID:40309773	研究论文	本研究探讨了淋巴结中CXCL12高表达的纤维网状细胞（FRCs）在调节T细胞介导的同种免疫反应中的作用	发现了一种特定的CXCL12hi FRCs亚群，其在淋巴结中表达高水平的免疫调节基因，并通过调节T细胞分化促进移植耐受	研究主要基于小鼠模型，人类淋巴结数据的验证仍需进一步研究	研究特定FRCs亚群在控制同种免疫反应中的作用	小鼠和人类淋巴结中的CXCL12hi FRCs	免疫学	移植免疫	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	小鼠和人类淋巴结样本
207	2025-05-02	A Visible-Light Photocatalysis/Hydrolysis Hydrogen-Generating Nanoplatform for Dynamic Inflammation Management via Immune Metabolism Orchestration during Wound Repair 2025-Apr-30, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.5c00667 PMID:40117501	研究论文	本研究介绍了一种通过可见光光催化/水解反应产生氢气的纳米平台，用于动态炎症管理，促进伤口修复	开发了一种新型的氢气生成纳米平台，实现了可控的氢气释放，并揭示了氢气在免疫代谢调控中的具体机制	未提及具体的临床前或临床试验结果，可能缺乏实际应用验证	探索氢气在动态炎症管理和伤口修复中的免疫代谢调控机制	炎症管理、伤口修复	纳米医学	慢性伤口	可见光光催化、水解反应、bulk-RNA测序、单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
208	2025-05-02	Spatial transcriptomics: advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor 2025-Apr-30, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaf116 PMID:40305521	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
209	2025-05-02	Lactylation-Driven NUPR1 Promotes Immunosuppression of Tumor-Infiltrating Macrophages in Hepatocellular Carcinoma 2025-Apr-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413095 PMID:40305758	研究论文	本研究探讨了核蛋白1（NUPR1）在肝细胞癌（HCC）肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的免疫抑制作用及其对免疫治疗结果的影响	首次揭示了NUPR1通过抑制ERK和JNK信号通路促进M2巨噬细胞极化，并通过组蛋白乳酸化上调NUPR1表达，形成免疫抑制反馈环	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证NUPR1靶向治疗的效果	探究NUPR1在HCC免疫抑制微环境中的作用机制及其作为免疫治疗生物标志物和靶点的潜力	肝细胞癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、体外和体内功能实验	NA	基因表达数据、功能实验数据	NA
210	2025-05-02	Single-Cell Transcriptome Reveals Aquaporin-Mediated Carbon Nanosol-Induced Growth Promotion of Plants 2025-Apr-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504459 PMID:40305768	研究论文	研究揭示了碳纳米溶胶通过水通道蛋白介导促进植物生长的单细胞转录组机制	首次在单细胞水平上解析了碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制，并发现水通道蛋白在此过程中的关键作用	研究仅针对烟草根部细胞，未涉及其他植物组织或物种	探究碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制	烟草根部细胞	植物分子生物学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	7,897个细胞（代表13种不同细胞类型）
211	2025-05-02	Tumor-infiltrating mast cells as potential chemoimmunotherapy enhancer in triple-negative breast cancer 2025-Apr-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011899 PMID:40306958	research paper	探讨肿瘤浸润性肥大细胞（TIMCs）在三阴性乳腺癌（TNBC）中作为化疗免疫治疗增强剂的潜力	揭示了TIMCs通过富集和激活多种免疫细胞群发挥抗肿瘤作用，为TIMCs靶向治疗与化疗免疫治疗联合应用提供了新思路	未明确提及研究的具体局限性	研究TIMCs在三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境（TIME）中的作用及其对化疗免疫治疗的影响	三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤浸润性肥大细胞（TIMCs）	肿瘤免疫学	三阴性乳腺癌	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	整合了小鼠和人类的单细胞测序数据（具体样本量未提及）
212	2025-05-02	KLRG1 identifies regulatory T cells with mitochondrial alterations that accumulate with aging 2025-Apr-30, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-025-00855-9 PMID:40307497	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术识别出与衰老相关的T细胞亚群，并开发了一种流式细胞术面板用于系统分析小鼠中的这些细胞	发现了一种表达KLRG1的调节性T细胞亚群，该亚群在衰老过程中积累并表现出线粒体改变和促炎表型	研究主要基于小鼠模型，人类数据验证有限	探索衰老过程中T细胞亚群的变化及其在炎症和衰老中的作用	小鼠和人类的CD4 T细胞亚群	免疫学	衰老相关疾病	单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	基因表达数据, 细胞表型数据	NA
213	2025-05-02	Selective inhibition of stromal mechanosensing suppresses cardiac fibrosis 2025-Apr-30, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08945-9 PMID:40307543	研究论文	研究通过抑制基质机械感知和TGFβ信号通路，探索治疗心血管纤维化的新策略	发现SRC激酶作为成纤维细胞富集的机械传感器，联合抑制SRC和TGFβ信号通路可协同抑制纤维化基因程序	研究主要基于小鼠模型和工程化心脏组织，尚未在人体临床试验中验证	探索抑制基质机械感知和TGFβ信号通路对心血管纤维化的治疗效果	心脏成纤维细胞和小鼠心脏纤维化模型	心血管疾病	心血管疾病	单细胞测序、药物抑制实验	小鼠模型和工程化心脏组织	基因表达数据、生理功能数据	公共人类和小鼠单细胞测序数据集的荟萃分析
214	2025-05-02	Single-cell transcriptomics reveal how root tissues adapt to soil stress 2025-Apr-30, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08941-z PMID:40307555	研究论文	通过单细胞转录组学和空间转录组学方法，研究水稻根部细胞如何适应不同的土壤条件	揭示了根部细胞在单细胞尺度上如何响应和适应不同土壤条件的分子机制	研究仅针对水稻根部，可能不适用于其他植物	探究根部组织如何在单细胞水平上适应不同土壤条件	水稻根部细胞	植物生物学	NA	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	转录组数据	NA
215	2025-05-02	Single cell RNA sequencing of haematopoietic cells in fresh and frozen human atheroma tissue 2025-Apr-29, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvaf014 PMID:39907372	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了新鲜和冷冻保存的人类动脉粥样硬化组织中造血细胞的活性和转录组学特征	首次评估了冷冻保存对动脉粥样硬化组织中造血细胞单细胞RNA测序结果的影响，证实冷冻保存样本可用于大规模生物样本库建设	研究中颈动脉样本缺少LYVE1+巨噬细胞，可能由于手术过程中外膜层丢失所致	评估冷冻保存对动脉粥样硬化组织单细胞RNA测序结果的影响，探索生物样本库建设的可行性	人类动脉粥样硬化组织中的造血细胞	单细胞测序	心血管疾病	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	5对新鲜和冷冻保存的动脉粥样硬化样本（3例冠状动脉和2例颈动脉）
216	2025-05-02	Microglia aging in the hippocampus advances through intermediate states that drive activation and cognitive decline 2025-Apr-29, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.97671 PMID:40298588	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和假时间分析，揭示了小鼠海马区小胶质细胞在衰老过程中的转录异质性，并确定了小胶质细胞衰老的中间状态	发现了小胶质细胞衰老的中间状态，并证明这些中间状态推动炎症激活和认知功能下降	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探究小胶质细胞在衰老过程中从稳态到功能障碍的进展机制	小鼠海马区小胶质细胞	神经科学	老年疾病	单细胞RNA-Seq, 假时间分析	条件性基因敲除小鼠模型	RNA测序数据	成年小鼠海马区小胶质细胞
217	2025-05-02	Single-cell multi-dimensional data analysis decodes RNF19A-mediated drug resistance in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes: mechanisms and biological insights 2025-Apr-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-025-05707-8 PMID:40293542	research paper	该研究通过单细胞多维数据分析，揭示了RNF19A在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中介导药物耐药的机制及其生物学意义	首次发现RNF19A在耐药性成纤维样滑膜细胞中显著过表达，并通过泛素化降解MKP-1激活MAPK信号通路，形成正反馈循环促进药物耐药	研究主要基于公共单细胞转录组数据，实验验证部分可能受样本量限制	探索类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞药物耐药的分子机制	骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织的单细胞转录组数据	生物信息学	类风湿关节炎	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	公共数据库中的骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织样本
218	2025-05-02	FOXM1 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for clear cell renal cell carcinoma via single-cell and bulk RNA-sequencing 2025-Apr-28, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02438-x PMID:40293585	研究论文	本研究探讨了FOXM1在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的预后和免疫调节作用	首次通过单细胞和批量RNA测序验证了FOXM1在ccRCC中作为预后和免疫调节桥梁的作用	研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证	探究FOXM1在ccRCC预后和免疫治疗中的作用机制	透明细胞肾细胞癌(ccRCC)组织和患者	癌症基因组学	肾细胞癌	批量RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组化, qRT-PCR	Cox回归分析	RNA测序数据, 临床数据	TCGA数据库中的ccRCC样本
219	2025-05-02	Mapping immune cell dynamics and macrophage plasticity in breast cancer tumor microenvironment through single-cell analysis 2025-Apr-28, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02419-0 PMID:40293603	研究论文	通过单细胞分析研究乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞动态和巨噬细胞可塑性	使用单细胞RNA测序技术和多种计算工具，全面分析乳腺癌中的免疫细胞亚群和巨噬细胞亚型，揭示了巨噬细胞亚型与乳腺癌细胞之间的潜在相互作用机制	NA	理解乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞与癌细胞之间的相互作用机制	乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞和巨噬细胞亚型	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	Sc-Type, infercnv, CellChat, CytoTRACE, Monocle	单细胞RNA测序数据	NA
220	2025-05-02	A Germline Heterozygous Dominant Negative IKZF2 Variant Causing Syndromic Primary Immune Regulatory Disorder and ICHAD 2025-Apr-28, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1 DOI:10.1007/s10875-025-01882-2 PMID:40295428	研究论文	本文详细描述了一名儿科患者的免疫学评估，该患者携带一种新发现的IKZF2基因变异，导致ICHAD综合征	首次报道了生殖系显性负性HELIOS缺陷的免疫表型，并在单细胞水平上扩展了对AIHA发病机制的理解	研究仅基于一名患者，样本量较小	研究IKZF2基因变异导致的免疫失调及其对淋巴细胞亚群功能的影响	携带IKZF2基因变异的儿科患者及其免疫细胞	免疫学	原发性免疫调节障碍	多参数流式细胞术、单细胞RNA测序	NA	基因测序数据、流式细胞数据	1名儿科患者