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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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201 | 2025-07-05 |
Landscape analysis of matrix metalloproteinases reveals key prognostic markers for prostate cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582992
PMID:40607407
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研究论文 | 本研究全面分析了基质金属蛋白酶(MMPs)在前列腺癌(PCa)中的作用,并特别强调了MMP11在肿瘤微环境重编程中的关键作用 | 首次全面评估了MMPs在PCa中的表达特征和预后价值,并发现MMP11通过重塑肿瘤微环境促进PCa进展 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅限于细胞水平 | 探索MMPs在PCa中的预后价值和生物学功能 | 前列腺癌组织和细胞 | 肿瘤生物学 | 前列腺癌 | 生物信息学分析(UCSC/GEO数据库)、COX回归分析、单细胞转录组分析、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 来自UCSC和GEO数据库的多个前列腺癌数据集 |
202 | 2025-07-05 |
The functional and clinical significance of nucleoporin NUP153 across human cancers: a systematic study based on multi-omics analysis and bench work validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1613688
PMID:40607419
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证,探讨了核孔蛋白NUP153在多种癌症中的功能和临床意义 | 首次系统研究了NUP153在多种癌症中的表达模式、突变情况、诊断价值及其与肿瘤免疫微环境的关系,并验证了其在胃癌中的高表达及其与免疫细胞浸润的相关性 | 需要进一步研究阐明NUP153在癌症中的具体分子机制及其临床应用的可行性 | 探索NUP153在癌症中的功能和临床意义 | 多种癌症类型,特别是胃癌 | 癌症研究 | 多种癌症,包括胆管癌、结直肠癌、头颈部鳞状细胞癌、胃癌等 | 多组学分析、免疫组化、RT-qPCR、单细胞分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、免疫细胞浸润数据、药物敏感性数据 | 来自TCGA和GTEx等公共数据库的数据,以及胃癌组织的实验验证样本 |
203 | 2025-07-05 |
Identification and validation of a KRAS-macrophage-associated gene signature as prognostic biomarkers and potential therapeutic targets in melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566432
PMID:40607411
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研究论文 | 本研究通过多平台方法识别并验证了一个与KRAS信号和巨噬细胞相关的基因特征(KMPAG),作为黑色素瘤的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次构建了KRAS-巨噬细胞预后相关基因特征(KMPAG),并验证其在黑色素瘤预后和治疗反应预测中的价值 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分仍需进一步扩展 | 探索KRAS信号通路在黑色素瘤肿瘤微环境中的作用,并开发预后生物标志物 | 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因集富集分析(GSEA)、免疫组化(IHC) | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的黑色素瘤样本 |
204 | 2025-07-05 |
Transiently increased coordination in gene regulation during cell phenotypic transitions
2024-Dec, PRX life
DOI:10.1103/prxlife.2.043009
PMID:40585428
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research paper | 该研究通过分析单细胞RNA测序数据,探讨了细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制 | 揭示了细胞表型转变过程中基因调控网络社区间相互作用的动态变化模式,并提出了一个普遍原则:在细胞表型转变过程中,社区间相互作用增加以协调全局基因表达重编程 | 研究仅分析了五种细胞转变过程,可能无法涵盖所有类型的细胞表型转变 | 探究细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制 | 五种不同的细胞转变过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | transition path theory | RNA-seq数据 | 五种不同的细胞转变过程 |
205 | 2025-07-05 |
Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET
2024-Nov-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05821-4
PMID:39548496
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学分析,揭示了促性腺激素和催乳素垂体神经内分泌肿瘤(PitNET)中基因表达特征与临床病理特征的联系 | 首次在PitNET中系统比较了促性腺激素和催乳素亚型的肿瘤微环境差异,并发现了与肿瘤侵袭性相关的淋巴细胞亚群 | 样本量相对较小(7例促性腺激素和3例催乳素PitNET),且主要关注两种亚型 | 探究PitNET肿瘤微环境与肿瘤侵袭性行为的关系 | 促性腺激素和催乳素垂体神经内分泌肿瘤 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq,免疫组化 | NA | 基因表达数据,组织切片图像 | 10例单细胞测序样本(7例促性腺激素+3例催乳素),134例bulk RNA-seq样本 |
206 | 2025-07-05 |
The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2
2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028
PMID:38796708
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研究论文 | 本文探讨了PSMP/MSMP作为急性肾损伤(AKI)的新型潜在治疗靶点,通过CCR2促进AKI的机制 | 首次揭示了PSMP在AKI中的关键作用,并证明PSMP中和抗体可作为AKI的治疗药物 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证PSMP中和抗体的疗效 | 探索PSMP在AKI中的作用机制并评估其作为治疗靶点的潜力 | AKI患者和小鼠模型 | 肾脏病学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | AKI小鼠模型(肾缺血再灌注损伤、甘油和顺铂诱导) | RNA测序数据、临床样本数据 | AKI患者和小鼠模型,具体样本量未明确说明 |
207 | 2025-07-05 |
S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis
2024-06-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06849-6
PMID:38942784
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研究论文 | 本文研究了S100A8/A9高表达的中性粒细胞通过线粒体复合物I缺陷在脓毒症期间诱导内皮细胞线粒体功能障碍和PANoptosis的机制 | 揭示了S100A8/A9通过下调Nrf1表达抑制线粒体复合物I中的Ndufa3表达,进而导致线粒体功能障碍和PANoptosis的新机制 | 研究主要基于体外实验和测序分析,缺乏在体实验验证 | 探究S100A8/A9在脓毒症期间诱导内皮细胞功能障碍的分子机制 | 中性粒细胞和内皮细胞 | 分子生物学 | 脓毒症 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 测序数据 | NA |
208 | 2025-07-05 |
Multiomics integration-based immunological characterizations of adamantinomatous craniopharyngioma in relation to keratinization
2024-06-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06840-1
PMID:38906852
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学对58,081个细胞核进行综合分析,揭示了颅咽管瘤的免疫微环境特征及其细胞间网络 | 首次通过多组学整合分析揭示了颅咽管瘤的免疫抑制微环境特征,并发现了一种与肿瘤角质化相关的调控网络 | 样本量相对有限,且研究结果需要进一步的功能验证 | 阐明颅咽管瘤的免疫微环境特征及其与肿瘤进展的关系 | 颅咽管瘤(ACP)样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单核RNA测序(snRNA-seq), 空间转录组学, asmFISH | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 58,081个细胞核 |
209 | 2025-07-05 |
CSTF3 contributes to platinum resistance in ovarian cancer through alternative polyadenylation of lncRNA NEAT1 and generating the short isoform NEAT1_1
2024-06-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06816-1
PMID:38898019
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研究论文 | 本研究揭示了CSTF3通过调节lncRNA NEAT1的选择性多聚腺苷酸化(APA)在卵巢癌铂类耐药中的作用机制 | 首次发现CSTF3通过调控NEAT1的APA过程生成短亚型NEAT1_1,从而促进卵巢癌铂类耐药的新机制 | 研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据,需要进一步实验验证 | 探索卵巢癌铂类耐药的分子机制 | 卵巢癌患者的铂类耐药和敏感组织 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 公共数据库中的卵巢癌患者单细胞RNA测序数据集 |
210 | 2025-07-05 |
CXCR7 activation evokes the anti-PD-L1 antibody against glioblastoma by remodeling CXCL12-mediated immunity
2024-06-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06784-6
PMID:38898023
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研究论文 | 本研究探讨了CXCR7激活通过重塑CXCL12介导的免疫反应,增强抗PD-L1抗体对胶质母细胞瘤的疗效 | 发现了CXCR7作为CXCL12的非典型受体在肿瘤细胞中的负调控作用,并验证了选择性CXCR7激动剂VUF11207能逆转GAM诱导的免疫抑制,增强抗PD-L1抗体的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证 | 探索通过靶向CXCR7-CXCL12轴增强胶质母细胞瘤免疫治疗效果的机制 | 胶质母细胞瘤细胞、胶质母细胞瘤相关巨噬细胞(GAMs)和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析、单细胞转录组测序、体外共培养系统 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 转录组数据、单细胞测序数据、体外实验数据 | 未明确说明样本数量,但使用了复发胶质母细胞瘤标本、公共胶质母细胞瘤数据集和小鼠模型 |
211 | 2025-07-05 |
Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2
2024-06-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06820-5
PMID:38890311
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞反向迁移(rM)的机制,发现趋化因子受体样2(Ccrl2)及其配体chemerin在这一过程中起关键作用 | 首次揭示了chemerin通过与其受体CCRL2相互作用吸引中性粒细胞离开炎症部位的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体中的相关性尚需验证 | 探索中性粒细胞反向迁移的分子机制 | 中性粒细胞及其迁移行为 | 免疫学 | 急性肺损伤 | scRNA-seq、气袋模型 | NA | 基因表达数据、细胞追踪数据 | 小鼠急性肺损伤模型 |
212 | 2025-07-05 |
The Mohawk homeobox gene represents a marker and osteo-inhibitory factor in calvarial suture osteoprogenitor cells
2024-06-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06813-4
PMID:38886383
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研究论文 | 该研究揭示了Mohawk同源盒基因(Mkx)在小鼠颅骨缝合间充质祖细胞中作为骨抑制因子的作用及其在骨修复中的机制 | 首次发现Mkx基因在颅骨缝合间充质祖细胞中作为骨抑制因子,并证明其机械响应性调控骨分化的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证 | 探究Mkx基因在颅骨缝合间充质祖细胞中的功能及其在骨修复中的作用机制 | 小鼠颅骨缝合间充质祖细胞 | 骨生物学 | 骨修复障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、基因敲除/敲低、机械拉伸实验 | 基因报告小鼠模型(Mkx; R26R) | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体样本量(使用转基因小鼠模型) |
213 | 2025-07-05 |
Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-06-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06699-2
PMID:38886351
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研究论文 | 提出一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略,通过SAMD4B-APOA2-PD-L1轴增强抗肿瘤免疫 | 首次提出基于三种常见抗肿瘤药物的协同免疫化疗策略,并揭示其通过SAMD4B介导的2'-O-甲基化修饰调控免疫微环境的机制 | 研究主要基于PDX小鼠模型,临床样本量可能有限 | 开发针对晚期肝细胞癌的有效治疗方案 | 肝细胞癌患者和PDX小鼠模型 | 肿瘤免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、2'-O-甲基化修饰、多重免疫荧光染色 | PDX小鼠模型 | RNA测序数据、免疫荧光图像数据 | 未明确说明具体样本量,涉及PDX小鼠模型和临床患者数据 |
214 | 2025-07-05 |
MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing
2024-06-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06775-7
PMID:38866777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现MAL2在肝内胆管癌中特异性富集,并通过调控EGFR/SREBP-1通路促进脂质代谢,影响癌细胞增殖和迁移 | 首次揭示MAL2通过稳定EGFR膜定位激活PI3K/AKT/SREBP-1轴促进脂质积累的机制,并筛选出小分子抑制剂sarizotan | 研究主要基于体外实验和类器官模型,尚未进行大规模临床验证 | 探究MAL2在肝内胆管癌发生发展中的作用机制及治疗靶点 | 肝内胆管癌细胞及类器官模型 | 肿瘤生物学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、代谢组学、分子对接、Co-IP | 类器官模型 | RNA测序数据、代谢物数据 | 未明确说明具体样本数量 |
215 | 2025-07-05 |
Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration
2024-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1
PMID:38585871
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示表达GPNMB的巨噬细胞在肌肉再生中的关键作用 | 发现了一个表达GPNMB的巨噬细胞亚群,该亚群在巨噬细胞介导的肌肉再生中发挥关键作用 | 研究未详细探讨GPNMB信号通路在肌肉再生中的具体分子机制 | 探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能 | 骨骼肌损伤后的巨噬细胞 | 单细胞测序 | 肌肉损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 不同时间点的骨骼肌单细胞样本 |
216 | 2025-07-04 |
Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2
2025-Aug, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70021
PMID:40580015
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research paper | 研究通过生成可诱导的Cntn2CreERT2小鼠系,追踪发育中鼻子内早期迁移神经元 | 利用Cntn2CreERT2小鼠系作为时间控制嵌合操作特定神经元群体的有效工具 | 可用的分子标记数量有限,可能限制了对早期迁移神经元的全面追踪和功能操作 | 研究发育中鼻子内早期迁移神经元的追踪和功能操作 | 啮齿动物发育中鼻子内的神经元,特别是嗅觉基板早期神经源性波中形成的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,可诱导CreERT2小鼠系 | Cntn2CreERT2小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
217 | 2025-07-04 |
Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q
2025-Jul-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025102
PMID:40073369
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研究论文 | 通过大规模依赖性和药物筛选,系统性表征了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性,并发现其对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性增加 | 首次系统性揭示了1q+多发性骨髓瘤对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性,并阐明了其作用机制 | 研究主要基于体外实验,尚未进行临床验证 | 开发针对1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗策略 | 1q+多发性骨髓瘤患者 | 肿瘤学 | 多发性骨髓瘤 | 大规模依赖性筛选、药物筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
218 | 2025-07-04 |
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-Jul-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027689
PMID:40163892
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了特发性多中心Castleman病(iMCD)患者的免疫景观,揭示了IL-6和IFN-II信号通路在疾病进展中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了iMCD患者中CCL单核细胞通过IFN-II信号与NK/NKT细胞相互作用,以及IFN-γ水平与疾病严重程度和治疗抵抗的正相关性 | 样本量较小(15例iMCD患者和4例健康对照),且部分发现需要在大规模独立队列中进一步验证 | 深入了解iMCD的免疫机制,建立早期预后分层并发现新的治疗靶点 | 特发性多中心Castleman病(iMCD)患者的外周血单个核细胞(PBMCs)、淋巴结和骨髓样本 | 免疫学 | 特发性多中心Castleman病(iMCD) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞(PBMCs),以及部分淋巴结和骨髓样本 |
219 | 2025-07-04 |
Choroid Plexus Fibroblast-ILC2 Niche Promotes Adult Hippocampal Neurogenesis after Traumatic Brain Injury
2025-Jul-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415984
PMID:40605604
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研究论文 | 本文研究了创伤性脑损伤(TBI)后脉络丛(ChP)中2型固有淋巴细胞(ILC2)的积累及其对神经发生的影响 | 首次揭示了ILC2通过优化免疫微环境和促进神经发生在TBI后的潜在治疗作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨TBI后脉络丛的结构变化和免疫细胞浸润特征及其对神经发生的影响 | 创伤性脑损伤(TBI)小鼠模型 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、组织学分析 | 小鼠模型 | RNA测序数据、组织学数据 | 未明确提及具体样本数量 |
220 | 2025-07-04 |
Cathepsin K Aggravates Pulmonary Fibrosis Through Promoting Fibroblast Glutamine Metabolism and Collagen Synthesis
2025-Jul-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413017
PMID:40605618
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研究论文 | 本文研究了组织蛋白酶K(CTSK)如何通过促进成纤维细胞的谷氨酰胺代谢和胶原合成加剧肺纤维化 | 首次发现CTSK通过SNX9介导的内吞作用促进TGF-β1诱导的SMAD3激活,进而上调GLS1和谷氨酰胺富集,最终增加胶原合成 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究肺纤维化中成纤维细胞异常活化的触发因素及其分子机制 | 肺纤维化小鼠模型和患者血清样本 | 分子病理学 | 肺纤维化 | 蛋白质组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞测序数据、血清生化指标 | 小鼠模型和患者血清样本(具体数量未明确说明) |