单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-06-03	Direct programming of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors with SOX17 and FGF2 2024-04-09, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.006 PMID:38518781	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术，发现SOX17在人类多能干细胞向内皮祖细胞分化中的关键作用，并证明SOX17过表达结合FGF2处理可高效生成内皮祖细胞	揭示了SOX17在人类多能干细胞向内皮祖细胞分化中的新作用，并开发了一种高效生成内皮祖细胞的方法	未探讨SOX17过表达对其他细胞类型分化的潜在影响	研究转录因子在人类多能干细胞向内皮祖细胞分化中的作用	人类多能干细胞(hPSCs)和内皮祖细胞(EPs)	干细胞生物学	NA	单细胞RNA测序, CRISPR-Cas13d	NA	RNA测序数据	NA
202	2025-06-03	MSX1+PDGFRAlow limb mesenchyme-like cells as an efficient stem cell source for human cartilage regeneration 2024-03-12, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.001 PMID:38428414	research paper	该研究识别并表征了具有显著骨软骨再生和微环境适应能力的MSX1间充质祖细胞，并开发了一种从人多能干细胞生成MSX1+PDGFRAlow肢体间充质样细胞（LML）的策略，用于人类软骨再生	发现了MSX1间充质祖细胞中的PDGFRA亚群具有最强的骨软骨能力，并成功从人多能干细胞生成LML细胞用于软骨再生	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证	寻找更有效的干细胞来源用于人类软骨再生	MSX1间充质祖细胞和从人多能干细胞生成的LML细胞	再生医学	骨退行性疾病	单细胞测序	小鼠损伤模型	基因表达数据	NA
203	2025-06-03	Activated mesenchymal stem/stromal cells promote myeloid cell differentiation via CCL2/CCR2 signaling 2024-03-12, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2024.02.002 PMID:38428413	研究论文	本研究探讨了间充质干细胞/基质细胞（MSCs）通过CCL2/CCR2信号通路对造血干细胞/祖细胞（HSPCs）及其祖细胞分化的影响	揭示了MSCs分泌的CCL2在髓系细胞分化早期阶段的重要作用，并通过单细胞RNA测序分析在人类骨髓细胞中验证了这一发现	研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步扩展	探究MSCs通过CCL2/CCR2信号通路对HSPCs及其祖细胞分化的调控机制	小鼠和人类的造血干细胞/祖细胞（HSPCs）及间充质干细胞/基质细胞（MSCs）	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
204	2025-06-03	ER stress and lipid imbalance drive diabetic embryonic cardiomyopathy in an organoid model of human heart development 2024-03-12, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2024.01.003 PMID:38335962	研究论文	使用人类心脏类器官系统模拟胚胎心脏发育，研究糖尿病对先天性心脏缺陷的影响	首次使用人类心脏类器官系统模拟糖尿病条件下的胚胎心脏发育，揭示了内质网应激和脂质代谢失衡在糖尿病胚胎心肌病中的作用	研究结果仍需在更复杂的体内模型中验证	探究糖尿病对胚胎心脏发育的影响机制	人类心脏类器官	发育生物学	先天性心脏病	scRNA-seq, 脂质组学	人类心脏类器官系统	基因表达数据, 脂质组数据	NA
205	2025-06-03	SinCMat: A single-cell-based method for predicting functional maturation transcription factors 2024-02-13, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2023.12.006 PMID:38215756	research paper	本文提出了一种基于单细胞RNA测序的计算方法SinCMat，用于预测功能成熟转录因子	SinCMat是首个专门考虑功能性细胞成熟过程的计算方法，能够识别身份转录因子和信号依赖性转录因子对，共同驱动功能成熟的基因	NA	旨在生成组织特异性成熟和功能性细胞，推动再生医学的发展	功能成熟转录因子	computational biology	NA	single-cell RNA sequencing (RNA-seq)	NA	RNA-seq data	大规模应用于Mouse Cell Atlas和Tabula Sapiens数据集
206	2025-06-03	Cross-site reproducibility of human cortical organoids reveals consistent cell type composition and architecture 2023-Jul-29, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.07.28.550873 PMID:37546772	research paper	该研究通过跨站点实验评估了人类皮质类器官（hCO）在细胞类型组成和结构上的可重复性	首次评估了使用统一协议在不同研究站点生成的hCO在细胞类型比例和组织结构上的一致性	研究中仍存在非目标分化、坏死核心和细胞应激等hCO模型的已知局限性	评估人类皮质类器官模型在神经发育障碍研究中的可重复性	人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的皮质类器官	神经科学	神经发育障碍	scRNA-seq, 3D荧光成像, 相差成像, qPCR, 流式细胞术	NA	基因表达数据, 图像数据	多个研究站点使用同一iPSC细胞系生成的hCO样本
207	2025-06-02	Endothelial Nrf2 deficiency promotes atherosclerotic lesion formation by shaping a proinflammatory niche 2025-Aug-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123725 PMID:40404122	研究论文	研究探讨了内皮细胞中Nrf2缺乏通过促炎性微环境促进动脉粥样硬化斑块形成的机制	揭示了内皮细胞Nrf2缺乏通过改变内皮细胞转录组和细胞间通讯动态促进动脉粥样硬化的新机制	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中得到验证	探究内皮细胞Nrf2在动脉粥样硬化发展中的细胞特异性作用和细胞间通讯机制	Nrf2Cdh5tKO小鼠和对照Nrf2flox/flox小鼠的主动脉	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 组织学分析	Nrf2Cdh5tKO小鼠模型	基因表达数据, 组织学数据	Nrf2Cdh5tKO小鼠和对照Nrf2flox/flox小鼠的主动脉样本
208	2025-06-02	Emergence of regulatory and matrix-producing stromal cells during adipogenic induction in human ceiling culture-derived preadipocytes 2025-Jul-22, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152012 PMID:40409116	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和表观遗传分析，探讨了人类天花板培养来源的前脂肪细胞在脂肪生成诱导早期的转录组变化	首次在单细胞水平上揭示了原发性培养的人类ccdPAs对脂肪生成的反应，并发现ATOH8在ccdPAs中的表达显著高于ASCs	研究仅关注了早期转录组变化，未涉及长期分化过程	探究天花板培养来源的前脂肪细胞在脂肪生成诱导早期的细胞异质性和转录组变化	人类天花板培养来源的前脂肪细胞(ccdPAs)和脂肪来源的干细胞(ASCs)	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 表观遗传分析	NA	单细胞转录组数据, 表观遗传数据	NA
209	2025-06-02	Single-cell RNA sequencing indicates AP-1 as a potential therapeutic target for autoimmune uveitis 2025-Jul, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2025.116945 PMID:40228638	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了AP-1在自身免疫性葡萄膜炎（EAU）发病机制中的关键作用，并提出了AP-1抑制剂作为潜在治疗策略	首次通过单细胞RNA测序揭示了AP-1在EAU中的关键作用，并发现AP-1通过GM-CSF/IL-23反馈环路支持Th17细胞的致病性	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	探索自身免疫性葡萄膜炎的发病机制并寻找潜在治疗靶点	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠的脾脏和颈部引流淋巴结（CDLNs）	数字病理学	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	EAU小鼠模型	RNA测序数据	正常和EAU小鼠的脾脏和颈部引流淋巴结（CDLNs）
210	2025-06-02	Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis 2025-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.43083 PMID:39681508	研究论文	本研究探讨了内源性逆转录元件(EREs)在早期类风湿性关节炎(eRA)中的表达及其与干扰素-α(IFN-α)产生和抗环瓜氨酸肽(anti-CCP)自身抗体生成的关系	首次在eRA中研究了外周血和滑膜组织中ERE的表达，揭示了ERE与IFN-I产生之间的潜在因果关系以及与anti-CCP自身抗体的有趣关联	样本量相对较小(eRA滑膜组织n=22，全血样本n=56)，且未进行机制验证实验	探究EREs作为类风湿性关节炎(RA)中干扰素源性触发因素的潜在作用	早期类风湿性关节炎(eRA)患者和早期银屑病关节炎(ePsA)患者的血液和滑膜组织样本	风湿病学	类风湿性关节炎	逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、NanoString技术、流式细胞分选、单细胞测序数据分析	NA	基因表达数据、蛋白质水平数据、单细胞测序数据	eRA滑膜组织样本22例，全血样本56例，以及ePsA患者样本
211	2025-06-02	Association of Synovial Innate Immune Exhaustion With Worse Pain in Knee Osteoarthritis 2025-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.43089 PMID:39690716	research paper	该研究探讨了膝关节骨关节炎（OA）患者滑膜先天免疫细胞耗竭与更严重疼痛之间的关联	首次发现滑膜免疫调节性巨噬细胞的耗竭和功能障碍与OA患者更严重的疼痛相关，并可能成为重要治疗靶点	样本量相对有限（n=122），且未探讨因果关系	识别与膝关节OA患者更严重疼痛相关的滑膜先天免疫细胞亚群和病理生理机制	122名轻度至重度膝关节OA疼痛患者	免疫病理学	骨关节炎	空间转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序	NA	组织活检样本、转录组数据、蛋白质组数据	122例膝关节OA患者的滑膜组织活检（其中32例进行空间组学分析，8例进行单细胞测序）
212	2025-06-02	Mitochondrial genetic landscape and its correlation with immune cell infiltration in preeclampsia: Insights from bioinformatics 2025-Jun, Journal of reproductive immunology IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.jri.2025.104527 PMID:40203595	研究论文	本研究通过生物信息学方法识别了与子痫前期(PE)相关的线粒体相关基因(MRGs)，并探讨了这些基因与免疫细胞浸润的关联	首次揭示了5个关键MRGs(MOCS1, CYP11A1, GATM, SFXN3, BCL2L11)在PE中的诊断价值，并发现CYP11A1与HELLP综合征的潜在关联	研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证	探索线粒体相关基因在子痫前期发病机制中的作用	子痫前期患者胎盘组织	生物信息学	子痫前期	LASSO回归分析、ROC曲线分析、基因集富集分析(GSEA)、单细胞测序分析、免疫荧光染色	预测模型	基因表达数据	多个GEO数据集(GSE114691, GSE190971, GSE75010, GSE25906)
213	2025-06-02	Novel PAP-targeted CAR-T therapy enhances antitumor efficacy through CoupledCAR approach 2025-May-31, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-011238 PMID:40449956	研究论文	本文提出了一种新型的PAP靶向CAR-T疗法，通过CoupledCAR方法增强抗肿瘤效果	首次证明PAP是前列腺癌CAR-T治疗的特定靶点，并开发了CoupledCAR平台技术，无需肿瘤抗原即可扩增肿瘤靶向CAR-T细胞	NA	克服前列腺癌CAR-T治疗中靶点缺乏和CAR-T细胞扩增及功能受限的问题	前列腺癌细胞	肿瘤免疫治疗	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	CAR-T	基因表达数据、免疫组化数据	NA
214	2025-06-02	Targeting BATF2-RGS2 axis reduces T-cell exhaustion and restores anti-tumor immunity 2025-May-30, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-025-02351-5 PMID:40442751	研究论文	本研究探讨了RGS2在肺癌免疫调节中的作用，并揭示了BATF2-RGS2轴在调节T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸中的关键机制	首次揭示了BATF2通过转录调控RGS2促进T细胞耗竭的分子机制，并证明靶向该轴可增强免疫治疗效果	研究样本量较小（仅6例LC患者），且主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证	探究RGS2在肺癌免疫调节中的作用及BATF2-RGS2轴的调控机制	肺癌患者CD8+ T细胞、小鼠3LL细胞、鼠类肿瘤类器官模型	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞转录组分析、荧光素酶报告基因检测	基因敲除小鼠模型	转录组数据、体内外功能实验数据	6例LC患者样本+多组小鼠实验
215	2025-06-02	Co-targeting of epigenetic regulators and BCL-XL improves efficacy of immune checkpoint blockade therapy in multiple solid tumors 2025-May-30, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-025-02352-4 PMID:40442785	research paper	该研究探讨了表观遗传调节剂与BCL-XL抑制剂联合免疫检查点阻断疗法在多种实体瘤中的治疗效果	发现表观遗传药物与BCL-XL抑制剂联合使用在实体瘤中产生显著的协同效应，与血液恶性肿瘤不同，实体瘤对BCL-XL抑制具有独特依赖性	研究主要基于体外和动物模型，尚未在人类临床试验中验证	探索表观遗传调节剂与BCL-XL抑制剂联合免疫检查点阻断疗法在实体瘤中的治疗效果	实体瘤细胞系（包括肺癌、结直肠癌、乳腺癌、黑色素瘤和胶质母细胞瘤）及小鼠模型	肿瘤学	多种实体瘤（肺癌、结直肠癌、乳腺癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤）	流式细胞术、单细胞RNA测序	小鼠同种移植和原位模型	体外实验数据、动物模型数据	大量实体瘤细胞系（来源患者和小鼠模型）及多种小鼠肿瘤模型
216	2025-06-02	Mefunidone treats pulmonary fibrosis by targeting SDH to regulate fibro-promoting macrophages 2025-May-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114971 PMID:40449267	research paper	该研究揭示了Mefunidone通过靶向SDH调节促纤维化巨噬细胞治疗肺纤维化的新机制	首次发现Mefunidone通过结合并抑制SDH活性来减少琥珀酸生成，进而抑制促纤维化巨噬细胞的转化	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明Mefunidone治疗肺纤维化的分子靶点和作用机制	博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型和促纤维化巨噬细胞	digital pathology	lung cancer	单细胞测序技术	小鼠肺纤维化模型	NA	NA
217	2025-06-02	Mendelian randomization reveals limited causal effects of genetic variants on cervical cancer risk: insights from immune cell populations 2025-May-29, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02819-2 PMID:40439950	research paper	该研究利用孟德尔随机化方法探讨了免疫细胞相关遗传变异与宫颈癌风险之间的潜在因果关系	首次综合应用多种孟德尔随机化方法评估免疫细胞亚群遗传变异对宫颈癌风险的因果效应	仅能检测遗传变异的中等及以上效应，无法捕捉微小效应	探究免疫细胞相关遗传因素在宫颈癌发病机制中的作用	与T细胞和B细胞亚群相关的遗传变异	遗传流行病学	宫颈癌	孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序	逆方差加权、MR-Egger、简单中位数、加权中位数	遗传数据、基因表达数据	NA
218	2025-06-02	Identification of novel therapeutic targets in hepatitis-B virus-associated membranous nephropathy using scRNA-seq and machine learning 2025-May-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-03625-0 PMID:40442195	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和机器学习技术，揭示了miR-223-3p和CRIM1在乙型肝炎病毒相关膜性肾病（HBV-MN）中的关键作用	首次结合scRNA-seq和机器学习技术，识别了HBV-MN中与疾病进展相关的特定足细胞亚群，并验证了miR-223-3p对CRIM1表达的调控机制	研究样本可能来自高HBV流行区，结果在其他人群中的普适性有待验证	阐明HBV-MN的分子机制并寻找潜在治疗靶点	乙型肝炎病毒相关膜性肾病（HBV-MN）的分子机制	数字病理学	乙型肝炎相关肾病	scRNA-seq, 双荧光素酶报告基因检测, 机器学习	机器学习模型（未指定具体类型）	单细胞RNA测序数据	NA
219	2025-06-02	Disulfide bond-related gene signature development for bladder cancer prognosis prediction and immune microenvironment characterization 2025-May-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-03974-w PMID:40442298	研究论文	开发了一种基于二硫键相关基因特征的膀胱癌预后预测模型，并表征了其与免疫微环境的关系	首次将二硫键相关基因特征与膀胱癌预后和免疫微环境特征联系起来，并开发了DRPS预测模型	需要进一步实验验证模型在临床实践中的适用性	开发膀胱癌预后预测模型并研究其与免疫治疗反应的关系	膀胱癌患者	生物信息学	膀胱癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qRT-PCR	StepCox[backward]算法优化的DRPS模型	基因表达数据	TCGA和GEO队列数据
220	2025-06-02	High-Resolution Spatial Map of the Human Facial Sebaceous Gland Reveals Marker Genes and Decodes Sebocyte Differentiation 2025-May-29, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2025.04.041 PMID:40449655	研究论文	本研究通过整合Stereo-seq空间转录组学、单细胞RNA测序和MERFISH验证，揭示了人类皮脂腺的分子特征和皮脂细胞分化的四个不同阶段	首次提供了人类皮脂腺的高分辨率空间分子图谱，并发现了皮脂细胞分化的四个阶段及其独特的基因标记	研究主要基于人类样本，但未涉及与其他物种（如小鼠）的直接比较	深入理解人类皮脂腺的细胞和分子机制，特别是皮脂细胞的分化过程	人类皮脂腺及其皮脂细胞	空间转录组学	痤疮、脂溢性皮炎、脱发	Stereo-seq空间转录组学、单细胞RNA测序、MERFISH	NA	空间转录组数据、单细胞RNA测序数据	NA