单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-09-28	A mouse model of stereotactic radiosurgery-induced neuroinflammation and blood-brain barrier compromise 2025-Sep-24, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-025-02112-x PMID:40993780	研究论文	建立小鼠立体定向放射外科模型，研究放射诱导的神经血管单元损伤机制	首次结合空间转录组学分析放射后神经血管单元各组分的基因表达变化和细胞间通讯	动物模型与人类病理存在物种差异，单次高剂量辐射与临床分次放疗方案不同	阐明立体定向放射外科对神经血管单元的影响机制	小鼠脑组织及神经血管单元（小胶质细胞、星形胶质细胞、内皮细胞）	神经科学	放射性脑坏死	空间转录组学、组织病理学分析	NA	转录组数据、组织学图像	接受15-60 Gy辐射的小鼠脑组织样本
202	2025-09-28	Unveiling the mechanisms of yanhusuo's therapeutic effects in neuropathic pain through network pharmacology, single-cell RNA sequencing, and molecular docking 2025-Sep-24, Hereditas IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s41065-025-00551-z PMID:40993792	研究论文	本研究通过整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接技术，系统揭示延胡索治疗神经病理性疼痛的多靶点作用机制	首次结合单细胞测序与网络药理学分析延胡索抗神经病理性疼痛的免疫细胞互作机制，并通过分子对接验证关键化合物与靶点的结合能力	研究结果主要基于生物信息学预测，需要后续实验验证其生物学功能	阐明延胡索治疗神经病理性疼痛的分子作用机制	神经病理性疼痛患者样本和延胡索活性成分	生物信息学	神经病理性疼痛	网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、生物信息学分析	NA	基因组数据、化合物结构数据	未明确样本数量，包含神经病理性疼痛患者分组样本
203	2025-09-28	JMJD6-driven epigenetic activation of COL4A2 reprograms glioblastoma vascularization via integrin α1β1-dependent PI3K/MAPK signaling 2025-Sep-24, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-025-02114-9 PMID:40993804	研究论文	本研究通过多组学分析发现JMJD6通过表观遗传激活COL4A2，进而通过整合素α1β1依赖的PI3K/MAPK信号通路调控胶质母细胞瘤血管生成	首次揭示JMJD6-COL4A2-ITGA1/ITGB1轴作为胶质母细胞瘤抗血管生成治疗的新靶点	NA	探究胶质母细胞瘤血管生成的分子机制并寻找新的治疗靶点	胶质母细胞瘤细胞和肿瘤相关内皮细胞	肿瘤生物学	胶质母细胞瘤	RNA-seq、单细胞RNA-seq、多组学分析	NA	基因组数据、转录组数据	NA
204	2025-09-28	Comprehensive profiling of immune cell infiltration and biomarker identification in intervertebral disc degeneration 2025-Sep-24, Journal of orthopaedic surgery and research IF:2.8Q1 DOI:10.1186/s13018-025-06250-9 PMID:40993805	研究论文	通过整合生物信息学分析和实验验证，系统描绘了椎间盘退变中的免疫细胞浸润动态并识别了关键治疗靶点	首次结合CIBERSORT、WGCNA和单细胞RNA测序技术全面解析IDD免疫浸润景观，发现术后第14天为免疫浸润高峰，并鉴定VAMP8/JUN为巨噬细胞相关调控因子	研究主要基于大鼠模型和体外实验，人类样本验证不足	揭示椎间盘退变的免疫浸润机制并筛选治疗靶点	大鼠椎间盘组织及髓核细胞	生物信息学	椎间盘退行性疾病	生物信息学分析、scRNA-seq、流式细胞术、Western blot、免疫组化	NA	基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据	公共数据集分析+大鼠椎间盘穿刺模型实验验证
205	2025-09-28	Single-cell RNA sequencing reveals the ameliorative effects of Kai-Xin-San on depression via regulating neuroplasticity and inflammation in the hypothalamus of rats 2025-Sep-24, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2025.09.037 PMID:41005486	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示开心散通过调节下丘脑神经可塑性和炎症改善大鼠抑郁的分子机制	首次运用单细胞RNA测序技术系统解析开心散抗抑郁作用的下丘脑微环境调控机制	研究局限于大鼠模型，人类临床相关性需进一步验证	探究开心散改善抑郁症状的分子作用机制	慢性不可预见温和应激诱导的抑郁模型大鼠	生物医学研究	抑郁症	单细胞RNA测序、分子生物学实验、行为学测试	动物模型	单细胞转录组数据、蛋白质表达数据	45,482个下丘脑细胞（来自对照组、CUMS模型组、开心散治疗组和氟西汀治疗组大鼠）
206	2025-09-28	Loss of RPL22 Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1 Deficient Endometrial Cancers with Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes 2025-Sep-24, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.modpat.2025.100899 PMID:41005533	研究论文	本研究通过免疫组化发现RPL22蛋白缺失可识别MLH1缺陷型子宫内膜癌中免疫细胞浸润较少的特殊亚型	首次揭示RPL22缺失与肿瘤微环境免疫抑制特征的相关性，并开发可临床应用的免疫组化检测方法	未明确RPL22突变与肿瘤突变负荷或PD-L1表达之间的关联机制	探索RPL22在MLH1缺陷型子宫内膜癌免疫调控中的作用	子宫内膜癌组织样本和细胞系	数字病理学	子宫内膜癌	免疫组化、数字空间转录组学、基因敲低	NA	组织切片图像、基因表达数据	子宫内膜癌队列（具体数量未明确）
207	2025-09-28	Macrophage-derived FN1 promotes peritoneal cavity metastasis of gastric cancer by inhibiting the Hippo signaling pathway via SDC4 2025-Sep-24, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120063 PMID:41005547	研究论文	本研究揭示巨噬细胞来源的FN1通过SDC4抑制Hippo信号通路促进胃癌腹膜腔转移的分子机制	首次发现FN1-SDC4轴介导巨噬细胞与胃癌细胞通讯，并阐明其通过抑制Hippo通路促进腹膜转移的新机制	NA	探究FN1在胃癌腹膜腔转移中的功能及分子机制	胃癌细胞系、巨噬细胞、动物模型	肿瘤生物学	胃癌	单细胞测序数据分析、Western blot、MTT法、迁移侵袭实验、克隆形成实验、细胞黏附实验、动物实验	NA	单细胞测序数据、实验数据	使用单细胞数据集GSE140182（具体样本量未明确说明）
208	2025-09-28	Lipid-laden macrophages in atherosclerosis and cancer 2025-Sep-24, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.semcancer.2025.09.007 PMID:41005549	综述	探讨脂质负载巨噬细胞在动脉粥样硬化和癌症中的双重作用及分子机制	通过单细胞RNA测序技术系统比较不同疾病背景下LL-Macs的基因特征差异	存在研究空白需要开发新的LL-TAM靶向疗法	阐明脂质代谢调控巨噬细胞极化在疾病中的作用机制	脂质负载巨噬细胞(LL-Macs)	分子病理学	动脉粥样硬化, 癌症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	NA
209	2025-09-28	Integrating multi-omic Mendelian randomization, microarray, single-cell RNA sequencing, and spatial RNA sequencing to identify potential therapeutic targets for vitiligo 2025-Sep-24, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2025.09.015 PMID:41005615	研究论文	通过多组学孟德尔随机化等方法识别CTSS作为白癜风潜在治疗靶点	首次整合多组学孟德尔随机化、单细胞和空间转录组技术系统筛选白癜风药物靶点	NA	识别白癜风的新型治疗靶点	人类白癜风患者样本（黑色素细胞、晕痣）	生物信息学	白癜风	多组学孟德尔随机化、微阵列、单细胞RNA测序、空间RNA测序	NA	基因组数据、转录组数据、临床样本数据	4,479个可成药基因的QTL数据，结合GWAS Catalog和FinnGen联盟的白癜风GWAS数据
210	2025-09-28	MMP13- and COL11A1-expressing cancer-associated fibroblasts: key drivers of esophageal squamous cell carcinoma progression and prognostic indicators 2025-Sep-24, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology DOI:10.1016/j.labinv.2025.104247 PMID:41005711	研究论文	通过单细胞RNA测序鉴定食管鳞癌中三种肌纤维母细胞性癌症相关成纤维细胞亚型，并揭示MMP13和COL11A1亚型与不良预后的关联	首次报道癌症相关成纤维细胞与食管鳞癌病理分期进展的关联，并发现MMP13和COL11A1两种特异性CAF亚型是预后不良的关键驱动因子	研究样本限于晚期食管鳞癌手术切除标本，未涵盖早期病例	探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞癌进展中的作用及其预后价值	食管鳞癌患者肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞	数字病理	食管癌	单细胞RNA测序、RNA原位杂交	NA	基因表达数据、组织标本	晚期食管鳞癌手术切除标本（具体数量未明确说明）
211	2025-09-28	Human brain cell types shape host-rabies virus transcriptional interactions revealing a preexisting pro-viral astrocyte subpopulation 2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116159 PMID:40864551	研究论文	通过单细胞RNA测序研究狂犬病毒与人脑细胞共培养中的宿主-病毒转录互作	发现存在预先存在的促病毒星形胶质细胞亚群，且解除先天免疫抑制反而增强狂犬病毒转录	研究基于体外共培养模型，未直接验证在体人脑中的情况	揭示先天免疫抑制如何影响不同脑细胞类型中宿主与病毒基因组的转录调控	人脑细胞共培养体系中的不同细胞类型	单细胞转录组学	狂犬病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	人脑细胞共培养样本（具体数量未明确说明）
212	2025-09-28	CD226 identifies effector CD8+ T cells during tuberculosis and costimulates recognition of Mycobacterium tuberculosis-infected macrophages 2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116184 PMID:40886314	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现CD226是区分结核病中效应CD8+T细胞的关键标志物，并证实其参与对结核分枝杆菌感染巨噬细胞的识别	首次在结核病模型中通过scRNA-seq鉴定CD226作为效应CD8+T细胞的关键区分标志，并证明其共刺激功能对感染巨噬细胞识别的重要性	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探究慢性结核感染中肺实质CD8+T细胞的多样性及其识别机制	C57BL/6J小鼠的肺实质CD8+T细胞和结核分枝杆菌感染的巨噬细胞	免疫学	结核病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、IFNγ-EYFP报告基因系统	NA	基因表达数据、细胞功能数据	感染6周和41周的C57BL/6J小鼠肺组织细胞
213	2025-09-28	Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type-specific responses in primary human pancreatic islets 2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116211 PMID:40892543	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究柯萨奇病毒B3感染对人类胰岛不同细胞类型的特异性影响	挑战了关于病毒优先靶向β细胞的传统认知，发现导管细胞表现出最强的免疫反应，并首次揭示长链非编码RNA MIR7-3HG在病毒感染调控中的作用	研究使用尸体来源的胰岛样本，可能无法完全反映活体生理状态	阐明CVB3感染对人类胰岛不同细胞类型的特异性影响及其与1型糖尿病发病机制的关联	人类尸体胰岛样本和干细胞衍生的胰岛细胞	单细胞生物学	1型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	人类尸体胰岛样本（具体数量未明确说明）
214	2025-09-28	Next-gen tools in cancer neuroscience 2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116258 PMID:40934086	综述	本文综述了推动癌症神经科学领域发展的新一代技术工具	系统整合单细胞/空间转录组学、光遗传学、化学遗传学等前沿技术，革新神经系统与癌症相互作用的研究方法	NA	探讨连接肿瘤学与神经科学的关键技术进展	癌症神经科学领域的研究工具与方法	癌症神经科学	癌症	单细胞转录组学、空间转录组学、光遗传学、化学遗传学、工程病毒、神经元活动可视化	NA	NA	NA
215	2025-09-28	Integrated spatial transcriptomic profiling to dissect the cellular characteristics of tumor-associated tertiary lymphoid structures 2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116250 PMID:40934085	研究论文	通过整合23种癌症的空间转录组数据构建泛癌TA-TLS图谱，揭示肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征与形成机制	首次构建泛癌TA-TLS空间转录组图谱，发现CCL19+血管周细胞的成纤维细胞功能及动脉内皮细胞通过Notch信号抑制获得高内皮静脉样表型的新机制	研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有待加强	解析肿瘤相关三级淋巴结构（TA-TLS）的细胞特征、空间组织及其形成成熟机制	23种癌症的肿瘤相关三级淋巴结构	空间转录组学	泛癌研究（多种癌症）	空间转录组学、生物信息学分析、体外实验	NA	空间转录组数据	涵盖23种癌症类型的多癌种数据集
216	2025-09-28	Innate Immune-Cloaked Microgel-Coated Mesenchymal Stromal Cells Reverse Persistent Pulmonary Fibrosis via Reparative Macrophages 2025-Sep-23, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202504590 PMID:40984773	研究论文	本研究开发了一种先天免疫伪装微凝胶包被的间充质基质细胞，用于治疗持续性肺纤维化	通过微凝胶包被和CD47自身标记激动剂功能化，使治疗细胞逃逸组织驻留巨噬细胞的清除，并发现过渡性抗原呈递巨噬细胞亚群介导修复效应	NA	开发新型细胞疗法逆转持续性肺纤维化	间充质基质细胞和肺纤维化模型	组织工程与再生医学	肺纤维化	单细胞RNA测序	细胞工程平台	基因表达数据	NA
217	2025-09-28	Tertiary lymphoid structures in Merkel cell carcinoma facilitate naïve and central memory T-cell infiltration linked to immunotherapy response 2025-Sep-23, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-012224 PMID:40992783	研究论文	本研究通过多组学分析揭示默克尔细胞癌中三级淋巴结构通过招募初始和中央记忆T细胞促进免疫治疗反应的机制	首次在MCC中结合空间转录组学和TCR克隆型映射，证实TLS作为 naïve T细胞进入门户的功能及其与免疫治疗响应的直接关联	样本量较小（27例患者），且为观察性研究难以确立因果关系	阐明三级淋巴结构在默克尔细胞癌免疫微环境中的作用机制	27例接受免疫检查点抑制剂治疗的默克尔细胞癌患者肿瘤组织	数字病理	默克尔细胞癌	转录组测序、多重免疫可视化分析、TCR克隆型映射、空间转录组学、WGCNA	NA	组织样本、转录组数据、空间转录组数据	27例MCC患者治疗前肿瘤样本
218	2025-09-28	Spatial regulation of CD8+ T cells at the HLA-E-NKG2A axis drives HIV persistence in lymph node B cell follicles 2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116181 PMID:40849901	研究论文	本研究通过空间转录组学和高维组织细胞计量技术，揭示了HIV在淋巴结B细胞滤泡中持续存在的免疫调控机制	首次发现HLA-E-NKG2A轴通过空间调控CD8+ T细胞功能驱动HIV免疫逃逸的新机制	研究样本局限于HIV感染者，未涉及其他免疫疾病模型的验证	探究淋巴结B细胞滤泡中HIV病毒库的免疫逃逸机制	HIV感染者的淋巴结组织样本	免疫学	HIV/AIDS	空间转录组学、高维组织细胞计量、FACS分析	NA	空间转录组数据、流式细胞数据、组织切片数据	不同抗逆转录病毒治疗阶段的HIV感染者淋巴结样本
219	2025-09-28	Distinct roles for NF-κB in hematopoietic stem cells and the bone marrow milieu in promoting hematopoietic aging 2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116193 PMID:40875292	研究论文	本研究通过NF-κB活性升高实验模型揭示其在造血衰老中的双重作用机制	首次明确区分NF-κB在造血干细胞自主功能与骨髓微环境中的不同作用，并建立单细胞RNA测序标记框架进行跨物种验证	实验模型为基因修饰小鼠，与自然衰老过程可能存在差异	解析炎症信号通路NF-κB在造血衰老表型形成中的具体作用机制	造血干细胞(HSC)及骨髓微环境	造血干细胞生物学	衰老相关血液疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、表观基因组学、转录组学分析	IκB缺陷小鼠模型	基因表达数据、功能实验数据	小鼠模型及人类HSC数据集（具体数量未明确说明）
220	2025-09-28	Junctional adhesion molecule C limits glioblastoma stem-like cell invasion by regulating integrin adhesion at the endothelial interface 2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116194 PMID:40875295	研究论文	本研究揭示了连接粘附分子C（JAMC）通过调节整合素粘附在胶质母细胞瘤干细胞样细胞（GSCs）与内皮界面相互作用中的关键抑制作用	首次发现JAMC通过调控整合素-SHARPIN轴限制GSCs在内皮界面的粘附和侵袭行为	研究主要基于体外实验和小鼠模型，人类样本验证相对有限	探究胶质母细胞瘤干细胞样细胞与内皮细胞相互作用的分子机制	胶质母细胞瘤干细胞样细胞（GSCs）和内皮细胞	癌症生物学	胶质母细胞瘤	脱细胞基质、共培养、器官型脑切片、空间转录组学、定量蛋白质组学	NA	分子生物学数据、转录组数据、蛋白质组数据	小鼠模型和人类样本（具体数量未明确说明）