单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27901 篇文献，本页显示第 21821 - 21840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21821 | 2024-08-08 |
Clinicopathological value of the upregulation of cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2 in osteosarcoma
2022-04-11, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01234-8
PMID:35410253
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞周期依赖性激酶调节亚单位2（CKS2）在骨肉瘤（OS）中的临床病理价值 | 首次通过多种技术手段证实了CKS2在骨肉瘤组织中的上调表达，并分析了其与临床病理参数的关系 | 尽管研究显示CKS2在骨肉瘤中的表达上调，但Kaplan-Meier曲线未显示出高CKS2表达组与低CKS2表达组在总体生存率上的显著差异 | 研究CKS2在骨肉瘤中的表达及其对临床病理参数的影响 | 骨肉瘤组织和非肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 免疫组织化学（IHC） | NA | 组织微阵列数据 | 217例骨肉瘤样本和87例非肿瘤样本 |
| 21822 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing coupled to TCR profiling of large granular lymphocyte leukemia T cells
2022-04-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29175-x
PMID:35411048
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序结合TCR分析，探讨了T细胞大颗粒淋巴细胞白血病（T-LGLL）在阿仑单抗治疗前后的变化 | 首次展示了T-LGLL中效应记忆T细胞的普遍存在以及T细胞受体（TCR）多样性的丧失，并揭示了治疗前后细胞凋亡基因表达的变化 | NA | 探究T-LGLL的病理生理机制及阿仑单抗治疗的效果 | T-LGLL患者的CD3 T细胞 | 数字病理学 | 淋巴增生性疾病 | 单细胞RNA测序，TCR分析 | NA | RNA序列数据 | 13名患者 |
| 21823 | 2024-08-08 |
Tracking down tumor-specific T cells
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.007
PMID:35413268
|
research paper | 本文通过两篇发表在《Cancer Cell》上的论文，展示了如何利用单细胞测序技术定义识别肿瘤特异性T细胞的分子表型 | 利用单细胞测序技术定义肿瘤特异性T细胞的分子表型 | NA | 研究如何通过单细胞测序技术识别肿瘤特异性T细胞 | 肿瘤特异性T细胞 | digital pathology | NA | 单细胞测序 | NA | 分子表型数据 | NA |
| 21824 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiles of neoantigen-reactive T cells in human gastrointestinal cancers
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.005
PMID:35413272
|
研究论文 | 本研究通过免疫筛选与单细胞RNA测序相结合的方法，分析了胆管癌和胰腺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞中新生抗原反应性T细胞的转录组特征 | 发现了新生抗原反应性CD8 T细胞和CD4 T细胞在胃肠道癌症中表现出独特的转录组特征，这些特征可能为利用这些细胞进行治疗提供新的机会 | NA | 研究胃肠道癌症中新生抗原反应性T细胞的转录组特征 | 胆管癌和胰腺癌患者肿瘤浸润淋巴细胞中的新生抗原反应性T细胞 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自胆管癌和胰腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 21825 | 2024-08-08 |
Neoantigen-specific CD4+ T cells in human melanoma have diverse differentiation states and correlate with CD8+ T cell, macrophage, and B cell function
2022-04-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.03.006
PMID:35413271
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序和T细胞受体序列，识别了浸润人黑色素瘤的肿瘤特异性CD4 T细胞的特征及其功能相关性 | 首次详细描述了肿瘤特异性CD4 T细胞在人黑色素瘤中的多样分化状态及其与CD8 T细胞、巨噬细胞和B细胞功能的关联 | NA | 探究肿瘤特异性CD4 T细胞在人黑色素瘤中的作用及其与免疫细胞功能的关联 | 人黑色素瘤中的肿瘤特异性CD4 T细胞及其功能相关性 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21826 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Cells from Degenerating and Non-Degenerating Intervertebral Discs from the Same Individual Reveals New Biomarkers for Intervertebral Disc Degeneration
2022-Apr-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23073993
PMID:35409356
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析技术，从同一患者的退变和非退变椎间盘组织中鉴定出新的细胞特异性生物标志物，并定义了不同细胞群 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了退变和非退变椎间盘细胞的功能差异，并发现了与细胞类型和退变状态相关的分子功能、生物过程和转录因子 | NA | 鉴定新的椎间盘退变生物标志物，以改善诊断和治疗选项 | 退变和非退变的人类椎间盘细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自同一患者的退变和非退变椎间盘组织 |
| 21827 | 2024-08-08 |
DNMT3A-dependent DNA methylation is required for spermatogonial stem cells to commit to spermatogenesis
2022-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01040-z
PMID:35410378
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研究论文 | 本文研究了DNA甲基化在精子发生中的作用，特别是DNMT3A依赖的DNA甲基化对精原干细胞（SSC）分化和精子发生的影响。 | 首次揭示了DNMT3A在精原干细胞中广泛甲基化基因组的作用，以及其对SSC可塑性的控制。 | NA | 探讨DNA甲基化在男性生育中的关键作用，特别是精原干细胞分化和终身精子发生供应的表观遗传编程。 | 精原干细胞（SSC）和精子发生过程中的DNA甲基化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序和染色质状态分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 21828 | 2024-08-08 |
Mapping human haematopoietic stem cells from haemogenic endothelium to birth
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04571-x
PMID:35418685
|
研究论文 | 本文通过创建单细胞转录组图谱，追踪了人类造血干细胞（HSCs）从胚胎早期到出生的发育过程 | 首次详细描述了HSCs在不同造血部位的成熟过程，并识别了区分HSCs与前体细胞的特定基因标记 | NA | 研究人类造血干细胞的发育过程及其分子机制 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 从胚胎早期到出生的多个造血组织样本 |
| 21829 | 2024-08-08 |
Single Cell Self-Paced Clustering with Transcriptome Sequencing Data
2022-Mar-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23073900
PMID:35409258
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研究论文 | 本文介绍了一种基于F-范数非负矩阵分解的单细胞自步聚类（scSPaC）方法和基于l21-范数非负矩阵分解的稀疏单细胞自步聚类（sscSPaC）方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | 提出了scSPaC和sscSPaC方法，通过逐步从简单到复杂添加单细胞，有效减少了噪声数据和异常值的影响 | NA | 解决现有单细胞聚类方法对噪声数据和异常值敏感的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 21830 | 2024-08-08 |
Primary Cell Cultures to Study the Regeneration Potential of Murine Müller Glia after MicroRNA Treatment
2022-03-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63651
PMID:35404354
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研究论文 | 本文研究了通过微RNA处理后小鼠Müller胶质细胞的再生潜力，使用初级细胞培养模型进行实验。 | 发现微RNA能够将Müller胶质细胞重新编程为视网膜祖细胞，并进一步分化为神经样细胞。 | NA | 研究小鼠Müller胶质细胞在微RNA处理后的再生潜力。 | 小鼠Müller胶质细胞及其再生潜力。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 实验中确认80%-90%的细胞为Müller胶质细胞。 |
| 21831 | 2024-08-08 |
Novel Blood Vascular Endothelial Subtype-Specific Markers in Human Skin Unearthed by Single-Cell Transcriptomic Profiling
2022-03-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11071111
PMID:35406678
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析健康成人皮肤中血液血管内皮细胞的分子异质性，并识别出六种不同的亚群 | 发现了与不同血管段相关的新的亚型特异性标志物，这些标志物在血管重塑和炎症反应中具有潜在作用 | NA | 揭示人类皮肤中血液血管内皮细胞的分子异质性和功能多样性 | 健康成人皮肤中的血液血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 健康成人皮肤样本 |
| 21832 | 2024-08-08 |
Low-input Nucleus Isolation and Multiplexing with Barcoded Antibodies of Mouse Sympathetic Ganglia for Single-nucleus RNA Sequencing
2022-03-23, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63397
PMID:35404341
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研究论文 | 本文介绍了一种利用条形码抗体对小鼠交感神经节进行低输入核分离和多重化的方法，用于单核RNA测序，以研究心脏交感神经元的生物学结构。 | 本文采用基于液滴的单核RNA测序技术，能够在长期样本保存的同时保持足够的RNA质量，并通过使用 hashtag oligos (HTOs) 进行核条形码化，实现测序后的解复用和样本追溯。 | 该方法主要针对交感神经节，可能不适用于所有类型的神经元。 | 研究心脏交感神经元在健康和疾病状态下的分子生物学结构。 | 小鼠交感神经节的双侧颈上神经节和星状神经节。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | RNA | 成年小鼠的交感神经节样本 |
| 21833 | 2024-08-08 |
An Efficient and Universal Protoplast Isolation Protocol Suitable for Transient Gene Expression Analysis and Single-Cell RNA Sequencing
2022-Mar-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23073419
PMID:35408780
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研究论文 | 本文介绍了一种简单高效的植物原生质体制备协议，适用于瞬时基因表达分析和单细胞RNA测序 | 该协议通过两种连续的酶消化过程，成功从多种植物器官中分离出高质量的原生质体，适用于多种表达分析，包括单细胞RNA测序 | NA | 提供一种在植物科学中克服多种植物物种原生质体分离障碍的稳健方法 | 植物原生质体的制备和应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞悬液 | 多种植物器官（花瓣、果实、块根和雌蕊）的代表性物种 |
| 21834 | 2024-08-08 |
Subpopulations of cancer-associated fibroblasts link the prognosis and metabolic features of pancreatic ductal adenocarcinoma
2022-Mar, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-407
PMID:35402584
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研究论文 | 研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）亚群在胰腺导管腺癌（PDAC）中的分子特征及其对临床结果的影响 | 引入了基于单细胞测序数据的算法“scFrac”，用于模拟CAF亚型在TCGA-PDAC队列中的富集及其预后影响，并通过多重免疫组织化学染色在外部验证组中确认 | NA | 揭示CAF亚群在PDAC中的分子特征及其代谢谱，并探索其在肿瘤生物学中的失调机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | 算法 | 基因表达数据 | 66名胰腺导管腺癌患者 |
| 21835 | 2024-08-08 |
IL-17 Producing Lymphocytes Cause Dry Eye and Corneal Disease With Aging in RXRα Mutant Mouse
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.849990
PMID:35402439
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研究论文 | 研究RXRα突变小鼠中IL-17相关机制在干眼病发展中的作用 | 首次揭示了RXRα在抑制干眼病诱导的IL-17产生淋巴细胞生成中的作用，并识别RXRα作为干眼病的潜在治疗靶点 | NA | 探讨IL-17相关机制在RXRα突变小鼠干眼病发展中的作用 | RXRα突变小鼠的干眼病症状及IL-17产生淋巴细胞 | NA | 干眼病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术，共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据 | Pinkie小鼠与野生型C57BL/6小鼠的比较研究 |
| 21836 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of Nasal Polyps Reveals a More Pronounced Type 2 Transcriptomic Profile of Epithelial Cells and Mast Cells in Aspirin-Exacerbated Respiratory Disease
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850494
PMID:35418991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞的转录组特征，特别是在阿司匹林加重呼吸疾病患者中的表现 | 首次详细描述了阿司匹林不耐受患者鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞的转录组差异，并揭示了这些细胞在疾病发病机制中的潜在作用 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究鼻息肉中上皮细胞和肥大细胞在阿司匹林不耐受患者中的转录组特征及它们在疾病发病机制中的作用 | 鼻息肉中的上皮细胞和肥大细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名阿司匹林加重呼吸疾病患者和9名慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 |
| 21837 | 2024-08-08 |
Discovery of Novel Circulating Immune Complexes in Lupus Nephritis Using Immunoproteomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850015
PMID:35419005
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研究论文 | 本研究通过免疫蛋白质组学方法，发现并验证了系统性红斑狼疮肾炎（LN）中的新型循环免疫复合物（ICx）作为潜在生物标志物。 | 本研究首次通过蛋白质A/G磁珠或C1q包被板捕获LN血清中的ICx，并利用液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）和单细胞RNA测序（scRNA Seq）数据库筛选出潜在的ICx标志物。 | NA | 发现系统性红斑狼疮肾炎（LN）中的新型循环免疫复合物（ICx）作为潜在生物标志物。 | 系统性红斑狼疮肾炎（LN）患者的血清样本。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS），单细胞RNA测序（scRNA Seq） | NA | 蛋白质 | 验证队列包括62名LN患者和21名健康对照（HC）。 |
| 21838 | 2024-08-08 |
SIEVE: identifying robust single cell variable genes for single-cell RNA sequencing data
2021-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000072
PMID:35402832
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research paper | 本文比较了九种常用方法在筛选单细胞RNA测序数据中可变基因的性能，并提出了一种新的策略SIEVE，通过多轮随机抽样来识别一组稳健的可变基因 | SIEVE策略通过多轮随机抽样，最小化随机噪声，并能恢复低表达的可变基因，显著提高了单细胞分类的准确性 | 现有的可变基因筛选方法在可重复性和准确性上存在不足，且偏好选择高表达基因 | 评估现有可变基因筛选方法的性能，并提出一种新的筛选策略 | 单细胞RNA测序数据中的可变基因筛选方法 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing | NA | text | 使用了来自造血干细胞/祖细胞和成熟血液细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 21839 | 2024-08-08 |
When blood development meets single-cell transcriptomics
2019-Aug, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000007
PMID:35402794
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在血液细胞发育中的应用，特别是造血干细胞（HSCs）的生成过程。 | 结合单细胞转录组学技术，提供了关于血液细胞生成过程中分子演变及其机制的新见解。 | NA | 探讨单细胞转录组学技术在血液细胞发育研究中的应用及未来展望。 | 血液细胞的生成过程，特别是造血干细胞（HSCs）。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21840 | 2024-08-08 |
Tumor heterogeneity of acute myeloid leukemia: insights from single-cell sequencing
2019-Aug, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000015
PMID:35402804
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术研究急性髓系白血病异质性的进展 | 单细胞测序技术为分析个体细胞层面的基因组、转录组、蛋白质组和表观基因组提供了强大工具 | 讨论了单细胞测序技术在急性髓系白血病预后和治疗中的局限性和未来方向 | 理解肿瘤在疾病进展和治疗干预选择下的演化 | 急性髓系白血病的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组和表观基因组数据 | NA |