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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2161 | 2026-03-28 |
Spatial transcriptomics in the human adult ovary: insights into key signalling pathways during follicular atresia
2026-Mar-26, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deag051
PMID:41886635
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,探究了人类成年卵巢中卵泡闭锁过程中的关键信号通路(WNT、TGFβ/BMP、NOTCH、HH)的变化 | 首次在人类成年卵巢中应用空间转录组学技术,系统性地研究了卵泡闭锁过程中关键信号通路的时空表达变化 | 研究使用的卵巢组织来自跨性别男性捐赠者,无法排除睾酮治疗对卵泡动态的影响 | 探究人类成年卵巢卵泡闭锁过程中关键信号通路(WNT、TGFβ/BMP、NOTCH、HH)的参与情况 | 人类成年卵巢组织中的健康及处于不同闭锁阶段的小窦状卵泡(直径0.5-4 mm) | 空间转录组学 | 卵巢相关疾病/生殖衰老 | 空间转录组学,单分子荧光原位杂交,苏木精-伊红染色 | NA | 空间转录组数据,组织切片图像 | 6名捐赠者的卵巢组织,共16个区域,包含21个小窦状卵泡 | Resolve BioSciences | 空间转录组学 | Molecular Cartography平台 | Resolve BioSciences Molecular Cartography平台,基于冷冻切片的单分子荧光原位杂交多重检测 |
| 2162 | 2026-03-28 |
Enhancing Proteasome Activity in T Cells Alleviates Exhaustion and Improves Antitumor Immunity
2026-Mar-26, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1246
PMID:41886620
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研究论文 | 本研究通过增强T细胞中的蛋白酶体活性,延缓了T细胞耗竭,改善了其功能,并转化为更强的抗肿瘤免疫和肿瘤控制 | 首次提出并验证了蛋白酶体活性是T细胞耗竭的关键调节因素,并证明通过药理学和遗传学方法增强蛋白酶体活性可以改善T细胞功能和抗肿瘤免疫 | 研究主要在体外模型和单细胞转录组学分析中进行,体内验证和临床转化效果需要进一步研究 | 探究T细胞耗竭的机制并寻找改善抗肿瘤免疫的新策略 | 耗竭T细胞 (TEX) 和非耗竭T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 涵盖16种肿瘤类型的单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2163 | 2026-03-28 |
Defective HNF1A hinders GLI3 processing favoring duodenal versus pancreatic fate, thus leading to intestinal elongation in vivo
2026-Mar-26, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353153.125
PMID:41887801
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研究论文 | 本文通过整合转录组学、显微镜技术、生理学和遗传细胞追踪方法,揭示了HNF1A与Hedgehog信号通路之间的自调控环路在调控后前肠细胞命运决定中的关键作用 | 发现HNF1A缺陷通过干扰GLI3加工,导致前肠细胞命运向十二指肠而非胰腺方向偏移,并鉴定出相关选择基因网络的失调 | 未明确提及研究的具体局限性,如样本量或模型系统的潜在偏差 | 探究后前肠中Hedgehog信号调控细胞谱系分离的分子机制 | 人诱导多能干细胞分化模型和小鼠转基因模型 | 发育生物学 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 显微镜技术, 生理学实验, 遗传细胞追踪 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2164 | 2026-03-28 |
Integrated single-cell transcriptomic atlas of human gastric and colorectal tissues across diverse phenotypes
2026-Mar-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-07108-3
PMID:41888163
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研究论文 | 本研究构建了一个全面的人类胃和结直肠组织单细胞转录组图谱,涵盖多种表型 | 提供了迄今为止最大规模的人类胃和结直肠组织单细胞转录组数据集,整合了超过100万个细胞和多种细胞类型,并进行了严格的数据验证和标准化注释 | 研究未提及具体的实验验证或功能机制探索,主要侧重于数据集的构建和描述 | 探索胃肠道癌症(特别是胃癌和结直肠癌)的肿瘤微环境复杂细胞景观,以促进单细胞分辨率下的元分析 | 人类胃组织和结直肠组织样本,涵盖多种表型 | 数字病理学 | 胃癌, 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 229个胃组织样本(574,532个细胞)和220个结直肠组织样本(479,629个细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2165 | 2026-03-28 |
Microbiota-Driven microglia reprogramming reverses depressive-like behaviors through Peripheral-to-Central immune crosstalk
2026-Mar-26, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03545-z
PMID:41888425
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研究论文 | 本研究通过肠道微生物干预逆转慢性不可预测轻度应激诱导的抑郁样行为,揭示了微生物群驱动的微胶质细胞重编程通过外周-中枢免疫轴调控抑郁表型 | 首次构建了中枢与外周免疫细胞单细胞图谱,发现稳态微胶质细胞2亚型通过激活轨迹调控微胶质状态,并鉴定Klf2作为单核细胞和HM2微胶质亚型的主调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证;微生物干预的具体机制尚未完全阐明 | 探究肠道微生物干预如何通过免疫轴调控改善抑郁样行为 | 小鼠脑组织、颅骨和外周血单核细胞中的微胶质细胞及非微胶质免疫细胞 | 神经免疫学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、染色质开放性测序、CD45免疫细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据 | 未明确样本数量,使用慢性不可预测轻度应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2166 | 2026-03-28 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveals senescence-associated changes in MIA-induced ASD male mouse brain
2026-Mar-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117191
PMID:41886454
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研究论文 | 本研究通过空间转录组和单核RNA测序分析,揭示了母体免疫激活诱导的自闭症谱系障碍小鼠大脑中衰老相关的变化机制 | 首次结合空间转录组和单核RNA测序技术,系统性地识别了MIA诱导的ASD大脑中衰老相关基因通路和细胞类型特异性调控机制 | 研究仅基于雄性小鼠模型,未涵盖雌性个体;机制验证主要在动物模型中进行,人类临床转化需进一步探索 | 探索母体免疫激活诱导的自闭症谱系障碍的神经生物学特征和调控机制 | MIA诱导的ASD雄性小鼠大脑组织 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 空间转录组测序, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2167 | 2026-03-28 |
Balancing off-target and on-target considerations for optimized CRISPR-Cas9 knockout library design
2026-Mar-25, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101190
PMID:41887225
|
研究论文 | 本文提出了一种优化CRISPR-Cas9敲除文库设计的策略,通过平衡脱靶和靶向考虑来创建紧凑且高效的文库 | 开发了一种同时权衡和平衡脱靶活性与靶向效能的框架,避免了不必要地排除活性向导RNA,从而最大化靶向活性 | NA | 优化CRISPR-Cas9敲除文库设计,以支持高维功能筛选 | 人类和小鼠基因组 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas9敲除筛选 | NA | 基因组注释数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高内涵成像 | NA | NA |
| 2168 | 2026-03-28 |
p53: defender of lineage fidelity and foe of plasticity in cancer and regeneration
2026-Mar-25, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2026.02.004
PMID:41887985
|
综述 | 本文综述了p53在肿瘤抑制和组织修复中,通过调控细胞状态变化来维持谱系保真度和抑制可塑性的新功能 | 揭示了p53在可塑的过渡细胞状态中,通过驱动肺泡1型细胞分化来抑制肺癌和促进肺损伤修复,并扩展了其在其他组织损伤修复中的作用 | p53肿瘤抑制功能的分子程序仍未完全阐明,且研究主要基于基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序 | 探讨p53在肿瘤抑制和组织修复中的分子机制与功能 | p53蛋白、肺腺癌、肺损伤修复、损伤诱导的肠道再生干细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2169 | 2026-03-28 |
A single-cell transcriptional reference for the functional and developmental diversity of neonatal innate lymphoid cells
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117000
PMID:41706587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合发育和功能分析,深入解析了脐带血中循环先天淋巴细胞的复杂性和多样性 | 首次在免疫学上未成熟的脐带血中,通过单细胞转录组学详细描绘了循环先天淋巴细胞的亚群多样性,并利用人工胸腺器官模型揭示了cILC1s的发育潜力仅限于NK细胞 | 研究主要基于脐带血样本,可能无法完全代表成人或其他组织中的先天淋巴细胞状态 | 旨在建立新生儿先天淋巴细胞的功能和发育多样性的单细胞转录参考图谱 | 脐带血中的循环先天淋巴细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但基于脐带血 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2170 | 2026-03-28 |
Intracellular bacteria modulate the immune microenvironment of oral squamous cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117019
PMID:41722049
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研究论文 | 本研究利用INVADEseq技术探究口腔鳞状细胞癌中细胞内细菌如何调控肿瘤免疫微环境及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 首次采用INVADEseq技术同时捕获宿主单细胞RNA测序数据和细菌特征,揭示了细胞内细菌通过抑制PDCD1表达、增强感染反应等方式调控免疫微环境的新机制 | 研究主要聚焦于口腔鳞状细胞癌,细胞内细菌与免疫细胞通讯减弱的机制仍需进一步验证 | 探究细胞内微生物如何影响口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫功能及免疫治疗反应 | 口腔鳞状细胞癌患者样本 | 单细胞测序 | 口腔鳞状细胞癌 | 入侵-黏附定向表达测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、细菌特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2171 | 2026-03-28 |
Single-cell transcriptional and epigenomic landscape of human blood immune cells across the lifespan
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117072
PMID:41818242
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,绘制了从胎儿中期到成年晚期人类外周血单个核细胞的转录组和表观基因组图谱,揭示了免疫细胞组成随年龄的动态变化 | 首次在单细胞水平上全面描绘了人类整个生命周期中外周血免疫细胞的转录和表观遗传景观,并识别了多个年龄相关的免疫细胞亚群和特征 | 研究仅基于健康供体的外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫细胞或疾病状态,样本量可能有限 | 探究人类生命周期中免疫细胞组成的动态变化及其与年龄相关的特征 | 健康供体的外周血单个核细胞,涵盖从胎儿中期到成年晚期的不同年龄阶段 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 来自健康供体的外周血单个核细胞样本,覆盖多个年龄阶段 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2172 | 2026-03-28 |
Spatiotemporal molecular profiling of macrophage-fibroblast crosstalk defines checkpoints orchestrating onset and resolution of inflammation
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117091
PMID:41832953
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术解析了炎症性关节炎中巨噬细胞与成纤维细胞在炎症起始和消退阶段的时空分子互作网络 | 首次结合单细胞RNA测序与单细胞ATAC测序技术,系统描绘了滑膜巨噬细胞与成纤维细胞亚群在炎症不同阶段的异质性信号回路,揭示了巨噬细胞亚群在促炎与消退过程中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分;未深入探究其他免疫细胞类型在炎症回路中的作用 | 阐明炎症性疾病中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的分子机制与时空动态 | 炎症性关节炎模型中的滑膜巨噬细胞与滑膜成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 生物信息学建模 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确(基于炎症不同阶段的滑膜组织样本) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2173 | 2026-03-28 |
Dendritic Cells Remodel Eccrine Sweat Gland Niche Metabolism Via Oxidative Phosphorylation During Aging
2026-Mar-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.011
PMID:41887396
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能实验,揭示了树突状细胞通过氧化磷酸化调控汗腺代谢的免疫-上皮回路,并阐明其在衰老过程中的失调机制 | 首次发现树突状细胞作为汗腺代谢稳态的守护者,通过NAMPT-INSR信号轴促进氧化磷酸化,并揭示衰老过程中MIF-CD74-CYBB信号通路导致细胞功能障碍的可逆机制 | 研究主要基于小鼠爪部和人类手掌皮肤样本,可能无法完全代表其他皮肤区域或物种的衰老过程 | 探究衰老过程中汗腺功能下降的细胞和分子机制,特别是与年龄相关的微环境重塑 | 小鼠爪部汗腺和人类手掌皮肤中的汗腺细胞及树突状细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学, scRNA-seq, 免疫染色, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及老年小鼠爪部和人类手掌皮肤 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2174 | 2026-03-28 |
A single-cell atlas of the human airways from patients with allergic rhinitis comorbid with asthma
2026-Mar-24, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2026.03.013
PMID:41887463
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了过敏性鼻炎合并哮喘患者上下呼吸道的细胞图谱,揭示了慢性炎症条件下的细胞分布和转录变化 | 首次构建了过敏性鼻炎合并哮喘患者上下呼吸道的单细胞图谱,并识别了共享的基因表达变化和细胞间通讯异常 | 样本量有限,且仅针对特定患者群体,可能无法完全代表所有哮喘或过敏性鼻炎患者 | 探究过敏性鼻炎合并哮喘患者上下呼吸道的细胞种群分布和转录变化 | 过敏性鼻炎合并哮喘患者及健康志愿者的鼻部和支气管刷取细胞 | 单细胞组学 | 过敏性鼻炎合并哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 患者与健康志愿者的鼻部和支气管刷取细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2175 | 2026-03-28 |
Asymmetric histone inheritance regulates olfactory stem cell fates during regeneration
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70987-y
PMID:41872193
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠嗅觉上皮中水平基底细胞(HBCs)在组织再生过程中存在组蛋白H4、H3和H3.3的不对称遗传现象,并证明该现象与细胞命运决定、组织再生及嗅觉行为恢复密切相关 | 首次在哺乳动物成体干细胞谱系中揭示了组蛋白的不对称遗传现象,并阐明了其在神经组织再生和动物行为中的生物学意义 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养系统,在人类组织中的普适性有待验证 | 探究成体干细胞在组织再生过程中组蛋白遗传的对称性及其对细胞命运调控的机制 | 小鼠嗅觉上皮中的水平基底细胞(HBCs) | 发育生物学/干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、细胞培养、组织再生模型 | NA | 基因表达数据、细胞行为数据 | 小鼠嗅觉上皮组织及体外培养的HBCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2176 | 2026-03-28 |
Protocol to evaluate mouse brain spatial cell type-resolved transcriptomic discoveries using 10× Visium spatial transcriptomics and FLEX scRNA-seq
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104277
PMID:41456279
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研究论文 | 本文介绍了一种结合10× Genomics Visium空间转录组学和FLEX单细胞RNA测序技术,用于研究小鼠脑组织中空间区域基因表达和细胞间信号变化的实验方案 | 整合了空间转录组学和单细胞RNA测序技术,提供了一种系统性的实验方案来解析小鼠脑组织在疾病状态下的空间分子特征 | NA | 研究疾病组织中空间区域基因表达和细胞间信号的变化机制 | 小鼠脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium, 10x FLEX | 10× Genomics Visium空间转录组学和10× Genomics FLEX单细胞RNA测序 |
| 2177 | 2026-03-28 |
Protocol for dual spatial transcriptomic profiling of infected tissues
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104282
PMID:41538322
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于感染组织的双重空间转录组学分析协议,旨在分析宿主和病原体的转录模式 | 开发了一种双重空间转录组学分析协议,能够同时分析宿主和病原体的转录模式,并建立病理适应特征以预测感染结果 | 协议的具体应用效果和局限性未在摘要中详细说明,需参考原始文献 | 建立感染组织中宿主和病原体转录模式的分析方法 | 感染组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2178 | 2026-03-28 |
Protocol for the generation of a human-derived nasal epithelial model and induction of tissue-resident memory-like T cells in a co-culture system
2026-Mar-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104401
PMID:41758640
|
研究论文 | 本文介绍了一种生成人源性鼻上皮模型并在共培养系统中诱导组织驻留记忆样T细胞的实验方案 | 开发了一种体外模型系统,用于研究人源性组织驻留记忆T细胞(TRMs),通过共培养诱导TRM样T细胞 | NA | 研究人源性组织驻留记忆T细胞(TRMs)的诱导和分析方法 | 人源性鼻上皮模型和自体免疫细胞 | NA | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞因子释放分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2179 | 2026-03-28 |
Transcriptional landscape of CD4+ T cells in Systemic Sclerosis
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.03.697349
PMID:41889800
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术深入表征了系统性硬化症患者中CD4+ T细胞的亚群,揭示了疾病相关的转录组特征和细胞状态变化 | 采用新颖的单细胞RNA测序方法,首次全面描绘了系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录景观,并结合TCR库分析,提供了前所未有的疾病细胞和分子机制见解 | 样本量相对较小(8名患者和8名健康对照),可能限制结果的普适性;研究主要关注CD4+ T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究系统性硬化症中CD4+ T细胞的转录组特征和亚群变化,以揭示疾病的细胞和分子基础 | 系统性硬化症患者和健康对照者的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 超过80,000个CD4+ T细胞,来自8名系统性硬化症患者和8名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2180 | 2026-03-28 |
Patches: A Representation Learning Framework for Decoding Shared and Condition-Specific Transcriptional Programs in Wound Healing
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630186
PMID:41889850
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研究论文 | 本文提出了一个名为Patches的表示学习框架,用于解码伤口愈合过程中共享和条件特异性的转录程序 | 开发了条件子空间学习方法,能够同时解析共享和条件特异性转录模式,特别适用于具有缺失数据、不匹配细胞群或复杂属性组合的实验设计 | 未明确说明框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 解码伤口愈合过程中共享和条件特异性的转录程序 | 皮肤损伤模型中的单细胞转录组数据 | 计算生物学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 条件子空间学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |