单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 21781 - 21800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21781 | 2024-08-08 |
Mesenchymal-epithelial interaction regulates gastrointestinal tract development in mouse embryos
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111053
PMID:35830795
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术，构建了小鼠胚胎期E9.5至E15.5胃和肠的时空转录组图谱 | 识别了多个亚群，包括Lox胃间质、Aldh1a3小肠间质和Adamdec1大肠间质，并揭示了上皮和间质细胞的区域化和异质性 | NA | 探究胚胎期小鼠胃和肠发育的细胞和分子变化机制 | 小鼠胚胎期胃和肠的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎期E9.5至E15.5的胃和肠样本 |
| 21782 | 2024-08-08 |
A guiding role of the Arabidopsis circadian clock in cell differentiation revealed by time-series single-cell RNA sequencing
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111059
PMID:35830805
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研究论文 | 本文通过时间序列单细胞RNA测序，揭示了拟南芥生物钟在细胞分化中的指导作用 | 利用高细胞命运可塑性的植物细胞进行单细胞RNA测序，开发了PeakMatch方法分析细胞分化过程，发现时钟基因表达变化先于细胞分化 | NA | 探究生物钟是否调控细胞分化 | 拟南芥的细胞分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21783 | 2024-08-08 |
A human adipose tissue cell-type transcriptome atlas
2022-07-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111046
PMID:35830816
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研究论文 | 本研究通过未分选的人体脂肪组织RNA-seq数据，解析了细胞类型特异性转录组图谱 | 本研究提供了一种利用批量RNA-seq数据来分析细胞类型特异性转录组的可访问方法 | NA | 定义细胞类型特异性基因并解析其在人体脂肪组织中的表达 | 人体脂肪组织的细胞类型特异性转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 527个内脏脂肪组织样本和646个皮下脂肪组织样本 |
| 21784 | 2024-08-08 |
Lymphocyte subsets in Atlantic cod (Gadus morhua) interrogated by single-cell sequencing
2022-07-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03645-w
PMID:35821077
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了大西洋鳕鱼（Gadus morhua）脾脏中的淋巴细胞异质性 | 首次描述了大西洋鳕鱼中的五种T细胞亚群和八种B细胞亚群，并提出了B细胞的分化轨迹 | NA | 进一步阐明因缺乏CD4阳性T淋巴细胞而引发的免疫适应性 | 大西洋鳕鱼（Gadus morhua）的淋巴细胞亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21785 | 2024-08-08 |
Increased H3K27 trimethylation contributes to cone survival in a mouse model of cone dystrophy
2022-Jul-10, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04436-6
PMID:35810394
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研究论文 | 本研究使用Pde6c小鼠模型，探讨了组蛋白去甲基化酶抑制剂GSK-J4对锥细胞生存的潜在治疗益处 | 首次研究了GSK-J4对锥细胞生存的影响，并发现其通过调节甲基化和乙酰化之间的相互作用，对受遗传性视网膜疾病影响的锥细胞有积极响应 | NA | 探讨GSK-J4对锥细胞生存的影响及其在遗传性视网膜疾病治疗中的潜在应用 | Pde6c小鼠模型中的锥细胞 | 遗传性视网膜疾病 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21786 | 2024-08-08 |
Innate immune regulation in HIV latency models
2022-07-08, Retrovirology
IF:2.7Q3
DOI:10.1186/s12977-022-00599-z
PMID:35804422
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研究论文 | 本文评估了在多种T细胞模型中，HIV潜伏期内的先天免疫和IFN反应 | 发现了潜伏感染的T细胞系在先天免疫激活或类型1 IFN治疗下未能诱导特定的干扰素刺激基因（ISGs） | NA | 研究HIV潜伏期内的先天免疫调控机制 | HIV潜伏模型中的T细胞 | NA | HIV感染 | RNA测序 | NA | RNA | 包括已建立的潜伏细胞系、Jurkat细胞以及ART抑制的初级CD4+ T细胞模型 |
| 21787 | 2024-08-08 |
The Desmoplastic Stroma of Pancreatic Cancer: Multilayered Levels of Heterogeneity, Clinical Significance, and Therapeutic Opportunities
2022-Jul-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14133293
PMID:35805064
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综述 | 本文综述了胰腺癌中促结缔组织增生基质的多层次异质性及其临床意义和治疗机会 | 利用单细胞转录组学和多重组织成像技术，深入了解胰腺癌患者和遗传工程小鼠模型中CAF的异质性 | NA | 探讨胰腺癌促结缔组织增生基质的分子病理基础及其在临床治疗中的潜在应用 | 胰腺癌中的促结缔组织增生基质及其相关纤维母细胞（CAFs） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学、多重组织成像技术 | NA | 组织 | NA |
| 21788 | 2024-08-08 |
Patient-derived renal cell carcinoma organoids for personalized cancer therapy
2022-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.970
PMID:35802820
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研究论文 | 本文建立了一种有效的三维培养系统，用于从临床肾细胞癌样本中生成肾癌类器官，并评估其在个性化癌症治疗中的应用 | 开发了一种新的三维培养系统，用于生成肾癌类器官，这些类器官保留了原始肿瘤组织的组织学结构、突变景观和转录组特征 | NA | 推进人类肾癌研究和治疗 | 肾细胞癌类器官 | 数字病理学 | 肾癌 | 全外显子测序、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 33种不同亚型的肾癌类器官 |
| 21789 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals localized tumour ablation and intratumoural immunostimulant delivery potentiate T cell mediated tumour killing
2022-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.937
PMID:35808806
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了局部肿瘤消融和肿瘤内免疫刺激剂递送对T细胞介导的肿瘤杀伤的影响。 | 首次揭示了局部消融免疫疗法（LAIT）通过诱导广泛的促炎反应和抑制抑制性信号来促进T细胞的免疫重塑，从而驱动抗肿瘤免疫。 | NA | 探讨局部消融免疫疗法（LAIT）对T细胞介导的肿瘤杀伤的影响。 | CD8+和CD4+ T细胞在局部消融免疫疗法（LAIT）治疗后的反应。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 肿瘤浸润T细胞 |
| 21790 | 2024-08-08 |
The accuracy of absolute differential abundance analysis from relative count data
2022-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010284
PMID:35816553
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研究论文 | 本文探讨了从相对计数数据进行绝对差异丰度分析的准确性 | 使用模拟数据和真实数据集验证了重规范化相对丰度与绝对丰度在差异丰度检测中的一致性，并评估了相对丰度数据特征的预测效用 | 在特征丰度广泛变化的条件下，一致性可能显著降低 | 研究相对丰度数据在差异丰度分析中的准确性和适用性 | 相对丰度数据的重规范化策略及其在差异丰度分析中的表现 | 生物信息学 | NA | 下一代测序 | NA | 序列数据 | 涉及大量真实数据集，包括16S metabarcoding、表达阵列、bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq实验 |
| 21791 | 2024-08-08 |
The Role of Microglia in Neuroinflammation of the Spinal Cord after Peripheral Nerve Injury
2022-06-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132083
PMID:35805167
|
综述 | 本文综述了周围神经损伤后脊髓中微胶质细胞在神经炎症中的作用及其激活机制和功能 | 利用单细胞转录组学、新型遗传小鼠模型和活体成像等神经免疫研究技术，深入分析了微胶质细胞激活的机制及其在神经保护、退化、再生、突触可塑性和脊髓回路重组中的功能 | NA | 旨在阐明周围神经损伤后脊髓微胶质细胞与神经元相互作用的多样性，解决相关争议 | 微胶质细胞在脊髓中的激活机制及其功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 21792 | 2024-08-08 |
Single B Cell Gene Co-Expression Networks Implicated in Prognosis, Proliferation, and Therapeutic Responses in Non-Small Cell Lung Cancer Bulk Tumors
2022-Jun-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14133123
PMID:35804895
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研究论文 | 本文通过比较非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤B细胞和正常B细胞的单细胞RNA测序数据，构建了肿瘤特异性B细胞基因共表达网络，并利用CRISPR-Cas9/RNA干扰筛选数据在92多个人类NSCLC上皮细胞系中筛选增殖基因，评估了这些基因的预后和预测价值。 | 本文首次构建了NSCLC肿瘤B细胞的基因共表达网络，并发现了一个九基因标志物，该标志物在NSCLC肿瘤转录组和蛋白质组中提供了准确的预后分层。 | NA | 探索非小细胞肺癌中B细胞功能障碍的机制及其在预后中的重要性，并寻找免疫治疗预测生物标志物。 | 非小细胞肺癌肿瘤B细胞和正常B细胞的基因共表达网络。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 1313个NSCLC肿瘤转录组样本和103个蛋白质组样本 |
| 21793 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Astrocyte and Microglial Heterogeneity in Health and Disease
2022-06-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132021
PMID:35805105
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究健康与疾病状态下星形胶质细胞和小胶质细胞异质性方面的应用 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了星形胶质细胞和小胶质细胞在神经退行性疾病及HIV感染中的异质性 | NA | 旨在理解星形胶质细胞和小胶质细胞在维持神经功能中的异质性，并识别调节其对HIV反应的基因和机制 | 星形胶质细胞和小胶质细胞的异质性及其在疾病状态下的变化 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 21794 | 2024-08-08 |
Role of GDF15/MAPK14 Axis in Chondrocyte Senescence as a Novel Senomorphic Agent in Osteoarthritis
2022-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137043
PMID:35806043
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研究论文 | 本文探讨了GDF15/MAPK14轴在软骨细胞衰老中的作用，以及GDF15作为骨关节炎新型抗衰老剂的潜力 | 首次揭示了GDF15在骨关节炎中通过诱导血管生成促进软骨细胞衰老的作用 | NA | 研究GDF15在骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 软骨细胞衰老和骨关节炎的进展 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序RNA | NA | 组织和滑膜液样本 | 来自骨关节炎患者的组织和滑膜液样本，C20A4细胞系和HUVEC细胞系 |
| 21795 | 2024-08-08 |
Hypothalamic CREB Regulates the Expression of Pomc-Processing Enzyme Pcsk2
2022-06-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11131996
PMID:35805082
|
研究论文 | 研究探讨了下丘脑CREB对Pomc加工酶Pcsk2表达的调控作用及其在实验性肥胖中的影响 | 首次证明了CREB在实验性肥胖中对下丘脑Pomc内肽酶系统的异常调控作用 | NA | 探究高脂饮食对下丘脑CREB表达及其对黑皮质素系统功能的影响 | 下丘脑Pomc神经元中的CREB及其对Pcsk2表达的调控 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序分析, PCR, 免疫印迹, ELISA和免疫荧光组织学检测 | NA | RNA | NA |
| 21796 | 2024-08-08 |
Differentiation Trajectory of Limbal Stem and Progenitor Cells under Normal Homeostasis and upon Corneal Wounding
2022-06-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11131983
PMID:35805068
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序在小鼠模型中识别正常稳态和角膜损伤情况下角膜缘干细胞及其前体细胞的异质细胞群及其分化轨迹 | 本研究首次识别出两种潜在的角膜缘干细胞类型，并揭示了它们在正常稳态和伤口愈合过程中的分化轨迹 | NA | 旨在识别正常稳态和角膜损伤情况下角膜缘干细胞及其前体细胞的异质细胞群 | 角膜缘干细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 21797 | 2024-08-08 |
Comparison of cell state models derived from single-cell RNA sequencing data: graph versus multi-dimensional space
2022-06-10, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022395
PMID:35801475
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研究论文 | 本文比较了两种基于单细胞RNA测序数据的细胞状态模型：图模型和多维空间模型 | 首次对比了图模型和多维空间模型在构建细胞状态转换数学模型中的应用 | 主要集中在图模型和多维空间模型的优缺点比较，未涉及其他可能的模型 | 探讨和比较两种不同的细胞状态几何模型在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据和造血系统 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 图模型和多维空间模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 21798 | 2024-08-08 |
Telomerase positive CTCs with PSMA high expression associated with prostate cancer metastasis
2022-Jun, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-21-1140
PMID:35812202
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺特异性膜抗原（PSMA）高表达的循环肿瘤细胞（CTCs）与前列腺癌转移进展的关系 | 采用基于端粒酶逆转录酶（TERT）的CTC检测方法，并通过基因本体（GO）功能分类和富集分析，证实了PSMA高表达组中增殖相关术语的富集 | NA | 旨在提供证据阐明PSMA高表达的CTCs与前列腺癌转移进展的关系 | 前列腺癌患者及其循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 基于端粒酶逆转录酶（TERT）的CTC检测方法 | NA | 单细胞测序数据 | 共71名患者，分为局部前列腺癌组（44名）和转移性前列腺癌组（27名） |
| 21799 | 2024-08-08 |
Recent advances in single-cell sequencing technologies
2022-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbac002
PMID:35821681
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综述 | 本文综述了单细胞组学测序技术在四个领域的最新进展 | 介绍了单细胞表观基因组测序、单细胞基因组测序用于谱系追踪、空间分辨的单细胞转录组学以及基于第三代测序平台的单细胞组学测序等新技术 | NA | 探讨单细胞组学测序技术在不同生物医学系统中的潜在应用和未来方向 | 单细胞组学测序技术及其在人类干细胞领域的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 单个细胞 |
| 21800 | 2024-08-08 |
Tracing the cell-type-specific modules of immune responses during COVID-19 progression using scDisProcema
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.06.066
PMID:35811838
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scDisProcema的基因共表达网络构建流程，用于追踪COVID-19进展过程中免疫系统响应的动态变化 | scDisProcema能够更方便地利用scRNA-seq数据提供的异质性信息，并有助于探索疾病进展和器官发育过程中的分子变化 | NA | 深入研究COVID-19免疫响应的分子机制 | COVID-19进展过程中细胞类型特异性分子网络的动态变化 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | 基因共表达网络 | 单细胞数据 | NA |