单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-05-23	Lipocalin-2 expression identifies an intestinal regulatory neutrophil population during acute graft-versus-host disease 2024-02-21, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adi1501 PMID:38381845	research paper	该研究通过单细胞RNA测序在小鼠急性移植物抗宿主病（aGVHD）中鉴定出一个表达脂质运载蛋白-2（LCN2）的中性粒细胞群体，并探讨了其在减轻aGVHD严重程度中的作用机制	首次发现LCN2表达的中性粒细胞群体通过调节巨噬细胞功能减轻aGVHD严重程度，并提出了LCN2作为aGVHD治疗新策略的可能性	研究主要基于小鼠模型，人类患者数据仍需进一步验证	探索肠道组织耐受性在aGVHD中的作用机制并寻找潜在治疗靶点	小鼠模型和人类aGVHD患者肠道活检样本	免疫学	急性移植物抗宿主病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多个aGVHD患者队列的肠道活检样本
202	2025-05-23	Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain 2024-02-07, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323 PMID:38324639	research paper	该研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，描述了缺血小鼠大脑的分子和细胞结构，并发现LGALS9-CD44信号通路在缺血性损伤后的重要作用	首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，详细描述了缺血大脑的分子和细胞结构，并发现LGALS9-CD44信号通路的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	研究缺血性中风后非神经元细胞的分子和空间特征以及细胞间的相互作用	缺血小鼠大脑	digital pathology	cardiovascular disease	spatial transcriptomics, single-cell RNA sequencing	murine stroke model	transcriptomic data	19,777 spots sequenced
203	2025-05-23	CD23+IgG1+ memory B cells are poised to switch to pathogenic IgE production in food allergy 2024-02-07, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adi0673 PMID:38324641	研究论文	该研究描述了在儿童花生过敏中，一种CD23+IgG1+记忆B细胞群体在2型免疫反应中出现，含有高亲和力的花生特异性克隆，并在激活后产生IgE生成细胞	发现了CD23+IgG1+记忆B细胞群体作为高亲和力致病性IgE生成细胞的前体，可能参与花生过敏的长期持续	研究主要针对儿童花生过敏，可能不适用于其他食物过敏或成人群体	探究食物过敏中B细胞记忆对持续性IgE反应的机制	儿童花生过敏患者	免疫学	食物过敏	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	儿童花生过敏患者样本
204	2025-05-23	Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve 2024-02-05, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.006 PMID:38198889	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多色克隆分析，揭示了小鼠心脏二尖瓣起源祖细胞的命运决定及其衍生物在瓣膜小叶中的行为与分布	首次定义了祖细胞特化的代谢过程及其对瓣膜细胞亚型的贡献，并描述了心内膜细胞衍生克隆的特定生长和行为模式	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类二尖瓣发育的直接证据	探究心脏二尖瓣发育过程中祖细胞的命运决定机制及其衍生物的行为	小鼠胚胎和出生后二尖瓣的心内膜细胞及其衍生物	发育生物学	先天性心脏病	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 多色克隆分析	NA	基因表达数据	基因标记的心内膜细胞和显微解剖的小鼠胚胎及出生后二尖瓣组织
205	2025-05-23	Myeloid and lymphoid expression of C9orf72 regulates IL-17A signaling in mice 2024-01-31, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adg7895 PMID:38295187	研究论文	该研究探讨了C9orf72基因在髓系和淋巴系中对IL-17A信号传导的调控作用及其在肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)中的机制	首次揭示了C9orf72在造血系统中的双重调控作用，并提出了IL-17A作为ALS/FTD相关神经炎症治疗靶点的新见解	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	阐明C9orf72基因突变导致ALS/FTD患者自身免疫和炎症反应的分子机制	小鼠造血系统细胞和人类ALS患者脊髓小胶质细胞	神经免疫学	肌萎缩侧索硬化症,额颞叶痴呆	条件性基因敲除、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质表达数据	多种造血谱系细胞及人类ALS患者样本
206	2025-05-23	Spatiotemporal modulation of growth factors directs the generation of multilineage mouse embryonic stem cell-derived mammary organoids 2024-01-22, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.003 PMID:38159568	research paper	通过定向分化小鼠胚胎干细胞，研究团队成功生成了多谱系ESC来源的乳腺类器官（MEMOs），并研究了其发育过程	首次通过BMP4和PTHrP的顺序激活及HH信号抑制，将皮肤类器官模型中的真皮间充质转化为乳腺特异性间充质，并生成MEMOs	研究仅在小鼠胚胎干细胞中进行，尚未在人类细胞中验证	研究乳腺等外胚层附属器官的发育过程，为再生医学和疾病建模提供基础	小鼠胚胎干细胞（mESCs）及其衍生的乳腺类器官（MEMOs）	再生医学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	乳腺类器官模型（MEMO）	基因表达数据	NA
207	2025-05-23	YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulation in murine bone development 2024-01-22, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.11.029 PMID:38141609	research paper	该研究揭示了YAP和TAZ在小鼠骨骼发育中如何协调成骨前体细胞的动员与血管生成及力学调控	首次发现YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中协调成骨前体细胞动员与血管生成，并介导力学调控	研究主要基于小鼠模型，人类细胞共培养实验仅作为补充验证	探究胚胎骨骼发育中成骨前体细胞动员与血管生成协调的分子机制	小鼠胚胎骨骼发育过程中的成骨前体细胞和血管系统	发育生物学	骨骼发育异常	单细胞RNA测序，3D人类细胞共培养	小鼠模型	基因表达数据，细胞培养数据	NA
208	2025-05-23	Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing 2024-01-10, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335 PMID:38198568	研究论文	利用单细胞RNA测序技术解析人类胎盘在分娩过程中的母胎交流	首次建立人类胎盘的单细胞图谱，揭示分娩过程中母体和胎儿细胞类型的转录组活性变化，并发现胎盘源性单细胞特征可用于无创预测早产	研究主要关注足月分娩，对早产的预测仍需进一步验证	解析分娩过程中母胎交流的细胞贡献和通讯机制	人类胎盘中的母体和胎儿细胞	单细胞转录组学	妊娠相关疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	人类胎盘组织样本（具体数量未明确说明）
209	2025-05-23	Insights into midgut cell types and their crucial role in antiviral immunity in the lepidopteran model Bombyx mori 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1349428 PMID:38420120	review	该综述探讨了鳞翅目模型家蚕中肠细胞类型及其在抗病毒免疫中的关键作用	揭示了昆虫中肠细胞在免疫防御中的新机制，包括单细胞转录组学发现的新亚群以及昆虫与高等哺乳动物胃肠道的相似性	NA	阐明中肠细胞类型在昆虫免疫防御中的复杂作用	家蚕中肠细胞（柱状细胞、肠内分泌细胞、杯状细胞和再生细胞）	昆虫免疫学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
210	2025-05-23	Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women with Systemic lupus erythematosus 2024, International reviews of immunology IF:4.3Q2 DOI:10.1080/08830185.2024.2376649 PMID:39066603	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了系统性红斑狼疮（SLE）孕妇外周血单个核细胞的免疫细胞组成和基因表达谱	首次在单细胞水平上比较了妊娠期活动性和非活动性SLE患者的免疫细胞类型比例和转录模式	样本量较小（仅12例患者），且未包含健康孕妇对照组	阐明妊娠期SLE患者的免疫细胞变化和分子机制	系统性红斑狼疮孕妇的外周血单个核细胞	数字病理学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序（10x Genomics技术）	NA	RNA测序数据	12例患者（分为4组，每组3人）
211	2025-05-23	Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing 2024, International reviews of immunology IF:4.3Q2 DOI:10.1080/08830185.2022.2144291 PMID:36369864	研究论文	通过单细胞RNA测序技术对先兆子痫孕妇及产后妇女的免疫细胞进行分析	首次在单细胞水平上描绘了先兆子痫患者母体免疫系统的景观和异质性	样本量较小（3例患者和2例对照）	研究先兆子痫与免疫系统改变的关系	先兆子痫孕妇及产后妇女的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞转录组学	先兆子痫	单细胞RNA测序（10× genomics平台）	NA	单细胞转录组数据	3例早发型先兆子痫孕妇和2例健康对照的PBMCs样本，共获得80,429个单细胞转录组
212	2025-05-23	Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues 2024, International review of cell and molecular biology DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003 PMID:39260934	综述	本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织中的存在和功能	详细讨论了常规趋化因子受体在免疫细胞中的关键作用及其在淋巴组织中的功能	主要关注常规趋化因子受体，对非典型趋化因子受体的讨论较少	探讨趋化因子受体在免疫细胞和淋巴组织中的作用	初级和次级淋巴组织中的免疫细胞	免疫学	NA	高维光谱流式细胞术、单细胞测序	NA	NA	NA
213	2025-05-23	YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulated bone development 2023-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.01.20.524918 PMID:36711590	research paper	该研究探讨了YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中如何协调成骨前体细胞的动员与血管生成及机械刺激响应的机制	揭示了YAP/TAZ信号在胚胎骨骼发育中通过调控Cxcl12表达，将成骨前体细胞动员与血管生成空间耦联的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类细胞实验数据有限	阐明胚胎骨骼发育过程中成骨前体细胞动员与血管生成的协调机制	小鼠胚胎骨骼和人类间充质基质细胞	发育生物学	骨骼发育异常	单细胞RNA测序、3D血管网络形成实验	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、影像数据	未明确说明具体样本数量，使用基因工程小鼠模型和人类间充质基质细胞
214	2025-05-23	Single cell RNA-sequencing profiling to improve the translation between human IBD and in vivo models 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1291990 PMID:38179052	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在提高人类炎症性肠病（IBD）与体内模型之间转化研究中的应用	强调了scRNA-seq技术在识别IBD中新型细胞亚群及其在疾病过程中的重塑作用，以及如何利用该技术提高临床前模型的转化潜力	scRNA-seq技术在IBD临床前模型中的应用尚未广泛开展	提高人类IBD与体内模型之间的转化研究，选择最合适的模型来测试假设和新疗法	炎症性肠病（IBD）的临床前动物模型和人类IBD患者	数字病理学	炎症性肠病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
215	2025-05-23	Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model 2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004 PMID:33862275	研究论文	本研究通过单细胞转录组学揭示了小鼠结肠炎模型中炎症消退的动态变化及Serpina3n的作用	首次在单细胞水平揭示了结肠基质细胞群在炎症消退过程中的动态作用，并发现Serpina3n作为炎症消退的关键调节因子	研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类仍需验证	阐明结肠炎炎症消退过程中的细胞类型变化及其相互作用机制	化学诱导结肠炎小鼠模型	单细胞转录组学	结肠炎	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	NA
216	2025-05-22	Deciphering the Premetastatic Lymphatic Niche of Oral Squamous Cell Carcinoma 2025-Jun, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241307894 PMID:40082761	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了口腔鳞状细胞癌（OSCC）淋巴结转移前微环境中的细胞结构，特别是CD4+ Tex-pre细胞的作用	首次在淋巴结转移前微环境中鉴定出CD4+ Tex-pre细胞亚群，并揭示其在免疫抑制和促进淋巴结转移中的作用	研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模的临床验证	探索口腔鳞状细胞癌淋巴结转移前微环境的细胞组成和免疫抑制机制	口腔鳞状细胞癌患者的淋巴结组织和小鼠模型	数字病理学	口腔癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNAscope原位染色，批量RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据，图像数据	OSCC患者的淋巴结样本（包括转移前引流淋巴结和配对的对侧淋巴结）和小鼠模型
217	2025-05-22	Antioxidant interventions reduced cytokine-induced pyroptosis of peripheral MAIT cells in patients with HBV-related cirrhosis 2025-Jun-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000714 PMID:40377492	研究论文	本研究探讨了HBV相关肝硬化患者外周MAIT细胞减少的特征及机制，发现抗氧化干预可减少细胞因子诱导的细胞焦亡	首次揭示了HBV相关肝硬化中MAIT细胞减少与细胞焦亡及氧化应激的关联，并证明抗氧化剂可有效减少这一过程	样本量较小（40例患者），且仅为体外实验验证	探究HBV相关肝硬化患者MAIT细胞减少的机制	HBV相关肝硬化患者的外周MAIT细胞	免疫学	肝硬化	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光、ELISA	NA	血液样本	20名健康对照和40名HBV相关肝硬化患者（20名代偿期和20名失代偿期）
218	2025-05-22	Single-cell analyses unravel ecosystem dynamics and intercellular crosstalk during gallbladder cancer malignant transformation 2025-Jun-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000697 PMID:40377484	research paper	该研究通过单细胞RNA测序分析了胆囊癌恶性转化过程中的细胞生态系统动态和细胞间通讯	揭示了胆囊癌恶性转化过程中免疫微环境的变化，并鉴定了与预后不良相关的上皮亚型TOP2A+ Epi和免疫抑制性巨噬细胞TOP2A+ Macro	样本量相对较小，仅包括2个正常邻近组织、2个高级别上皮内瘤变和6个胆囊癌样本	理解胆囊癌恶性转化过程中的细胞和分子变化，以识别早期生物标志物和治疗靶点	胆囊癌患者的正常邻近组织、高级别上皮内瘤变组织和胆囊癌组织	digital pathology	gallbladder cancer	单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、多重免疫荧光染色	10种机器学习方法	RNA测序数据、图像数据	98,113个细胞，来自2个正常邻近组织、2个高级别上皮内瘤变和6个胆囊癌样本
219	2025-05-22	Immunopipe: a comprehensive and flexible scRNA-seq and scTCR-seq data analysis pipeline 2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1 DOI:10.1093/nargab/lqaf063 PMID:40391086	研究论文	介绍了一个名为immunopipe的综合灵活的单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)数据分析流程	提供了命令行工具和用户友好的网页界面，支持无编程经验的研究者进行数据分析和监控	未提及具体的技术验证或性能比较数据	增强对T细胞介导的免疫和免疫治疗的理解	单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据	生物信息学	NA	scRNA-seq, scTCR-seq	NA	单细胞测序数据	NA
220	2025-05-22	Isolation of Mouse Bone Marrow Niche Cells for Single-Cell Sequencing 2025-May-22, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/7651_2025_630 PMID:40397275	研究论文	描述了从小鼠股骨和胫骨中分离骨髓微环境细胞用于单细胞RNA测序的方法	利用荧光激活细胞分选技术确保高活性和高纯度的骨髓微环境细胞分离	NA	研究骨髓微环境中的细胞群体	小鼠骨髓微环境细胞	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选	NA	RNA序列数据	小鼠股骨和胫骨中的骨髓微环境细胞