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当前共找到 32645 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-11-15 |
Integrated multi-omic analysis unravels the characteristics of the metabolism-related intratumoral microbes and establishes a novel signature for predicting prognosis and therapeutic response in lung adenocarcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-357
PMID:41234824
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了肺腺癌中代谢相关瘤内微生物的特征，并建立了一个预测预后和治疗反应的新型标志物 | 首次系统鉴定肺腺癌中代谢相关瘤内微生物，建立基于微生物丰度的预后预测标志物，并揭示其与肿瘤微环境的关联 | 基于公共数据集的分析，需要实验验证；样本量有限；机制研究不够深入 | 探究肺腺癌中代谢相关瘤内微生物的特征及其在预后预测和治疗反应中的作用 | 肺腺癌患者样本和相关的微生物组、转录组数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 微生物组分析，bulk RNA-seq，单细胞RNA-seq，多组学整合分析 | 无监督聚类，Scissor算法，预后预测模型 | 微生物组数据，转录组数据，单细胞数据 | 公共数据集中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq，微生物组分析 | NA | NA |
| 202 | 2025-11-15 |
The role of liquid-liquid phase separation in hepatocellular carcinoma: single-cell analysis and identification of prognostic biomarkers
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-726
PMID:41234822
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了液-液相分离相关特征(LLPSRS)模型，用于预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应 | 首次在单细胞水平系统研究液-液相分离在肝细胞癌中的作用，并构建了9基因预后特征模型 | 研究主要基于TCGA数据库，需要更多外部验证数据 | 评估液-液相分离相关特征在肝细胞癌中的预测价值和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，LASSO Cox回归 | 风险预测评分模型，列线图 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，临床数据 | TCGA数据库肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2025-11-15 |
Bulk and single-cell transcriptomics of stomach adenocarcinoma provide prognostic insights via the application of a novel gene signature associated with manganese metabolism
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1826
PMID:41234821
|
研究论文 | 本研究通过分析胃腺癌中锰代谢相关基因，开发了一个预后特征模型 | 首次将锰代谢相关基因应用于胃腺癌预后评估，并基于单细胞RNA测序数据验证关键基因表达 | 研究基于TCGA数据库，需要进一步实验验证 | 探索锰代谢相关基因在胃腺癌预后评估中的作用 | 胃腺癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后评分模型, 聚类分析 | 基因表达数据, 临床信息 | TCGA数据库中的胃腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2025-11-15 |
Prognostic significance of key immune cell functional alterations in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-971
PMID:41234823
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别透明细胞肾细胞癌中的关键免疫细胞功能改变并构建预后模型 | 首次系统揭示ccRCC中CD8+ T细胞和NK细胞的功能极化状态，并开发基于10个免疫相关基因的预后特征模型 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要前瞻性临床研究进一步验证 | 阐明透明细胞肾细胞癌中关键免疫细胞的功能改变及其预后意义 | 透明细胞肾细胞癌患者和肿瘤浸润免疫细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 支持向量机递归特征消除, LASSO回归, 随机森林, Cox回归 | 基因表达数据 | 训练集511例(TCGA-KIRC), 验证集101例(E-MTAB-1980) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2025-11-15 |
Single-cell analysis revealed a diagnostic model of hepatocellular carcinoma based on cancer stem cell-related gene
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-606
PMID:41234843
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了基于癌症干细胞相关基因的肝细胞癌诊断模型 | 整合单细胞RNA测序数据与DDRTree算法识别癌症干细胞，并构建了4基因预后特征模型 | 模型仅在TCGA和GEO数据集上进行验证，需要进一步临床验证 | 建立可靠的基于癌症干细胞的肝细胞癌预后特征 | 肝细胞癌患者样本 | 单细胞分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析 | 多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA-LIHC队列训练集和两个独立验证数据集(GSE14520-GPL571, GSE14520-GPL3921) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 206 | 2025-11-15 |
Bioinformatics analysis identifies ULK3 as a novel prognostic and immune-related biomarker in esophageal cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-989
PMID:41234868
|
研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定ULK3作为食管癌的新型预后和免疫相关生物标志物 | 首次系统研究ULK3在食管癌中的表达模式、预后价值和免疫调控作用，结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析 | 主要基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探讨ULK3在食管癌预后和肿瘤免疫中的作用 | 食管癌组织和正常组织样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | Cox回归模型,富集分析 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | 多个GEO数据集和TCGA队列，包括179例食管鳞癌和179例正常组织等 | NA | 单细胞RNA测序,基因表达分析 | NA | NA |
| 207 | 2025-11-15 |
A novel manganese metabolism- and immune-related prognostic risk model for acute myeloid leukemia
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-933
PMID:41234859
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于锰代谢和免疫相关基因的预后风险模型，用于预测急性髓系白血病患者的预后 | 首次将锰代谢相关基因与免疫相关基因结合构建AML预后风险模型，并验证了模型在外部数据集中的预测效能 | 研究基于回顾性数据分析，需要进一步的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 建立急性髓系白血病的预后预测模型 | 急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，Cox回归分析，KEGG/GO富集分析 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 208 | 2025-11-15 |
Identification of cancer-associated fibroblast subpopulation and construction of an immunotherapy signature for gastric cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-996
PMID:41234876
|
研究论文 | 通过单细胞测序识别胃癌中癌症相关成纤维细胞亚群并构建免疫治疗特征 | 首次将胃癌微环境中的CAFs分为四个异质性亚群，并发现基于Cluster3的CRS3评分可预测预后和免疫治疗反应 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证和前瞻性临床队列验证 | 识别胃癌中CAFs亚群并评估其预后和免疫治疗相关性 | 胃癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序，生物信息学分析 | 无监督聚类，CIBERSORT算法 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 209 | 2025-11-15 |
Single-cell analysis of tumor microenvironment immune homeostasis and identification of prognostic biomarkers in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-999
PMID:41234874
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫稳态，并鉴定预后生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下揭示HNSCC中T细胞从初始状态到耗竭状态的分化轨迹，并构建基于六个关键基因的预后风险模型 | 预后风险模型的曲线下面积仅为0.66，预测准确性有待提高 | 阐明HNSCC肿瘤微环境中的免疫稳态机制并开发预后评估工具 | 头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是T细胞亚群 | 单细胞分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA-HNSC项目的样本数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-11-15 |
CC/CXC chemokine risk signature at single-cell resolution: a machine learning model for precision stratification in cervical cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1137
PMID:41234865
|
研究论文 | 本研究开发了基于趋化因子相关基因的宫颈癌预后风险特征，并在单细胞分辨率下探索了其临床效用 | 首次构建趋化因子相关基因风险特征，在单细胞分辨率下揭示肿瘤-免疫-基质相互作用 | NA | 开发宫颈癌预后风险特征并探索其临床分层价值 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，机器学习算法 | Cox风险模型，机器学习算法 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | TCGA-CESC队列和GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 211 | 2025-11-15 |
Molecular dynamics simulation and single-cell and spatial transcriptomics validate immune and prognostic biomarkers in colorectal cancer and construct a clinical prognostic model
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-918
PMID:41234880
|
研究论文 | 通过分子动力学模拟、单细胞和空间转录组学验证结直肠癌免疫和预后生物标志物并构建临床预后模型 | 整合分子动力学模拟与单细胞/空间转录组学多维度验证生物标志物，首次发现ULBP2、INHBB和STC2作为结直肠癌关键生物标志物 | 研究样本主要来自TCGA数据库，需要更多独立队列验证模型普适性 | 系统识别结直肠癌免疫和预后相关差异表达基因，构建可靠预后模型 | 698例结直肠癌患者临床和RNA测序数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子动力学模拟, 分子对接 | LASSO, Cox回归, 五种机器学习算法 | 基因表达数据, 临床数据 | 698例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2025-11-15 |
CCT4 as a prognostic biomarker correlated with immune infiltration and hepatocyte dedifferentiation in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1277
PMID:41234881
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据，研究CCT4在肝细胞癌中的生物学功能及其与免疫浸润和肝细胞去分化的关联 | 首次整合单细胞和批量转录组数据揭示CCT4通过促进肝细胞去分化和免疫微环境改变驱动肝癌进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探究CCT4在肝细胞癌中的生物学功能及其临床意义 | 肝细胞癌患者组织和转录组数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | Cox回归模型, 列线图模型 | 转录组数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 213 | 2025-11-15 |
The role of cancer stem cells in the progression of colorectal cancer and the tumor microenvironment: new perspectives from single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analyses
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-586
PMID:41234894
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析结直肠癌干细胞亚型及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术定义结直肠癌干细胞亚型，并发现NPDC1和NSMF作为新型预后标志物 | 机制研究尚不充分，需要进一步实验验证WNT信号通路调控假说 | 阐明结直肠癌干细胞在肿瘤进展中的作用及其与肿瘤微环境的相互作用机制 | 结直肠癌干细胞亚型(Co-CSS)和肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,基因交叉分析 | CytoTRACE | 基因表达数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 214 | 2025-11-15 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveal T cell-related prognostic risk model and tumor immune microenvironment modulation in colorectal cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1104
PMID:41234898
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了结直肠癌中T细胞相关的预后风险模型并研究肿瘤免疫微环境调控 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据，识别T细胞特征基因并构建三基因预后模型 | 使用公共数据库数据，缺乏实验验证和前瞻性临床研究 | 探索结直肠癌中T细胞异质性，构建预后模型预测患者结局和免疫治疗反应 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，Cox回归，LASSO回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | GEO和TCGA数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-11-15 |
Single-cell spatial transcriptomics reveal intraglomerular cell activation and ligand-receptor relationships in chronic, active antibody mediated rejection
2025-Oct-29, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.042
PMID:41173191
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示了慢性活动性抗体介导排斥反应中肾小球内细胞激活状态和配体-受体关系 | 首次在单细胞分辨率下通过空间转录组学技术揭示CAMR中肾小球内细胞特异性激活状态和空间分子相互作用机制 | 样本量相对有限，且仅针对肾脏活检组织进行分析 | 探究慢性活动性抗体介导排斥反应的分子机制和细胞间相互作用 | 肾脏移植活检组织中的肾小球内皮细胞、自然杀伤细胞和巨噬细胞 | 空间转录组学 | 肾脏移植排斥反应 | 空间转录组学，单细胞RNA分析 | 细胞分型、聚类分析、降维分析、差异基因表达分析 | 空间转录组数据，基因表达数据 | CAMR患者和对照组的肾脏活检组织 | Nanostring | 单细胞空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪用于福尔马林固定石蜡包埋肾脏活检组织的单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 216 | 2025-11-15 |
CAT1 modulates hepatic fibrosis via IL-6-mediated inflammatory and fibrogenic pathways in hepatic stellate cells
2025-Oct-27, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120075
PMID:41161609
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研究论文 | 本研究探讨了阳离子氨基酸转运蛋白1（CAT1）通过调控IL-6介导的炎症和纤维化通路在肝纤维化中的作用机制 | 首次揭示CAT1通过IL-6/JAK2/STAT3信号通路调控肝星状细胞活化的分子机制，并证实CAT1-IL-6轴在肝纤维化中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床验证；对CAT1与其他炎症通路的相互作用研究不够深入 | 阐明CAT1在肝纤维化中的作用及其与IL-6介导的炎症和纤维化通路的调控关系 | 肝星状细胞（HSCs）、CCl₄诱导的肝纤维化模型和非酒精性脂肪肝病（NAFLD）模型 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、功能实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2025-11-15 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Oct-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
|
研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术识别了促进免疫治疗反应的肿瘤微环境结构CRATER | 首次在斑马鱼和人类黑色素瘤中发现CRATER结构，揭示了其作为CD8+T细胞与肿瘤细胞相互作用的关键区域 | 研究主要聚焦于黑色素瘤，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索肿瘤微环境中促进免疫治疗成功的特定结构域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | NA | 图像、空间转录组数据 | 斑马鱼和人类黑色素瘤样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学、多重成像 | NA | NA |
| 218 | 2025-11-15 |
Focal Adhesion Kinase-Dependent Reprogramming of IFN-γ Signaling through PYK2 Coinhibition Sensitizes Melanoma to Immune Checkpoint Blockade
2025-Oct-14, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.09.376
PMID:41101630
|
研究论文 | 本研究揭示了黏着斑激酶(FAK)及其同源物PYK2在IFN-γ介导的免疫检查点阻断耐药中的不同作用机制 | 首次阐明FAK作为主要支架蛋白、PYK2作为辅助因子在IFN-γ信号通路中的协同作用，并提出联合抑制策略可增强免疫治疗效果 | 研究主要基于临床前模型，需进一步临床验证；PYK2抑制的最佳程度尚未完全确定 | 探索克服黑色素瘤免疫检查点阻断耐药的新策略 | 黑色素瘤细胞、小鼠模型、临床患者样本 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 无标记磷酸化蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA皮肤黑色素瘤队列、GSE91061临床数据集、抗PD-1耐药小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2025-11-15 |
Single-cell clonal lineage tracing identifies the transcriptional program controlling the cell-fate decisions by neoantigen-specific CD8+ T cells
2025-Oct-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0203
PMID:41081433
|
研究论文 | 通过单细胞克隆谱系追踪揭示新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控程序 | 首次结合单细胞转录组和T细胞受体谱分析，系统描绘了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹 | 研究基于小鼠前列腺癌模型，人类临床样本验证有限 | 解析新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控机制 | 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2025-11-15 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
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研究论文 | 开发了一种多组学单细胞测序方法，用于精确识别CRISPR编辑的疾病变异效应 | 结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞功能基因组学方法 | 未明确说明样本量限制或技术适用范围 | 识别疾病相关非编码等位基因的功能后果并确定因果变异 | 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因 | 功能基因组学 | 自身免疫疾病 | CRISPR-Cas编辑, 多组学单细胞测序 | NA | 基因组DNA, 转录组, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |