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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-05-01 |
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-04-28, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101214
PMID:42055852
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2026-05-01 |
Deep profiling of lupus nephritis kidneys reveals dynamic changes in myeloid cells associated with disease progression
2026-Apr-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.004
PMID:42055919
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学深度分析狼疮性肾炎肾脏,揭示与疾病进展相关的髓系细胞动态变化 | 首次大规模结合scRNA-seq和空间转录组学,系统描绘狼疮性肾炎肾脏中髓系细胞亚群的动态变化及其与组织损伤和炎症的关系 | 未明确说明,但样本量有限(6例LN患者和2例对照用于空间转录组学) | 探究狼疮性肾炎中髓系细胞介导的免疫反应及其与组织学异质性的关联 | 狼疮性肾炎患者的肾脏样本(156例患者和30例健康对照用于scRNA-seq;6例患者和2例对照用于空间转录组学) | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 156例LN患者和30例健康对照(scRNA-seq),6例LN患者和2例对照(空间转录组学) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 203 | 2026-05-01 |
Correction: Kobayashi et al. Pathogenesis of Graves' Disease Determined Using Single-Cell Sequencing with Thyroid Autoantigen Peptide Stimulation in B Cells. Cells 2025, 14, 1102
2026-Apr-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090751
PMID:42059808
|
更正 | 对Kobayashi等人2025年发表论文的作者名单进行更正,补充遗漏的作者 | 无 | 无 | 更正论文作者信息 | 论文作者 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2026-05-01 |
Diabetes-induced TREM2-endothelial cell signaling impairs ischemic vascular repair
2026-Apr-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adu3761
PMID:42018669
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析糖尿病诱导的TREM2-内皮细胞信号对缺血性血管修复的损害机制 | 首次构建人类糖尿病血管的单细胞和空间分辨率转录组与互作组图谱,鉴定TREM2-内皮细胞相互作用是糖尿病血管病变的关键驱动因素 | 未明确说明研究的局限性 | 探索糖尿病加速血管疾病(如外周动脉疾病)的细胞和分子机制,特别是内皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 人类肠系膜动脉组织(来自非糖尿病和2型糖尿病供体)、糖尿病小鼠后肢缺血模型 | 数字病理学 | 糖尿病、外周动脉疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类肠系膜动脉组织来自非糖尿病和2型糖尿病供体;糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 205 | 2026-05-01 |
Neutrophil-derived reactive oxygen species and bystander tissue damage in inflammatory bowel disease
2026-Apr-22, Free radical biology & medicine
|
综述 | 探讨中性粒细胞来源的活性氧在炎症性肠病中旁观者组织损伤的作用机制 | 整合了氧化还原蛋白质组学、空间转录组学、活体成像和单细胞分析等最新技术,揭示了中性粒细胞氧化损伤并非不可规避的炎症副产物,而是动态、情境依赖且具有治疗靶向潜力的过程 | 未明确指出具体的实验数据或临床验证,属于文献综述,缺乏原创实验证据 | 综述中性粒细胞氧化自由基生物学在胃肠道黏膜中的知识,评估减轻旁观者损伤同时保留宿主防御的治疗策略 | 中性粒细胞及其在炎症性肠病中产生的活性氧和活性氮物种 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 氧化还原蛋白质组学, 空间转录组学, 活体成像, 单细胞分析 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台,Illumina NovaSeq测序系统 |
| 206 | 2026-05-01 |
Metabolic reprogramming and signalling networks in microglial activation: Implications for neurodegeneration
2026-Apr-22, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103138
PMID:42031319
|
评论 | 综述小胶质细胞激活中的代谢重编程和信号网络,及其在神经退行性疾病中的作用 | 提出将小胶质细胞激活视为代谢-炎症整合网络,并强调炎症消退失败而非持续激活是慢性神经炎症的关键 | 代谢抑制剂的临床不可行性,需转向TREM2免疫调节剂和消退激动剂 | 整合单细胞转录组学、空间蛋白质组学和代谢组学,提供小胶质细胞激活的综合视角 | 小胶质细胞,特别是疾病相关小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2026-05-01 |
From inflammation to malignancy: the dynamic evolution of cancer-associated fibroblasts in IBD-CRC
2026-Apr-21, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101310
PMID:42019096
|
综述 | 提出炎症相关结直肠癌中成纤维细胞从炎症到恶变动态演化的概念框架 | 提出“基质炎症记忆”假说,揭示PFKFB3介导的糖酵解转变和aPKC缺失驱动的上皮-基质互作机制 | 部分机制(如基质炎症记忆)仍处于假说阶段,缺乏直接实验证据验证 | 阐明炎症性肠病相关结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的动态演化及其在肿瘤微环境中的作用 | 肠道成纤维细胞、癌症相关成纤维细胞亚群(iCAF、myCAF、apCAF) | 机器学习 | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2026-05-01 |
Deciphering IFN signaling in gastric cancer: A single-cell and bulk transcriptomic integration reveals CXCR4 as a key immunomodulator and prognostic determinant
2026-Apr-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102778
PMID:42019279
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学整合,解析胃癌中干扰素信号通路,发现CXCR4作为关键免疫调节因子和预后决定因子 | 首次在单细胞分辨率下深入解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号网络,并识别出CXCR4作为与干扰素信号紧密相关的关键免疫调节因子和预后生物标志物 | 研究主要基于公开数据集和体外细胞实验,缺乏体内验证和临床队列的进一步证实 | 解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号通路的作用,识别可干预的靶点以优化免疫治疗策略 | 胃癌患者的肿瘤组织样本及AGS胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、qRT-PCR、Western blot、流式细胞术、CCK-8、Transwell、划痕实验 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌患者样本数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2026-05-01 |
Transcriptome and single-cell RNA sequencing data identify and validate candidate biomarkers associated with lysosomal and ferroptosis in osteoarthritis
2026-Apr-21, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2026.113141
PMID:42025819
|
研究论文 | 通过转录组和单细胞RNA测序数据识别并验证骨关节炎中与溶酶体和铁死亡相关的候选生物标志物SLC7A5和SLC3A2 | 首次同时整合溶酶体相关基因和铁死亡相关基因,通过多组学分析识别骨关节炎的候选生物标志物,并利用单细胞测序鉴定成纤维细胞为关键细胞类型 | 需要进一步的实验和临床验证以确认这些生物标志物的实际应用价值 | 识别骨关节炎中与溶酶体功能和铁死亡相关的候选生物标志物,为后续实验研究提供理论基础 | 骨关节炎患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习和生物信息学 | 骨关节炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 机器学习 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 公共数据库中的骨关节炎数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2026-05-01 |
RARG promotes gastric cancer progression by activating PMEPA1 transcription and Wnt/β-catenin signalling
2026-Apr-21, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112552
PMID:42025891
|
research paper | 本研究揭示了RARG通过转录激活PMEPA1及增强Wnt/β-catenin信号通路促进胃癌进展的机制 | 首次发现RARG作为PMEPA1的转录调控因子,并通过双重机制(转录激活PMEPA1和直接结合β-catenin)促进胃癌进展 | 研究中未阐述RARG在胃癌微环境中的免疫调控作用,且临床样本验证规模有限 | 探究RARG在胃癌中的功能及其下游调控机制 | 胃癌细胞系、胃癌临床组织样本、小鼠模型 | machine learning | 胃癌 | CUT&Tag测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 胃癌组织样本(未明确数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组分析 |
| 211 | 2026-05-01 |
Immunoregulatory mechanisms underlying vitexin-mediated attenuation of concanavalin A-induced liver injury
2026-Apr-21, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158231
PMID:42054738
|
研究论文 | 本研究利用单细胞策略,结合质谱流式技术和单细胞RNA测序,系统解析了山奈酚苷在ConA诱导的小鼠自身免疫性肝炎模型中的免疫调节机制 | 首次整合CyTOF和scRNA-seq技术,从单细胞层面全面揭示山奈酚苷对T细胞亚群的重编程作用,特别是其在Runx2+CD4+效应T细胞和Cxcr6+CD4+组织驻留记忆T细胞中抑制IFN信号的新机制 | NA | 阐明山奈酚苷在自身免疫性肝炎中的免疫调节机制及其治疗潜力 | ConA诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型的肝免疫微环境 | 计算生物学 | 自身免疫性肝炎 | 质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2026-05-01 |
Single-Cell sequencing investigation of endoplasmic reticulum stress-related genes in gastric cancer prognostic models and identification of NOX5 as a novel therapeutic target
2026-Apr-20, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102780
PMID:42013548
|
研究论文 | 利用单细胞测序研究内质网应激相关基因在胃癌预后模型中的作用,并鉴定NOX5为新治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析构建基于内质网应激的胃癌预后模型,并发现NOX5作为新潜在治疗靶点 | NA | 开发基于单细胞分析的内质网应激相关预后标志物,并鉴定潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和MKN-45 | 机器学习,自然语言处理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 213 | 2026-04-20 |
Deciphering immune and cellular reprogramming during the progression from inflammatory bowel disease to colorectal cancer using multi-omics single-cell and spatial transcriptomics
2026-Apr-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08158-2
PMID:42001187
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2026-05-01 |
A self-perpetuating cycle of Type H vessel proliferation and T-2 induced inflammation drives KBD pathogenesis
2026-Apr-16, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2026.04.004
PMID:42000119
|
研究论文 | 本研究探讨了T-2毒素诱导的H型血管增殖与炎症在大骨节病(KBD)发病机制中的作用,并验证了其形成自循环驱动KBD进展 | 首次发现H型血管在大骨节病发病中的关键中介作用,揭示了T-2毒素运输、炎症与软骨损伤之间的恶性循环机制 | 未明确说明 | 探究H型血管在大骨节病(KBD)发病机制中的作用 | 大鼠KBD模型、H型血管 | 机器学习 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qPCR、免疫荧光、组织病理学 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 大鼠分为四组:对照组、低硒+T-2组、低硒+T-2+Roxadustat组、低硒+T-2+Halofuginone组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 215 | 2026-05-01 |
Cholangiocyte Biology in Primary Sclerosing Cholangitis and Other Cholangiopathies: Pathogenesis, Clinical Insights, and Experimental Tools
2026-Apr-13, Physiological reviews
IF:29.9Q1
DOI:10.1152/physrev.00022.2025
PMID:41973609
|
综述 | 本文综述了胆管细胞在原发性硬化性胆管炎及其他胆管疾病中的生物学特性,包括其发育、功能可塑性、分泌、吸收和细胞信号传导作用,并探讨了发病机制、临床见解及实验工具 | 整合了胆管细胞异质性与可塑性的最新发现,结合了类器官培养、单细胞转录组学、表观基因组学和空间组学等新技术对胆管病理生理学的转变性理解 | 未提及具体局限性,但作为综述受限于现有研究的覆盖范围和所引用研究的质量 | 全面探讨胆管细胞生物学及其在胆管疾病中的角色,特别是原发性硬化性胆管炎的发病机制、临床见解和实验工具 | 胆管细胞及其在胆管疾病(如原发性硬化性胆管炎)中的作用机制 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 类器官培养、单细胞转录组学、表观基因组学、空间组学 | NA | 文本及综述引用的实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 216 | 2026-05-01 |
Locat: Joint enrichment and depletion testing identifies localized marker genes in single-cell transcriptomics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.716370
PMID:41993378
|
研究论文 | 提出一种名为Locat的框架,通过联合评估单细胞转录组数据中基因表达的富集和缺失,识别高度特异性的局部化标记基因 | 传统方法仅关注基因在候选群体内的富集,Locat同时检测表达在群体外是否显著缺失,并整合两者形成统一的局部化评分 | NA | 开发一种新的统计框架,以识别单细胞转录组数据中具有高度空间特异性的标记基因 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2026-05-01 |
Spatial Transcriptomics and Dual Dye Mapping Identify Wnt-Driven BBB Protection in Endothelial EphA4-Deficiency
2026-Apr-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9261231/v1
PMID:41994141
|
研究论文 | 通过空间转录组学和双染料标记技术,揭示EphA4缺失内皮细胞中Wnt信号驱动的血脑屏障保护机制 | 首次结合双染料标记系统与空间转录组学,解析创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的时空动态及EphA4/Wnt信号通路的作用 | 未明确说明局限性 | 研究创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的分子和空间特征,以及EphA4/Wnt信号在保护血脑屏障中的作用 | 内皮细胞特异性EphA4基因敲除小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学, 双染料标记, 免疫组化 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 小鼠样本,具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 218 | 2026-05-01 |
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715992
PMID:41993471
|
研究论文 | 利用人类扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR干扰技术,揭示了衰老通过限制CXCL13+滤泡辅助性T细胞的成熟来影响人类体液免疫 | 首次在人类特异性免疫衰老研究中发现衰老导致CXCL13 GC-Tfh细胞选择性缺失,并鉴定BACH2和SOX4为与年龄相关的分化转录调控因子 | 未明确说明限制条件 | 探究衰老对滤泡辅助性T细胞(Tfh)成熟的影响及其在抗体反应下降中的作用 | T滤泡辅助细胞(Tfh细胞)和B细胞 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序、CRISPR干扰 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 来自年轻和年长供体的人类扁桃体类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2026-05-01 |
Defining the RNA Modification Landscape of Multiple Myeloma Reveals METTL3-Dependent m6A Regulation of NEAT1
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716518
PMID:41993494
|
研究论文 | 通过整合质谱、Nanopore直接RNA测序和甲基化RNA免疫沉淀测序,定义了多发性骨髓瘤的RNA修饰景观,并揭示了METTL3依赖的m6A修饰对NEAT1的调控作用 | 首次系统描绘多发性骨髓瘤中RNA修饰的全景图谱,发现了超过15000个m6A位点,并鉴定了m6A修饰的长链非编码RNA NEAT1在疾病中的关键调控作用 | 未明确提及研究的局限点 | 解析多发性骨髓瘤中的RNA修饰图谱及m6A修饰的长链非编码RNA在疾病中的作用机制 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 质谱, Nanopore直接RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞样本 | Oxford Nanopore Technologies | Nanopore直接RNA测序, 单细胞RNA测序 | Nanopore测序平台 | Nanopore直接RNA测序用于鉴定RNA修饰类型和m6A位点 |
| 220 | 2026-05-01 |
Meningioma cell reprogramming and microenvironment interactions underlie brain invasion
2026-Apr-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf292
PMID:41476144
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示脑膜瘤细胞重编程与微环境相互作用在脑侵袭中的机制 | 首次结合批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学分析脑膜瘤脑侵袭的分子特征,并发现TGM2、S100A11、ZYX和PDGFRA在肿瘤-脑界面富集 | 未说明具体局限性 | 阐明脑膜瘤脑侵袭的分子和细胞特征及其与肿瘤微环境的相互作用 | 脑侵袭性脑膜瘤患者样本及神经元共培养模型 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 共聚焦显微镜, 多电极阵列记录, 活细胞钙成像 | NA | 基因表达数据, 图像, 电生理数据 | 199例脑膜瘤样本(其中33例脑侵袭性肿瘤),空间映射样本,共培养系统 | Illumina | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq | 批量RNA测序、单细胞RNA测序及空间转录组测序平台,具体配置未详述 |