单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 21941 - 21960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21941 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Immune Characteristics of Myeloid Cells and Memory T Cells in Recovered COVID-19 Patients With Different Severities
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.781432
PMID:35046942
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不同严重程度的康复期COVID-19患者及健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs）的免疫特征 | 首次提供了大规模的康复期COVID-19患者外周免疫反应的单细胞图谱 | NA | 探究康复期COVID-19患者的免疫细胞特征 | 康复期COVID-19患者及健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41个样本，包含超过260,000个外周血单个核细胞 |
| 21942 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Bone Marrow Cells in Aplastic Anemia
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745483
PMID:35046994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了再生障碍性贫血患者的骨髓细胞，揭示了B细胞在疾病中的作用及其对造血功能的影响 | 首次大规模单细胞转录组测序分析了再生障碍性贫血患者的骨髓细胞，并鉴定了B细胞与造血细胞相互作用的特定配体-受体对 | NA | 探讨B细胞在再生障碍性贫血中的作用及其对造血功能的影响 | 再生障碍性贫血患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20,000个骨髓细胞，来自再生障碍性贫血患者和健康供体 |
| 21943 | 2024-08-08 |
A Ductal-Cell-Related Risk Model Integrating Single-Cell and Bulk Sequencing Data Predicts the Prognosis of Patients With Pancreatic Adenocarcinoma
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.763636
PMID:35047000
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据，开发了一种与导管细胞相关的风险模型，用于预测胰腺腺癌患者的预后 | 首次通过整合单细胞和批量测序数据，开发了一种新的风险评分模型，用于区分胰腺腺癌患者的高风险和低风险组 | 研究未提及免疫细胞浸润分数在两组间的显著差异 | 旨在通过整合单细胞和批量测序数据，提取导致不同预后的导管细胞特征 | 胰腺导管腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序（scRNA-seq） | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 21944 | 2024-08-08 |
Single-Cell and Bulk Transcriptome Data Integration Reveals Dysfunctional Cell Types and Aberrantly Expressed Genes in Hypertrophic Scar
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.806740
PMID:35047019
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，揭示了肥厚性瘢痕中的功能障碍细胞类型和异常表达基因 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，详细分析了肥厚性瘢痕中的细胞组成、细胞间通讯和关键转录调控网络的变化 | NA | 研究肥厚性瘢痕的生物学特性，特别是细胞组成和转录调控网络的变化 | 肥厚性瘢痕中的细胞类型、细胞间通讯和转录调控网络 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 21945 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Mesenchymal Stromal Cells: Identification, Classification, and Differentiation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.787118
PMID:35047499
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综述 | 本文综述了骨髓间充质干细胞（BMSCs）的鉴定、分类及其分化机制的最新进展 | 通过谱系追踪和单细胞测序技术，揭示了BMSCs的新亚群及其在生理和病理条件下的作用，以及调控BMSCs命运的关键因子和机制 | BMSCs的鉴定和分类仍存在争议，限制了其在临床上的应用 | 探讨BMSCs的鉴定、分类及其在临床应用中的重要意义 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）及其亚群 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 21946 | 2024-08-08 |
Calcium-Prolactin Secretion Coupling in Rat Pituitary Lactotrophs Is Controlled by PI4-Kinase Alpha
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.790441
PMID:35058881
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研究论文 | 本文研究了磷脂酰肌醇激酶（PIKs）在钙驱动的垂体催乳素（PRL）释放中的作用，特别是在垂体乳头细胞中的作用 | 揭示了PI4KA在钙分泌偶联中的关键作用，这是通过电压门控和PI(4, 5)P2依赖的钙信号传导途径实现的 | NA | 分析磷脂酰肌醇激酶在钙驱动的催乳素释放中的作用 | 垂体乳头细胞中的催乳素释放 | NA | NA | 单细胞RNA测序、qRT-PCR分析、放射免疫测定、ELISA、Fura 2成像 | NA | RNA、激素、钙信号 | 单细胞水平的研究 |
| 21947 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Profiling Identifies Pathways Associated With CD8+ T-Cell Activation in Severe Aplastic Anemia
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.790990
PMID:35058969
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和代谢组学分析，结合转录组学分析，探讨了严重再生障碍性贫血（SAA）患者中CD8+ T细胞激活的关键通路 | 本研究首次揭示了SAA患者中CD8+ T细胞激活的新通路，并提供了潜在的治疗靶点 | NA | 揭示严重再生障碍性贫血患者中CD8+ T细胞激活的调控机制 | 严重再生障碍性贫血（SAA）患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学 | NA | 蛋白质、代谢物、RNA | SAA患者和健康捐赠者的血浆、骨髓上清液和CD8 T细胞 |
| 21948 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Phosphorylation-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.734287
PMID:35059393
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序数据和TCGA RNA-seq数据，分析了肝细胞癌患者中的蛋白激酶、磷酸酶及其他磷酸化相关基因的表达情况 | 发现了九种在肝细胞癌干细胞中高表达的蛋白激酶和磷酸化相关基因，这些基因与肝细胞癌患者的预后不良相关，并揭示了它们在细胞周期相关通路中的作用 | NA | 探讨蛋白激酶信号传导的潜在机制，以提高肝细胞癌治疗的效果 | 肝细胞癌患者的蛋白激酶、磷酸酶及其他磷酸化相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 肝细胞癌患者 |
| 21949 | 2024-08-08 |
Lidocaine Ameliorates Psoriasis by Obstructing Pathogenic CGRP Signaling‒Mediated Sensory Neuron‒Dendritic Cell Communication
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.002
PMID:35032503
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研究论文 | 本研究通过使用利多卡因的硬膜外注射治疗银屑病患者，发现利多卡因能显著降低患者的临床评分，并在咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型中显示出治疗效果。 | 首次揭示了利多卡因通过阻断病理性CGRP信号传导介导的感觉神经-树突状细胞通信来改善银屑病。 | 本研究为初步研究，样本量较小，需要进一步的大规模临床试验验证。 | 探索利多卡因对银屑病的治疗效果及其作用机制。 | 银屑病患者及咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型。 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者样本量未明确提及，大鼠模型使用咪喹莫特诱导的银屑病大鼠。 |
| 21950 | 2024-08-08 |
FSCAM: CAM-Based Feature Selection for Clustering scRNA-seq
2022-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00495-8
PMID:35028910
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研究论文 | 本文提出了一种基于凸分析混合方法的单细胞特征选择方法FSCAM，用于改进单细胞RNA测序数据的聚类准确性 | FSCAM方法考虑了基因间的'多对多'关系，与传统的'一对一'方法相比，增加了相关性、冗余性和完整性的组合选择 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的基因特征选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PAM聚类算法 | 转录组数据 | 使用真实数据集进行验证 |
| 21951 | 2024-08-08 |
Combined effects of arsenic and 2,2-dichloroacetamide on different cell populations of zebrafish liver
2022-May-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2022.152961
PMID:35031379
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研究论文 | 研究了砷和2,2-二氯乙酰胺对斑马鱼肝脏不同细胞群体的联合效应 | 首次揭示了砷和2,2-二氯乙酰胺在斑马鱼肝脏中的细胞特异性联合反应 | NA | 探讨砷和2,2-二氯乙酰胺对斑马鱼肝脏不同细胞群体的联合效应 | 斑马鱼肝脏中的不同细胞群体 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共获得13,563个细胞，包括肝细胞、肝管细胞、内皮细胞和巨噬细胞 |
| 21952 | 2024-08-08 |
Cell2location maps fine-grained cell types in spatial transcriptomics
2022-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01139-4
PMID:35027729
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cell2location的贝叶斯模型，用于在空间转录组数据中解析细粒度的细胞类型并创建全面的细胞图谱 | cell2location模型能够处理技术变异源，并通过跨位置借用统计强度，实现单细胞和空间转录组学数据的高灵敏度和高分辨率整合，优于现有工具 | NA | 开发一种能够全面映射细胞类型在空间转录组数据中的新模型 | 细胞类型在不同组织中的空间分布 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 转录组数据 | 在三种不同组织（小鼠大脑、人类淋巴结和人类肠道）中进行了评估 |
| 21953 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of tumour evolution in multiple myeloma - opportunities for precision medicine
2022-04, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00593-y
PMID:35017721
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在多发性骨髓瘤（MM）中的应用，探讨了其在揭示MM克隆进化模式和个体细胞突变及表型特征方面的潜力 | 利用单细胞测序技术深入解析MM及其前体阶段的遗传异质性，为精准医疗提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在多发性骨髓瘤中的应用及其对临床诊断和治疗策略的潜在影响 | 多发性骨髓瘤及其前体阶段的遗传异质性和克隆进化模式 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 21954 | 2024-08-08 |
A robust and scalable graph neural network for accurate single-cell classification
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab570
PMID:35018408
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研究论文 | 本文开发了一种基于图神经网络（GNN）的稳健且可扩展的方法GraphCS，用于准确进行单细胞分类 | 通过预计算扩散信息，使用近似广义PageRank算法，实现了亚线性复杂度，提高了处理大规模数据的速度和可扩展性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析中细胞类型识别的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图神经网络（GNN） | 数据 | 100万细胞 |
| 21955 | 2024-08-08 |
A comprehensive comparison of supervised and unsupervised methods for cell type identification in single-cell RNA-seq
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab567
PMID:35021202
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研究论文 | 本研究对比了监督学习和无监督学习方法在单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的表现 | 研究不仅解释了不同实验设置下细胞类型识别方法的行为，还提供了根据科学目标和数据特性选择方法的一般指导 | 监督方法的优越性可能会被研究中调查的一些不良数据特性所削弱，导致参考数据集不具信息性和偏倚 | 评估监督和无监督方法在单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的表现 | 8种监督方法和10种无监督方法在14个公共单细胞RNA测序数据集上的表现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14个不同组织、测序协议和物种的公共单细胞RNA测序数据集 |
| 21956 | 2024-08-08 |
Host T Cell Dedifferentiation Effects Drive HIV-1 Latency Stability
2022-03-09, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01974-21
PMID:35019721
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研究论文 | 本文研究了HIV-1潜伏感染的T细胞中的转录组异质性，并揭示了这些细胞表现出一种去分化表型，类似于造血干细胞，这种表型对HIV-1潜伏稳定性有影响。 | 本文首次揭示了HIV-1潜伏感染的T细胞去分化表型，并提供了数据挖掘和软件集成方法来识别药物靶点，以重新分化病毒宿主细胞，从而破坏HIV-1潜伏感染。 | 本文的局限性在于对控制机制的理解仍然有限，需要进一步研究以完全理解这些机制。 | 研究HIV-1潜伏感染的生物分子机制，以开发治愈性治疗干预措施。 | HIV-1潜伏感染的T细胞及其去分化表型。 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自患者的HIV-1潜伏感染的T细胞 |
| 21957 | 2024-08-08 |
A chemoresistance lncRNA signature for recurrence risk stratification of colon cancer patients with chemotherapy
2022-Mar-08, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.12.015
PMID:35036055
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研究论文 | 本研究通过分析公共数据库中的长非编码RNA表达谱，识别出55种化疗特异性的长非编码RNA，并构建了一个名为CRLSig的化疗抵抗lncRNA特征，用于区分结肠癌化疗患者的无复发生存率。 | 首次构建了一个化疗抵抗lncRNA特征（CRLSig），能够有效区分结肠癌化疗患者的复发风险。 | NA | 开发一种新的分子标志物，用于评估结肠癌患者化疗后的复发风险。 | 结肠癌患者的化疗效果及复发风险。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序 | NA | RNA表达谱 | 多个队列的结肠癌患者，具体数量未详述 |
| 21958 | 2024-08-08 |
Origin, molecular specification, and stemness of astrocytes
2022-03, Developmental neurobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1002/dneu.22863
PMID:35006642
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞的起源、分子特化及其干细胞特性 | 利用单细胞测序技术深入理解星形胶质细胞谱系的模式和分子特化 | 星形胶质细胞的发育分期和命运特化及分化的分子机制仍未完全明确 | 探讨星形胶质细胞的早期发育、异质性及其在不同条件下的功能适应性 | 星形胶质细胞及其在神经系统中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 21959 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Embryonic Endothelial Heterogeneity at Spatiotemporal Level and Multifunctions of MicroRNA-126 in Mice
2022-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.317093
PMID:35021856
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了胚胎期小鼠内皮细胞在时空水平上的异质性以及微小RNA-126（miR-126）的多功能性 | 首次详细探讨了胚胎期内皮细胞的转录异质性，并揭示了miR-126在维持内皮细胞异质性中的关键作用 | NA | 评估发育期内皮细胞在时空水平上的转录异质性，并揭示miR-126敲除对胚胎期内皮细胞聚类的影响 | 小鼠胚胎期的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6J小鼠胚胎14.5天，以及Tie2-cre介导的内皮细胞特异性miR-126敲除胚胎 |
| 21960 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Temporal Diversity and Dynamics of Cardiac Immunity after Myocardial Infarction
2022-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100752
PMID:35023642
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了心肌梗死后不同时间点心脏Cd45免疫细胞的多样性和动态变化 | 首次揭示了心肌梗死后心脏免疫细胞的时序多样性和动态变化，并识别了主要的免疫细胞群及其亚型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探讨心肌梗死后心脏免疫反应的时序调控机制 | 心肌梗死后心脏Cd45免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠左前降冠状动脉结扎模型中的免疫细胞样本 |