单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 41079 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2026-06-26
Targeting non-canonical antigens unlocks functional T-cell responses in renal cell carcinoma
2026-Jun-24, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 开发整合蛋白质组学方法,系统鉴定肾细胞癌中非经典抗原,并证明其能激活功能性T细胞反应 首次证明低突变负荷肾细胞癌中非经典抗原驱动免疫原性,发现人类内源性逆转录病毒和长链非编码RNA衍生的肿瘤特异性抗原在患者间共享 未明确说明 系统鉴定肾细胞癌中非经典肿瘤特异性抗原并评估其免疫治疗潜力 肾细胞癌样本中的非经典抗原和T细胞反应 数字病理学 肾细胞癌 免疫肽组学,外显子组测序,转录组测序,单细胞RNA测序 NA 测序数据,细胞实验数据,小鼠模型数据 患者肾细胞癌样本,患者来源肿瘤样细胞簇,小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
202 2026-06-26
Spatial immune atlas of breast cancer brain metastasis reveals CD163+ macrophage reprogramming associated with immune escape
2026-Jun-24, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过整合高多重成像质谱流式、单细胞RNA测序和空间转录组数据,揭示了乳腺癌脑转移中CD163+巨噬细胞重编程与免疫逃逸相关的空间免疫图谱 首次在单细胞分辨率下整合成像质谱流式、单细胞RNA测序和空间转录组数据,系统构建了乳腺癌脑转移的空间免疫微环境图谱,并发现了CD163+巨噬细胞重编程与免疫逃逸之间的关联 样本量有限,仅包含20个原发肿瘤和40个脑转移组织的感兴趣区域;功能验证仅在体内动物模型中进行 阐明乳腺癌脑转移中免疫微环境的空间组织和分子回路 人类乳腺原发肿瘤组织和脑转移组织 数字病理学 乳腺癌 IMC, scRNA-seq, 空间转录组 NA 图像, 文本 20个原发肿瘤感兴趣区域和40个脑转移感兴趣区域;10例乳腺癌和12例脑转移的单细胞RNA测序样本;7例乳腺癌和1例脑转移的空间转录组样本 NA NA NA NA
203 2026-06-26
From xylem atlases to developmental continuity in forestry
2026-Jun-24, Trends in plant science IF:17.3Q1
研究论文 通过整合单细胞、单核和空间转录组学数据,在白杨木质部中重建发育连续性,揭示细胞状态与解剖背景的联系 提出将细胞解析图谱置于解剖学背景中解释,并关联发育连续性与实验验证的新原则 未明确提及研究局限性,可能包括样本量限制或模型物种的代表性不足 从细胞图谱中恢复木质部发育的连续性 白杨木质部 机器学习 NA 单细胞转录组学, 单核转录组学, 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
204 2026-06-26
An immunological panacea for cancer-related cachexia
2026-Jun-24, Trends in cancer IF:14.3Q1
综述 本文系统总结了癌症恶病质中免疫系统作为组织消耗核心驱动力的最新发现,并提出免疫代谢网络调控理论 将癌症恶病质从单纯营养缺乏概念重塑为免疫系统主导的多器官免疫代谢网络失调,并整合单细胞多组学与人工智能推动临床分型 未涉及具体临床干预策略的验证性数据,且对免疫代谢网络的分子机制描述仍停留在理论框架层面 阐明免疫系统在癌症恶病质组织消耗中的核心调控作用,提出个体化免疫代谢干预的理论框架 癌症恶病质患者及动物模型中的免疫细胞、肌肉细胞、脂肪细胞及其相互作用网络 数字病理学、机器学习 癌症相关疾病(恶病质) 单细胞多组学、空间转录组学 NA 多组学数据(转录组、空间转录组) NA 10x Genomics 单细胞多组学、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 单细胞多组学与空间转录组测序平台
205 2026-06-26
Persistent hindrances to data re-use in single-cell genomics
2026-Jun-24, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 评估公共单细胞RNA测序研究数据重用性的障碍 系统评估了10x Genomics单细胞RNA-seq数据在GEO中的可重用性,揭示了仅约40%的研究提供了可用的处理计数数据 研究仅聚焦于10x Genomics平台的数据,可能不适用于其他单细胞技术平台 评估公共单细胞RNA-seq研究数据的可重用性现状 Gene Expression Omnibus数据库中公开的10x Genomics单细胞RNA-seq研究数据集 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 表达计数矩阵数据、细胞类型注释数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium平台单细胞RNA测序
206 2026-06-26
Neutrophil-derived S100A8/A9 impairs megakaryocyte maturation in immune thrombocytopenia
2026-Jun-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞和空间转录组学揭示中性粒细胞来源的S100A8/A9通过TLR4-JNK/c-Jun信号轴损害免疫性血小板减少症中巨核细胞成熟 首次发现中性粒细胞-巨核细胞轴在ITP骨髓中的作用,并确定S100A8/A9-TLR4-JNK/c-Jun通路为治疗靶点 未明确提及局限性 探究炎症介质如何损害免疫性血小板减少症中的血小板生成机制 免疫性血小板减少症患者的骨髓样本和小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 图像、文本 ITP患者骨髓样本和CD34来源的巨核细胞培养物;小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞基因表达,10x Visium空间基因表达
207 2026-06-26
High-resolution spatial transcriptomics of adult and pediatric human liver with Visium HD
2026-Jun-24, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 利用10x Genomics的Visium HD技术对成人和儿童人类肝脏进行高分辨率空间转录组学分析,构建细胞级别和空间分辨的肝脏图谱 首次应用Visium HD空间转录组学技术以2微米亚细胞分辨率对肝脏样本进行高分辨率空间基因表达图谱构建,避免了单细胞解离中的细胞类型偏差 未提及具体局限性,但可能涉及样本数量有限(仅3例供体)及技术可及性 构建高分辨率肝脏空间转录图谱以揭示细胞和结构异质性,为疾病特异性空间标志物和治疗靶点识别提供资源 来自2名成人和1名儿童供体的健康人类肝脏组织样本 空间转录组学 NA Visium HD空间转录组学 聚类分析 空间基因表达数据 3例人类肝脏供体样本(2名成人、1名儿童) 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD 10x Genomics Visium HD技术,bin宽度为2微米,实现亚细胞分辨率
208 2026-06-26
Hypoimmunogenic iPSC-derived hepatic organoids featuring a functional vascular network
2026-Jun-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究结合组织工程与低免疫原性iPSC技术,生成了包含功能性血管网络且低免疫原性的肝类器官 首次将低免疫原性iPSC技术与组织工程结合,构建出包含多种实质与非实质细胞(包括血管和窦状内皮细胞)的肝类器官,并验证其具有功能性血管网络 未提及具体研究局限性 为解决终末期肝病移植供体短缺和免疫排斥问题,开发一种即用型、低免疫原性的肝类器官 诱导多能干细胞(iPSC)衍生的肝细胞、胆管细胞、肝星状细胞、库普弗细胞以及血管和窦状内皮细胞 数字病理学 终末期肝病 单细胞RNA测序 NA 图像 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
209 2026-06-26
ScQCenrich enables multi-metric quality control for single-cell RNA sequencing
2026-Jun-24, Communications biology IF:5.2Q1
research paper 提出scQCenrich,一种用于单细胞RNA测序的多指标质量控制框架,整合规范指标与内含子比例、MALAT1富集、解离应激特征等,跨数据集验证减少过度过滤并保持细胞群体一致性 首次将内含子比例、MALAT1富集和解离应激特征整合到单细胞RNA测序的质量控制框架中,提供可解释的多指标QC决策,优于传统固定阈值和基于模型的比较方法 仅适用于细胞调用后的全细胞单细胞RNA测序数据,在高品质外周血单核细胞数据中表现保守,可能对某些特殊细胞类型或平台适用性需进一步验证 开发并验证一个多指标、可解释的质量控制框架,以改进单细胞RNA测序数据的质量控制决策 小鼠大脑、小鼠心脏和肺癌数据集,以及高品质外周血单核细胞数据 machine learning lung cancer scRNA-seq NA 单细胞基因表达数据 小鼠大脑、小鼠心脏和肺癌数据集,以及高品质外周血单核细胞数据 NA single-cell RNA-seq NA NA
210 2026-06-26
ZFP36L1 and ZFP36L2 cooperatively regulate thymic epithelial cell function to prevent early-onset thymic involution
2026-Jun-24, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 该研究揭示了ZFP36L1和ZFP36L2两种RNA结合蛋白协同调节胸腺上皮细胞功能,防止早发性胸腺退化的机制 首次发现ZFP36L1和ZFP36L2在胸腺上皮细胞中具有协同作用,通过转录后调控维持胸腺微环境,防止过早胸腺退化 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;具体分子机制如靶基因识别仍需进一步探索 阐明胸腺上皮细胞分化过程中RNA结合蛋白ZFP36L1和ZFP36L2的功能及分子机制 胸腺上皮细胞及其分化过程 机器学习 NA 单细胞转录组测序,条件性基因敲除,谱系追踪 NA 单细胞转录组数据 成年小鼠胸腺组织样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
211 2026-06-26
A novel lactylation-related gene signature deciphers the immunosuppressive microenvironment and stratifies precision therapy in colorectal cancer
2026-Jun-24, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 构建了一种新的乳酸化相关基因特征,用于解析结直肠癌的免疫抑制微环境并指导精准治疗 首次基于组蛋白乳酸化修饰构建了9基因预后特征,整合了代谢重编程与免疫微环境分析,并提出了针对不同风险分层的差异化治疗策略 未提供明确的局限性说明 探索结直肠癌中乳酸化相关基因的预后价值及其对肿瘤微环境和治疗敏感性的影响 结直肠癌患者的转录组数据、单细胞RNA测序数据和蛋白质水平验证 机器学习 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Cox回归, LASSO 基因表达数据 TCGA和GEO队列(具体样本数未提及) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
212 2026-06-26
Elucidating the therapeutic targets and multi-target mechanisms of salvianolic acid A for diabetic nephropathy
2026-Jun-24, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 本研究系统阐释了丹酚酸A通过多靶点机制治疗糖尿病肾病的分子靶点和药理作用 结合机器学习和孟德尔随机化方法鉴定核心靶点,并利用单细胞RNA测序揭示靶点在肾细胞类型中的特异性表达 目前仅通过体外高糖诱导足细胞损伤模型验证,缺乏体内动物实验和临床试验的进一步验证 阐明丹酚酸A治疗糖尿病肾病的潜在靶点和多靶点作用机制 丹酚酸A的潜在药物靶点和糖尿病肾病相关靶点 机器学习和生物信息学 糖尿病肾病 R T - Q P C R 人工智能 基因表达数据 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用
213 2026-06-26
Stage-associated remodeling of CD169 macrophage states is linked to immune regulation in colitis-associated colorectal cancer
2026-Jun-24, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1
研究论文 通过遗传耗竭、单细胞转录组学和药理学干预,研究CD169巨噬细胞状态在结肠炎相关结直肠癌进展过程中的重塑及其免疫调节作用 首次揭示CD169巨噬细胞在结肠炎相关结直肠癌不同阶段的功能状态重塑,发现CD169-low和CD169-mid/high巨噬细胞具有相反的免疫调控作用,并提出CD169相关巨噬细胞作为炎症驱动结直肠癌的潜在治疗靶点 NA 研究CD169巨噬细胞状态在结肠炎相关结直肠癌进展中的动态变化及其免疫调节机制 CD169相关巨噬细胞状态 机器学习 结直肠癌 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 人类结肠炎相关结直肠癌标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
214 2026-06-26
Airway immune signatures of protection and disease progression in recent human tuberculosis household contacts
2026-Jun-24, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 以单细胞分辨率探究近期结核病家庭接触者气道免疫特征,揭示保护与疾病进展的免疫机制 首次在活动性结核患者和结核进展者支气管肺泡灌洗液中通过单细胞RNA测序揭示I型IFN依赖性和非依赖性中性粒细胞特征,并发现非进展者的T细胞保护性特征与调节、静止及干细胞样基因表达相关 样本量有限且仅聚焦于近期接触者,未纳入远期感染控制人群 明确结核分枝杆菌感染后个体能否维持健康或进展为活动性结核的局部免疫决定因素 近期结核病家庭接触者(包括感染控制者和疾病进展者)以及初诊活动性结核患者 单细胞转录组学 结核病 单细胞RNA测序 NA 支气管肺泡灌洗液基因表达数据 近期结核病家庭接触者(感染控制者和进展者)及活动性结核患者的支气管肺泡灌洗液样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
215 2026-06-26
Epigenetic and immunological alterations in umbilical cord blood of overweight/obese women with gestational diabetes mellitus: insights into DNA methylation signatures and immune cell dysregulation
2026-Jun-24, BMC pregnancy and childbirth IF:2.8Q1
研究论文 探讨超重/肥胖妊娠期糖尿病患者脐带血中DNA甲基化特征及免疫细胞失调的表观遗传和免疫变化 首次通过Illumina 850K甲基化芯片和单细胞RNA测序结合Lasso回归构建基于CpG位点的分类模型,揭示GDM在超重/肥胖孕妇脐带血中的DNA甲基化与免疫细胞组成变化的关联 样本量较小(30例),且仅限于超重/肥胖孕妇人群,结果需在更大规模前瞻性队列中验证 探究GDM对超重/肥胖孕妇脐带血DNA甲基化模式及免疫细胞组成的影响,并开发潜在生物标志物 30例超重/肥胖妊娠女性的脐带血样本(含GDM和非GDM组) 表观遗传学 妊娠期糖尿病 Illumina 850K甲基化芯片, 单细胞RNA测序 Lasso回归分类模型 甲基化数据, 单细胞转录组数据 30例孕妇脐带血样本(训练集)及独立单细胞RNA测序队列 Illumina 甲基化芯片, 单细胞RNA测序 Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip (850K) NA
216 2026-06-26
ACOT9, a mitochondrial metabolism-related gene, promotes ROS-associated epithelial remodeling in laryngeal squamous cell carcinoma
2026-Jun-24, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 开发喉鳞状细胞癌线粒体代谢相关基因预后特征并验证ACOT9通过线粒体活性氧促进肿瘤进展的生物学功能 首次构建基于178种机器学习模型组合的线粒体代谢相关基因预后特征,并通过虚拟敲除分析揭示ACOT9调控LAMC2和KRT17的新机制 基于公开数据库分析,缺乏多中心大样本队列的外部验证;ACOT9具体分子调控机制尚未完全阐明 开发喉鳞状细胞癌的线粒体代谢相关基因预后特征并阐明ACOT9在肿瘤进展中的生物学作用 喉鳞状细胞癌患者的肿瘤组织标本和细胞系 数字病理学 喉癌 RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,免疫荧光,qRT-PCR,蛋白免疫印迹,活性氧检测 机器学习组合模型(包括Cox比例风险模型、随机生存森林等) 基因表达数据,单细胞转录组数据,病理图像,细胞实验数据 TCGA-LSCC队列(具体样本数未提供),GSE65858独立验证集,GSE290927单细胞数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
217 2026-06-26
Non-syndromic premature ovarian insufficiency associated with monoallelic LIG4 mutation via haploinsufficiency
2026-Jun-24, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
研究论文 该研究通过全外显子组测序发现LIG4基因的杂合移码突变与非综合征型卵巢早衰相关,并利用功能实验和单细胞RNA测序数据揭示了其通过单倍体不足影响DNA损伤修复和卵母细胞成熟的机制 首次报道LIG4基因杂合突变通过单倍体不足机制导致非综合征型卵巢早衰,揭示了NHEJ通路在人类卵巢功能维持中的新作用 研究结果需要在更生理相关的模型中进行进一步验证 探究LIG4基因变异对非综合征型卵巢早衰的潜在贡献 一个三代汉族非综合征型卵巢早衰家系 机器学习 卵巢早衰 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 NA DNA序列, 单细胞RNA表达数据 一个三代家系中的多名患者 NA 单细胞RNA测序 NA 公共单细胞RNA测序数据
218 2026-06-26
Mapping the evolutionary landscape of intestinal organoids: from self-organization biology to precision medicine
2026-Jun-24, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
综述 通过文献计量分析,系统绘制了肠道类器官研究从1986年至2025年的演进图谱,揭示其从基础自我组织生物学向精准医学转化的趋势 首次利用文献计量学综合揭示肠道类器官领域的全球研究格局、影响力分布及新兴热点(如器官芯片、力学生物学、单细胞测序) 文献来源仅基于Web of Science核心合集,可能遗漏部分灰色文献或非英语研究 系统梳理肠道类器官研究演进轨迹,为未来精准工程化肠道模型开发提供导航 肠道类器官研究领域的全球文献和科研主题 NA 结直肠癌、炎症性肠病 NA NA 文本(文献数据) NA NA 单细胞测序 NA NA
219 2026-06-26
Genetic and epigenetic underpinnings of biological aging: a multi-omics study integrating Mendelian randomization, spatial transcriptomics, and drug target discovery
2026-Jun-24, Clinical epigenetics IF:4.8Q1
研究论文 通过整合孟德尔随机化、空间转录组学和药物靶点发现的多组学研究,揭示生物衰老的遗传和表观遗传基础 开发了四层分析框架,整合因果筛选、多组学效应基因定位、空间转录组学和药物靶点评估,首次在遗传水平上表征驱动多维表观遗传衰老的因果炎症介质及其效应基因 未明确说明 探究炎症因子驱动表观遗传衰老的因果机制,并识别潜在的药物靶点 91种循环炎症蛋白与六种衰老表型,全血分子QTL资源(eQTL、sQTL、pQTL、mQTL),小鼠E16.5胚胎图谱 机器学习 老年性疾病 孟德尔随机化、空间转录组学、多组学分析 NA 基因表达、剪接、蛋白质、甲基化数据 eQTL(31,684人)、sQTL(755人)、pQTL(34,232人)、mQTL(1,980人),小鼠E16.5胚胎(121,767个细胞) NA 空间转录组学 NA NA
220 2026-06-26
The role of ESRRA and JUNB in oxyphil cells: insights from spatial transcriptomics and single-cell transcriptomics in uremic secondary hyperparathyroidism
2026-Jun-24, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 通过空间转录组学和单细胞转录组学整合分析,揭示ESRRA和JUNB在尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症嗜酸细胞中的作用 首次整合空间转录组学和单细胞转录组学,高置信度鉴定嗜酸细胞,并揭示ESRRA参与线粒体生物合成及JUNB通过结合VDR基因启动子区改善钙三醇抵抗的新机制 未提及明显局限性 探究尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中嗜酸细胞的特征及其与钙三醇抵抗的关系 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症患者的甲状旁腺嗜酸细胞 数字病理学 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 6例尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症样本和3例正常甲状旁腺样本用于单细胞转录组学,1例最适样本用于空间转录组学(共93073个细胞) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
回到顶部