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当前共找到 33643 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2025-12-04
Cellular dynamics in cerebrospinal fluid unveils the key regulators of intracranial response to immune checkpoint inhibitors in NSCLC brain metastases
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌脑转移患者在接受免疫检查点抑制剂治疗期间,脑脊液和脑转移瘤中的细胞动态变化,并识别出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞作为颅内治疗反应的关键预测因子 首次在脑脊液中利用单细胞RNA测序构建了高分辨率的细胞动态图谱,并鉴定出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞这一新型免疫细胞亚群作为免疫检查点抑制剂颅内疗效的阳性预测标志物 样本量相对较小(脑脊液样本n=20),且依赖于外部数据库数据进行整合分析,可能需要更大规模的前瞻性队列验证 探索非小细胞肺癌脑转移患者对免疫检查点抑制剂治疗的颅内反应机制,并寻找预测性生物标志物 非小细胞肺癌伴脑转移的患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质组学分析, 多重免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质组数据, 免疫组织化学图像 脑脊液样本20例, 外部数据库样本20例, 流式细胞验证队列8例, 蛋白质组学验证队列31例, 多重免疫组化验证队列25例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
202 2025-12-04
Blocking PCSK9 suppresses hepatocellular carcinoma immune escape by decreasing FLI1-mediated SPP1 and PD-L1 expression
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了PCSK9通过NOTCH3/FLI1信号通路上调SPP1和PD-L1表达,从而促进肝细胞癌免疫逃逸的机制,并探索了基于CRISPR碱基编辑和小分子抑制剂的干预策略 首次发现PCSK9通过NOTCH3/FLI1通路调控SPP1和PD-L1表达,介导肝细胞癌免疫逃逸,并开发了新型ABE碱基编辑器和小分子抑制剂parecoxib作为治疗策略 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体临床试验中验证,且PCSK9抑制剂parecoxib的具体作用机制和长期安全性需进一步研究 揭示PCSK9促进肝细胞癌免疫逃逸的分子机制,并探索靶向PCSK9的治疗策略 肝细胞癌细胞系(Hepa1-6、H22、HepG2)、小鼠肝细胞癌模型、CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、CRISPR腺嘌呤碱基编辑、共培养实验 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 多种肝细胞癌细胞系及小鼠模型,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
203 2025-12-04
UGP2 is a potential target for breast cancer, based on bioinformatics analysis and in vitro experiments
2025-Nov-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和体外实验,探讨了UGP2在乳腺癌中的临床意义和功能机制,发现其高表达与不良预后相关,尤其是在TNBC亚型中 首次系统性地将UGP2与乳腺癌亚型(特别是TNBC)的临床预后和肿瘤微环境中的空间分布联系起来,并通过功能实验验证了其促进恶性表型的作用 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证,且临床样本量相对有限(118例) 探究UGP2在乳腺癌进展中的临床相关性和功能机制,以评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 乳腺癌患者样本(来自TCGA等数据库和118例临床标本)以及乳腺癌细胞系 生物信息学 乳腺癌 生物信息学分析、免疫组化、单细胞RNA测序、siRNA敲低实验 NA 多组学数据、临床样本数据、单细胞RNA测序数据 118例临床标本,加上TCGA和GEO数据库中的样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
204 2025-12-04
Spatial transcriptomics expression prediction from histopathology based on cross-modal mask reconstruction and contrastive learning
2025-Nov-25, Medical image analysis IF:10.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于对比学习的深度学习方法,用于从全切片图像预测空间分辨的基因表达 提出了一种结合跨模态掩码重建与对比学习的新方法,无需大规模预训练数据集或抽象语义表征,即可在特征空间建立组织病理学形态与空间基因表达的对应关系 方法在空间转录组数据获取成本高、大规模数据稀缺的场景下表现良好,但未明确讨论其在更广泛组织类型或更复杂疾病模型中的泛化能力 从组织病理学全切片图像预测空间转录组基因表达,以降低数据获取成本并促进肿瘤微环境分析 六种不同疾病数据集的空间转录组数据及对应的全切片图像 数字病理学 肿瘤 空间转录组学 基于对比学习的深度学习模型 图像(全切片图像)、基因表达数据 涉及六个疾病数据集,具体样本数量未明确说明 NA 空间转录组学 NA NA
205 2025-12-04
Integration of spatial and single-cell transcriptomic analysis uncovers cellular and molecular alterations in the hypertensive brain
2025-Nov-24, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过整合空间和单细胞转录组分析,揭示了高血压大脑中的细胞和分子改变 首次结合空间转录组测序和单细胞RNA测序,识别了高血压大鼠下丘脑和延髓中先前未知的脑区及特定神经元亚群,并发现Eno1的上调在神经调控血压中的作用 研究主要基于大鼠模型,人类样本验证有限,且样本量相对较小,可能影响结果的普适性 旨在表征高血压相关中枢神经系统区域的空间和单细胞转录组特征,以揭示神经源性高血压的分子机制 自发性高血压大鼠和正常血压Wistar-Kyoto对照大鼠的下丘脑和延髓组织,以及人类脑组织样本 数字病理学 心血管疾病 空间转录组测序, 单细胞RNA测序, 组织学分析 NA 转录组数据, 图像数据 大鼠样本(自发性高血压大鼠和Wistar-Kyoto对照,4周和10周龄),人类脑组织样本 NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
206 2025-12-04
Determining gene specificity from multivariate single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于熵度量的基因特异性测量方法ember,用于从多变量单细胞RNA测序数据中识别基因特异性,并应用于小鼠和人类数据集 通过公理化方法定义了基因特异性测量应满足的四个关键属性,并证明ember是唯一满足这些属性的方法,从而提供了一种更可靠和直观的基因特异性分析工具 未明确讨论ember方法在计算效率或大规模数据集上的可扩展性限制 开发一种基于公理化属性的基因特异性测量方法,以更准确地识别单细胞RNA测序数据中与生物类别或实验条件相关的特异性基因 小鼠八个组织的单细胞RNA测序数据以及来自255个不同个体的人类PBMC单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 小鼠八个组织的样本以及255个人类个体的PBMC样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
207 2025-12-04
Selective modification of glycoprotein substrates by GnT-V in mouse kidney
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了小鼠肾脏中N-乙酰葡糖胺转移酶-V(GnT-V)对蛋白质底物选择性的机制 通过凝集素辅助蛋白质组学鉴定出ANPEP和MEP1A为GnT-V的主要底物,并揭示了修饰位点的结构特征和极化亚细胞运输在选择性修饰中的作用 研究仅基于小鼠肾脏模型,未在其他组织或物种中验证,且机制细节仍需进一步探索 探究GnT-V在蛋白质选择性糖基化中的机制 小鼠肾脏中的糖蛋白底物,特别是ANPEP和MEP1A 糖生物学 NA 凝集素辅助蛋白质组学、单细胞转录组学 NA 蛋白质组数据、转录组数据 NA NA NA NA NA
208 2025-12-04
Niclosamide suppresses gastric cancer progression through YTHDF2 inhibition-affected lactate metabolic reprogramming
2025-Nov-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了胃癌的代谢重编程特征,并发现药物氯硝柳胺通过抑制m6A甲基化调控蛋白YTHDF2来影响代谢基因,从而抑制胃癌进展 首次将氯硝柳胺的抗癌作用与m6A甲基化调控蛋白YTHDF2联系起来,并系统阐明了其在调节乳酸代谢重编程和肿瘤微环境乳酸穿梭中的作用机制 NA 探究胃癌代谢重编程的分子机制,并评估氯硝柳胺通过靶向YTHDF2抑制胃癌进展的治疗潜力 胃癌患者样本、胃癌细胞系 肿瘤代谢 胃癌 非靶向代谢组学、转录组学、单细胞RNA-seq NA 代谢组数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
209 2025-12-04
stTransfer enables transfer of single-cell annotations to spatial transcriptomics with single-cell resolution
2025-Nov-17, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为stTransfer的方法,通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据,利用图自编码器和迁移学习实现单细胞级别的细胞类型注释 stTransfer方法通过图自编码器和迁移学习最小化scRNA-seq与ST数据集间的信息传递损失,在准确性和鲁棒性上优于现有方法 未在摘要中明确说明 解决空间转录组技术中因检测灵敏度和基因覆盖度限制导致的单细胞级别细胞类型注释难题 斑胸草雀视顶盖的高精度Stereo-seq数据集中的神经元群体 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 图自编码器, 迁移学习 基因表达数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Stereo-seq 高精度Stereo-seq
210 2025-12-04
Development of a single-cell derived MDSCs signature score for prognostic risk stratification and therapeutic decision guidance in breast cancer
2025-Nov-17, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过结合单细胞RNA测序与批量多组学数据,开发了一个基于单细胞来源的MDSCs特征基因的预后风险评分模型,用于乳腺癌的预后分层和治疗决策指导 首次系统性地表征了乳腺癌中新的MDSCs基因特征,并建立了一个具有多方面临床转化能力的MDSCs相关标志物评分框架,将MDSCs的基础生物学与精准肿瘤学联系起来 NA 开发一个基于MDSCs特征基因的预后风险评分模型,用于乳腺癌的预后风险分层和治疗决策指导 乳腺癌患者中的髓源性抑制细胞(MDSCs)及其特征基因 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量多组学数据分析 机器学习方法 单细胞RNA测序数据,批量多组学数据 整合了单细胞数据集GSE161529和GSE176078,识别了12,767个MDSCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
211 2025-12-04
GPR15 and CD38 define a subset of peripheral blood pathogenic effector Th2 cells associated with active eosinophilic esophagitis
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,识别了外周血中GPR15+ CD38+致病性效应Th2细胞亚群与活动性嗜酸性食管炎的关联 首次将外周血GPR15+致病性效应Th2细胞与食管组织中的对应细胞直接关联,并发现CD38表达上调可作为活动性疾病的标志,为非侵入性诊断提供了新靶点 样本量相对有限(外周血74例,活检17例;单细胞测序外周血27例,活检10例),且机制研究如环境暴露的具体因素需进一步探索 评估GPR15+致病性效应Th2细胞在嗜酸性食管炎发病机制中的作用及其作为疾病状态生物标志物的潜力 嗜酸性食管炎患者及对照者的外周血和食管活检样本 数字病理学 嗜酸性食管炎 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 流式细胞术:74例外周血样本和17例活检样本;单细胞RNA测序:27例外周血样本和10例活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
212 2025-12-04
Integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data reveals age-related immune cell alterations in primary glioblastoma associated with prognosis
2025-Nov-12, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析,揭示了原发性胶质母细胞瘤中与年龄相关的免疫细胞变化及其与预后的关联 首次系统比较了原发性与复发性胶质母细胞瘤中年龄相关的免疫细胞差异,并发现小胶质细胞在老年原发性患者中经历显著的细胞状态变化,其中HSPB1高表达与不良预后相关 研究样本量相对有限,单细胞数据仅来自25名患者,且主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证 探究衰老如何影响胶质母细胞瘤进展,特别是年龄相关的免疫细胞变化在原发性与复发性肿瘤中的差异 胶质母细胞瘤患者(包括原发性和复发性)以及年轻和老年小鼠的异种移植模型 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,批量转录组分析,细胞间通讯分析,轨迹分析 NA 转录组数据,临床数据,基因组变异数据 13名原发性胶质母细胞瘤患者和12名复发性患者,共计88,908个细胞的单细胞数据;TCGA和CGGA数据库的批量数据;年轻和老年小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
213 2025-12-04
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-Nov-07, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠皮下白色脂肪组织中胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性及其混合起源 首次在单细胞水平上全面解析了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组动态变化,并揭示了其混合起源(成年骨髓和胚胎来源) 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;急性冷暴露的长期效应和具体机制仍需进一步探索 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性产热反应中的转录组可塑性和细胞起源 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞(表达胆碱乙酰转移酶) 单细胞转录组学 代谢性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,但涉及热中性或急性冷暴露条件下的小鼠脂肪组织 未明确指定 单细胞RNA-seq 未明确指定 未明确指定
214 2025-12-04
Tumor microenvironment remodeling across thyroid cancer differentiation states revealed by spatial transcriptomics
2025-Nov-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究利用空间转录组学技术揭示了甲状腺癌去分化过程中肿瘤微环境的动态重塑 首次在甲状腺癌不同分化状态中应用空间转录组学技术,系统揭示了去分化与免疫抑制性肿瘤微环境(特别是髓系细胞和CAFs增加)的空间关联,并识别了JAK-STAT和VEGF信号通路的激活 样本量较小(仅12例患者),需要更大队列研究验证结果;空间转录组学分辨率有限,可能无法完全解析细胞亚型异质性 探究甲状腺癌去分化过程中肿瘤微环境的动态变化及其与临床侵袭性的关系 甲状腺癌患者的肿瘤组织样本,包括分化型(PTC、FTC)和去分化型(PDTC、ATC) 数字病理学 甲状腺癌 空间转录组学、免疫组化、生物信息学分析(CellDART、PROGENy、REACTOME) NA 空间转录组数据、组织图像数据 12例甲状腺癌患者(涵盖PTC、FTC、PDTC、ATC亚型)的FFPE肿瘤组织 10x Genomics 空间转录组学 Visium CytAssist Visium CytAssist平台用于FFPE组织的空间转录组分析
215 2025-12-04
Partial Reprogramming in Senescent Schwann Cells Enhances Peripheral Nerve Regeneration via Restoration of Stress Granule Homeostasis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了衰老过程中雪旺细胞应激颗粒稳态失衡是导致周围神经再生受损的关键机制,并证明部分重编程可通过恢复该稳态来促进神经再生 首次发现Runx2雪旺细胞群在神经再生中的病理积累与应激颗粒稳态失衡相关,并证明部分重编程可通过恢复该稳态来逆转衰老相关的神经再生缺陷 研究主要基于大鼠模型,尚未在人类样本中得到验证;部分重编程的长期安全性和具体分子调控网络仍需进一步探索 探究部分重编程对衰老过程中周围神经再生的影响及其分子机制 年轻和衰老大鼠的坐骨神经损伤模型中的雪旺细胞 单细胞转录组学 周围神经损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻和衰老大鼠的坐骨神经样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
216 2025-12-04
Enhancer Reprogramming Reveals the Tumorigenic Role of PTPRZ1 in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合多组学分析揭示了肺鳞状细胞癌中增强子驱动的转录网络,并识别出PTPRZ1-MDK轴作为关键的可靶向通路 首次通过整合ChIP-seq、bulk RNA-seq、单细胞ATAC/RNA-seq和空间转录组学等多组学数据,系统描绘了LUSC中的肿瘤特异性致癌增强子网络,并发现PTPRZ1-MDK轴在肿瘤发生中的关键作用 研究样本量相对有限(59对匹配样本),且主要基于体外和体内功能验证,临床转化应用仍需进一步探索 识别肺鳞状细胞癌的新型致癌驱动因子并解析其表观遗传调控机制 59对匹配的肺鳞状细胞癌肿瘤组织和邻近正常组织 数字病理学 肺癌 ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因组学数据、表观基因组学数据、转录组学数据、空间转录组数据 59对匹配的LUSC肿瘤和邻近正常组织 NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq NA NA
217 2025-12-04
Spatial Transcriptomics Reveals Transcriptomic and Immune Microenvironment Reprogramming during Thyroid Carcinoma Dedifferentiation
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用空间转录组学技术揭示了甲状腺癌去分化过程中的转录组和免疫微环境重编程机制 首次在共存的不同分化程度甲状腺癌区域进行空间转录组测序,揭示了从分化型甲状腺癌向未分化型甲状腺癌逐步重编程的轨迹,并鉴定出PDCD4和TYMP等关键调控因子及其在诱导免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞形成中的作用 样本量较小(7例),且为回顾性研究,需要更大样本的前瞻性研究验证 阐明甲状腺癌去分化过程的分子机制和免疫微环境变化 甲状腺癌组织样本(包含未分化型、低分化型和分化型甲状腺癌共存区域) 空间转录组学 甲状腺癌 空间转录组测序、全外显子组测序、inferCNV分析、轨迹分析 NA 空间转录组数据、基因组数据 7个包含共存区域的样本 NA 空间转录组测序 NA NA
218 2025-12-04
Inhibition of Macrophage ARID3A Alleviates Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury After Heart Transplantation by Reducing THBS1/CD47 Signaling-Mediated Neutrophil Extracellular Traps Formation
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了巨噬细胞ARID3A在心脏移植后心肌缺血再灌注损伤中的作用,发现通过THBS1/CD47信号通路减少中性粒细胞胞外陷阱形成可缓解损伤 首次揭示了M1巨噬细胞通过THBS1/CD47轴促进NETs形成,并发现4-OI能特异性抑制巨噬细胞ARID3A,为治疗心肌缺血再灌注损伤提供了新靶点 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证,且具体信号通路的详细机制有待深入探索 探究心脏移植后心肌缺血再灌注损伤的分子机制,并寻找潜在治疗策略 巨噬细胞、中性粒细胞及其相互作用在心肌缺血再灌注损伤中的角色 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序、分子对接分析 NA 单细胞转录组数据 使用髓系特异性ARID3A敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
219 2025-12-04
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and cystic fibrosis disease
2025-Nov-01, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质免疫定位,首次将大鼠小肠中的CFTR高表达细胞鉴定为能够感知和响应管腔pH的神经足细胞,并确认BEST4+细胞在近端小肠中即为CHEs,为肠道生理和囊性纤维化疾病提供了新见解 首次将大鼠小肠中的CFTR高表达细胞鉴定为神经足细胞,并揭示其在管腔pH调节中的关键作用,同时首次在CF大鼠模型中表征了CHEs中CFTR及相关mRNA和蛋白质的变化 研究主要基于大鼠模型,人类数据验证有限;样本量未明确说明;未探讨CHEs在其他肠道疾病中的潜在作用 探究肠道中BEST4+细胞的身份、功能及其在囊性纤维化疾病中的作用机制 人类和大鼠肠道上皮细胞,特别是BEST4+细胞和CFTR高表达细胞(CHEs) 数字病理学 囊性纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),蛋白质免疫定位 NA RNA序列数据,蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
220 2025-12-04
Intrinsic changes in cell differentiation and identity drive impaired wound healing in aged female murine skin
2025-Nov-01, Biogerontology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了老年雌性小鼠皮肤中细胞内在变化如何导致伤口愈合受损的机制 首次在老年雌性小鼠皮肤和伤口中应用单细胞RNA测序,全面解析了细胞内在变化对伤口微环境的影响 研究仅针对雌性小鼠,且伤口观察时间点限于损伤后3天,未涵盖其他性别或更长时间窗口 探究老年皮肤中细胞内在变化如何影响伤口愈合的早期反应 年轻和老年雌性小鼠的完整皮肤及损伤后3天的伤口组织 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 年轻和老年雌性小鼠的皮肤及伤口组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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