单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40164 篇文献，本页显示第 2161 - 2180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2161 | 2026-05-16 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Mar, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
|
研究论文 | 通过先进的单细胞转录组学分析技术，本研究揭示了囊性纤维化气道上皮中的新型基因和调控网络，为开发靶向治疗策略提供了新靶点 | 本研究采用改进的分析方法，整合多源数据并利用全面的肺部参考面板进行标准化和映射，发现了此前未与囊性纤维化气道疾病关联的新型基因和调控网络 | NA | 通过增强的单细胞转录组学分析阐明囊性纤维化相关的分子机制，并识别新的治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照的肺组织样本 | 机器学习 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2162 | 2026-05-16 |
Efficient Predictor for Immunotherapy Efficacy: Detecting Pan-Clones Effector Tumor Antigen-Specific T Cells in Blood by Nanoparticles Loading Whole Tumor Antigens
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409913
PMID:39498880
|
研究论文 | 开发一种通过纳米颗粒加载全肿瘤抗原检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞的方法，用于预测免疫治疗效果 | 首次提出利用纳米颗粒加载全细胞肿瘤抗原来激活和检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞，将ETASTs与其他T细胞的区别转化为激活和非激活状态，通过检测激活状态和细胞毒性功能标记物实现区分 | 检测方法可能受ETASTs与其他T细胞表型重叠影响；研究仅在肺癌中验证，其他癌症类型需进一步确认；样本量信息未明确 | 开发一种高效、非侵入性的生物标志物，用于预测免疫治疗疗效 | 肺癌患者、健康个体、良性肺结节患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 纳米颗粒加载全肿瘤抗原，单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 未明确 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2163 | 2026-05-16 |
Deficiency of FABP7 Triggers Premature Neural Differentiation in Idiopathic Normocephalic Autism Organoids
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406849
PMID:39556706
|
研究论文 | 该研究通过分析正常头围自闭症谱系障碍个体来源的脑类器官，发现FABP7缺失会触发神经干细胞过早分化，并揭示了FABP7/MEK通路在其中的作用 | 首次从正常头围自闭症患者的前瞻性出生队列中建立iPSC来源的脑类器官模型，结合多细胞系和时间序列单细胞RNA测序，揭示了FABP7/MEK通路在神经干细胞异常分化中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究正常头围自闭症谱系障碍个体中神经发育异常的分子机制 | 正常头围自闭症谱系障碍个体的诱导多能干细胞来源的脑类器官 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 多细胞系和时间序列样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2164 | 2026-05-16 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Unraveled Spatial Evolution of Papillary Thyroid Cancer
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404491
PMID:39540244
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示甲状腺乳头状癌的空间演化机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学解析甲状腺乳头状癌的空间异质性和演化路径，发现肿瘤细胞通过增强有氧代谢、抑制mRNA翻译及蛋白质合成、以及细胞间相互作用驱动多路径演化，并识别出恶性与转移基因足迹 | 单细胞RNA测序丢失空间信息，空间转录组学分辨率有限，可能遗漏稀有细胞亚型；需要更大样本验证足迹的诊断价值 | 阐释甲状腺乳头状癌的空间异质性、恶性进展和转移机制，提出改进的诊断策略 | 甲状腺乳头状癌肿瘤细胞及其正常甲状腺细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2165 | 2026-05-16 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629650
PMID:39764057
|
研究论文 | 提出IN-DEPTH方法，实现同一玻片上的空间多组学整合，揭示肿瘤病毒相关的肿瘤微环境空间重组 | 首次开发了IN-DEPTH方法，实现了同一玻片上单细胞空间蛋白质组学和空间转录组学的迭代捕获，并引入SGCC方法进行多模态空间多组学分析 | 当前方法在多重视图、空间分辨率及分析方法上仍有限制，但IN-DEPTH已在一定程度上克服了这些限制 | 开发可扩展、资源高效的空间多组学方法，用于剖析肿瘤微环境并推动临床相关发现 | 淋巴组织和EBV阳性及EBV阴性弥漫性大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | SGCC | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | IN-DEPTH方法兼容各种空间平台 |
| 2166 | 2026-05-16 |
Reprogramming of cells during embryonic transfating: overcoming a reprogramming block
2024-12-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.203152
PMID:39628450
|
研究论文 | 研究海胆胚胎细胞转分化的重编程过程，揭示其分子机制及信号时序对重编程成功的影响 | 通过单细胞RNA测序随时间追踪，首次揭示胚胎细胞转分化的完整重编程序列，并发现Delta信号在Nodal之前表达可恢复色素细胞缺失 | 未提供明确数据量和统计分析，且研究中仅针对海胆特定细胞类型，结论推广性有限 | 阐明胚胎转分化过程中重编程的分子机制及调控因素 | 海胆16细胞期的小裂球（成骨细胞前体）及内胚层、中胚层和色素细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未知（研究中未明确样本量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序随时间追踪 |
| 2167 | 2026-05-16 |
Early autonomous patterning of the anteroposterior axis in gastruloids
2024-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202171
PMID:39552366
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠类胚体中前后轴早期自主模式形成 | 首次揭示了类胚体在无外部信号引导下自主建立前后轴极化的早期分子事件，包括T+和T-群体的细胞状态转变和转录特征，并发现该过程对聚集大小变化具有稳健性 | 尽管类胚体与小鼠胚胎在转录上具有相似性，但初始多能细胞状态差异明显，可能影响早期发育模拟的准确性 | 解析小鼠类胚体中前后轴建立的早期动态过程，特别是外部Wnt刺激前的细胞命运空间限制和转录变化 | 小鼠胚胎干细胞聚集形成的类胚体 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 多个小鼠类胚体样本，未具体说明数量 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2168 | 2026-05-16 |
INSPIRE: interpretable, flexible and spatially-aware integration of multiple spatial transcriptomics datasets from diverse sources
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614539
PMID:39386646
|
研究论文 | 提出INSPIRE，一种基于深度学习的多空间转录组数据集整合方法，可解释、灵活且空间感知 | 结合图神经网络和对抗学习机制，实现空间感知的数据整合；使用非负矩阵分解揭示可解释的空间因子和基因程序，并能够构建3D组织模型 | 未在论文标题和摘要中明确提及 | 开发一种方法，有效整合和解释来自不同样本、技术和发育阶段的多空间转录组数据集 | 人类皮层切片、小鼠脑切片、小鼠海马和胚胎切片、时空器官发生图谱（包含50万个空间点） | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 1D | 多种数据集，包括人类皮层切片、小鼠脑切片、小鼠海马和胚胎切片，以及包含约50万个空间点的时空器官发生图谱 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2169 | 2026-05-16 |
Physical modeling of embryonic transcriptomes identifies collective modes of gene expression
2024-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.26.605398
PMID:39131269
|
研究论文 | 利用统计物理学方法和早期海鞘胚胎的单细胞测序数据，构建胚胎转录组的物理模型，识别基因表达的集体模式 | 整合自然变异与统计物理的建模及推断技术，从完整互联胚胎层面分析转录组，通过统计相关性揭示细胞间相互作用网络及基因表达的集体模式 | 未明确提及，可能依赖于特定物种（海鞘）的数据，方法推广性有待验证 | 从单细胞基因表达测量中推断空间相互作用及其诱导的集体表达模式，探索整体胚胎转录组的动态特性 | 早期海鞘胚胎的转录组 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 利用近期早期海鞘胚胎的单细胞测序数据（具体样本量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2170 | 2026-05-16 |
Somatic BrafV600E mutation in the cerebral endothelium induces brain arteriovenous malformations
2024-08, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-024-09918-8
PMID:38700584
|
研究论文 | 通过脑内皮细胞中的体细胞BrafV600E突变成功诱导出与人类病变高度相似的小鼠脑动静脉畸形模型 | 首次在脑内皮细胞中引入BrafV600E突变，开发出与人类临床表型一致的散发性脑动静脉畸形小鼠模型 | 达拉非尼对成熟脑动静脉畸形病变的疗效仍不确定 | 探索脑动静脉畸形的发病机制并评估潜在治疗策略 | 携带脑内皮细胞Braf突变的小鼠 | 机器学习 | 脑血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄组及不同脑区的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序系统 |
| 2171 | 2026-05-16 |
Generation and characterisation of scalable and stable human pluripotent stem cell-derived microvascular-like endothelial cells for cardiac applications
2024-08, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-024-09929-5
PMID:38775849
|
研究论文 | 开发并表征了一种可规模化、稳定的基于人多能干细胞的心肌微血管样内皮细胞生成方案 | 首次利用三维搅拌罐生物反应器结合高浓度VEGF-A处理，从血管类器官中生成表型稳定且具有心脏特异性的微血管样内皮细胞和壁细胞 | 未明确说明局限性，但可能涉及长期稳定性及体内功能验证的不足 | 为冠状动脉微血管疾病的研究及心脏组织工程应用提供可靠的细胞模型 | 人多能干细胞来源的内皮细胞和壁细胞 | 机器学习和数字病理学 | 冠状动脉微血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2172 | 2026-05-16 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell landscape following antimony exposure during spermatogenesis in Drosophila testes
2023-Mar-09, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-023-01391-4
PMID:36894529
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示锑暴露对果蝇睾丸精子发生过程中细胞景观的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示锑暴露对果蝇睾丸精子发生的转录调控机制，并发现新的基因（如Dup98B）在精子发生过程中的状态偏向表达 | 未提及具体局限性 | 研究锑暴露对果蝇睾丸精子发生的影响及单细胞分辨率下的转录调控机制 | 果蝇睾丸细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 果蝇暴露于锑10天的睾丸样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2173 | 2026-05-16 |
Single cell RNA-seq analysis reveals temporally-regulated and quiescence-regulated gene expression in Drosophila larval neuroblasts
2022-08-24, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-022-00163-7
PMID:36002894
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析果蝇幼虫神经母细胞的基因表达，揭示时间调控和静止调控的特征 | 首次在多个发育时间点对果蝇幼虫中枢神经系统进行单细胞转录组分析，发现新的祖细胞亚型标记物，并鉴定出静止神经母细胞对胰岛素信号通路的转录预备状态 | 未提及具体局限性 | 探究果蝇幼虫神经系统发育中神经多样性的生成机制 | 果蝇幼虫中枢神经系统中的神经母细胞和中间祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育时间点的果蝇幼虫样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2174 | 2026-05-16 |
Recurrent transcriptional responses in AML and MDS patients treated with decitabine
2022-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2022.04.002
PMID:35429619
|
研究论文 | 系统鉴定了地西他滨在体内诱导的全局基因组和转录组改变，包括全基因组亚硫酸氢盐测序、RNA测序和单细胞RNA测序分析 | 首次系统描述了地西他滨在体内治疗过程中诱导的全局性、可逆性低甲基化及其相关转录组变化，并发现红系相关通路在治疗中受抑制而在复发时逆转 | 样本量有限且患者间变异大，限制了检测较小临床效应的统计效力 | 阐明地西他滨治疗骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者时引起的体内分子变化机制 | 接受地西他滨治疗的骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者的原代骨髓样本 | 机器学习和生物信息学 | 骨髓增生异常综合征, 急性髓系白血病 | 全基因组亚硫酸氢盐测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 多名患者的原代骨髓样本 | NA | 全基因组亚硫酸氢盐测序, 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | NA |
| 2175 | 2026-05-16 |
The AIM2 inflammasome exacerbates atherosclerosis in clonal haematopoiesis
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03341-5
PMID:33731931
|
研究论文 | 本研究揭示AIM2炎症小体在克隆性造血相关动脉粥样硬化中的恶化作用 | 首次阐明JAK2突变通过DNA复制应激激活AIM2炎症小体加剧动脉粥样硬化的机制 | 未提及具体局限性 | 探究克隆性造血相关基因突变（JAK2）促进动脉粥样硬化的分子机制 | 携带JAK2突变的巨噬细胞和模拟克隆性造血的嵌合小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2176 | 2026-05-16 |
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102147
PMID:33665566
|
研究论文 | 本文介绍了Constellation-Seq，一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤技术，能显著提高灵敏度并降低成本 | 实现两个数量级的灵敏度提升，通过最大化读取利用率减少数据稀疏性和测序成本 | 仅展示了在外周血单核细胞样本中的应用，未提及对多种复杂组织的验证 | 开发一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤方法，用于稀缺转录本识别和下游分析 | 外周血单核细胞样本中的稀有树突状细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，Constellation-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2177 | 2026-05-16 |
Input-output signal processing plasticity of vagal motor neurons in response to cardiac ischemic injury
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102143
PMID:33665562
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示迷走神经背侧运动核神经元在心脏缺血损伤中的输入-输出信号处理可塑性 | 首次揭示稳态下DMV神经元可组织为可区分的输入-输出信号处理单元，并发现远程缺血预适应和慢性心脏缺血损伤诱导的神经元状态转变及其相关的调控microRNA变化 | 研究仅限于DMV神经元，且样本量可能有限，未能涵盖所有相关脑区或长期动态变化 | 探索DMV神经元的分子表型及其在心脏缺血损伤中的可塑性，为生物电子医学提供新靶点 | 数百个DMV神经元（稳态及生理扰动后） | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数百个DMV神经元（稳态及生理扰动后） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2178 | 2026-05-16 |
Isolation of human ESC-derived cardiac derivatives and embryonic heart cells for population and single-cell RNA-seq analysis
2021-03-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100339
PMID:33644774
|
protocol | 描述了一种结合人口和单细胞RNA测序分析，从人胚胎干细胞分化和发育组织中分离心脏衍生物和胚胎心脏细胞的方法 | 结合群体和单细胞RNA测序分析，利用hESC分化和发育组织建立器官特异性细胞和分子图谱 | NA | 建立人胚胎发生中器官特异性细胞和分子图谱 | 人胚胎干细胞分化的心脏衍生物和人类胚胎心脏细胞 | NA | NA | RNA-seq, Smart-seq2 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 群体RNA-seq | NA | NA |
| 2179 | 2026-05-16 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，在单细胞分辨率下描绘人类肠道发育的时空图谱 | 首次在单细胞水平系统性地构建人类肠道发育的时空图谱，揭示肠道形成的动态过程及多种细胞类型的分化层次 | 研究仅基于胎儿组织样本，可能无法完全代表出生后肠道发育的完整过程 | 解析人类肠道发育过程中的细胞组成、基因表达动态和空间组织规律 | 人类胎儿肠道组织的发育阶段（不同时间点的样本） | 数字病理学 | 罕见肠道发育障碍 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 未具体说明样本数量，涉及多个时间点的人类胎儿肠道组织 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium进行单细胞RNA测序，10x Visium进行空间转录组学分析 |
| 2180 | 2026-05-16 |
Directed induction of alveolar type I cells derived from pluripotent stem cells via Wnt signaling inhibition
2021-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3302
PMID:33241896
|
研究论文 | 通过Wnt信号抑制诱导多能干细胞来源的肺泡I型细胞分化 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定出诱导多能干细胞来源的肺泡I型细胞，并证明XAV-939通过抑制经典Wnt信号通路促进其分化 | 未明确说明局限性（原文未提及） | 研究肺泡I型细胞的分化机制 | 人诱导多能干细胞来源的肺泡上皮细胞和胎儿肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量（涉及成纤维细胞依赖的肺泡类器官） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |