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当前共找到 33678 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2025-12-05
Lymphotoxin-driven cancer cell eradication by tumoricidal CD8 + TIL
2025-Nov-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过患者来源的TIL-黑色素瘤共培养系统,鉴定并表征了一种新型CD8+ TIL亚群,该亚群能够进行HLA I类非依赖性癌细胞裂解,并揭示了淋巴毒素β受体和干扰素感应通路在TIL介导的癌细胞杀伤中的关键作用 首次识别出一种新型CD8+ TIL亚群,该亚群具有HLA I类非依赖性癌细胞裂解能力,并通过全基因组CRISPR筛选确定了淋巴毒素β受体和干扰素感应通路为TIL介导癌细胞杀伤的关键决定因素 研究主要基于患者来源的TIL-黑色素瘤共培养系统,可能未完全反映体内肿瘤微环境的复杂性,且临床样本量有限 探究肿瘤浸润淋巴细胞疗法中关键TIL亚群及其介导癌细胞杀伤的分子机制 患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞和黑色素瘤细胞 免疫肿瘤学 黑色素瘤 全基因组CRISPR筛选、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 NA 单细胞测序数据、CRISPR筛选数据 患者来源的TIL和黑色素瘤细胞样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq NA NA
202 2025-12-05
Serum Procalcitonin: A Novel Tumor Biomarker for Diagnosis and Follow-Up in Fibrolamellar Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究探讨了血清降钙素原(PCT)作为纤维板层肝细胞癌(FLC)的新型肿瘤生物标志物在诊断和治疗监测中的潜在作用 首次将血清PCT确定为FLC的敏感且特异性生物标志物,并在血清和肿瘤水平上验证了其诊断和监测价值,填补了FLC缺乏可靠循环生物标志物的空白 样本量相对较小(18例FLC患者),且为回顾性研究,未来需要前瞻性验证和更大规模队列研究 评估血清降钙素原(PCT)作为纤维板层肝细胞癌(FLC)生物标志物的诊断和监测效用 纤维板层肝细胞癌(FLC)患者、肝细胞癌(HCC)患者、胆管癌(CCA)患者、肝硬化患者以及相关肿瘤组织样本 数字病理学 肝细胞癌 RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 NA 血清样本、肿瘤组织RNA测序数据、空间转录组学数据、免疫组织化学图像 34份血清样本来自18例转移性FLC患者,以及64例HCC、24例CCA、20例肝硬化患者;RNA测序分析包括27例FLC肿瘤、331例HCC肿瘤、39例CCA肿瘤、71例肝母细胞瘤、34例肝细胞腺瘤和55例非肿瘤肝样本;空间转录组学分析3例FLC;免疫组织化学分析13例FLC和34例其他原发性或继发性肝癌 NA RNA测序, 空间转录组学 NA NA
203 2025-12-05
A Multimodal Atlas Reveals the Anatomical Distribution of Medium Spiny Neuron Subtypes and a Novel RGS6+ Population in the Primate Striatum
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究结合单核多组学测序和高通量空间转录组学,构建了猕猴纹状体中型多棘神经元的全面图谱,揭示了新的神经元亚型和疾病风险关联 首次在灵长类纹状体中结合多组学和空间转录组学技术,识别出两个新的腹侧纹状体亚型(D1-VS-RGS6和D2-VS-RGS6),并揭示了细胞类型沿头尾轴的梯度分布 研究主要基于猕猴模型,结果向人类直接推广需谨慎;空间转录组学分辨率可能不足以捕捉所有细胞亚型细节 构建灵长类纹状体中型多棘神经元的综合图谱,以理解其细胞多样性、解剖分布及与疾病机制的关联 猕猴纹状体中的中型多棘神经元 数字病理学 帕金森病、物质使用障碍、精神分裂症、双相情感障碍 单核多组学测序、空间转录组学、ATAC-seq NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 约540万个空间解析细胞,覆盖纹状体全头尾和背腹范围 NA 单核多组学测序、空间转录组学 NA NA
204 2025-12-05
CBKMR: A Copula-based Bayesian Kernel Machine Regression Framework for Optimal Marker Detection in Omics Data
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于Copula的贝叶斯核机器回归框架,用于优化组学数据中的生物标志物检测 提出了CBKMR模型,通过使用适合离散结果的边际分布和捕获观测间核诱导依赖性的高斯Copula,解决了传统BKMR在处理离散结果时的偏差和不稳定性问题,并进一步引入了基于最近邻高斯过程的NNCBKMR变体以提高计算效率 NA 开发一个能够捕获非线性基因-结果关系和高阶相互作用,同时具备自动相关性确定和不确定性量化的生物标志物检测框架 高通量组学数据中的生物标志物检测 机器学习 NA 单细胞RNA测序 贝叶斯核机器回归,高斯Copula,最近邻高斯过程 组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
205 2025-12-05
sc4D: spatio-temporal single-cell transcriptomics analysis through embedded optimal transport identifies joint glial response to Alzheimer's disease pathology
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究提出了一个名为sc4D的生物可解释性时空分析框架,用于整合单细胞转录组数据,以研究阿尔茨海默病中的胶质细胞反应机制 开发了结合自编码器嵌入与最优传输的时空(4D)分析框架,能够联合建模疾病过程中的细胞状态、空间环境与时间动态,并预测干预措施 当前计算方法在联合建模复杂动态或从扰动实验中推断细胞轨迹方面能力有限 阐明疾病机制并预测能够改善细胞反应的候选干预措施 阿尔茨海默病小鼠模型的纵向空间转录组样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学,空间转录组学 自编码器,最优传输 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
206 2025-12-05
CDH3 as a Novel Therapeutic Target in Basal-like Double-Negative Prostate Cancer
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了CDH3在基底样前列腺癌中的作用,并评估了针对CDH3的抗体药物偶联物和CAR T细胞治疗策略 首次将CDH3识别为基底样前列腺癌的关键标志物和功能驱动因子,并开发了针对CDH3的ADC和CAR T细胞疗法,展示了在临床前模型中的显著疗效 研究主要基于小鼠模型和临床前实验,尚未在人类临床试验中验证,且样本量有限 阐明CDH3在基底样前列腺癌中的作用,并评估CDH3靶向治疗策略的潜力 基底样(双阴性)前列腺癌 癌症研究 前列腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、抗体药物偶联物和CAR T细胞技术 基因工程小鼠模型、异种移植模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 小鼠前列腺癌模型和人类前列腺癌数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
207 2025-12-05
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Neutrophil Clusters Associated with Autoimmune Neuroinflammation
2025-Nov-19, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了与自身免疫性神经炎症相关的嗜中性粒细胞簇,并发现Saa3/SAA1作为潜在生物标志物和治疗靶点 首次在EAE模型中利用scRNA-Seq揭示嗜中性粒细胞在CNS炎症中的异质性,并识别出Saa3/SAA1作为MS的潜在生物标志物 研究基于小鼠EAE模型,结果在人类MS中的直接适用性需进一步验证 探究嗜中性粒细胞在自身免疫性神经炎症(如多发性硬化症)中的具体作用和异质性 小鼠EAE模型中的嗜中性粒细胞,以及多发性硬化症患者的血浆样本 单细胞组学 多发性硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 单细胞转录组数据 小鼠小脑和脊髓的嗜中性粒细胞,以及MS患者和健康对照的血浆样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
208 2025-12-05
CD301b lectin expression in the breast tumor microenvironment augments tumor growth
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了CD301b凝集素在乳腺癌微环境中的表达如何促进肿瘤生长 首次将肿瘤糖基化与CD301b⁺髓系细胞的凝集素信号传导联系起来,揭示其在调节免疫活性和促进肿瘤进展中的作用 研究主要基于小鼠模型,人类数据有限,且机制细节需进一步验证 研究肿瘤糖基化与凝集素相互作用对乳腺癌进展的影响 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类乳腺癌样本 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
209 2025-12-05
Comparative Single-Cell Transcriptomics Uncovers Shared and Distinct Molecular Signatures in Cystic Fibrosis and Primary Ciliary Dyskinesia
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过比较单细胞转录组学分析,揭示了囊性纤维化(CF)和原发性纤毛运动障碍(PCD)之间的共享和独特分子特征 利用预训练的transformer模型(scGPT)进行微调,并通过差异注意力分析识别两种疾病之间注意力分数改变的基因和通路,首次在单细胞水平上比较CF和PCD的分子机制 研究依赖于公开可用的测序数据,可能受数据质量和样本来源的限制,未涉及长期临床结果验证 比较CF和PCD的细胞异质性、分子通路和基因网络差异,以揭示其不同的分子机制 囊性纤维化(CF)和原发性纤毛运动障碍(PCD)患者的呼吸道细胞 自然语言处理 囊性纤维化 单细胞RNA-seq transformer(scGPT) 文本(基因表达数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
210 2025-12-05
Analysis of clinical, single cell, and spatial data from the Human Tumor Atlas Network (HTAN) with massively distributed cloud-based queries
2025-Nov-17, Research square
研究论文 本文介绍了人类肿瘤图谱网络(HTAN)开发的基于云的基础设施,用于整合和分析大规模、多模态的癌症数据集 引入了两个关键创新:1)基于来源的HTAN ID表,简化了队列构建和跨检测整合;2)新颖地适配了BigQuery的地理空间功能用于空间生物学,实现了肿瘤微环境的邻域和相关性分析 未明确提及具体的技术或计算限制 开发一个云基础设施,以降低整合、探索和分析大规模多模态癌症数据集的技术和计算障碍 人类肿瘤图谱网络(HTAN)生成的数据集,包括单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像数据以及临床数据 空间生物学 癌症 单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像 NA 单细胞数据、空间数据、临床数据、元数据 NA Google 单细胞RNA-seq、空间转录组学 Google BigQuery 基于Google BigQuery的云基础设施,托管于系统生物学研究所癌症云网关(ISB-CGC)
211 2025-12-05
Multiscale Cell-Cell Interactive Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种多尺度细胞-细胞交互空间转录组学分析方法,用于整合基因表达谱与空间位置信息 首次在空间转录组学分析中系统性地整合了多尺度细胞-细胞相互作用,并结合了多尺度拓扑表示与前沿空间深度学习技术 NA 开发一种能够捕捉多尺度细胞-细胞相互作用的空间转录组学分析方法 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 空间深度学习技术 空间转录组学数据 37个基准空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
212 2025-12-05
Decipherment of disulfidptosis-related mutation profile, chemosensitivity, and prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Nov, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
研究论文 本研究通过分析弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)及其他多种肿瘤的转录组、体细胞突变和单细胞RNA测序数据,探索了二硫键死亡相关基因(DRGs)的表达谱、突变特征及其与预后和化疗敏感性的关联,并构建了一个新的DRGs风险评分模型 首次在DLBCL中系统研究了二硫键死亡相关基因(DRGs)的表达、突变及其临床意义,并构建了一个新的DRGs风险评分模型,该模型在DLBCL及泛癌分析中显示出良好的预后预测和化疗敏感性评估价值 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证DRGs评分模型的临床应用价值 探索二硫键死亡相关基因(DRGs)在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的表达、突变特征及其与患者预后、化疗敏感性的关系 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者及其他30种肿瘤类型的转录组、体细胞突变和单细胞RNA测序数据 生物信息学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 转录组测序,单细胞RNA测序(scRNA-seq),体细胞突变分析,分子对接分析 风险评分模型 转录组数据,突变数据,单细胞RNA测序数据 涉及DLBCL患者及30种肿瘤类型的转录组和突变数据,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
213 2025-12-05
Adenylate Uridylate- (AU-) Rich Element Gene-Based Prognostic Signature and Molecular Subtypes of Prostate Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Immune Microenvironment
2025-Nov, Archivos espanoles de urologia IF:0.6Q4
研究论文 本研究基于腺苷酸尿苷酸富集元件基因构建了一个前列腺腺癌的预后特征和分子亚型,用于预测预后和反映免疫微环境特征 首次利用AREGs基因(ACSM3、ACTG2、DES)构建前列腺腺癌的预后模型,并关联免疫微环境分析 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅限于qRT-PCR,缺乏更深入的体内外功能验证 开发前列腺腺癌的预后预测模型并探索其与免疫微环境的关系 前列腺腺癌患者 生物信息学 前列腺癌 加权基因共表达网络分析、Cox回归、LASSO正则化、CIBERSORT免疫浸润分析、单细胞转录组学、qRT-PCR 预后风险模型 基因表达数据 基于公共PRAD数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞转录组学 NA NA
214 2025-12-05
Video - Visual Integration of Drosophila Enhancer Organization: A tool for integrating and visualizing chromatin accessibility, in vivo transcription factor binding and motif occurrence in tissue-specific differentially expressed genes
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为VIDEO的基于网络的分析工具,用于整合和可视化果蝇增强子组织中染色质可及性、转录因子结合及基序出现情况 开发了一个交互式工具,允许研究人员在组织特异性背景下探索转录因子结合基序如何与转录活性和染色质可及性相交 NA 开发一个工具以促进对组织特异性差异表达基因调控机制的理解 果蝇增强子组织、组织特异性差异表达基因 生物信息学 NA RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 原位杂交, 微阵列, scRNA-seq NA 基因组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq NA NA
215 2025-12-05
BASIN: Bayesian mAtrix variate normal model with Spatial and sparsIty priors in Non-negative deconvolution
2025-Oct-24, ArXiv
PMID:41281239
研究论文 本文提出了一种名为BASIN的贝叶斯矩阵变量正态模型,用于空间转录组学中的细胞类型反卷积,通过结合空间和稀疏性先验来提高反卷积的准确性和效率 BASIN首次将矩阵变量贝叶斯非负矩阵分解方法应用于细胞类型反卷积,通过保持变量矩阵形式推导更高效的矩阵正态后验,并提供不确定性量化 未明确说明模型在复杂组织或高噪声数据中的泛化能力,以及计算效率在大规模数据集上的具体表现 开发一种新的细胞类型反卷积方法,以从空间转录组学数据中推断细胞组成 空间转录组学数据 数字病理学 NA 空间转录组学 贝叶斯非负矩阵分解(NMF) 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
216 2025-12-05
Sepsis Induces Age- and Sex-Specific Chromatin Remodeling in Myeloid-Derived Suppressor Cells
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单分子表观遗传学技术揭示了脓毒症后骨髓源性抑制细胞(MDSCs)中与年龄和性别相关的染色质重塑机制 首次使用MAPit-FENGC单分子技术同时分析DNA甲基化和染色质可及性,构建了脓毒症后MDSCs的高分辨率表观遗传图谱,并揭示了年龄和性别特异性的染色质动态变化 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;样本量相对有限 阐明脓毒症幸存者长期免疫功能障碍的表观遗传机制 骨髓源性抑制细胞(MDSCs) 表观遗传学 脓毒症 MAPit-FENGC(单分子DNA甲基化和染色质可及性分析),单细胞RNA测序 无监督聚类分析 表观遗传数据,转录组数据 年轻和年老成年雄性和雌性小鼠的脾脏MDSCs NA 单细胞RNA测序 NA NA
217 2025-12-05
A lifespan transcriptomic atlas of the human prefrontal cortex at single-cell resolution
2025-Oct-06, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究构建了人类背外侧前额叶皮层(DLPFC)的首个跨生命周期的单细胞核转录组图谱,揭示了其细胞和分子程序随年龄变化的动态规律 首次构建了覆盖人类完整生命周期(0-97岁)的DLPFC单细胞核转录组图谱,识别了三个不同的转录组阶段和十种年龄相关轨迹,并发现了成年晚期神经元核心生物钟节律丧失与胶质细胞应激适应性节律出现的新现象 研究基于死后样本,可能无法完全反映活体组织的动态过程;样本量虽大但个体差异可能影响部分结论的普适性 绘制人类前额叶皮层跨生命周期的细胞和分子图谱,以理解大脑发育、衰老及疾病易感性的基础 人类背外侧前额叶皮层(DLPFC) 数字病理学 老年性疾病 单细胞核RNA测序,空间转录组学 非线性建模,伪时间分析 转录组数据,空间基因表达数据 284例死后样本,超过130万个细胞核 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
218 2025-12-05
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Oct, JACC. Basic to translational science
研究论文 本研究评估了一种小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的可行性和耐久性 首次在灵长类动物模型中评估小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的长期性能,并利用空间转录组学揭示了宿主细胞浸润对血管重塑的调控机制 研究样本量较小(n=5),仅评估了6个月的短期效果,未与传统自体血管进行直接比较 开发冠状动脉旁路移植术的替代血管移植物 成年狒狒的冠状动脉系统 组织工程 心血管疾病 空间转录组学,计算机断层扫描血管造影 NA 影像数据,基因表达数据,组织学数据 5只成年狒狒 NA NA NA NA
219 2025-12-05
Loss of Ribosomal Protein L22 (RPL22) Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1-Deficient Endometrial Cancers With Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes
2025-Sep-24, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过免疫组化检测和数字空间转录组学分析,发现RPL22表达缺失可识别MLH1缺陷子宫内膜癌中一个免疫低亚型,该亚型具有较少的肿瘤相关淋巴细胞 首次证明RPL22缺失是MLH1缺陷子宫内膜癌中免疫低亚型的易检测标志物,并揭示其与β-2微球蛋白表达降低及CD8+ T细胞浸润减少相关 未发现RPL22表达或肿瘤相关T淋巴细胞水平与肿瘤突变负荷或PD-L1表达相关,且样本队列规模未明确说明 探究RPL22在MLH1缺陷子宫内膜癌中的表达意义及其与肿瘤免疫微环境的关系 子宫内膜癌(EC)样本,特别是MLH1缺陷亚型 数字病理学 子宫内膜癌 免疫组化(IHC),数字空间转录组学 NA 组织图像,转录组数据 NA NA 数字空间转录组学 NA NA
220 2025-12-05
Airway Epithelial Heterogeneity and Mucus Plugging in Asthmatic Bronchioles
2025-Sep-23, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 本研究探讨了哮喘患者细支气管上皮异质性与黏液栓形成的关系,揭示了MUC5AC高表达细胞微环境在T2炎症驱动的上皮重塑中的作用 首次在哮喘细支气管中识别出MUC5AC高表达的异质性细胞微环境,并发现其独立于免疫细胞定位,为理解哮喘细支气管疾病的分子病理生理学提供了新视角 研究样本主要来自严重和致命性哮喘患者,可能无法代表所有哮喘亚型;体外培养模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 验证哮喘细支气管上皮生物学紊乱导致MUC5AC主导的黏液栓形成的假说 严重哮喘患者、致命性哮喘患者和对照者的外周肺组织,以及分离的细支气管和支气管基底细胞 空间转录组学 哮喘 组织学、RNA原位杂交、免疫组织化学、细胞培养、空间转录组学、多重免疫表型分析 NA 组织切片图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 严重哮喘患者、致命性哮喘患者和对照者的外周肺组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
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