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当前共找到 41240 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2026-07-03
stDGCN: A dual-augmentation graph convolutional network for identifying spatial domains with attention mechanism
2026-Jul-01, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出一种双增强图卷积网络stDGCN,结合注意力机制和零膨胀负二项解码器,实现空间转录组数据的稳健空间域识别 创新性提出双增强策略,结合空间邻域增强和高斯扰动生成多样化的基因表达视图;采用注意力融合模块自适应整合原始和空间增强嵌入;引入零膨胀负二项解码器处理数据稀疏性和过度离散性 未明确说明局限性,但可能涉及计算复杂度较高、对大规模数据集的适用性需进一步验证 开发稳健的空间域识别方法,以提高空间转录组数据分析的准确性和鲁棒性 空间转录组数据中的空间域区域 机器学习 NA 空间转录组学 图卷积网络(GCN)、注意力机制、零膨胀负二项解码器 基因表达数据、空间坐标数据 6个空间转录组数据集,包括人脑、乳腺癌、小鼠视觉皮层、小鼠脑和胚胎数据 NA 空间转录组学 NA NA
202 2026-07-03
Hypoxia-driven T cell-macrophage-stromal cross-talk sustains fibrosis in preclinical models of cutaneous chronic graft-versus-host disease
2026-Jul, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 该研究揭示了缺氧驱动的T细胞-巨噬细胞-基质细胞相互串扰在皮肤慢性移植物抗宿主病纤维化中的作用机制 首次在慢性移植物抗宿主病中发现HIF-1α-PI3Kδ-IL-13信号轴介导的缺氧驱动炎症与纤维化程序 未提及具体局限性 阐明皮肤慢性移植物抗宿主病纤维化的缺氧驱动机制并探索治疗靶点 慢性移植物抗宿主病患者的皮肤组织、人类表皮细胞系、诱导多能干细胞衍生皮肤类器官及小鼠模型 数字病理学 慢性移植物抗宿主病 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 NA 图像、文本 未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
203 2026-07-03
Endozoicomonas acroporae enhances coral thermal resilience through host-microbe coordination
2026-Jul-01, The ISME journal
研究论文 建立Endozoicomonas acroporae Acr-14T作为珊瑚益生菌,并表征其对造礁珊瑚Stylophora pistillata热耐受性的增强作用及宿主-微生物协调机制 首次在体内证明Endozoicomonas acroporae作为珊瑚益生菌能增强宿主热耐受性,并结合染色体级别基因组和单细胞转录组揭示细胞类型特异性的宿主响应机制 益生菌处理对机会性微生物相对丰度的降低和潜在有益类群的富集仅基于微生物谱分析,具体因果机制仍需进一步验证 阐明益生菌Endozoicomonas acroporae增强珊瑚热胁迫下恢复力的分子机制 造礁珊瑚Stylophora pistillata及其共生细菌Endozoicomonas acroporae Acr-14T 微生物学、生态学 珊瑚热应激 益生菌处理、基因组组装、单细胞转录组学、微生物谱分析 无特定模型 基因组序列、单细胞转录组数据、微生物组数据 Stylophora pistillata珊瑚样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组学用于分析胃皮层细胞的基因表达变化
204 2026-07-03
Cross-Platform Gene Signature to Predict Survival Outcomes for Nasopharyngeal Carcinoma
2026-Jul, JCO precision oncology IF:5.3Q1
研究论文 基于跨平台基因签名预测鼻咽癌生存预后的研究 首次建立并验证了一个5基因签名(SPP1, IL18BP, PALMD, WDR35和SOCS6),可在不同转录组平台间稳定预测局部晚期鼻咽癌患者预后,且优于已有转移相关模型 作为回顾性研究,样本量有限,可能数据未涵盖所有相关基因签名 开发并验证一个基于基因表达的预后签名,用于局部晚期鼻咽癌的个体化治疗风险分层 局部晚期鼻咽癌患者 机器学习 鼻咽癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO-Cox回归 基因表达数据, 单细胞基因表达数据 发现队列99例(NPC-0501试验),验证队列133例(香港伊利沙伯医院和中山大学肿瘤防治中心) NA 单细胞RNA-seq NA NA
205 2026-07-03
Diversity, Equality, and Inclusion in the naïve T Cell Receptor Repertoire
2026-Jul, Immunological reviews IF:7.5Q1
综述 通过多样性、平等性和包容性视角,审视人类初始T细胞受体库的基本特性 首次提出从多样性、平等性和包容性三个维度系统分析初始T细胞受体库,强调克隆型大小不均等性主要源于胸腺或胸腺后扩张而非体细胞重组,挑战了传统阴性选择的实验证据有限性 克隆型大小异质性驱动机制仍不明确,阴性选择导致的功能性“空洞”实验证据不足 阐明初始T细胞受体库的基本特性及其对初级免疫应答的影响 人类初始T细胞受体库 机器学习 NA 单细胞测序 数学模型 序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
206 2026-07-03
A salivary protein panel for detecting malignant transformation of oral leukoplakia
2026-Jul-01, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 本文通过基于质谱的唾液蛋白质组学分析和机器学习,鉴定了一个五蛋白唾液标志物组合,用于检测口腔白斑的恶性转化 首次利用唾液蛋白质组学数据结合XGBoost和LASSO回归,开发出基于MMP1、SUMO4、SMS、TMBIM1和MUC5AC的五蛋白标志物组合,并在多个独立队列和单细胞RNA测序数据中验证其生物学相关性 研究样本量中等,且缺乏对不同阶段OLK恶性转化的纵向跟踪数据,需进一步在更大前瞻性队列中验证标志物的临床实用性 探索唾液蛋白质组学作为非侵入性方法用于检测口腔白斑向口腔鳞状细胞癌的恶性转化 48名口腔白斑患者和83名OLK相关口腔鳞状细胞癌患者的唾液样本 机器学习, 数字病理学 口腔癌, 口腔白斑 质谱, 单细胞RNA测序 XGBoost, LASSO回归 蛋白质组学数据, 单细胞转录组数据 131个唾液样本(48个OLK和83个OLK-OSCC),18个小鼠模型样本,39个独立OSCC组织样本 NA 质谱, 单细胞RNA测序 NA NA
207 2026-07-03
Four-dimensional molecular mapping from a spatial snapshot reveals the dynamics of hair follicle organogenesis
2026-Jul-01, Cell IF:45.5Q1
研究论文 开发3D组织透明技术3DEEP,结合空间转录组学从小鼠皮肤空间快照中重建毛囊器官发生的四维分子图谱,揭示发育动态 首次通过去除基因组DNA的3D组织透明技术(3DEEP)实现数百微米厚组织内的空间转录组学分析,并利用分子推断的发育年龄将单次空间快照转化为四维分子图谱,揭示器官发生的隐藏动态 未明确提及局限性,但可能涉及技术对组织类型的适用性及推断发育年龄的准确性 通过空间转录组学从单次空间快照中揭示器官发生的四维分子动态 新生小鼠皮肤及其发育中的毛囊 数字病理学 遗传性皮肤病(无毛症模型) 空间转录组学、3D组织透明技术(3DEEP) NA 空间转录组数据(图像及分子谱) 新生小鼠皮肤组织(数百个发育中的毛囊) NA 空间转录组学 NA 3DEEP:一种基于组织透明和基因组DNA去除的深层空间转录组学方法
208 2026-07-03
Spatiomolecular mapping reveals anatomical organization of heterogeneous cell types in the human nucleus accumbens
2026-Jul-01, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 通过整合单细胞和空间转录组学,生成人类伏隔核的空间分子图谱,揭示异质细胞类型的解剖组织 首次整合单细胞和空间转录组学构建人类伏隔核空间分子图谱,揭示D1岛状结构及连续空间基因表达梯度,并关联精神病和成瘾相关风险 NA 解析人类伏隔核中异质细胞类型的空间组织及其在神经精神疾病中的相关性 人类死后伏隔核组织 数字病理学 神经精神疾病 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 图像, 文本 死后伏隔核组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
209 2026-07-03
BulkFormer: A large-scale foundation model for bulk transcriptomes
2026-Jul-01, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 提出了BulkFormer,一个面向批量转录组的大规模基础模型,涵盖20,010个蛋白质编码基因并在581,503个人类批量RNA-seq数据上预训练 首次针对批量转录组模式设计基础模型,使用混合编码器结合图神经网络和Performer模块,在五个下游任务中优于单细胞基础模型且训练成本更低 未提及局限性信息 开发适用于批量转录组分析的基础模型,解决单细胞RNA-seq数据稀疏性导致的转录组建模不足问题 人类批量RNA-seq数据及基因表达关系 机器学习 NA 批量RNA-seq 混合编码器(图神经网络 + Performer) 批量转录组数据 581,503个人类批量RNA-seq样本 NA 批量RNA-seq NA NA
210 2026-07-03
Ultraviolet B-induced oxidative stress drives stromal remodeling and malignant transformation of actinic keratosis via a podoplanin-C-type lectin-like receptor 2 signaling axis
2026-Jul-01, Free radical biology & medicine
研究论文 通过整合多组学分析揭示紫外线B诱导氧化应激通过PDPN-CLEC-2信号轴驱动光线性角化病恶性转化的机制 首次发现角质形成细胞来源的PDPN通过与成纤维细胞上的CLEC-2相互作用触发基质重塑,建立了氧化应激与光线性角化病恶性转化之间的直接分子联系,并鉴定出以PDPN为中心的12基因诊断和预后特征 未在体内模型中验证PDPN-CLEC-2轴作为药物靶点的临床可行性,且可能遗漏其他非编码RNA或表观遗传调控机制 阐明紫外线B诱导的氧化应激如何通过特定信号通路驱动光线性角化病恶性转变为皮肤鳞状细胞癌的分子机制 光线性角化病患者的皮肤组织样本、角质形成细胞和成纤维细胞 数字病理学 皮肤癌 Bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 六个独立队列,包含正常皮肤、光线性角化病和皮肤鳞状细胞癌样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒和Illumina NovaSeq平台用于测序
211 2026-07-03
Anti-CCL2-conjugated platelets attenuate early allograft and ischemia-reperfusion injury by inhibiting monocyte infiltration
2026-Jul-01, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究通过转录组测序和单细胞测序技术发现趋化因子CCL2是早期同种异体移植功能障碍的关键分子,并开发了一种基于血小板的药物递送系统(PLT-aCCL2)以抑制单核细胞浸润、减轻炎症损伤和急性排斥反应 首次报道血小板可将抗CCL2抗体定向递送至肝脏移植物,打破CCL2-CCR2+单核细胞信号通路驱动的免疫-炎症级联反应,并证明PLT-aCCL2能通过减少髓系细胞与T细胞相互作用来缓解急性细胞排斥反应 研究主要基于临床队列和动物模型,未在大型临床随机对照试验中验证治疗效果;血小板制剂的长期安全性和稳定性有待进一步评估 阐明肝脏移植后早期炎症损伤和排斥反应的关键驱动机制,并开发靶向干预策略 接受肝脏移植的患者及原位肝移植小鼠模型 数字病理学 肝脏疾病 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 基因表达数据 临床队列和原位肝移植小鼠模型 Illumina bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq Illumina NovaSeq bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq测序平台
212 2026-07-03
Anserine restores antibacterial immunity in cirrhosis via a protective CCL5-mediated hepatocyte-CD44+pDC crosstalk
2026-Jul-01, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 小鼠肝脏单细胞RNA测序发现肝硬化中一种保护性CCL5介导的肝细胞-CD44+浆细胞样树突状细胞串扰被破坏,鹅肌肽通过恢复该轴增强抗菌免疫 首次揭示鹅肌肽-CCL5-pDC-巨噬细胞代谢-免疫轴在肝硬化中受损,并证明鹅肌肽补充可恢复该轴以降低感染风险 研究主要在动物模型中进行,人类数据虽来自多中心队列但样本量有限,且机制验证依赖于多种体外和体内实验,尚未直接评估鹅肌肽在人类中的治疗效果 探究肝硬化患者易感细菌感染的免疫缺陷机制,特别是肝脏内细胞串扰的失调 对照和肝硬化小鼠(有无细菌感染)、肝硬化患者(来自全国多中心前瞻性队列CATCH-LIFE) 数字病理学 肝脏疾病, 肝硬化 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 靶向代谢组学, 质谱, 外体共培养, 体内过继转移, 抗体阻断, 转基因小鼠模型, 人类批量转录组学和单细胞转录组学数据集 NA 基因表达数据, 代谢组学数据, 临床队列数据 对照和肝硬化小鼠多个, 人类多中心前瞻性队列(CATCH-LIFE) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒
213 2026-07-03
Single-cell transcriptomic profiling reveals functional heterogeneity and regulatory programs of neutrophils in experimental autoimmune uveitis
2026-Jul-01, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示实验性自身免疫性葡萄膜炎中嗜中性粒细胞的功能异质性和调控程序 首次系统性地利用单细胞转录组分析揭示实验性自身免疫性葡萄膜炎视网膜中嗜中性粒细胞的功能异质性和两种不同的活化状态(促炎与抗炎/修复状态),并识别出关键转录调控因子及其下游靶基因 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类自身免疫性葡萄膜炎中嗜中性粒细胞的作用;此外,样本量有限,需要进一步在更大规模队列中验证 阐明实验性自身免疫性葡萄膜炎中嗜中性粒细胞的功能异质性和调控机制 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的视网膜样本 数字病理学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA(未在摘要中明确提及具体样本数量) Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
214 2026-07-03
4-1BBL on monocyte lineage cells rather than on classical dendritic cells drives CD8+ T cell accumulation in the respiratory tract and protects from severe respiratory influenza infection
2026-Jul-01, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了在急性流感感染期间,单核细胞谱系细胞而非经典树突状细胞上的4-1BBL驱动CD8+ T细胞在呼吸道的积累,并保护机体免受严重呼吸道流感感染 首次明确区分单核细胞谱系细胞和经典树突状细胞在提供4-1BBL方面的不同作用,发现炎性单核细胞独特地提供4-1BBL以增加CD8 T细胞在肺部的积累,这种分工对于抵御严重流感感染至关重要 研究主要在鼠模型中进行,结果向人类的转化需要进一步验证;未阐明4-1BBL表达调控的分子机制 阐明提供4-1BBL的抗原呈递细胞类型及其在流感感染中驱动CD8 T细胞积累和保护作用中的分工 小鼠的单核细胞谱系细胞、经典树突状细胞、CD8效应T细胞和组织驻留记忆T细胞 免疫学 流感病毒感染 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, 混合骨髓嵌合体, Cre重组酶敲除 NA 基因表达数据, 流式细胞术数据 小鼠模型,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
215 2026-07-03
Systemic immune profiling in hepatocellular carcinoma: navigating etiological heterogeneity and selection bias
2026-Jul-01, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
评论文章 本文对一项关于晚期肝细胞癌联合免疫疗法循环免疫生物标志物的单细胞RNA测序研究进行了方法学评论,指出了病因异质性、选择偏倚和统计膨胀以及生物学适用性三个关键问题 指出病因异质性(病毒性 vs 非病毒性HCC)可能混淆治疗方案特异性免疫特征,强调1:1应答者与非应答者平衡研究设计导致的“选择偏倚”和效应量统计膨胀,质疑在高流量外周循环环境中稳定配体-受体相互作用的生物学适用性 未提供实证数据验证,仅为方法学评论;缺乏对如何在未来验证中解决这些问题的具体方案 对Nishio等人的研究进行方法学评论,提升循环免疫生物标志物的临床有效性 晚期肝细胞癌(HCC)患者的循环免疫细胞 自然语言处理 肝细胞癌 单细胞RNA测序 (CITE-seq) NA 单细胞转录组数据 NA(原始研究样本量未提及) NA 单细胞RNA测序, CITE-seq NA NA
216 2026-07-03
ENPP3 CAR T cells combined with CD206 modulation suppress adrenocortical carcinoma
2026-Jul-01, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 采用患者来源异种移植模型鉴定肾上腺皮质癌的免疫治疗靶点ENPP3,并通过联合CD206调节策略增强CAR T细胞的抗肿瘤效果 首次鉴定ENPP3作为肾上腺皮质癌CAR T细胞治疗的新靶点,并发现联合CD206+肿瘤相关巨噬细胞调节可克服免疫抑制微环境,实现肿瘤生长抑制 未提及 开发针对肾上腺皮质癌的新型CAR T细胞免疫治疗策略 肾上腺皮质癌患者来源异种移植模型中的肿瘤细胞和肿瘤微环境 数字病理学 肾上腺皮质癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、表面蛋白质组学分析、流式细胞术 CAR T细胞 基因表达数据、蛋白质组数据 7个患者来源异种移植模型 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
217 2026-07-03
OT-55 reshapes tolerogenic BH3-mimetic-induced apoptosis toward immunogenic cell death in acute myeloid leukemia, potentiating PD-1/Tim-3 blockade
2026-Jul-01, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本文揭示了OT-55作为免疫原性佐剂可将BH3模拟物介导的耐受性凋亡转变为免疫原性细胞死亡,从而增强PD-1/Tim-3阻断在急性髓系白血病疗效 首次证明羟基香豆素OT-55与小分子BH3模拟物联合可将耐受性凋亡转化为免疫原性细胞死亡,并增强免疫检查点抑制,且通过多队列转录组分析建立了9基因AML ICD评分模型 暂无明显的局限性描述 评估ICD诱导剂OT-55与Bcl-xL抑制剂联合是否能增强检查点免疫疗法并克服AML免疫逃逸 急性髓系白血病(Bcl-xL依赖性)小鼠模型及来自三个AML患者队列(TARGET-AML、BEAT-AML、GSE37642)的转录组数据 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、CIBERSORTx免疫组成推断 NA 转录组、单细胞RNA测序 三个AML患者队列及AML与健康供体骨髓样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
218 2026-07-03
Multi-omics profiling reveals systemic rejuvenation of the aged kidney through senolytic therapy
2026-Jul-01, NPJ Regenerative medicine IF:6.4Q1
研究论文 通过多组学分析揭示衰老清除疗法(达沙替尼和槲皮素)对老年肾脏的系统性年轻化作用 首次采用多组学方法系统评估长期衰老清除治疗对自然衰老小鼠肾脏的多层级系统性机制,包括单细胞转录组学和细胞间通讯分析 研究基于小鼠模型,人类肾脏衰老的响应机制可能有所不同 探究达沙替尼和槲皮素联合治疗对老年肾脏长期影响及其多层级系统性机制 自然衰老小鼠的肾脏组织 机器学习 老年性疾病 蛋白质组学、单细胞转录组学 NA 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 自然衰老小鼠样本,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
219 2026-07-03
Single-cell architecture of purinergic signaling in human cord blood hematopoietic stem and progenitor cells
2026-Jul-01, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 应用单细胞RNA测序揭示人脐带血造血干和祖细胞中嘌呤能信号传导的转录组结构 首次在人造血干和祖细胞亚群中描绘嘌呤能信号网络的层级组织,发现原始HSPC具有受限的嘌呤能受体库并耦合胞内核苷酸回收机制,而谱系偏向簇则富集与炎症激活和迁移相关的受体和核苷外酶 该研究仅基于转录组分析,未在蛋白或功能水平验证嘌呤能受体和酶的表达与活性,且样本来源限于脐带血,可能不反映成体骨髓中HSPC的特征 阐明嘌呤能信号在人造血干和祖细胞不同亚群中的转录组织及其在早期造血调控中的作用 人脐带血来源的CD133⁺Lin⁻CD45⁺和CD34⁺Lin⁻CD45⁺富集HSPC细胞 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人脐带血样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
220 2026-07-03
Connecting single-cell transcriptomes to projectomes in the mouse visual cortex
2026-Jul-01, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文通过结合单细胞转录组学和投射组学,在小鼠视觉皮层中建立了兴奋性神经元类型的综合分类系统 首次将单细胞转录组数据与长程轴突投射特征直接关联,通过多步分类器整合跨模态数据,揭示转录组变异与形态电生理表型及投射靶点的对应关系 研究仅限于小鼠视觉皮层中的兴奋性神经元,未涉及抑制性神经元,且跨物种扩展性尚未验证 建立小鼠视觉皮层兴奋性神经元的综合分类系统,并探索转录组特征与投射靶点之间的预测关系 小鼠视觉皮层中的兴奋性神经元 机器学习 NA 单细胞RNA测序, Patch-seq 多步分类器 转录组数据, 形态学数据, 电生理数据 1,528个Patch-seq兴奋性神经元和341个全神经元形态数据 NA 单细胞RNA测序, Patch-seq NA NA
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