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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-11-07 |
Transforming histologic assessment: artificial intelligence in cancer diagnosis and personalized treatment
2025-Sep-24, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03206-y
PMID:40993310
|
综述 | 本文综述人工智能在组织学评估中的变革作用,从癌症诊断到个性化治疗的应用进展 | AI从诊断辅助工具发展为临床决策的核心组成部分,通过深度学习技术复制并增强病理学家决策,解决观察者间变异性和诊断可重复性挑战 | AI预测验证存在挑战,特别是在预后应用方面,资源有限环境中的可及性仍需解决 | 探讨人工智能在组织病理学评估中的变革作用及其在癌症诊断和个性化治疗中的应用 | 组织学评估、癌症诊断、个性化治疗 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习、空间转录组学、多模态方法 | 深度学习模型 | 全切片图像(WSIs)、基因组数据、临床数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 202 | 2025-11-07 |
CCDC137 knockdown suppresses bladder cancer progression by downregulating SCD
2025-Sep-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07033-w
PMID:40993629
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证揭示了CCDC137在膀胱癌中的促癌作用及其通过调控SCD影响肿瘤进展的机制 | 首次系统表征CCDC137在膀胱癌中的表达模式和功能,发现其通过调控脂代谢酶SCD影响肿瘤进展 | 未明确CCDC137调控SCD的具体分子机制,缺乏临床前药物开发验证 | 探究CCDC家族基因在膀胱癌中的临床意义和功能机制 | 膀胱癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 机器学习算法、RNA测序、定量RT-PCR、蛋白质印迹 | 预后模型 | 多组学数据、单细胞测序、空间转录组 | TCGA-BLCA队列及组织微阵列样本 | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 203 | 2025-11-07 |
PLIN2 promotes colorectal cancer progression through CD36-mediated epithelial-mesenchymal transition
2025-Jul-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07836-1
PMID:40640171
|
研究论文 | 本研究揭示了PLIN2通过稳定CD36蛋白表达促进结直肠癌上皮-间质转化和肿瘤进展的分子机制 | 首次发现PLIN2通过抑制CD36蛋白的蛋白酶体降解途径稳定其表达,进而促进EMT过程和结直肠癌进展 | NA | 构建可靠的预后预测模型并阐明结直肠癌进展的关键分子机制 | 结直肠癌细胞、临床标本、组织芯片 | 生物信息学 | 结直肠癌 | WGCNA、单细胞RNA测序、空间转录组、免疫沉淀、免疫荧光 | LASSO回归、Cox回归、Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达谱、临床数据 | 120个免疫细胞表达谱及临床标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 204 | 2025-11-07 |
Identification of Seven in absentia homolog 2 as a potential efferocytosis-related biomarker in diabetic foot ulcers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334163
PMID:41183121
|
研究论文 | 本研究鉴定SIAH2作为糖尿病足溃疡中胞葬作用相关的潜在生物标志物,并探讨其在伤口愈合中的作用机制 | 首次发现SIAH2在糖尿病足溃疡中与胞葬作用相关,并揭示其通过调控角质形成细胞迁移、血管生成和细胞间通讯参与伤口愈合过程 | 样本量较小(仅20例患者),缺乏更大规模的验证研究 | 探究糖尿病足溃疡伤口愈合机制,寻找与胞葬作用相关的生物标志物 | II型糖尿病患者的血液和皮肤样本 | 生物医学研究 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞测序, 生物信息学分析, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 20例II型糖尿病患者 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 205 | 2025-11-07 |
Identification of Dendritic Cell-Associated Genes in COPD Based on Bioinformatics
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S543753
PMID:41185886
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证鉴定COPD患者肺组织中树突状细胞相关基因 | 首次结合单细胞RNA测序、RNA测序数据和WGCNA分析系统鉴定COPD中树突状细胞相关基因,并通过动物模型和细胞实验验证 | 研究主要基于公共数据库和动物模型,需要在人类临床样本中进一步验证 | 鉴定慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者肺组织中树突状细胞相关基因 | COPD患者肺组织、香烟烟雾诱导的肺气肿小鼠模型、骨髓来源树突状细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,加权基因共表达网络分析,RT-qPCR,Western blot | NA | 基因表达数据 | 多个公共数据库(GSE196638, GSE26296, GSE38974)和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2025-11-07 |
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.21.619529
PMID:39484491
|
研究论文 | 本研究整合空间转录组学和谱系追踪技术,揭示了肺腺癌肿瘤生长和转移过程中的时空动态结构 | 首次将高分辨率空间转录组学与演化谱系追踪技术相结合,阐明肿瘤扩张、可塑性和转移与微环境重塑的协同演化关系 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 探究肿瘤进展过程中癌细胞与微环境相互作用的时空动态演化机制 | Kras驱动的肺腺癌小鼠模型 | 空间转录组学 | 肺腺癌 | 空间转录组学, 谱系追踪 | 小鼠模型 | 空间转录组数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞技术 | NA | NA |
| 207 | 2025-11-06 |
Decoding Xylem Development in Flowering Plants: Insights From Single-Cell Transcriptomics
2025-Dec, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70169
PMID:40905378
|
综述 | 本文综述单细胞转录组测序技术在解码开花植物木质部发育中的应用进展 | 整合激光显微切割原位转录组分析技术,提供更精确的细胞类型注释并支持当前最佳的木质部发育谱系工作模型 | 存在跨研究比较的技术挑战,包括生物信息学流程不一致、原生质体化效率变异和潜在错误注释的标记基因使用 | 研究开花植物木质部发育过程 | 单子叶植物和双子叶植物的初生及次生木质部 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 激光显微切割 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2025-11-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals T and B cell-related immune features in foot and mouth disease virus-infected mice
2025-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2580141
PMID:41144693
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中T细胞和B细胞的免疫特征 | 首次在单细胞水平系统揭示口蹄疫病毒感染过程中T细胞和B细胞的组成变化、基因表达特征、细胞间通讯状态和调控网络 | 研究仅限于小鼠模型,未在自然宿主中验证 | 解析口蹄疫病毒感染过程中适应性免疫应答的特征 | 口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中的T细胞和B细胞 | 单细胞组学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | FMDV感染组和模拟感染对照组小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2025-11-06 |
Single-cell aneuploidy and chromosomal arm imbalances define subclones with divergent transcriptomic phenotypes
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf138
PMID:41179709
|
研究论文 | 开发了一种整合单细胞RNA测序和单细胞DNA测序的计算框架scAlign,用于在单个细胞分辨率下定义亚克隆的细胞表型 | 开发了scAlign计算框架,首次实现了在单个细胞水平上整合scRNA-seq和scDNA-seq数据,能够基于基因剂量将细胞分配到特定亚克隆并分析其转录组表型 | 仅使用G0/G1期的细胞进行分析,可能忽略了细胞周期其他阶段的生物学信息 | 研究癌症中亚克隆的基因组不稳定性与转录组表型之间的关系 | 原发性和转移性癌症中的肿瘤细胞亚克隆 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序, 多组学整合分析 | scAlign计算框架 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-11-06 |
New advances on the interaction between internal and external factors in the tumor microenvironment of solid tumors
2025-Nov-05, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2585349
PMID:41177968
|
综述 | 本文综述了实体瘤肿瘤微环境中内外因素相互作用的最新研究进展,重点关注肿瘤免疫逃逸、代谢重编程和神经免疫等领域 | 整合单细胞测序和空间肿瘤学技术揭示肿瘤微环境中细胞间相互作用的复杂细节,为联合免疫治疗提供新思路 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 寻求突破实体瘤免疫治疗瓶颈的联合治疗方案 | 实体瘤肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞测序技术,空间肿瘤学技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 211 | 2025-11-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Retina Reveals Nna1 Upregulation in Myopic Diabetic Retinopathy as a Protective Factor Against Diabetic Damage
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500438
PMID:41190783
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现近视糖尿病视网膜病变中Nna1上调,并证实其通过抑制微管过度谷氨酰化发挥保护作用 | 首次揭示Nna1在近视对糖尿病视网膜病变保护作用中的关键机制,发现其通过调节微管谷氨酰化水平影响细胞自噬和凋亡 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究近视对糖尿病视网膜病变的保护机制及Nna1在此过程中的作用 | db/db糖尿病小鼠的视网膜组织及Müller细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | db/db糖尿病小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2025-11-06 |
A Single-Cell-Inspired Self-Enrichment Therapeutic Strategy Delays Intervertebral Disc Degeneration by Inhibiting Pyroptosis
2025-Nov-05, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202516405
PMID:41190793
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学与临床验证构建椎间盘退变细胞图谱,开发自富集纳米载体延缓椎间盘退变进程 | 首次发现STING介导的炎症通路激活髓核细胞焦亡机制,并设计具有不对称气泡推进功能的自富集纳米载体实现病变组织选择性穿透 | 未明确纳米载体在长期使用中的潜在安全性问题及临床转化可行性 | 开发靶向治疗策略延缓椎间盘退变进程 | 椎间盘退变组织及髓核细胞 | 单细胞组学与纳米医学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 纳米载体技术, siRNA干扰 | NA | 单细胞转录组数据, 体内外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 213 | 2025-11-06 |
Microvascular Endothelial Cells License APS Vasculopathy Through YAP1- and CCN2-Mediated Signaling
2025-Nov-04, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示抗磷脂综合征微血管内皮细胞通过YAP1-CCN2信号通路促进血管病变的机制 | 首次发现YAP1-CCN2信号轴在APS血管病变中的关键作用,并证明抗CCN2抗体可抑制血管平滑肌细胞增殖 | 研究主要基于皮肤和肾脏样本,其他器官血管病变机制仍需验证 | 阐明抗磷脂综合征微血管病变的分子机制 | 抗磷脂综合征患者皮肤活检组织、血浆样本及小鼠模型 | 单细胞生物学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光显微镜, ELISA, 定量PCR, 免疫印迹 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据, 显微镜图像, 蛋白质定量数据 | APS患者皮肤活检和肾脏活检样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2025-11-06 |
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence via assessing tumor's immunosuppressive properties
2025-Nov-04, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0326
PMID:41186269
|
研究论文 | 本研究开发了Sig27基因面板及其衍生面板Sig27IMG,用于评估前列腺癌的免疫抑制特性并预测复发风险 | 首次提出27基因面板Sig27及其5基因核心面板Sig27IMG,能够通过评估肿瘤免疫抑制特性来分层前列腺癌复发风险 | 研究基于现有数据集,需要进一步实验验证 | 开发前列腺癌复发风险分层工具并探索其免疫学机制 | 前列腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA测序 | 基因表达面板 | 基因表达数据 | 批量RNA-seq数据集13个(n=3,133肿瘤),单细胞RNA-seq数据集6个(n=53患者) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-11-06 |
Benchmarking porcine pancreatic ductal organoids for drug screening applications
2025-Nov-04, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00330-3
PMID:41188536
|
研究论文 | 本研究建立并评估猪胰腺导管类器官作为药物筛选平台的应用潜力 | 首次建立猪胰腺导管类器官模型,通过单细胞RNA测序与人类胰腺导管类器官进行系统比对 | 猪胰腺导管类器官向内分泌谱系的分化潜力有限 | 开发可靠的胰腺导管/祖细胞生物学模型用于药物筛选 | 猪胰腺导管类器官、人类胰腺导管类器官和原代猪胰腺组织 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 多个发育阶段的猪胰腺导管类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 216 | 2025-11-06 |
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2025-Nov-04, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03331-3
PMID:41188622
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子特征 | 首次在单细胞分辨率下解析了压后皮层在记忆巩固期间的转录组特征,并发现了阿尔茨海默病模型中神经元激活的减少 | 研究主要聚焦于小鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探索压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子机制 | 小鼠压后皮层的兴奋性神经元 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病及相关痴呆 | 空间转录组学,深度学习计算工具,化学遗传学方法 | 深度学习 | 空间转录组数据 | 成年小鼠压后皮层组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析 |
| 217 | 2025-11-06 |
Single Cell Sequencing Identifies Distinct Cellular Alterations in Impaired Aged and Diabetic Wounds
2025-Nov-04, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70217
PMID:41189300
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较老年和糖尿病小鼠伤口愈合的细胞差异 | 首次在单细胞水平直接比较老年和糖尿病伤口愈合过程,揭示不同的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本验证 | 探究老年和糖尿病伤口愈合障碍的细胞机制差异 | 老年和糖尿病小鼠的伤口组织 | 单细胞组学 | 糖尿病、老年性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),伪时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年和糖尿病小鼠伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2025-11-06 |
Single-cell characterization of trophoblast-epithelial interactions at the human maternal-fetal interface during early implantation
2025-Nov-04, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf246
PMID:41189328
|
研究论文 | 本研究利用输卵管异位妊娠模型通过单细胞RNA测序技术探索人早期胚胎植入过程中母胎界面滋养细胞与上皮细胞的相互作用机制 | 首次利用输卵管异位妊娠模型作为研究工具,通过单细胞转录组分析揭示母胎界面细胞间通讯网络 | 研究基于异位妊娠模型,与正常宫内妊娠存在生理环境差异 | 阐明人类早期胚胎植入过程中母胎界面的分子机制 | 输卵管异位妊娠和正常宫内妊娠的母胎界面组织 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | CellPhoneDB,CellChat | 单细胞转录组数据 | 输卵管异位妊娠患者植入部位样本及公共数据库正常宫内妊娠数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2025-11-06 |
Epigenetic repression of hepatocyte FoxO1 disrupts local immune homeostasis and promotes liver inflammation
2025-Nov-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001590
PMID:41190981
|
研究论文 | 本研究揭示了肝细胞FoxO1通过JMJD1C维持的表观遗传调控在肝脏免疫稳态中的关键作用 | 首次发现JMJD1C通过调控Foxo1启动子区H3K9二甲基化水平控制FoxO1转录,从而维持肝脏局部免疫稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明肝细胞FoxO1在肝脏免疫稳态和炎症中的作用机制 | 人类肝脏样本、肝细胞特异性Foxo1敲除小鼠、酒精性肝炎和血吸虫病肝病小鼠模型 | 表观遗传学 | 肝脏炎症性疾病 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag分析、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 多种肝脏疾病患者样本和基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 220 | 2025-11-06 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-Nov-03, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
|
研究论文 | 通过时间序列单细胞测序技术研究小鼠皮层放射状胶质细胞的谱系进展与细胞多样化机制 | 首次构建了皮层细胞谱系进展的全面分子图谱,揭示染色质可及性通过限制转录因子表达时序驱动细胞多样化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类皮层发育可能存在物种特异性差异 | 探索皮层细胞多样化的细胞内在程序机制 | 小鼠皮层放射状胶质细胞及其衍生细胞类型 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 | 胚胎期和出生后多个发育阶段的小鼠皮层祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |