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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-06-06 |
GSTO1 as a Potential Risk Factor for Diabetic Nephropathy: Evidence From Mendelian Randomisation and Multi-Omics Analyses
2026-Jan, Nephrology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/nep.70165
PMID:41549440
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析探讨GSTO1与糖尿病肾病的潜在因果关系 | 首次利用孟德尔随机化联合单细胞RNA测序和多组学数据揭示GSTO1在糖尿病肾病中的因果作用 | 研究结果基于公共数据库和体外实验,尚需更大样本量和体内实验验证 | 探究GSTO1与糖尿病肾病风险之间的潜在因果关系 | GSTO1基因变异、糖尿病肾病样本及高糖处理HK-2细胞 | 机器学习和生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、表达分析 | NA | 基因型数据、表达谱数据、单细胞RNA测序数据 | MR分析包含GWAS汇总数据,表达分析涉及Nephroseq、GEO数据集及人肾小管上皮细胞系HK-2 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 202 | 2026-06-06 |
Increased mROS Generation Associates With Cardiovascular Risk in BioHEART-CT PBMCs
2026-Jan, Clinical and translational science
DOI:10.1111/cts.70469
PMID:41549547
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研究论文 | 研究外周血单核细胞线粒体活性氧生成与冠心病风险的关系 | 通过联合MitoSOX流式细胞术和单细胞RNA测序,初步探索CCBE1基因在PBMC中的表达差异 | 样本量较小(40例),未发现PBMC线粒体活性氧与冠心病状态的一致关联,且亚组分析结果探索性且不稳健 | 评估PBMC线粒体活性氧作为冠心病血液生物标志物的潜力 | BioHEART-CT队列参与者外周血单核细胞(PBMCs) | 医学影像学,数字病理学 | 冠心病,心血管疾病 | 流式细胞术(MitoSOX),单细胞RNA-seq | NA | 流式细胞术数据,单细胞转录组数据 | 40例BioHEART-CT参与者(不同冠心病状态) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析PBMC中CCBE1差异表达 |
| 203 | 2026-06-06 |
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70134
PMID:41549697
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研究论文 | 探究长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎中通过增强破骨细胞生成促进牙槽骨吸收的机制 | 首次揭示lncRNA ZFAS1在牙周炎微环境中作为双重路径调控因子,同时促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成,并通过单细胞和bulk RNA测序技术验证其与早期破骨标志基因的强相关性 | 未提供具体局限性信息 | 阐明lncRNA ZFAS1在牙周炎骨重塑失调中的机制作用 | 牙周炎患者和健康者的牙周组织,以及RAW264.7和MC3T3-E1细胞系 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、qPCR、组织学、免疫组化 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 包含健康和患病牙周组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2026-06-06 |
IL-21 mediates crosstalk between T cells and NK cells during the remission of type 1 diabetes
2026-Jan, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01439-y
PMID:41566069
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研究论文 | 揭示IL-21介导T细胞与NK细胞在1型糖尿病缓解期中的相互作用机制 | 首次鉴定出在1型糖尿病发病时扩增的CD226+CD56-CD16+ NK细胞亚群,并证明其通过IL-21和mTOR信号通路受到CD161+CD4+ T细胞调控,连接适应性免疫与先天免疫 | 主要在雌性小鼠模型中验证机制,人类纵向样本量有限 | 阐明自然杀伤细胞在1型糖尿病进展和缓解中的作用及免疫调节机制 | 1型糖尿病患者及雌性小鼠模型中的NK细胞和T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1型糖尿病患者样本(横断面和纵向分析)及雌性小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 205 | 2026-06-06 |
Spatiotemporal Evolution of Malignant Hepatocyte Clones Unveils Immune Evasion Features and Therapeutic Vulnerabilities in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70181
PMID:41566770
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学分析揭示肝细胞癌中恶性肝细胞克隆的时空演化特征、免疫逃逸机制及治疗脆弱性 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据,首次系统揭示了Scissor细胞(主要为肝细胞)向恶性细胞演化过程中的免疫逃逸特征和关键信号通路(如MDK-SDC4和COL4A-SDC)驱动机制 | 未提及具体限制 | 探究肝癌发生和进展过程中的多细胞生态系统分子特征 | 肝细胞癌患者样本中的多种细胞类型,特别是Scissor肝细胞及其演化过程中的恶性克隆 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据(单细胞和空间转录组) | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学 |
| 206 | 2026-06-06 |
Single-cell RNA-seq reveals the piperlongumine is a potential drug for ischemic stroke
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340725
PMID:41575950
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序揭示胡椒碱是缺血性中风的潜在治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序结合Connectivity Map分析和分子对接,发现胡椒碱可通过结合Actb和Cflar编码的蛋白治疗缺血性中风 | 仅基于一个公共单细胞数据集(GSE174574)进行分析,需更多样本验证 | 探索缺血性中风的潜在分子机制和有效治疗药物 | 缺血性中风的细胞类型和分子机制 | 机器学习 | 脑血管疾病,缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个公共数据集(GSE174574) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 207 | 2026-06-06 |
AugGCL: Multimodal graph learning for spatial transcriptomics analysis with enhanced gene and morphological data
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013912
PMID:41576146
|
研究论文 | 提出AugGCL框架,通过增强基因和形态学数据的图卷积学习来改进空间转录组学分析 | 采用双流加权图卷积网络联合建模基因特征与图像形态信息,并引入图像感知辅助重建以增强弱空间信号和锐化边界 | 未提及具体局限性 | 提升空间转录组学中空间域重建的准确性和边界清晰度 | 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎的组织样本 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 加权图卷积网络 | 基因表达数据和图像数据 | 多个数据集(包括人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2026-06-06 |
Development of an in situ small intestinal injection technique for targeted macromolecule delivery and in vivo functional studies in mice
2026-Jan, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70123
PMID:41577652
|
研究论文 | 介绍了一种用于小鼠小肠的微创原位注射技术,实现靶向大分子递送并评估其功能性应用 | 开发了一种绕过胃部降解的微创原位注射技术,实现生物大分子精准递送至小肠上皮细胞,并成功应用于单细胞RNA测序研究 | 未提及与口服灌胃或类器官培养相比的长期功能和安全性对比数据,且仅在小鼠模型中验证 | 开发一种用于小鼠小肠的微创原位注射技术,实现靶向大分子递送并进行体内功能研究 | 小鼠小肠及肠上皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2026-06-06 |
Differential Roles of Notch Receptors in Regulating Activation of Intact Adult Mouse Spinal Cord-Derived NSCs
2026-Jan, Developmental neurobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1002/dneu.70013
PMID:41581227
|
research paper | 研究成年小鼠脊髓来源神经干细胞中Notch受体在调控其激活中的差异角色 | 首次揭示Notch1和Notch2在成年脊髓神经干细胞激活和静息状态中的不同调控作用 | 研究对象仅局限于8周龄C57/BL6小鼠的脊髓神经干细胞,且未涉及体内环境验证 | 探究Notch受体在调控成年脊髓神经干细胞激活中的具体作用机制 | 8周龄C57/BL6小鼠脊髓来源的神经干细胞 | digital pathology | spinal cord injury | single-cell RNA sequencing, lentiviral vector infection, Western blot analysis | NA | single-cell transcriptome data | 8周龄C57/BL6小鼠脊髓来源的神经干细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 210 | 2026-06-06 |
Intrahepatic Lymphangiogenesis Is Associated with Early Post-Hepatectomy Liver Regeneration, in Part via IL-6/STAT3 Signaling
2026, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.106849
PMID:41583514
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研究论文 | 研究揭示肝内淋巴管生成通过IL-6/STAT3信号通路部分促进肝切除术后早期肝脏再生 | 首次阐明肝内淋巴管生成在肝脏再生中的具体作用及其通过IL-6/STAT3信号通路的机制 | 研究基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证;部分依赖于IL-6/STAT3信号,可能还有其他通路参与 | 探讨肝内淋巴管生成在肝脏再生中的作用及潜在机制 | 肝内淋巴管内皮细胞(LyECs)以及肝切除术后的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blotting,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(70%肝切除术后),具体样本量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 211 | 2026-06-06 |
Exploring the Dynamic Changes of Intercellular Connections in Cervical Cancer: Insights From Transcriptomic Data Combined With Single-Cell Sequencing
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8140041
PMID:41584728
|
研究论文 | 利用转录组数据和单细胞测序探索宫颈癌细胞间连接的动态变化 | 通过单细胞测序揭示宫颈癌上皮细胞亚群间的相互作用,鉴定出低CNV评分的细胞簇,并构建基于标志基因的预后模型,发现COL4A1作为潜在治疗靶点 | 需要进一步验证模型和靶点在更大样本和临床实践中的有效性 | 研究宫颈癌肿瘤微环境中上皮细胞亚群间的相互作用并构建预后模型 | 宫颈癌上皮细胞亚群及其细胞间相互作用 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据和单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2026-06-06 |
Unveiling the molecular mechanisms of burn injury through integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341725
PMID:41592030
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析揭示烧伤的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析烧伤微环境的细胞图谱,并结合机器学习方法鉴定关键标记基因 | 样本量有限且缺乏实验验证 | 探究烧伤损伤的免疫学微环境及其分子机制 | 烧伤微环境中的细胞亚群,特别是巨噬细胞和其他免疫细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 烧伤 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 随机森林 | UMAP | 基因表达数据 | 9248个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 213 | 2026-06-06 |
Exploring key genes related to air pollutants in polycystic ovary syndrome: A comprehensive analysis from transcriptome and single-cell analysis combined with network toxicology
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119623
PMID:41601053
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研究论文 | 结合转录组和单细胞分析以及网络毒理学,探索空气污染物与多囊卵巢综合征相关的关键基因 | 首次整合批量RNA-seq、单细胞RNA-seq数据与空气污染物相关分子靶点,采用差异表达、机器学习、功能富集和分子对接分析,鉴定了ESR2、FAAH和MAOB三个关键基因,并揭示其与污染物诱导内分泌紊乱的关联 | NA | 探讨空气污染物与多囊卵巢综合征的关联机制并识别潜在的分子生物标志物 | 多囊卵巢综合征患者与健康对照的转录组和单细胞数据 | 机器学习 | 多囊卵巢综合征 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 214 | 2026-06-06 |
SpaConTDS: A multimodal contrastive learning framework for identifying spatial domains by applying tuple disturbing strategy
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013893
PMID:41610146
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research paper | 提出了一种名为SpaConTDS的多模态对比学习框架,通过应用元组扰动策略来识别空间域 | 将强化学习与自监督多模态对比学习相结合,通过数据增强和伪标签元组扰动策略生成正负样本,动态优化模型超参数,无需先验对齐即可整合多个组织切片并校正批次效应 | 未在摘要中明确提及 | 准确识别空间域,探索细胞结构和功能 | 多模态空间转录组学数据 | machine learning | NA | 空间转录组学 | 多模态对比学习框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 215 | 2026-06-06 |
PIK3R1 as a Gastric Cancer Biomarker Linked to CD73 + Treg-Mediated Immunosuppression
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.069453
PMID:41613810
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research paper | 研究PIK3R1作为胃癌生物标志物与CD73+Treg介导的免疫抑制作用的关系 | 首次建立整合PIK3R1和CD73表达与临床参数的预后模型,用于胃癌患者风险分层 | NA | 探究PIK3R1在胃癌中的预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 胃癌患者(包括TCGA和中山大学肿瘤防治中心队列) | machine learning | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 免疫组化图像 | TCGA和SYSUCC两个队列的胃癌患者样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA数据集使用Illumina平台进行RNA测序 |
| 216 | 2026-06-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Suggests That JUN May Regulate BAMBI to Promote Osteosarcoma Cell Migration and Invasion
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9261651
PMID:42211757
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示JUN可能通过调控BAMBI促进骨肉瘤细胞迁移和侵袭 | 首次利用单细胞RNA测序技术解析骨肉瘤转移过程中的细胞异质性,并发现JUN通过调控BAMBI表达激活TGF-β信号通路促进转移的新机制 | 未在体内模型中验证该调控机制,且BAMBI在更大样本中的临床相关性有待进一步确认 | 探究骨肉瘤转移的分子机制并识别免疫诊断和治疗标志物 | 骨肉瘤患者瘤内异质性及转移相关细胞亚群 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨肉瘤患者样本(具体数量文中未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 217 | 2026-06-06 |
dNK3 cells in normal pregnancy and recurrent pregnancy loss: from molecular identity to functional imbalance
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1822205
PMID:42212143
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研究论文 | 探讨dNK3细胞在正常妊娠和复发性流产中的分子特征与功能失衡 | 首次系统阐明dNK3细胞的分子特征、功能特性及其在复发性流产中的比例失衡现象,并提出dNK1/dNK3比值作为诊断生物标志物和潜在治疗靶点 | 目前证据尚不足以支持临床转化,需解决因果关系、跨研究可比性以及dNK3/ieILC1发育关系等关键问题 | 研究dNK3细胞在正常妊娠和复发性流产中的分子身份与功能失衡 | 蜕膜自然杀伤(dNK)细胞,特别是dNK3亚群 | 机器学习 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个独立研究的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 218 | 2026-06-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of halo nevi and normal nevi reveals CD8+ T cell activation in melanocytic autoimmunity
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1771401
PMID:42220500
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研究论文 | 研究对晕痣和正常痣进行单细胞RNA测序,揭示了CD8+ T细胞在黑色素细胞自身免疫中的活化机制 | 首次构建晕痣与正常痣的单细胞转录组图谱,发现黑色素细胞亚群中抗原呈递分子和干扰素刺激基因显著上调,揭示了黑色素细胞内源性和免疫介导的自身免疫破坏机制,以及与白癜风的共同致病通路 | 未明确说明上游触发因素,且样本量较小,可能影响结论的普适性 | 探索晕痣中CD8+ T细胞活化的上游触发因素和黑色素细胞自身免疫的分子机制 | 晕痣和正常痣组织 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性皮肤病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 晕痣和正常痣样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2026-06-06 |
Immunometabolic reprogramming and glycolysis-associated signatures in sepsis: insights from single-cell RNA sequencing and machine learning
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1817391
PMID:42220506
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习揭示脓毒症中的免疫代谢重编程和糖酵解相关特征 | 整合单细胞转录组和全血芯片数据,利用多种机器学习算法筛选出五种糖酵解相关基因,并识别出TGFBI作为单核细胞中心通信网络的关键生物标志物 | 仅基于公开数据集和动物模型验证,缺乏大规模临床队列的进一步验证 | 阐明脓毒症中免疫代谢重塑的糖酵解相关生物标志物及其细胞类型背景 | 人外周血单细胞和全血样本,以及小鼠盲肠结扎穿刺模型 | 自然语言处理 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 芯片, qRT-PCR | LASSO, 随机森林, Boruta | 单细胞转录组数据, 全血芯片数据, qRT-PCR数据 | 公开数据集GSE175453(单细胞)和GSE100159(芯片),以及CLP手术小鼠与对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 芯片, qRT-PCR | GSE175453, GSE100159 | NA |
| 220 | 2026-06-06 |
Integrated multi-omics deciphers sepsis immune dysregulation: a dual-pathway targeted small-molecule therapy improves survival and ameliorates multi-organ dysfunction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1809540
PMID:42220532
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研究论文 | 整合多组学数据解析脓毒症免疫失调,提出双通路小分子联合疗法改善生存并减轻多器官功能障碍 | 通过整合多组学数据(单细胞RNA-seq、miRNA-seq、RNA-seq)解析脓毒症免疫细胞动态和失调通路,设计靶向炎症和Hippo/Wnt再生通路的双通路小分子组合疗法,显著提升生存率并减轻多器官损伤 | 未提及具体局限性,但可能涉及样本量、模型外推性及临床转化挑战 | 解析脓毒症免疫失调机制并开发有效的联合治疗策略 | 脓毒症患者免疫细胞及小鼠模型中免疫反应与组织修复 | 机器学习和数字病理学(通过多组学分析) | 脓毒症(全身性感染相关器官功能障碍) | 单细胞RNA-seq、miRNA-seq、RNA-seq | NA(未提及具体模型类型) | 转录组数据(单细胞RNA-seq、miRNA-seq、RNA-seq) | NA(摘要未明确说明样本量) | 10x Genomics, Illumina, BGI(推测的多组学数据来源) | 单细胞RNA-seq、miRNA-seq、批量RNA-seq | 10x Chromium(单细胞RNA-seq)、Illumina NovaSeq(RNA-seq)、BGISEQ(miRNA-seq) | 10x Chromium单细胞3'测序、Illumina NovaSeq批量RNA-seq、BGISEQ miRNA测序 |