单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-09-28	Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress 2021-09-14, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006 PMID:34363749	研究论文	本研究揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下调节心肌细胞适应性生长的重要机制	首次证明特定巨噬细胞亚群来源的IGF-1是心脏适应高血压应激的必需因素，并发现人类心肌病中存在保守的IGF1表达巨噬细胞亚群	NA	探究免疫细胞在高血压引起的心脏适应性生长过程中的作用机制	心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞转录组学、基因命运图谱、诱导性细胞消融	NA	基因表达数据	正常血压和高血压动物模型，人类心肌病样本
202	2025-09-27	Single-cell multi-omics data reveal heterogeneity in liver tissue microenvironment induced by hypertension 2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids DOI:10.1016/j.omtn.2025.102696 PMID:40989794	研究论文	通过单细胞多组学技术揭示高血压诱导的肝脏组织微环境异质性	首次结合scRNA-seq、scATAC-seq和组蛋白ChIP-seq技术鉴定高血压相关肝细胞亚群及其调控网络	NA	探究高血压对肝脏细胞亚群微环境的影响机制	高血压模型与正常肝脏组织	生物信息学	心血管疾病	单细胞多组学、scRNA-seq、scATAC-seq、组蛋白ChIP-seq	NA	单细胞测序数据	NA
203	2025-09-27	Single-cell RNA sequencing analysis reveals a novel porcine alveolar macrophage subtype with high SLAMF7 expression promoting PRRSV infection 2025-Dec, Virulence IF:5.5Q1 DOI:10.1080/21505594.2025.2560894 PMID:40944943	研究论文	通过单细胞RNA测序分析发现表达SLAMF7的新型猪肺泡巨噬细胞亚型可促进PRRSV感染	首次通过单细胞测序鉴定出具有高SLAMF7表达的新型猪肺泡巨噬细胞亚型，并证实其在PRRSV感染中的关键作用	体外培养与体内真实环境存在差异，仅部分GO术语和KEGG通路重合	探究PRRSV感染过程中猪肺泡巨噬细胞的异质性及其分子机制	猪肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞	生物信息学	猪繁殖与呼吸综合征	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	未明确具体样本数量（涉及体外培养和新鲜分离的猪肺泡巨噬细胞）
204	2025-09-27	Type I IFN drives neutrophil swarming, impeding lung T cell-macrophage interactions and TB control 2025-Dec-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20250466 PMID:40986319	研究论文	本研究通过比较不同小鼠模型，揭示了I型干扰素在结核感染早期通过促进中性粒细胞聚集而限制CD4+ T细胞浸润的免疫机制	发现相对耐药小鼠早期肺内I型干扰素反应更强，并首次阐明I型干扰素通过调控中性粒细胞群聚影响T细胞-巨噬细胞空间互作的机制	研究局限于小鼠模型，尚未在人类结核感染中验证	探究结核分枝杆菌感染早期决定感染结局的免疫机制	C57BL/6和C3HeB/FeJ小鼠的肺组织免疫细胞	免疫学	结核病	bulk RNA-seq, scRNA-seq	NA	基因表达数据	两种基因型小鼠在感染后数周内的肺组织样本
205	2025-09-27	T Cells Expressing Ras Homolog Family Member a Display Enhanced Cytotoxicity but are Reduced in Lupus Peripheral Blood 2025-Oct, Immunological investigations IF:2.9Q3 DOI:10.1080/08820139.2025.2517364 PMID:40536306	研究论文	本研究探讨系统性红斑狼疮患者T细胞亚群中RhoA蛋白的表达特征及其临床意义	首次揭示RhoA+ T细胞具有增强的细胞毒性功能，并发现其在狼疮外周血中的异常分布模式	样本量有限且仅针对新诊断患者，缺乏纵向随访数据	探索RhoA在狼疮T细胞亚群中的表达规律和临床诊断价值	系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血T细胞	免疫学	系统性红斑狼疮	流式细胞术、单细胞RNA测序、ROC曲线分析	NA	流式细胞数据、基因表达数据	新诊断SLE患者与年龄性别匹配的健康对照者外周血样本
206	2025-09-27	Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence 2025-Sep-26, Expert review of clinical immunology IF:3.9Q2 DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589 PMID:40999941	综述	本文综述单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展	利用单细胞技术发现新型免疫细胞亚群（如GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞）及其相互作用网络	尚未建立完善的动物模型，空间转录组/蛋白质组学等新技术应用有待深入	阐明IgG4-RD的免疫发病机制并为精准治疗提供新靶点	浆母细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞等免疫细胞及成纤维细胞	免疫病理学	IgG4相关疾病	单细胞RNA测序、高度多重免疫荧光	NA	单细胞转录组数据、免疫荧光图像数据	NA
207	2025-09-27	Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury 2025-Sep-26, Global spine journal IF:2.6Q1 DOI:10.1177/21925682251383489 PMID:41001708	研究论文	本研究探讨芦丁和奥奇那黄酮通过调控PI3K/AKT和NF-κB信号通路减轻脊髓损伤后神经炎症和神经元凋亡的机制	首次结合单细胞RNA测序和网络药理学揭示两种黄酮类化合物的协同神经保护作用，并发现其通过抑制PI3K/AKT/NF-κB通路磷酸化发挥作用	研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；分子机制研究尚未涉及其他潜在信号通路	阐明芦丁和奥奇那黄酮在脊髓损伤中的神经保护机制	小鼠脊髓损伤模型、BV2小胶质细胞系、小胶质细胞-神经元共培养系统	神经药理学	脊髓损伤	单细胞RNA测序、网络药理学、Western blot、免疫荧光、ELISA	动物疾病模型、细胞模型	基因表达数据、蛋白质数据、细胞影像数据	小鼠模型及细胞实验样本（具体数量未明确说明）
208	2025-09-27	Immunoregulatory Roles of Tumor-Originated Pericytes Identified by Single-Cell Analysis in Glioblastoma 2025-Sep-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202511856 PMID:41001759	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示胶质母细胞瘤中肿瘤源性周细胞的免疫调节功能	首次在胶质母细胞瘤中鉴定出具有CD44标记的肿瘤源性周细胞亚群，并发现其通过促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化调控肿瘤微环境	研究主要基于单细胞测序数据分析，需要进一步实验验证具体分子机制	探究胶质母细胞瘤中周细胞的起源和功能异质性	人类原发性胶质母细胞瘤样本中的CD146阳性周细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	人类原发性GBM样本和公共单细胞数据库数据
209	2025-09-27	Time-Series Transcriptomics Identifies Xanthine Dehydrogenase in Injured Neurons Correlated With Orthodontic Pain 2025-Sep-26, Orthodontics & craniofacial research IF:2.4Q2 DOI:10.1111/ocr.70036 PMID:41002069	研究论文	通过时间序列转录组学鉴定正畸疼痛中受损神经元内的黄嘌呤脱氢酶表达机制	首次结合bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq数据揭示Xdh在Atf3+受损神经元中的动态表达模式，并开发交互式分析平台	研究局限于小鼠模型，尚未进行临床验证	解析正畸牙齿移动疼痛的分子细胞机制	小鼠三叉神经节神经元	神经科学	口腔疼痛	RNA-seq、单细胞RNA-seq、qPCR、免疫荧光、micro-CT	NA	转录组数据、行为学数据	小鼠正畸疼痛模型（具体数量未明确说明）
210	2025-09-27	Increased AIF-1-mediated p38 MAPK phosphorylation in the mid-secretory endometrium impairs endometrial receptivity in women with recurrent implantation failure 2025-Sep-26, Human reproduction (Oxford, England) DOI:10.1093/humrep/deaf174 PMID:41003697	研究论文	本研究探讨AIF-1通过p38 MAPK磷酸化影响复发性种植失败患者子宫内膜容受性的机制	首次揭示AIF-1在RIF患者子宫内膜基质细胞中通过p38 MAPK磷酸化途径抑制细胞增殖和蜕膜化的分子机制	AIF-1在子宫内膜巨噬细胞中对胚胎植入的作用尚不明确	探究AIF-1对复发性种植失败患者子宫内膜容受性的影响机制	复发性种植失败患者和生育能力正常女性的子宫内膜组织、人子宫内膜基质细胞系、CD-1小鼠模型	生殖医学	复发性种植失败	单细胞RNA测序、定量PCR、Western blot、免疫组化、免疫荧光、RNA测序、基因过表达和沉默技术	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据、组织切片图像	18例RIF患者和18例对照患者的分泌中期子宫内膜样本，另加30例对照患者月经周期五个不同阶段的子宫内膜样本
211	2025-09-27	Integrated multi-omics analysis reveals PTM networks as key regulators of colorectal cancer progression and immune evasion 2025-Sep-26, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-03445-8 PMID:41003898	研究论文	通过多组学分析揭示翻译后修饰网络作为结直肠癌进展和免疫逃逸的关键调控因子	首次全面整合多组学数据揭示PTM网络在CRC中的核心作用，发现GALNT6介导的糖基化通过PD-L1稳定化驱动免疫逃逸，并建立5基因PTM活性特征	研究主要基于回顾性队列数据，需要进一步实验验证PTM网络的功能机制	探索翻译后修饰在结直肠癌进展和免疫逃逸中的综合调控作用	结直肠癌患者组织样本和细胞数据	生物信息学	结直肠癌	多组学整合分析（RNA-seq、单细胞转录组、孟德尔随机化）、机器学习（LASSO/SVM/Random Forest）、空间转录组学	机器学习模型（LASSO/SVM/Random Forest）	基因组学数据、转录组学数据	1,783例批量RNA-seq样本（来自GEO/TCGA数据库），41,143个单细胞
212	2025-09-27	Multi-omics analysis reveals the prognostic value and immunomodulatory role of CTSW in breast cancer 2025-Sep-26, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-03550-8 PMID:41003895	研究论文	通过多组学分析揭示CTSW基因在乳腺癌中的预后价值及免疫调节作用	首次采用多组学框架系统研究CTSW在乳腺癌免疫微环境中的功能质量而不仅是数量指标	基于生物信息学分析的发现需要未来实验验证	探索乳腺癌新型生物标志物和治疗靶点	乳腺癌患者基因表达数据和免疫微环境	生物信息学	乳腺癌	转录组学、甲基化组学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序	Cox回归、Kaplan-Meier生存分析	基因组数据、表观遗传数据、临床数据	基于公共数据库的多组学数据集（未明确具体样本数）
213	2025-09-27	Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness 2025-Sep-25, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adl1988 PMID:40997217	研究论文	本研究通过表观基因组分析技术鉴定了一类响应机械微环境的基因组增强子——机械增强子	首次系统性地识别了能够响应基质硬度变化的机械敏感性基因组增强子，并证明通过表观基因组编辑可重编程细胞对机械微环境的响应	NA	探索机械微环境如何通过表观遗传机制精确调控基因转录	肺成纤维细胞（来自健康供体和纤维化患者）	表观遗传学	肺纤维化	全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑、单细胞RNA-seq CRISPR筛选	NA	基因组表观遗传数据、单细胞转录组数据	NA
214	2025-09-27	High Treg and PMN-MDSC densities are a hallmark of tertiary lymphoid structures in fatal cases of cervical cancer 2025-Sep-25, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-012613 PMID:40998518	研究论文	本研究通过比较HPV相关头颈鳞癌和宫颈癌中三级淋巴结构(TLS)的密度与组成，揭示TLS组成（而非数量）与宫颈癌患者预后的关联	首次发现宫颈癌中TLS的高Treg和PMN-MDSC浸润特征与患者死亡相关，并揭示PMN-MDSC通过精氨酸酶1抑制T细胞功能的机制	样本来源限于两种HPV相关癌症，未验证其他癌症类型的普适性	探究TLS在不同HPV相关癌症中对免疫微环境调控及预后的差异影响	宫颈癌(CESC)和头颈鳞癌(HNSCC)患者组织样本	肿瘤免疫学	宫颈癌	多重免疫荧光、免疫组化、空间转录组、流式细胞术	NA	组织切片、流式细胞数据	未明确样本数量的宫颈癌和头颈鳞癌患者组织
215	2025-09-27	Change in brain molecular landscapes following electrical stimulation of the nucleus accumbens 2025-Sep-25, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology IF:6.6Q1 DOI:10.1038/s41386-025-02241-w PMID:40999234	研究论文	本研究利用空间转录组学技术探究小鼠伏隔核深部脑刺激引起的脑内分子景观变化	首次应用高分辨率空间转录组学(Stereo-seq)在单细胞水平解析NAc DBS诱导的神经环路分子机制	研究局限于小鼠模型，临床转化意义需进一步验证	揭示伏隔核深部脑刺激治疗神经精神疾病的分子机制	小鼠脑组织及伏隔核神经环路	神经科学	神经精神疾病（抑郁、焦虑、成瘾）	空间转录组学(Stereo-seq)、深部脑刺激(DBS)	动物模型（小鼠）	空间基因表达数据	随机分组的刺激组与假手术组小鼠样本
216	2025-09-27	MAN1A1 promotes colorectal cancer liver metastasis by maintaining TGFBR2 protein stability 2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1 DOI:10.3724/abbs.2025164 PMID:40999906	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析发现MAN1A1通过维持TGFBR2蛋白稳定性促进结直肠癌肝转移	首次揭示高尔基体糖基化酶MAN1A1通过调控TGFBR2蛋白稳定性驱动结直肠癌肝转移的具体分子机制	未明确MAN1A1介导的糖基化修饰对TGFBR2蛋白稳定的具体作用位点	探究结直肠癌肝转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点	结直肠癌细胞系及临床患者样本	癌症生物学	结直肠癌	单细胞RNA测序、基因操作、transwell实验	NA	基因表达数据、蛋白质稳定性数据	公共数据库单细胞RNA测序数据及结直肠癌细胞系
217	2025-09-27	Single-cell transcriptomics reveals apolipoprotein A4-mediated metabolic-immune reprogramming in lymphocytes during early obesity-related chronic kidney disease 2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1 DOI:10.3724/abbs.2025171 PMID:40999903	研究论文	本研究通过单细胞转录组学揭示载脂蛋白A4在肥胖相关慢性肾病早期淋巴细胞代谢-免疫重编程中的关键调控作用	首次在单细胞水平系统阐明Apoa4通过调控转录因子网络和细胞间信号通路维持淋巴细胞代谢-免疫稳态的新机制	研究局限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探究Apoa4在肥胖诱导的慢性肾病早期免疫细胞代谢和功能调控中的作用	野生型和Apoa4基因敲除小鼠的肾脏淋巴细胞	单细胞组学	慢性肾病	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光染色、qPCR	基因敲除动物模型	单细胞转录组数据	野生型和Apoa4-KO小鼠的高脂饮食诱导肥胖模型
218	2025-09-27	Single-cell RNA sequencing across diverse cell types to identify PFOA-induced ovarian cellular senescence 2025-Sep-24, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119089 PMID:40997563	研究论文	通过单细胞RNA测序研究PFOA暴露诱导小鼠卵巢细胞衰老的机制	首次从细胞衰老角度揭示PFOA卵巢毒性的单细胞水平机制，发现卵丘细胞对PFOA诱导的耗竭特别敏感	研究仅使用小鼠模型，人类相关性需进一步验证	探究PFOA暴露导致卵巢功能障碍的细胞机制	雌性ICR小鼠的卵巢组织细胞	单细胞组学	生殖功能障碍	单细胞RNA测序	动物模型	单细胞转录组数据	29,000+个细胞，包含8种不同细胞群体
219	2025-09-27	TRIB3 promotes endometrial cancer progression through interacting with E2F1 and enhancing PKM2-mediated tumor glycolysis 2025-Sep-24, Gynecologic oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.ygyno.2025.09.008 PMID:40997650	研究论文	本研究探讨了TRIB3通过稳定E2F1和增强PKM2转录促进子宫内膜癌进展的机制	首次揭示TRIB3-E2F1-PKM2信号轴在子宫内膜癌糖酵解和恶性进展中的关键作用，并发现吲达帕胺可作为TRIB3抑制剂	NA	探索TRIB3对子宫内膜癌的影响及其潜在分子机制	子宫内膜癌组织和细胞系	癌症生物学	子宫内膜癌	单细胞RNA测序、免疫组化、qRT-PCR、Western blot、Co-IP、双荧光素酶报告基因、免疫荧光、泛素化实验、ChIP	NA	基因组数据、蛋白质数据、细胞实验数据、动物模型数据	TCGA数据库数据、人类子宫内膜癌及癌旁组织样本、异种移植小鼠模型
220	2025-09-27	Inflammatory, transcriptomic, and cell fate responses underlying the mammalian transmission of avian influenza viruses 2025-Sep-23, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.00647-25 PMID:40778772	研究论文	本研究通过雪貂鼻上皮细胞对H1N1禽流感病毒的反应，揭示了与病毒空气传播能力相关的宿主应答机制	首次系统揭示了鼻上皮细胞中基因毒性应激、NF-κB信号通路和细胞命运通路等宿主应答与禽流感病毒传播能力的关联	研究仅限于雪貂模型，尚未在人类中验证；机制性研究需要进一步深入	探究禽流感病毒在哺乳动物呼吸道传播的宿主决定因素	雪貂鼻上皮细胞对H1N1禽流感病毒株的应答	病毒学	禽流感	单细胞转录组学	NA	转录组数据	使用一组H1N1禽流感病毒株感染的雪貂鼻上皮细胞样本