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当前共找到 40811 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2026-06-22
Nanoplastics target lung monocytes, disrupting immune dynamics
2026-May-01, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
research paper 利用全身荧光成像、流式细胞术和单细胞RNA测序,研究纳米塑料在雌性小鼠体内的生物分布及其对肺免疫动态的影响 发现纳米塑料优先靶向肺脏,并特异性被非经典单核细胞和CD206+间质巨噬细胞摄取,扰乱了单核细胞向巨噬细胞的分化过程 仅使用雌性小鼠模型,未探讨不同性别或长期暴露的影响 探究纳米塑料在生物体内的分布及其对肺免疫动态的直接干扰机制 系统性暴露于纳米塑料的雌性小鼠的肺脏和血液细胞 machine learning geriatric disease 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 荧光成像 NA 单细胞转录组数据, 荧光成像数据 雌性小鼠(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 版本
202 2026-06-22
Multi-Omics Graph Attention Network for Key Gene Prediction in Triple-Negative Breast Cancer
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出基于图注意力网络的多模态框架,整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和影像组学数据,用于三阴性乳腺癌关键基因预测 首次将图注意力网络应用于单细胞多组学与影像组学的跨模态整合,通过多模态图结构捕捉转录调控、染色质可及性和成像特征间的相互作用,并利用集成多层感知器分层患者预后 未详细说明方法在更大规模或不同种族队列中的泛化能力,以及对计算资源的需求 开发可解释的多模态生物标志物发现策略,用于三阴性乳腺癌的个性化治疗 三阴性乳腺癌患者的单细胞转录组、染色质可及性和影像组学数据 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 影像组学 图注意力网络, 多层感知器 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 影像组学数据 外部TCGA-TNBC队列(未明确样本数量) NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
203 2026-06-22
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies BCAA metabolism-related prognostic signatures in head and neck squamous cell carcinoma
2026-05, Immunobiology IF:2.5Q3
研究论文 通过整合单细胞和批量RNA-seq分析,识别头颈部鳞状细胞癌中支链氨基酸代谢相关的预后基因特征 首次整合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据构建BCAA代谢相关四基因预后模型,并揭示其在免疫微环境和细胞分化中的潜在作用 结论主要基于计算预测,RT-qPCR验证队列样本量小,限制了实验验证的强度 识别头颈部鳞状细胞癌中与BCAA代谢相关的预后基因并阐明其功能角色 头颈部鳞状细胞癌患者样本 机器学习 头颈部鳞状细胞癌 RNA-seq, RT-qPCR Cox回归模型,LASSO回归模型 基因表达数据 多个数据集(TCGA-HNSCC, GSE65858, GSE41613, GSE103322, GSE140042)及RT-qPCR小样本 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
204 2026-06-22
Inferring gene-regulatory networks using epigenomic priors
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 利用表观基因组先验网络提高基因调控网络推断的准确性 通过整合DNA甲基化、染色质可及性和组蛋白修饰等多组学数据构建表观基因组先验网络,显著提升基因调控网络推断精度,且发现DNA甲基化数据在推断先验网络时比染色质可及性数据覆盖更多基因 未说明 开发基于表观基因组先验网络的基因调控网络推断方法并验证其有效性 12项不同研究的数据集,包括人类胚胎发育和乳腺癌风险女性的样本 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序、DNA甲基化测序、染色质可及性测序、组蛋白修饰测序 基因调控网络推断模型 基因表达数据、表观基因组数据 12项研究的公开数据集 NA 单细胞RNA测序、DNA甲基化测序、染色质可及性测序 NA NA
205 2026-06-22
DJ-1 inhibition reshapes tumor microenvironment and potentiates immune checkpoint inhibitors
2026-Apr-10, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 发现DJ-1作为T细胞负调控因子,抑制DJ-1通过调控巨噬细胞重编程增强抗肿瘤免疫并提高免疫检查点抑制剂疗效 首次揭示DJ-1通过调控巨噬细胞ROS/NF-κB/STAT3信号通路重编程肿瘤微环境,间接激活T细胞,并验证双硫仑作为DJ-1抑制剂可有效增强PD-1阻断抗肿瘤效果 主要为小鼠模型研究,临床转化仍需进一步验证 探索DJ-1作为免疫检查点抑制剂增敏靶点的潜力及机制 DJ-1基因敲除小鼠及荷瘤模型、肿瘤浸润CD45细胞、巨噬细胞 机器学习 癌症 单细胞测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠模型(具体样本量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于肿瘤浸润CD45细胞单细胞测序
206 2026-06-22
BEASTsim-a benchmarking and analysis platform for spatial transcriptomics simulations
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 介绍了一个用于空间转录组模拟的综合基准平台BEASTsim,评估不同模拟方法在数据属性分布、生物信号保存和相似性度量方面的性能 提出了一个超越简单数据复制的基准框架,强制模拟生成具有生物学意义的变异,并构建了帮助用户选择最合适模拟模型的决策树 未明确讨论平台的计算效率或大规模数据集上的扩展性,也未涉及真实组织类型模拟中可能出现的生物学复杂性不足 开发一个统一的评估平台,标准化空间转录组模拟方法的比较,促进空间转录组与单细胞RNA测序数据的整合 空间转录组模拟方法及单细胞RNA测序与空间转录组数据的整合分析 计算生物学 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、空间转录组数据 未知 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
207 2026-06-22
EZH2-Mediated Epigenetic Modifications Induce Pyroptosis in Dental Pulp Endothelial Cells via Activation of NLRP6 Inflammasome During Pulpitis Development
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究探索牙髓炎过程中牙髓组织的细胞组成变化和细胞焦亡通路,并初步验证EZH2通过NLRP6在脂多糖诱导的血管内皮细胞焦亡中的调控作用 首次揭示EZH2/NLRP6轴在牙髓炎内皮细胞焦亡中的关键调控作用,并提出其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于细胞和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,EZH2/NLRP6轴的临床相关性需进一步确认 阐明牙髓炎中内皮细胞焦亡的分子机制及EZH2的调控作用 牙髓组织中的血管内皮细胞(包括EOMA细胞系) 机器学习 牙髓炎 单细胞RNA测序,RNA测序,微阵列分析 NA 基因表达数据 公开单细胞RNA测序和微阵列数据,以及EZH2fl/fl;Tie2-Cre+/-小鼠牙髓组织 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
208 2026-06-22
Single-cell analysis of inhibitory efferent neurons of the zebrafish lateral line
2026, PloS one IF:2.9Q1
research paper 对斑马鱼侧线系统中抑制性传出神经元的单细胞分析 首次对斑马鱼侧线中三种抑制性传出神经元(REN、ROLE和RELL)进行单细胞RNA测序,揭示其转录组和神经支配模式的差异 转录分析未发现内在分子差异,功能差异需进一步通过逆行追踪等方法验证 探究斑马鱼侧线抑制性传出神经元的功能差异 斑马鱼幼虫的抑制性传出神经元(REN、ROLE和RELL) machine learning NA RNA-seq NA 基因表达数据 5日龄斑马鱼幼虫 NA single-cell RNA-seq NA NA
209 2026-06-22
A murine model of sepsis induces age- and sex-specific chromatin remodeling in myeloid-derived suppressor cells
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过高分辨率单分子技术MAPit-FENGC,构建小鼠脓毒症模型中髓源性抑制细胞的年龄和性别特异性染色质量塑图谱 首次采用单分子方法同时分析DNA甲基化和染色质可及性,揭示脓毒症后髓源性抑制细胞中年龄和性别依赖的启动子表观遗传类别 研究仅针对小鼠模型,且聚焦于特定靶基因启动子区域,可能无法完全反映人类脓毒症的复杂性 阐明脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制,特别是年龄和性别对髓源性抑制细胞染色质状态的影响 年轻和老年成年雄性及雌性小鼠的脾脏髓源性抑制细胞 表观遗传学 脓毒症 MAPit-FENGC,单细胞RNA测序 无监督聚类 DNA甲基化数据,染色质可及性数据,转录组数据 包括年轻和老年成年雄性及雌性小鼠,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA MAPit-FENGC用于单分子DNA甲基化和染色质可及性分析,单细胞RNA测序用于转录组分析
210 2026-06-22
Interrogation of glioma immune microenvironment identifies a non-canonical role for microglial Galectin-9 in tumor cell adhesion and phagocytosis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学和配体-受体相互作用分析,揭示小胶质细胞Galectin-9在胶质瘤免疫微环境中调控肿瘤细胞粘附和吞噬的非经典功能 首次发现小胶质细胞中的Galectin-9具有促进胶质瘤细胞粘附和吞噬的非经典作用,而非传统认知中的免疫抑制功能 基于体外共培养系统,缺乏体内实验验证;样本量有限且未涵盖所有IDH突变亚型 识别具有抗胶质瘤功能的髓系效应细胞并阐明其分子机制 胶质瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞(GAMs) 机器学习 胶质瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 18例IDH分型胶质瘤患者的肿瘤脑组织CD45+白细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
211 2026-06-22
Identification of non-cardiomyocytes marker genes in patients with diabetes and cardiomyopathy through single-cell analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,识别糖尿病和心肌病患者的非心肌细胞标志基因 首次通过单细胞RNA测序揭示非心肌细胞在糖尿病心肌病中的代谢、炎症和纤维化机制异质性,并发现PTPRC作为潜在治疗靶点 未提及该研究的局限性 探索非心肌细胞如何通过代谢、炎症和纤维化机制驱动糖尿病心肌病,并揭示新的治疗靶点 2型糖尿病患者的心脏组织中的非心肌细胞 生物信息学 糖尿病心肌病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
212 2026-06-22
Sphingolipid metabolic enzyme GLA expression in gliomas: prognostic implications and therapeutic potential
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 分析GLA在胶质瘤中的表达及其预后意义和治疗潜力 首次系统评估鞘脂代谢酶GLA在胶质瘤中的表达模式及其与预后、治疗抵抗和代谢通路的关系 主要基于数据库分析,功能验证仅在细胞系层面,缺乏体内实验和临床样本验证 探索GLA作为胶质瘤预后生物标志物的可能性及其生物学功能 胶质瘤患者肿瘤组织和胶质瘤细胞系 机器学习 胶质瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 基因敲低 NA 基因表达数据, 临床数据 TCGA和CGGA数据集中的胶质瘤样本,具体数量未提及 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina测序平台 NA
213 2026-06-22
Hypobaric hypoxia can lead to an increase in lung dendritic cells and promote T-cell immunosuppression, thereby preventing the excessive progression of high-altitude pulmonary edema
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究探讨了低压低氧环境下肺部树突状细胞增加及T细胞免疫抑制在高原肺水肿发展中的调控作用 首次揭示低压低氧诱导的肺部树突状细胞招募通过促进CD4+ T细胞免疫抑制来延缓高原肺水肿进展,并发现TNF-α在其中的负向调控作用 未提及具体局限性 阐明低压低氧条件下肺部树突状细胞对T细胞免疫抑制的影响及其在高原肺水肿发展中的保护机制 大鼠和小鼠的高原肺水肿模型,包括TNF-α缺陷小鼠和CD4中和抗体处理小鼠 机器学习 高原肺水肿 单细胞测序,流式细胞术,体外共培养 NA 单细胞测序数据,流式细胞数据 大鼠和小鼠的高原肺水肿模型样本,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
214 2026-06-22
Bioinformatics combined with machine learning for the identification of malignant transformation markers in colorectal polyps
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 利用生物信息学与机器学习方法,鉴定结直肠息肉恶变的标志物,并构建高精度诊断模型 结合单细胞RNA测序数据与多种机器学习算法(Boruta、LASSO、XGBoost)筛选出六个核心基因,并建立脊回归诊断模型,为结直肠癌早期诊断提供新标志物 未提及外部验证队列的多样性或模型在临床实践中的适用性限制 筛选调控结直肠肿瘤发生的核心基因,构建可靠的结直肠癌诊断模型 结直肠息肉恶变过程中的关键基因和诊断标志物 机器学习 结直肠癌 RNA-seq、单细胞RNA测序、qRT-PCR 脊回归、LASSO、XGBoost、Boruta算法 基因表达数据 GSE209741数据集(样本量未明确)、GSE161277单细胞RNA测序数据集、TCGA-COADREAD队列、GSE41258队列、CRC细胞系SW480和HCT116、正常结直肠上皮细胞系NCM460 NA 单细胞RNA-seq NA NA
215 2026-06-22
FCGR2B + Macrophages as a Critical Node Linking Ferroptosis and Immunosuppression: A Multiomics Framework for Prognosis and Therapy in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过多组学分析发现FCGR2B+巨噬细胞连接铁死亡与免疫抑制,并构建了高级别浆液性卵巢癌预后和治疗的多组学框架 首次将FCGR2B+肿瘤相关巨噬细胞作为连接铁死亡和免疫抑制的关键节点,并基于此构建四基因预后风险模型 未在更大规模或不同种族队列中验证模型,且缺乏对FCGR2B+巨噬细胞功能的进一步实验验证 探索FCGR2B+巨噬细胞在高级别浆液性卵巢癌中的预后意义及治疗潜力 FCGR2B+肿瘤相关巨噬细胞亚群及高级别浆液性卵巢癌患者 数字病理学 高级别浆液性卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
216 2026-06-21
Unraveling the role of non-coding RNAs in Parkinson's disease: Molecular mechanisms and therapeutic insights
2026 Aug-Sep, The international journal of biochemistry & cell biology
综述 该文章揭示了非编码RNA在帕金森病发病机制中的分子调控作用及其治疗潜力 系统整合了miRNA、lncRNA和circRNA三类非编码RNA在帕金森病中调控α-突触核蛋白稳态、线粒体功能、自噬及神经炎症的多层次机制,并引入单细胞测序和多组学数据揭示细胞特异性失调模式 仅基于现有文献综述,缺乏原始实验验证;未深入讨论非编码RNA作为治疗靶点的临床转化障碍(如递送系统、脱靶效应) 阐明非编码RNA在帕金森病中的分子机制并探索治疗前景 帕金森病相关的非编码RNA(miRNA、lncRNA、circRNA)及其调控网络 机器学习 神经退行性疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
217 2026-06-21
Blood IL-6 is a critical trigger of depressive symptoms in a mouse model for human atopic dermatitis
2026-Jun-20, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 探究特应性皮炎小鼠模型中血液IL-6如何触发抑郁样行为 首次发现外周血IL-6和sIL-6Rα通过破坏血脑屏障并激活海马IL-6Rβ信号抑制未成熟神经元生成,从而驱动特应性皮炎相关抑郁症状 研究仅在NC/Tnd小鼠模型中进行,未在人类受试者中验证临床相关性 阐明特应性皮炎导致抑郁的分子机制,特别是IL-6在海马神经发生中的角色 NC/Tnd自发特应性皮炎小鼠及IL-6缺陷小鼠 自然语言处理 特应性皮炎、抑郁症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NC/Tnd小鼠、IL-6缺陷小鼠以及联体共生小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
218 2026-06-21
Glucocorticoid and mitophagy signaling-based molecular subtyping reveals HMGA1 as a prognostic and immunotherapy biomarker in lung adenocarcinoma
2026-Jun-20, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究整合批量转录组和空间转录组数据,基于糖皮质激素与线粒体自噬信号通路对肺腺癌进行分子分型,并发现HMGA1作为预后和免疫治疗生物标志物 首次将糖皮质激素与线粒体自噬信号通路结合进行肺腺癌分子分型,并通过空间转录组学验证HMGA1在肿瘤上皮细胞中的富集及其与不良预后的关联 基于公开数据库的分析可能需要更多独立队列进行验证,功能性实验主要在体外和动物模型中进行,临床转化尚需进一步研究 探索肺腺癌的分子异质性并识别新的预后和免疫治疗生物标志物 肺腺癌患者的肿瘤组织和细胞系 数字病理学 肺癌 RNA测序,空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,空间转录组数据 TCGA和多个多中心队列的批量转录组数据,空间转录组样本用于原位验证 NA 批量RNA测序,空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
219 2026-06-21
ChatMDV: Reducing Technical Barriers in Bioinformatics Analysis using Large Language Models
2026-Jun-19, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 提出ChatMDV系统,通过自然语言界面与大型语言模型结合,降低生物信息学分析的技术门槛 将检索增强生成(RAG)流水线与大型语言模型集成到多维可视化工具MDV中,实现自然语言指令直接生成可执行Python代码和交互式可视化输出 未提及具体限制,可能依赖高质量语言表达和数据集兼容性 降低生物信息学可视化分析的技术壁垒,提升数据探索的可及性和可重复性 三个单细胞RNA测序数据集:PBMC3K、人类细胞图谱肺癌数据集和TAURUS纵向研究数据集 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 大型语言模型 文本 三个单细胞RNA测序数据集 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序平台
220 2026-06-21
Respiratory syncytial viral load drives ciliated cell dedifferentiation and suppresses antiviral immunity
2026-Jun-19, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序分析RSV感染人气道上皮细胞后病毒载量驱动的纤毛细胞去分化及抗病毒免疫抑制机制 揭示了RSV病毒载量依赖性地关闭纤毛细胞中纤毛形成、抗原呈递和先天免疫相关基因,并发现IRF1作为不被RSV抑制的抗病毒转录因子具有治疗潜力 未提及具体局限性 探究RSV如何重塑气道上皮细胞并逃避先天免疫的机制 成年原代人气道上皮细胞培养物及RSV感染后细胞 单细胞转录组学 呼吸道合胞病毒感染相关疾病 单细胞RNA测序、成像 NA 单细胞转录组数据、成像数据 成年原代人气道上皮细胞培养物,未明确样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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