单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28917 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-06-18 |
Molecular mechanisms after optic nerve injury: Neurorepair strategies from a transcriptomic perspective
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00794
PMID:40313107
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综述 | 本文综述了视神经损伤后的分子机制，以及通过转录组学视角探讨神经修复策略 | 利用单细胞转录组学技术揭示了视神经损伤和青光眼模型中视网膜神经节细胞损伤的分子机制，并鉴定了与神经保护和轴突再生相关的关键基因和转录因子 | 未来研究需要整合先进的单细胞测序与多组学方法，以更全面地研究视网膜神经节细胞损伤和再生的细胞特异性反应 | 探讨视神经损伤后的分子机制，并寻找神经修复的新策略 | 视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 微阵列分析、RNA测序、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9筛选、ATAC-seq分析 | 视神经挤压模型和青光眼模型 | 转录组数据 | NA |
| 202 | 2025-06-17 |
Data-informed insights into sex differences in peripheral blood mononuclear cells from single-cell transcriptomics
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101525
PMID:40520998
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2025-06-17 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals epithelial cell alterations in benign prostatic hyperplasia following finasteride treatment
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101526
PMID:40520997
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2025-06-18 |
Suppression of the Prostaglandin I2-Type 1 Interferon Axis Induces Extramedullary Hematopoiesis to Promote Cardiac Repair After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation
IF:35.5Q1
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research paper | 本研究探讨了脾脏髓外造血（EMH）在心肌梗死（MI）后心脏修复中的作用及其机制 | 揭示了PGI2-IFN轴在MI后脾脏EMH中的作用，为缺血性心脏损伤提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究脾脏EMH在MI后心脏修复中的作用及其调控机制 | 小鼠模型中的脾脏造血干细胞/祖细胞（HSPCs） | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 流式细胞术、液相色谱-串联质谱、单细胞RNA测序 | Tcf21CreER Scfflox/flox MI小鼠模型 | 转录组数据、脂质组数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了GFP+造血干细胞和Tcf21CreER Scfflox/flox小鼠 |
| 205 | 2025-06-18 |
Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition
2025-Jun-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501175
PMID:40525246
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了TRPC6通道抑制在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 发现了一种新型内皮细胞亚群ECRIN，并揭示了TRPC6抑制通过Prnp转录因子调控网络减轻肾纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类CKD样本，临床转化需要进一步验证 | 探究TRPC6通道抑制在慢性肾脏病中的治疗潜力及其分子机制 | 小鼠UUO模型、2个月慢性缺血再灌注损伤模型及人类CKD患者的肾脏样本 | digital pathology | chronic kidney disease | scRNA-Seq, immunofluorescence, western blot | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类CKD患者的肾脏样本（具体数量未明确说明） |
| 206 | 2025-06-18 |
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-Jun-16, American journal of hypertension
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/ajh/hpaf027
PMID:39989120
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research paper | 本文探讨了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性及其机制与治疗前景 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞的分子多样性和转录异质性，并探讨了内皮细胞重编程等新型治疗策略 | 未具体说明研究中使用的样本数量或实验模型的局限性 | 研究内皮细胞的表型可塑性在心血管疾病中的作用及其治疗潜力 | 内皮细胞及其在心血管疾病中的表型转变 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 207 | 2025-06-18 |
LARP7 Protects Vascular Smooth Muscle Cell Contractile Phenotype in CKD by Coupling with P300
2025-Jun-16, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000761
PMID:40522739
|
研究论文 | 本研究探讨了LARP7在维持血管平滑肌细胞（VSMC）收缩表型及缓解慢性肾病（CKD）相关血管病变中的作用 | 发现了LARP7作为内源性正调节因子通过其与P300的相互作用维持VSMC收缩表型的新机制 | 研究主要基于体外和动物模型，临床样本验证有限 | 探究LARP7在CKD相关血管病变中的作用机制 | 血管平滑肌细胞（VSMC） | 分子生物学 | 慢性肾病（CKD） | 单细胞RNA测序、免疫染色分析 | NA | RNA测序数据、免疫染色图像 | CKD患者及小鼠模型样本 |
| 208 | 2025-06-18 |
RIDDEN: Data-driven inference of receptor activity from transcriptomic data
2025-Jun-16, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013188
PMID:40522999
|
研究论文 | 开发了一种名为RIDDEN的计算工具，用于从受体调控的基因表达谱中预测受体活性，而非基于配体和受体基因的表达 | RIDDEN是首个直接关注受体活性而非配体-受体相互作用的计算方法，且不依赖配体和受体的共表达来推断活性 | NA | 开发一种能够从转录组数据中推断受体活性的计算工具，以促进细胞间通讯的研究 | 受体活性的系统水平分析 | 生物信息学 | NA | 转录组数据分析 | RIDDEN | 转录组数据 | 229种不同受体的14463个扰动基因表达谱 |
| 209 | 2025-06-18 |
Spatial Transcriptomics to Study Virus-Host Interactions
2025-Jun-16, Annual review of virology
IF:8.1Q1
|
review | 本文探讨了空间转录组学在研究病毒-宿主相互作用中的潜力及其技术细节 | 强调了空间转录组学在病毒致病机制研究中的变革性潜力 | 未提及具体的技术实施难点或数据解读的限制 | 开发新的抗病毒治疗方法和诱导保护性免疫的策略 | 植物、动物和人类中的病毒疾病 | digital pathology | NA | spatial transcriptomics | NA | transcriptomic data | NA |
| 210 | 2025-06-18 |
Comprehensive identification of crucial biomarkers and therapeutic targets in cholestasis via integrated single-cell RNA and transcriptome sequencing analysis
2025-Jun-16, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10146-8
PMID:40523982
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA和转录组测序分析，全面鉴定胆汁淤积症的关键生物标志物和治疗靶点 | 利用单细胞和转录组测序技术揭示了IL32、CRIP2、ANXA2和VWF作为胆汁淤积症的关键基因，并通过药物重定位分析提出了潜在的治疗药物 | 样本量较小（13例胆汁淤积性肝病患者和10例对照），且研究结果需要进一步验证 | 探究胆汁淤积症的细胞通讯网络和分子机制，寻找生物标志物和治疗靶点 | 胆汁淤积性肝病（CLD）患者和对照组的肝组织 | 数字病理学 | 胆汁淤积症 | 单细胞RNA测序、转录组测序 | Lasso回归 | RNA测序数据 | 13例胆汁淤积性肝病患者和10例对照 |
| 211 | 2025-06-18 |
Single-cell and bulk RNA sequencing reveals specific Trem2 positive B cell subtype niche after myocardial infarction in mice
2025-Jun-16, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10144-w
PMID:40523981
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，揭示了小鼠心肌梗死后特定Trem2阳性B细胞亚型的生态位 | 发现了一种具有调节性B细胞特征的特定B细胞亚型B_Trem2，其过表达Spp1，并揭示了Apoe可能通过结合Lrp1、Sdc4和Sdc3受体促进Spp1表达的机制 | 仅比较了心肌梗死后不同时间点及稳态条件下梗死区域免疫细胞群的变化，未涉及其他区域或其他时间点的分析 | 鉴定心肌梗死后小鼠B细胞亚型并寻找不良重塑的潜在治疗靶点 | 心肌梗死后小鼠的B细胞亚型 | 数字病理 | 心血管疾病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 来自GEO数据库的scRNA-seq数据(GSE163129)和批量RNA测序数据(GSE19322) |
| 212 | 2025-06-18 |
Functional defects in FOXG1 variants predict the severity of brain anomalies in FOXG1 syndrome
2025-Jun-16, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03077-y
PMID:40524015
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研究论文 | 研究FOXG1基因变异如何影响脑部异常严重程度及其功能缺陷 | 通过结合蛋白表达、COUP-TFI抑制和神经元迁移实验，开发了一种预测FOXG1综合征严重程度的分层范式 | 样本量较小（14例），可能影响结果的普遍性 | 探究FOXG1基因变异与脑部异常严重程度之间的精确关系 | 14名携带FOXG1变异的个体及小鼠胚胎脑部 | 神经科学 | 神经发育障碍 | scRNA-seq, IUE, 荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、脑部影像数据 | 14名FOXG1变异个体及小鼠胚胎脑部 |
| 213 | 2025-06-18 |
Role for Complement C5 in Eosinophilic Inflammation of Severe Asthma
2025-Jun-16, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16616
PMID:40524528
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research paper | 该研究探讨了补体系统，特别是补体C5，在严重哮喘中嗜酸性炎症的作用 | 首次通过痰蛋白质组学分析揭示了补体C5在严重哮喘嗜酸性炎症中的直接作用，并验证了C5抑制在小鼠模型中的抗炎效果 | 研究样本可能有限，且小鼠模型结果需进一步验证是否完全适用于人类 | 阐明补体C5在严重哮喘嗜酸性炎症中的病理机制 | 健康对照者和严重哮喘患者的痰样本，以及哮喘小鼠模型 | 生物医学研究 | 哮喘 | 数据依赖性采集质谱、加权相关网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | 小鼠哮喘模型 | 蛋白质表达数据、RNA测序数据 | 健康对照者和严重哮喘患者（具体数量未明确说明） |
| 214 | 2025-06-18 |
Loss of N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 leads to meiotic prophase abnormalities and male sub-fertility in mice†
2025-Jun-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf052
PMID:40079145
|
研究论文 | 本研究揭示了N-6腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1（N6AMT1）在小鼠精子发生过程中的减数分裂进展中的关键作用 | 首次证明N6AMT1在减数分裂性染色体失活（MSCI）和DNA双链断裂（DSB）修复中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中进行验证 | 探究N6AMT1在精子发生和雄性生育能力中的作用机制 | 小鼠生殖细胞特别是精母细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据 | N6amt1基因敲除小鼠及其对照组的生殖细胞样本 |
| 215 | 2025-06-18 |
The role of tumor microenvironment and immune cell crosstalk in triple-negative breast cancer (TNBC): Emerging therapeutic opportunities
2025-Jun-15, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217865
PMID:40516902
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）中肿瘤微环境（TME）和免疫细胞相互作用的研究现状，以探索新兴的治疗机会 | 整合单细胞RNA测序和空间分析技术，揭示了T细胞异质性和细胞间相互作用对TNBC预后的影响，并提出了针对Tregs和TK1等新靶点的治疗策略 | 需要更多多组学数据和患者来源模型来验证和优化治疗干预措施 | 探索TNBC中肿瘤微环境和免疫细胞相互作用的新治疗机会 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤微环境和免疫细胞 | 肿瘤学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 216 | 2025-06-18 |
A multi-omics resource of B cell activation reveals genetic mechanisms for immune-mediated diseases
2025-Jun-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.05.22.25328104
PMID:40475139
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了B细胞激活过程中的基因调控机制及其与免疫介导疾病的关联 | 首次系统研究了B细胞在多种激活状态下的基因调控动态，并建立了交互式浏览器共享数据 | 样本仅来自26名健康女性捐赠者，未包括疾病患者或男性样本 | 阐明B细胞激活状态下的基因调控机制及其在免疫介导疾病中的作用 | 26名健康女性捐赠者的B细胞 | 基因组学 | 免疫介导疾病（包括自身免疫、过敏、感染和癌症相关疾病） | RNA-seq、单细胞RNA-seq（CITE-seq）、ATAC-seq | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 26名健康女性捐赠者的B细胞，在6种激活条件下产生24种激活状态和5种对照条件 |
| 217 | 2025-06-18 |
Single-cell transcriptomics identify a chemotherapy-resistance related cluster overexpressed CLIC3 in ovarian cancer
2025-Jun-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02882-9
PMID:40515890
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学识别卵巢癌中与化疗耐药相关的细胞亚群及其关键基因CLIC3 | 首次在卵巢癌中识别出一个与化疗耐药和不良预后相关的特定上皮细胞亚群c3，并确定CLIC3为其关键标记基因 | 样本量较小（仅5个卵巢癌样本） | 探索卵巢癌化疗耐药机制 | 卵巢癌患者样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | GSVA分析、细胞通讯分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 5个卵巢癌样本（3个耐药，2个敏感） |
| 218 | 2025-06-18 |
Single-cell and bulk RNA analysis identifies EMT-associated CAF signatures and prognostic model in lung adenocarcinoma
2025-Jun-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02951-z
PMID:40517220
|
research paper | 该研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，识别与上皮-间质转化(EMT)相关的癌症相关成纤维细胞(CAFs)特征基因，并构建了肺腺癌(LUAD)的预后模型 | 整合单细胞和批量转录组数据识别EMT-CAF相关基因，构建具有临床价值的预后风险评分模型 | 需要进一步研究验证这些发现的临床适用性和生物学机制 | 理解CAFs在LUAD中的分子机制及其临床意义 | 肺腺癌(LUAD)患者 | digital pathology | lung cancer | RNA-seq | LASSO regression | RNA sequencing data | 来自TCGA和GEO数据库的LUAD患者RNA测序数据和临床信息 |
| 219 | 2025-06-18 |
Enhanced cytotoxicity of aging associated NKG2C + CD8 + T cells in ankylosing spondylitis via HLA-B27
2025-Jun-14, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03585-w
PMID:40517268
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研究论文 | 本研究探讨了衰老与强直性脊柱炎(AS)发病机制之间的共同机制，并确定了潜在的治疗靶点 | 发现HLA-B27通过激活PI3K‒Akt信号通路驱动衰老相关的NKG2C+ CD8+ T细胞的细胞毒性，提出NKG2C抑制可能作为AS的新型治疗策略 | 样本量相对较小(87例AS患者)，且部分机制验证依赖于小鼠模型 | 探索衰老与强直性脊柱炎发病机制的联系并寻找治疗靶点 | 强直性脊柱炎患者和小鼠模型 | 免疫学 | 强直性脊柱炎 | 多维流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序 | HLA-B27转基因小鼠模型 | 流式细胞数据、RNA测序数据 | 87例AS患者及匹配对照 |
| 220 | 2025-06-18 |
Novel Transcriptomic Signatures in Fibrostenotic Crohn's Disease: Dysregulated Pathways, Promising Biomarkers, and Putative Therapeutic Targets
2025-Jun-13, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaf021
PMID:39977234
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研究论文 | 本研究探索了克罗恩病纤维狭窄性回肠病变的转录组特征，以全面描述肠道纤维化的生物学和细胞机制 | 发现了81个差异表达基因，并利用机器学习分析和单细胞RNA测序技术鉴定了与纤维狭窄相关的特异性基因和细胞亚群 | 样本量较小（仅9名患者），且仅针对手术切除样本进行研究 | 探索克罗恩病纤维狭窄性回肠病变的转录组特征及其潜在治疗靶点 | 克罗恩病患者的纤维狭窄性回肠组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA测序（bulk RNA-seq和scRNA-seq）、qPCR | 随机森林模型 | RNA测序数据 | 9名克罗恩病患者的纤维狭窄性回肠组织样本 |