单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 21881 - 21900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21881 | 2024-08-08 |
Dynamic inference of cell developmental complex energy landscape from time series single-cell transcriptomic data
2022-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009821
PMID:35073331
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图的非线性Fokker-Planck方程模型GraphFP，用于从时间序列单细胞转录组数据中重建细胞状态转换的复杂势能景观 | GraphFP模型明确考虑了细胞间的非线性相互作用，并通过动态最优传输框架和伴随方法有效解决了模型推断问题 | NA | 旨在从时间序列单细胞转录组数据中重建细胞状态转换过程并揭示细胞间的非线性相互作用 | 时间序列单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非线性Fokker-Planck方程 | 转录组数据 | 小鼠胚胎大脑皮层发育的时间序列scRNA-seq数据集 |
| 21882 | 2024-08-08 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 本研究旨在优化分离的人胰岛细胞的冷冻保存方法，并获得可用于单细胞转录组研究的功能性细胞，以探讨糖尿病的病理和治疗方法 | 本研究采用迭代分级冷冻方法，成功地在冷冻保存后维持了细胞的膜完整性、分子和功能表型 | NA | 优化分离的人胰岛细胞的冷冻保存方法，并获得功能性细胞用于糖尿病的病理和治疗研究 | 分离的人胰岛细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | NA |
| 21883 | 2024-08-08 |
Clinical challenges of tissue preparation for spatial transcriptome
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.669
PMID:35083877
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研究论文 | 本文研究了影响空间转录组学质量的潜在因素，特别是在肺癌、癌旁或正常组织中的应用 | 强调了样本处理时间及干燥条件对空间转录组学样本质量的关键影响 | 未发现组织学评分与RNA完整性数（RIN）和唯一分子标识符（UMI）之间的显著相关性 | 旨在定义影响空间转录组学质量的潜在因素 | 研究了肺癌、癌旁或正常组织的空间转录组学质量 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学测序 | NA | 组织样本 | 具体样本数量未提及 |
| 21884 | 2024-08-08 |
Molecular mechanisms governing circulating immune cell heterogeneity across different species revealed by single-cell sequencing
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.689
PMID:35092700
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，比较了12个物种的免疫细胞单细胞转录组，揭示了循环免疫细胞在不同物种间的异质性和组成 | 首次提供了跨物种外周血单核细胞（PBMCs）的单细胞转录组图谱的综合分析 | NA | 深入理解外周血单核细胞的细胞分类学和基本功能，以及在进化生物学、发育生物学和免疫系统疾病中的应用 | 12个物种的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组 | 12个物种的免疫细胞 |
| 21885 | 2024-08-08 |
Dissecting the heterogeneity of the microenvironment in primary and recurrent nasopharyngeal carcinomas using single-cell RNA sequencing
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2026583
PMID:35096485
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研究论文 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术分析了四例原发性鼻咽癌和两例复发性鼻咽癌的约60,000个细胞的转录组，以深入了解复发性鼻咽癌在放射治疗区域内的动态变化 | 首次对复发性鼻咽癌的免疫微环境进行单细胞RNA测序分析，揭示了免疫细胞和肿瘤细胞的异质性及其在复发性鼻咽癌中的变化 | 研究样本相对有限，可能影响结果的普遍性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入了解复发性鼻咽癌的免疫微环境，以促进针对性的免疫治疗 | 原发性鼻咽癌和复发性鼻咽癌的免疫细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约60,000个细胞，来自四例原发性鼻咽癌和两例复发性鼻咽癌病例 |
| 21886 | 2024-08-08 |
Identification of a unique tumor cell subset employing myeloid transcriptional circuits to create an immunomodulatory microenvironment in glioblastoma
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2030020
PMID:35096487
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了一种计算方法来描绘胶质母细胞瘤的免疫特征并识别新的分子亚群，以用于免疫治疗 | 发现了新的胶质母细胞瘤细胞亚群TC-6，该亚群具有免疫入侵特征，并与肿瘤相关巨噬细胞相互作用，形成免疫抑制性微环境 | NA | 揭示胶质母细胞瘤免疫微环境的异质性，并为优化胶质母细胞瘤免疫治疗提供新见解 | 胶质母细胞瘤细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21887 | 2024-08-08 |
NonLoss: a novel analytical method for differential biological module identification from single-cell transcriptome
2021-Dec, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-6401
PMID:35071482
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研究论文 | 本文介绍了一种名为NonLoss的新型计算分析方法和桌面应用程序，用于从单细胞转录组数据中识别差异生物模块 | NonLoss方法通过处理特定功能模块中所有基因的表达水平数据，进行降维和功能识别的可靠性分析，避免了单个基因的随机干扰 | NA | 开发一种更稳健的计算分析方法，以从单细胞转录组数据中提取真实的生物学差异 | 单细胞转录组数据中的差异生物模块 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 21888 | 2024-08-08 |
Targeting TIGIT Inhibits Bladder Cancer Metastasis Through Suppressing IL-32
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.801493
PMID:35069212
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序探索肿瘤细胞组成，发现高表达TIGIT和IL-32的Treg细胞亚群，并探讨了靶向TIGIT通过抑制IL-32来抑制膀胱癌转移的机制 | 首次揭示了TIGIT作为膀胱癌免疫治疗新靶点的双重效应，并阐明了IL-32在膀胱癌转移中的促进作用 | NA | 开发新的免疫治疗靶点以改善膀胱癌的治疗效果 | 膀胱癌及其转移机制 | NA | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 21889 | 2024-08-08 |
Granulocyte Macrophage-Colony Stimulating Factor Produces a Splenic Subset of Monocyte-Derived Dendritic Cells That Efficiently Polarize T Helper Type 2 Cells in Response to Blood-Borne Antigen
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.767037
PMID:35069539
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研究论文 | 研究探讨了粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子（GM-CSF）诱导的脾脏树突状细胞（GMiDCs）在血液抗原刺激下促进T辅助细胞2型（Th2）极化和过敏反应的能力 | 首次详细分析了GM-CSF注射后在脾脏中形成的特定树突状细胞亚群，并揭示了其在Th2细胞极化和过敏反应中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类中验证这些发现 | 探究GM-CSF对树突状细胞亚群的影响及其在免疫反应中的作用 | 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子（GM-CSF）诱导的树突状细胞（GMiDCs）及其在脾脏中的功能 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序分析，细胞转移实验 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 21890 | 2024-08-08 |
Cardiovascular Risk After SARS-CoV-2 Infection Is Mediated by IL18/IL18R1/HIF-1 Signaling Pathway Axis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.780804
PMID:35069552
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研究论文 | 本研究旨在阐明基于多组学数据的COVID-19相关心血管风险机制 | 发现HIF-1信号通路是动脉瘤、动脉粥样硬化和SARS-CoV-2感染的共同关键通路，并通过细胞间通讯分析揭示了巨噬细胞衍生的IL-18通过IL18R1激活HIF-1信号通路 | NA | 阐明COVID-19相关心血管风险的机制 | COVID-19感染后的心血管风险机制 | NA | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组分析、表观遗传分析 | NA | 多组学数据 | NA |
| 21891 | 2024-08-08 |
Immune Dysfunctions of CD56neg NK Cells Are Associated With HIV-1 Disease Progression
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.811091
PMID:35069597
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研究论文 | 本研究分析了CD56neg自然杀伤细胞在HIV-1感染中的表型和功能特征，并探讨了其与疾病进展的关系 | 首次系统分析了CD56neg自然杀伤细胞的表型和功能特征，并揭示了其与HIV-1疾病进展的关联 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的HIV-1感染阶段 | 探讨CD56neg自然杀伤细胞在HIV-1感染中的作用及其与疾病进展的关系 | CD56neg自然杀伤细胞的表型和功能特征 | 免疫学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术 | NA | 细胞 | 84名捐赠者，包括34名未治疗的HIV-1感染患者、29名接受抗逆转录病毒治疗成功的HIV-1感染患者和21名健康对照 |
| 21892 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Profiling of Human Skin Reveals Age-Related Loss of Dermal Sheath Cells and Their Contribution to a Juvenile Phenotype
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.797747
PMID:35069694
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自不同年龄捐赠者的人类皮肤活检样本中的72,048个细胞的转录组，揭示了随着年龄增长，真皮鞘细胞的丢失及其对年轻皮肤表型的贡献。 | 首次详细描述了人类真皮鞘细胞在单细胞水平上的身份、衰老过程中的丢失、干细胞特性及其对年轻皮肤表型的贡献。 | 研究主要集中在人类皮肤样本上，未涉及动物模型或其他细胞类型的比较。 | 探究人类皮肤中真皮鞘细胞的年龄相关变化及其对皮肤稳态的影响。 | 人类皮肤中的真皮鞘细胞及其在衰老过程中的变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 72,048个细胞，包括50,149个成纤维细胞 |
| 21893 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveals Cell Types Involved in Heart Failure
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.779225
PMID:35071201
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，揭示了心力衰竭中涉及的细胞类型 | 本研究首次综合利用批量和单细胞RNA测序数据，详细分析了心力衰竭中的细胞类型和分子机制 | NA | 旨在深入识别心力衰竭的遗传因素，为理解其分子基础提供新视角 | 心力衰竭相关的非衰竭（NF）、扩张型心肌病（DCM）和缺血性心肌病（ICM）心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | PCA、GSEA、GSVA | RNA测序数据 | 包括非衰竭（NF）、扩张型心肌病（DCM）和缺血性心肌病（ICM）心脏组织 |
| 21894 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomes Combining with Consecutive Genomics Reveal Clonal Evolution and Gene Regulatory Networks in Relapsed and Refractory Multiple Myeloma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.794144
PMID:35071234
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和连续基因组学，揭示了复发和难治性多发性骨髓瘤中的克隆进化和基因调控网络 | 首次结合单细胞RNA测序和全外显子测序，分析了从诊断到死亡的单个复发和难治性多发性骨髓瘤患者的动态基因组变化，并揭示了骨髓瘤细胞的内部异质性和基因调控网络 | 研究仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性和广泛适用性 | 探讨多线治疗后复发/难治性多发性骨髓瘤中克隆结构的进化及其潜在的调控网络 | 复发和难治性多发性骨髓瘤患者的基因组和转录组 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全外显子测序（WES），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 一名63岁女性患者，从诊断到死亡约37个月，进行了8次全外显子测序和1次单细胞RNA测序 |
| 21895 | 2024-08-08 |
Recent Advances in Single-Cell View of Mesenchymal Stem Cell in Osteogenesis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.809918
PMID:35071243
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综述 | 本文综述了单细胞技术在骨生成中对间充质干细胞（MSCs）的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）识别骨生成标记物和分化途径，结合实验技术获得MSCs相关的新见解 | NA | 探讨MSCs在骨发育、维持和再生中的作用及其与微环境的相互作用 | 间充质干细胞（MSCs）及其在骨生成中的作用 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 21896 | 2024-08-08 |
The Cell Differentiation of Idioblast Myrosin Cells: Similarities With Vascular and Guard Cells
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.829541
PMID:35082820
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综述 | 本文综述了异细胞芥子细胞与维管细胞/保卫细胞的相似性和差异性 | 分析了芥子细胞和保卫细胞在细胞类型特异性基因表达模式上的显著相似性 | NA | 探讨芥子细胞与维管细胞/保卫细胞的相似性和差异性 | 芥子细胞、维管细胞和保卫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21897 | 2024-08-08 |
Dissecting Cellular Heterogeneity Based on Network Denoising of scRNA-seq Using Local Scaling Self-Diffusion
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.811043
PMID:35082838
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研究论文 | 本文提出了一种基于局部尺度自扩散网络去噪的单细胞RNA测序（scRNA-seq）方法，用于解析细胞异质性 | 本文创新性地提出了局部尺度自扩散（LSSD）方法，通过增强细胞相似性的度量学习来克服传统无监督聚类中的噪声和冗余信息问题 | NA | 识别不同细胞的表型和相互作用 | 细胞异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两个模拟数据集和四个真实scRNA-seq数据集 |
| 21898 | 2024-08-08 |
The Development of Single-Cell Metabolism and Its Role in Studying Cancer Emergent Properties
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.814085
PMID:35083160
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综述 | 本文综述了单细胞代谢组学技术在研究肿瘤代谢调控关键因子中的应用及其对基于代谢的抗癌策略发展的影响 | 单细胞代谢组学技术能够提供比传统代谢组学更详细的单细胞代谢信息，有助于筛选肿瘤治疗的代谢靶点 | NA | 探讨单细胞测序技术在寻找调控肿瘤代谢关键因子中的作用 | 肿瘤细胞的代谢调控关键因子 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞代谢组学 | NA | 代谢物 | NA |
| 21899 | 2024-08-08 |
Prognostic Autophagy-Related Model Revealed by Integrating Single-Cell RNA Sequencing Data and Bulk Gene Profiles in Gastric Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.729485
PMID:35083210
|
研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别出一个与自噬相关的风险模型，该模型能够区分胃癌患者的不良预后 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个与自噬相关的风险模型，并验证了其在胃癌患者预后评估中的应用价值 | NA | 旨在揭示自噬相关模型在胃癌中的临床意义 | 胃癌患者的预后评估 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用了TCGA和两个独立的Gene Expression Omnibus队列的数据 |
| 21900 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiles of Age-Related Osteoarthritis Uncover Underlying Heterogeneity Associated With Disease Progression
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.748360
PMID:35083277
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了与年龄相关的骨关节炎（OA）滑膜组织的细胞异质性 | 首次揭示了OA滑膜组织中免疫细胞亚群的转录组多样性及其在疾病进展中的作用 | NA | 旨在描绘骨关节炎滑膜组织的细胞间异质性 | 骨关节炎滑膜组织中的细胞异质性 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA表达数据 | 整合了GSE55235和GSE55457两个数据集 |