本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-29 | Cancer-associated fibroblasts drive lung adenocarcinoma progression via THBS2-mediated epithelial-mesenchymal transition 
          2025-Nov, Oncogene
          
          IF:6.9Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41388-025-03569-9
          PMID:40973793
         | 研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过THBS2介导的上皮-间质转化驱动肺腺癌进展的机制 | 首次发现高表达THBS2的基质CAF亚型在肺腺癌进展中的关键作用,并阐明THBS2-SDC4-EMT信号轴 | 未明确THBS2-SDC4相互作用的具体分子机制及在其他癌症类型中的普适性 | 解析癌症相关成纤维细胞在肺腺癌发生发展中的作用机制 | 人肺腺癌组织样本及体外模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | 包含原位腺癌、微浸润腺癌和浸润性腺癌的多阶段样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | 
| 202 | 2025-10-29 | ITGA5 drives glioblastoma progression through SLK-mediated activation of the PI3K-Akt pathway 
          2025-Nov, Neurological research
          
          IF:1.7Q4
          
         
          DOI:10.1080/01616412.2025.2512437
          PMID:40544320
         | 研究论文 | 本研究揭示了ITGA5通过SLK激活PI3K-Akt通路驱动胶质母细胞瘤进展的分子机制 | 首次发现ITGA5通过SLK介导的PI3K-Akt通路激活促进胶质母细胞瘤进展,并证实ITGA5-SLK轴可作为新的治疗靶点 | NA | 阐明ITGA5在胶质母细胞瘤中的促癌机制 | 胶质母细胞瘤组织和细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高通量RNA测序 | NA | NA | 
| 203 | 2025-10-29 | Circulating Cathepsin D Exacerbates Injury-Induced Brain Damage by Promoting Neutrophil Infiltration Into the Brain 
          2025-Oct-28, Journal of the American Heart Association
          
          IF:5.0Q1
          
         
          DOI:10.1161/JAHA.125.043416
          PMID:41147378
         | 研究论文 | 本研究揭示循环组织蛋白酶D通过上调脑内皮VCAM-1表达促进中性粒细胞浸润,从而加剧损伤诱导的脑损伤 | 首次发现循环非酶原型CTSD通过激活脑内皮VCAM-1促进中性粒细胞迁移的分子机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究循环CTSD对脑损伤后炎症反应的影响机制 | 转基因hCTSDhi小鼠和CTSDMono敲除小鼠的脑组织 | 神经科学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两组转基因小鼠模型(创伤性和缺血性损伤) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 204 | 2025-10-29 | Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation 
          2025-Oct-28, Asian journal of andrology
          
          IF:3.0Q1
          
         
          DOI:10.4103/aja202561
          PMID:41147439
         | 研究论文 | 评估II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后伤口修复的影响 | 首次通过临床试验和动物实验证实II型5α-还原酶抑制剂通过减轻纤维化和炎症促进术后伤口修复 | 样本量有限(87例患者,12只比格犬),研究周期为6个月 | 研究II型5α-还原酶抑制剂对BPH患者TURP术后恢复的影响 | BPH患者和比格犬动物模型 | 临床医学 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序,ELISA,组织学分析 | NA | 临床数据,分子标记数据 | 87例BPH患者(47例治疗组,42例安慰剂组),12只比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 205 | 2025-10-29 | Single-cell RNA sequencing reveals the protective role of renal Cx3cr1+ macrophages in cisplatin-induced acute kidney injury 
          2025-Oct-28, The FEBS journal
          
         
          DOI:10.1111/febs.70302
          PMID:41147753
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肾脏Cx3cr1+巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤中的保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序解析了顺铂诱导的急性肾损伤中肾脏巨噬细胞的异质性,并发现Cx3cr1+巨噬细胞亚群具有保护功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究急性肾损伤中肾脏巨噬细胞亚群的分类和功能 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠模型中的肾脏巨噬细胞 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,bulk测序,细胞耗竭实验,过继转移实验,细胞共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠肾脏样本(从第0天到第7天的时间序列) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 206 | 2025-10-29 | Subclinical Fields of BRAF V600E-Mutant Melanocytes Populate Human Skin and Are Enriched Around Melanoma and Naevi 
          2025-Oct-28, The British journal of dermatology
          
         
          DOI:10.1093/bjd/ljaf412
          PMID:41148046
         | 研究论文 | 本研究在人类皮肤中发现存在BRAF V600E突变黑色素细胞的亚临床区域,这些区域在黑色素瘤和痣周围更为富集 | 首次证实正常皮肤中存在BRAF V600E突变黑色素细胞区域,挑战了BRAF V600E表达必然导致肿瘤形成的传统观点 | 样本主要来自高风险澳大利亚黑色素瘤队列,可能限制结果的普适性 | 确定BRAF V600E突变黑色素细胞是否常见于高风险成人非病变皮肤中 | 97例组织学和临床正常的非病变皮肤样本,包括痣或黑色素瘤切除部位邻近皮肤、光损伤皮肤和光保护皮肤,以及低风险新生儿包皮来源的黑色素母细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 免疫组织化学, 微滴数字PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 组织切片, 基因表达数据 | 97例非病变皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 207 | 2025-10-29 | Altered thymopoiesis in thymoma is associated with defects in negative selection machinery and decreased Treg abundance 
          2025-Oct-27, Cancer immunology research
          
          IF:8.1Q1
          
         
          DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0190
          PMID:41143696
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间分析揭示胸腺瘤中胸腺生成异常与自身免疫的关系 | 首次结合表型分析、单细胞RNA测序和空间分析系统研究胸腺瘤中T细胞发育异常机制 | 样本量有限,未明确胸腺生成异常与自身免疫的直接因果关系 | 探究胸腺瘤中胸腺生成异常与自身免疫发生的机制 | 胸腺瘤患者肿瘤组织中的T细胞和胸腺上皮细胞 | 数字病理学 | 胸腺瘤 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学连续染色, 空间分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫组织化学图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 208 | 2025-10-29 | Single-cell RNA sequencing reveals genes relevant to periodontal therapy and periodontitis 
          2025-Oct-27, Physiological genomics
          
          IF:2.5Q2
          
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析健康与牙周炎状态下人类口腔组织的基因表达差异和细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平系统比较口腔黏膜和牙龈的分子差异,并揭示牙周炎中连接上皮细胞的抗氧化基因表达变化和成纤维细胞的自分泌信号机制 | 研究样本量有限,未涉及不同病程阶段的动态变化分析 | 探究口腔黏膜与牙龈的分子差异及牙周感染对组织间相互作用的影响 | 人类口腔黏膜组织、健康牙龈组织和牙周炎影响的牙龈组织 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 209 | 2025-10-29 | Multi-omics dissection of RAD21-PON1 axis reveals metabolic-immune crosstalk and prognostic significance in hepatocellular carcinoma 
          2025-Oct-27, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
          
          IF:2.7Q2
          
         
          DOI:10.1007/s00335-025-10166-4
          PMID:41143965
         | 研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了RAD21-PON1轴在肝细胞癌中调控代谢-免疫串扰的机制及其预后意义 | 首次发现RAD21通过结合PON1启动子调控代谢通路活性并塑造免疫微环境,建立了RAD21-PON1风险特征用于预后分层 | 研究主要基于组学数据分析,需要进一步实验验证机制细节 | 探究RAD21是否调控PON1以及该轴如何整合HCC中的代谢和免疫信号 | 肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学, ChIP-seq, 单细胞RNA测序, GSVA, TIDE, LASSO建模 | LASSO | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序, 转录组测序 | NA | NA | 
| 210 | 2025-10-29 | The SPI1/LILRB2 axis modulates macrophage tolerance via crosstalk with TLR8 signaling: implications for sepsis immunotherapy 
          2025-Oct-27, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
          
          IF:4.8Q2
          
         
          DOI:10.1007/s00011-025-02125-1
          PMID:41144021
         | 研究论文 | 本研究揭示了SPI1/LILRB2轴通过调控TLR8信号通路调节巨噬细胞耐受性的新机制 | 首次发现转录因子SPI1直接上调抑制性受体LILRB2表达,进而抑制TLR8介导的MyD88/NF-κB信号通路,强化免疫抑制表型 | SPI1作用的特异性需进一步确认,需排除对其他耐受调节因子的间接影响;LILRB2对TLR8的非常规抑制机制在病毒共感染情况下的特异性需验证;TLR8在LPS耐受中的主导作用需更多验证 | 探索巨噬细胞LPS耐受的分子机制及其在脓毒症免疫治疗中的应用潜力 | 巨噬细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA | 
| 211 | 2025-10-29 | Single-cell rna sequencing reveals T and B cell-related immune features in foot and mouth disease virus-infected mice 
          2025-Oct-27, Virulence
          
          IF:5.5Q1
          
         
          DOI:10.1080/21505594.2025.2580141
          PMID:41144693
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中T细胞和B细胞的免疫特征 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示口蹄疫病毒感染期间T细胞和B细胞的组成变化、基因表达特征、细胞间通讯状态和调控网络 | 研究仅针对小鼠模型,结果向其他物种的推广需进一步验证 | 探究口蹄疫病毒感染过程中适应性免疫反应的特征 | 口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中的T细胞和B细胞 | 单细胞组学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 口蹄疫病毒感染组和模拟感染对照组小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 212 | 2025-10-29 | The CXCL12-CXCR4 Axis Mediates Lymphocyte Immune Overactivation in IgG4-Related Chronic Rhinosinusitis 
          2025-Oct-27, Allergy
          
          IF:12.6Q1
          
         
          DOI:10.1111/all.70124
          PMID:41144786
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IgG4相关慢性鼻窦炎中CXCL12-CXCR4轴介导淋巴细胞免疫过度激活的机制 | 首次在单细胞水平揭示IgG4相关慢性鼻窦炎的转录组变化,发现CXCL12-CXCR4轴在免疫细胞过度激活中的关键作用 | 样本量较小(仅5例患者),需要更大规模研究验证 | 阐明IgG4相关慢性鼻窦炎的发病机制 | IgG4相关慢性鼻窦炎患者的鼻黏膜组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多色免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 组织图像 | 5例患者样本+3个已发表对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 213 | 2025-10-29 | CD70-Targeting CAR-NK Cells Overcome BCMA Downregulation and Improve Survival in High-Risk Multiple Myeloma Models 
          2025-Oct-27, Blood cancer discovery
          
          IF:11.5Q1
          
         
          DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0130
          PMID:41144785
         | 研究论文 | 本研究开发了靶向CD70的CAR-NK细胞疗法,可克服BCMA下调并在高危多发性骨髓瘤模型中提高生存率 | 首次证明CD70在高危多发性骨髓瘤中高表达且与不良预后相关,并开发了包含CD27和IL-15的CAR-NK细胞疗法 | 临床前研究阶段,需通过临床试验进一步验证疗效和安全性 | 开发针对高危多发性骨髓瘤的新型免疫疗法 | 多发性骨髓瘤患者样本和细胞模型 | 免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | CAR-NK细胞, CAR-T细胞 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 两个多发性骨髓瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 214 | 2025-10-29 | Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis 
          2025-Oct-27, Diabetes, obesity & metabolism
          
         
          DOI:10.1111/dom.70239
          PMID:41144938
         | 研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析识别出糖尿病多发性神经病变的潜在药物靶点 | 首次将TNFRSF14确定为糖尿病多发性神经病变的潜在治疗靶点,并通过单细胞测序揭示其致病机制 | NA | 识别糖尿病多发性神经病变的新药靶点以提高治疗效果 | 糖尿病多发性神经病变患者及相关蛋白质 | 生物医学 | 糖尿病多发性神经病变 | 血浆蛋白质组学, 单细胞测序, 遗传分析 | NA | 蛋白质组数据, 遗传数据, 临床数据 | 大型前瞻性队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 
| 215 | 2025-10-29 | Improved reconstruction of single-cell developmental potential with CytoTRACE 2 
          2025-Oct-27, Nature methods
          
          IF:36.1Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41592-025-02857-2
          PMID:41145665
         | 研究论文 | 开发了CytoTRACE 2深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据预测细胞发育潜能 | 提出了可解释的深度学习框架,在多种平台和组织中优于先前方法,能够详细绘制单细胞分化图谱 | NA | 预测细胞的绝对发育潜能,即细胞分化为其他细胞类型的能力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 216 | 2025-10-29 | CSF1R and macrophage infiltration: Integrated magnetic resonance imaging radiomics and deep learning-driven models for the preoperative assessment of glioma 
          2025-Oct-27, Chinese medical journal
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1097/CM9.0000000000003827
          PMID:41146428
         | 研究论文 | 本研究开发了基于磁共振影像组学和深度学习的CSF1R预测模型,用于术前评估胶质瘤 | 首次整合传统影像组学特征和深度学习特征构建CSF1R预测模型,并系统验证其与巨噬细胞浸润的关联 | 样本量相对有限,特别是单细胞测序样本较少(n=2),需要更大规模验证 | 开发非侵入性术前预测胶质瘤CSF1R水平的影像学方法 | 胶质瘤患者 | 医学影像分析 | 胶质瘤 | 磁共振成像、影像组学、深度学习、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 支持向量机、随机森林、朴素贝叶斯等12种机器学习分类器 | 磁共振图像、基因表达数据、免疫组化数据、单细胞测序数据 | 477例患者(训练集64例,内部测试38例,外部验证101例,生存分析255例,免疫组化16例,单细胞测序2例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 217 | 2025-10-29 | In vitro models of cancer-associated fibroblast heterogeneity uncover subtype-specific effects of CRISPR perturbations 
          2025-Oct-27, Molecular oncology
          
          IF:5.0Q1
          
         
          DOI:10.1002/1878-0261.70153
          PMID:41146557
         | 研究论文 | 开发了能够可靠代表肿瘤中观察到的癌症相关成纤维细胞表型的共培养模型,并利用单细胞转录组学分析CAF亚型异质性 | 建立了能够模拟肿瘤微环境中CAF表型的可转化共培养模型系统,并首次系统评估了CRISPR扰动对不同CAF亚型的特异性影响 | 研究主要基于胰腺癌患者的CAF细胞系,模型系统的可转化性仍需进一步验证 | 研究癌症相关成纤维细胞亚型异质性及其对CRISPR扰动的特异性响应 | 胰腺癌患者来源的原代CAF和永生化肿瘤细胞系 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, CRISPR基因编辑 | 共培养模型 | 单细胞RNA测序数据 | 胰腺癌患者来源的CAF细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 218 | 2025-10-29 | Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment 
          2025-Oct-25, Neuro-oncology
          
          IF:16.4Q1
          
         
          DOI:10.1093/neuonc/noaf248
          PMID:41137658
         | 研究论文 | 开发了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,用于研究胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调节 | 首次将人血浆样培养基与稳定同位素示踪技术结合,在体外模型中保留了肿瘤微环境的完整性 | 体外模型仍无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫系统的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 癌症代谢研究 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪, 空间转录组学 | 体外培养模型 | 代谢组数据, 转录组数据 | 人IDH野生型胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 219 | 2025-10-29 | Clinical and translational study of ivosidenib plus nivolumab in advanced solid tumors harboring IDH1 mutations 
          2025-Oct-25, The oncologist
          
         
          DOI:10.1093/oncolo/oyaf362
          PMID:41138165
         | 研究论文 | 评估ivosidenib联合nivolumab在携带IDH1突变的晚期实体瘤中的临床活性和转化研究 | 首次在临床研究中验证IDH1抑制剂联合PD-1抗体在mIDH1实体瘤中的免疫调节作用 | 样本量较小(n=15),临床获益有限 | 评估ivosidenib联合nivolumab在mIDH1晚期实体瘤中的初步疗效和安全性 | 携带IDH1突变的晚期或难治性实体瘤患者 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 药效学、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 临床数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 15例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 220 | 2025-10-29 | Deciphering lactate/lactylation networks in AML: integrated scRNA-seq and transcriptomics reveal functions and prognostic model 
          2025-Oct-25, BMC cancer
          
          IF:3.4Q2
          
         
          DOI:10.1186/s12885-025-14938-8
          PMID:41139200
         | 研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组学数据,揭示乳酸/乳酸化网络在急性髓系白血病中的功能并构建预后模型 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统研究乳酸代谢和组蛋白乳酸化在AML中的预后价值,并构建了基于机器学习的7基因预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能实验验证机制 | 探索乳酸/乳酸化相关基因在急性髓系白血病中的预后价值和分子机制 | 急性髓系白血病患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Western blot | 10种机器学习算法构建的预后模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |