单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28877 篇文献，本页显示第 21861 - 21880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21861 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of peripheral CD8+ T cell responses in patients receiving checkpoint blockade immunotherapy for cancer
2023-Feb, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03263-9
PMID:35907015
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合T细胞受体测序技术，分析了接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者外周血中CD8+ T细胞的反应 | 首次详细描述了免疫检查点抑制剂治疗前后，患者外周血中CD8+ T细胞的转录组变化，并发现这些变化与患者的生存期相关 | 研究样本量较小，且结果在更大规模患者群体中的预测能力有待验证 | 探讨免疫检查点抑制剂治疗对癌症患者外周血中CD8+ T细胞反应的影响及其与临床疗效的关系 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者外周血中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53名癌症患者 |
| 21862 | 2024-08-08 |
Granulocytic myeloid-derived suppressor cells to prevent and treat murine immune-mediated bone marrow failure
2023-01-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022007254
PMID:35895513
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研究论文 | 研究粒细胞样髓源性抑制细胞（G-MDSCs）在预防和治疗小鼠免疫介导的骨髓衰竭中的作用 | 首次探讨了G-MDSCs在免疫性再生障碍性贫血（AA）中的作用，并展示了其在MHC匹配的小鼠模型中的治疗效果 | 研究结果显示G-MDSCs的治疗效果依赖于免疫背景，MHC不匹配的模型中效果不佳 | 探讨G-MDSCs在免疫介导的骨髓衰竭中的作用及其治疗潜力 | 粒细胞样髓源性抑制细胞（G-MDSCs）在免疫性再生障碍性贫血（AA）和骨髓衰竭（BMF）小鼠模型中的作用 | 免疫学 | 骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了MHC匹配的C.B10 BMF小鼠和MHC不匹配的CByB6F1 AA模型小鼠 |
| 21863 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in the context of neuropathic pain: progress, challenges, and prospects
2023-01, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2022.07.004
PMID:35902034
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在神经病理性疼痛研究中的应用、挑战和前景 | scRNA-seq技术能够无偏差、高通量和高分辨率地分析与神经病理性疼痛相关的细胞转录组，有助于深入理解疼痛机制并实现个性化疼痛管理 | scRNA-seq在神经病理性疼痛领域的应用相对较新，且主要基于动物模型，需要更多关注转化医学研究 | 探索神经病理性疼痛的机制，以改善临床上对疼痛的诊断、治疗和管理 | 神经病理性疼痛及其相关细胞的转录组 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 21864 | 2024-08-08 |
Clonal germinal center B cells function as a niche for T-cell lymphoma
2022-11-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015451
PMID:35921527
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研究论文 | 研究使用小鼠模型和人类样本，探讨了TET2突变免疫细胞如何促进血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）的发展 | 首次揭示了TET2突变免疫细胞作为AITL发展的生态位，并通过单细胞RNA测序和计算机网络分析，识别了CD40-CD40LG轴在GCB细胞和肿瘤细胞集群交互中的潜在作用 | NA | 探究TET2突变免疫细胞在AITL发展中的机制 | 小鼠模型和人类AITL样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 超过50,000个细胞 |
| 21865 | 2024-08-08 |
Analyzing the gene regulatory network in hepatitis B patients by single-cell ATAC sequencing
2022-Nov, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-022-06310-z
PMID:35902485
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC测序分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，以揭示其病理生理机制 | 首次使用单细胞ATAC测序技术分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，为理解疾病发展提供了新的视角 | NA | 旨在通过分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，揭示其病理生理机制 | 慢性乙型肝炎患者的基因调控网络 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 8016个细胞 |
| 21866 | 2024-08-08 |
The scINSIGHT Package for Integrating Single-Cell RNA-Seq Data from Different Biological Conditions
2022-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0244
PMID:35920848
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研究论文 | 介绍了一种名为scINSIGHT的新型单细胞RNA测序数据整合方法及其R包的使用 | scINSIGHT基于一种新颖的非负矩阵分解模型，能够学习不同生物或实验条件下样本中的共同和条件特异性基因模块 | NA | 改进多单细胞样本的整合，识别细胞身份和不同细胞类型或条件下的活跃生物过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 多个单细胞样本 |
| 21867 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Dynamic Cardiac Transition Program from ADCs Induced by Leukemia Inhibitory Factor
2022-10-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac048
PMID:35896368
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了白血病抑制因子（LIF）诱导的脂肪来源细胞（ADCs）向心肌细胞转变过程中的细胞异质性和动态变化 | 本研究首次揭示了ADCs在LIF诱导下进入心肌生成程序时的不同亚群反应，以及ADCs向心肌细胞转变的时间依赖性和Nrf2信号通路的瞬时变化 | NA | 探索ADCs的异质性和LIF诱导的ADCs向心肌细胞转变的细胞动力学 | 脂肪来源细胞（ADCs）及其在LIF诱导下的心肌细胞转变过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 39,432个单细胞 |
| 21868 | 2024-08-08 |
Cluster-independent marker feature identification from single-cell omics data using SEMITONES
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac639
PMID:35909238
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEMITONES的方法，用于从单细胞组学数据中进行无聚类标记特征识别 | SEMITONES是一种无聚类标记识别方法，不依赖细胞的聚类分配，适用于发育数据等复杂情况 | NA | 开发一种无需细胞聚类的新方法，用于从单细胞组学数据中识别细胞身份标记 | 人类造血系统的单细胞数据以及空间转录组数据 | 单细胞组学 | NA | SEMITONES | NA | 单细胞数据 | 使用了多个模拟和精选的数据集进行验证 |
| 21869 | 2024-08-08 |
Tyrosine Kinase Inhibition Alters Intratumoral CD8+ T-cell Subtype Composition and Activity
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-1039
PMID:35917579
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研究论文 | 研究酪氨酸激酶抑制剂（TKI）对肿瘤内CD8+ T细胞亚型组成和活性的影响 | 发现TKI与IL15超激动剂（IL15SA）联合使用可恢复肿瘤内效应CD8+ T细胞功能和CD8+ T细胞内PI3K信号传导，从而增强肿瘤破坏 | 尽管联合使用TKI和免疫检查点阻断（ICB）在晚期GIST中取得了一定效果，但治疗效果仍然有限 | 探讨TKI对肿瘤内CD8+ T细胞亚型组成和活性的影响，并评估联合治疗策略的效果 | 胃肠间质瘤（GIST）中的CD8+ T细胞亚型和活性 | 数字病理学 | 胃肠间质瘤 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | 使用了基因工程小鼠模型和人类GIST样本 |
| 21870 | 2024-08-08 |
Constitutive programmed death ligand 1 expression protects gastric G-cells from Helicobacter pylori-induced inflammation
2022-Oct, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.12917
PMID:35899973
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研究论文 | 研究胃肠道化生（GIM）患者组织在幽门螺杆菌感染后是否通过PD-L1表达逃避免疫监视 | 发现G-细胞在幽门螺杆菌感染期间通过PD-L1表达得到保护，而GIM本身不表达PD-L1 | NA | 探究GIM患者组织在幽门螺杆菌感染后是否通过PD-L1表达逃避免疫监视 | GIM患者的组织样本 | NA | 胃肠道疾病 | 免疫组织化学染色，多重免疫荧光染色，单细胞测序 | NA | 组织样本 | 来自已知GIM患者的一组样本 |
| 21871 | 2024-08-08 |
Research strategies for single-cell transcriptome analysis in plant leaves
2022-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15927
PMID:35904970
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在植物叶片研究中的进展，并探讨了相关的分析方法及当前研究中遇到的困难和问题 | NA | 植物单细胞研究面临细胞分离、细胞类型注释、细胞功能分析和细胞间通信网络等挑战，且缺乏可靠稳定的分析方法和标准 | 总结植物叶片中单细胞转录组分析的研究进展，并探讨未来的发展方向 | 植物叶片的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 21872 | 2024-08-08 |
Ontogenetic rules for the molecular diversification of hypothalamic neurons
2022-10, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-022-00615-3
PMID:35906427
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、小鼠遗传学和内分泌学研究，描述了下丘脑发育的关键阶段，包括局部神经发生、谷氨酸能神经元的直接终末分化、GABA能神经元和GABA能细胞衍生多巴胺细胞的过渡级联、局部神经元迁移的波次以及神经肽和激素的顺序富集。 | 本文利用分子指纹技术，提供了前所未有的数据量和深度，以区分甚至预测多种神经元模式的突触和内分泌能力、连接性和刺激选择性。 | NA | 研究下丘脑神经元的分子多样化和发育分离的分子规则。 | 下丘脑的神经元及其在发育过程中的分子多样化和终末分化。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种神经元亚型 |
| 21873 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing: Unravelling the Bone One Cell at a Time
2022-10, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-022-00735-w
PMID:35915289
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综述 | 本文综述了使用单细胞RNA测序和新兴的空间RNA测序技术在骨骼研究中的最新发现 | 单细胞RNA测序揭示了骨骼细胞谱系中新的和转录上不同的细胞集群，空间转录组学方法提供了不同细胞群的定位信息 | NA | 总结近期使用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术在骨骼研究中的发现，描述不同骨骼驻留细胞类型及其分子程序 | 骨骼中的不同细胞类型及其分子程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21874 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of fractional CO2 laser efficiency in treating a mouse model of alopecia
2022-10, Lasers in surgery and medicine
IF:2.2Q2
DOI:10.1002/lsm.23590
PMID:35916125
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了分次二氧化碳激光治疗小鼠模型脱发的分子和细胞机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了激光照射后皮肤中细胞群及其基因表达的变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证其效果 | 探究分次二氧化碳激光治疗脱发的有效条件及其分子和细胞机制 | 小鼠模型的脱发治疗 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型的皮肤样本 |
| 21875 | 2024-08-08 |
GLOBE: a contrastive learning-based framework for integrating single-cell transcriptome datasets
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac311
PMID:35901449
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的单细胞转录组数据集整合框架GLOBE，该框架通过定义自适应平移变换和使用硬度感知与一致性感知的损失函数来去除批次效应，并支持多样化的下游分析 | GLOBE框架通过自适应平移变换和硬度感知与一致性感知的损失函数，提高了批次效应去除的稳定性和表示对齐的一致性 | NA | 开发一种改进的基于对比学习的批次效应校正框架，以整合来自多个来源的单细胞转录组数据集 | 单细胞转录组数据集的批次效应去除 | 生物信息学 | NA | 对比学习 | 对比学习框架 | 转录组数据 | 广泛的数据集，包括两个发育中的小鼠新皮质数据集 |
| 21876 | 2024-08-08 |
GE-Impute: graph embedding-based imputation for single-cell RNA-seq data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac313
PMID:35901457
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研究论文 | 提出了一种基于图嵌入的神经网络模型GE-Impute，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | GE-Impute通过学习每个细胞的神经图表示并重建细胞间相似性网络，从而更准确地填补缺失值 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据的可靠性和生物学解释性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图嵌入神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 21877 | 2024-08-08 |
Learning discriminative and structural samples for rare cell types with deep generative model
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac317
PMID:35914950
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研究论文 | 本文提出了一种新的深度生成模型scLDS2，用于利用少量细胞样本准确估计不同细胞的分布，通过对抗学习区分稀有和非稀有细胞类型 | scLDS2模型通过生成稀疏的假样本并学习细胞间的关系，增强了样本的可解释性，并将细胞类型的识别问题转化为分类问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型识别的挑战 | 稀有细胞类型的识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成模型 | 基因表达数据 | 20个数据集 |
| 21878 | 2024-08-08 |
SECEDO: SNV-based subclone detection using ultra-low coverage single-cell DNA sequencing
2022-09-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac510
PMID:35900151
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单核苷酸变异（SNV）的超低覆盖率单细胞DNA测序数据进行亚克隆检测的新方法SECEDO | SECEDO利用贝叶斯过滤方法和读取重叠与相位技术，有效地对肿瘤细胞进行聚类，相较于现有技术，在超低覆盖率数据上显著提高了SNV检测的敏感性和准确性 | NA | 开发一种新的方法来基于SNV对肿瘤细胞进行聚类，以更全面地了解肿瘤内异质性 | 肿瘤细胞的亚克隆结构 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序 | 贝叶斯过滤方法 | DNA序列数据 | 合成数据集包含7250个细胞和八个肿瘤亚克隆，真实数据集每个包含约2000个细胞 |
| 21879 | 2024-08-08 |
Lysosomal acid lipase, CSF1R, and PD-L1 determine functions of CD11c+ myeloid-derived suppressor cells
2022-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156623
PMID:35917184
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研究论文 | 研究探讨了溶酶体酸性脂肪酶（LAL）、集落刺激因子1受体（CSF1R）和程序性死亡配体1（PD-L1）在CD11c+髓源性抑制细胞中的作用 | 通过单细胞RNA测序和药理学阻断方法，揭示了LAL缺陷小鼠中CD11c+细胞的代谢转变及其对T细胞抑制和肿瘤生长的影响 | NA | 探究LAL、CSF1R和PD-L1在CD11c+髓源性抑制细胞功能中的作用及其对免疫抑制和肿瘤生长的影响 | CD11c+髓源性抑制细胞、LAL缺陷小鼠、非小细胞肺癌患者 | NA | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LAL缺陷小鼠和非小细胞肺癌患者的样本 |
| 21880 | 2024-08-08 |
Function of normal oral mucosa revealed by single-cell RNA sequencing
2022-09, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.30307
PMID:35894175
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了正常口腔黏膜细胞的功能和相互作用 | 首次通过单细胞转录组测序技术绘制了正常口腔黏膜细胞的全面图谱，并发现了具有高表达主要组织相容性复合体II类分子的上皮细胞亚群、CD8 GZMK T细胞亚群和两种活化的巨噬细胞 | NA | 探讨正常口腔黏膜细胞的功能和相互作用 | 正常口腔黏膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 26,398个细胞来自三例正常口腔黏膜 |