本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
2161 | 2025-10-06 |
WITHDRAWN: Single-cell RNA Sequencing Revealing that MMP12+ Macrophages are Associated with Cancer Liver Metastasis
2024-09-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
撤稿文章 | 该文章因作者要求已被出版商撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2162 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA sequencing of endothelial cells and proteomics to unravel the role of ICAM1-PTGS2 communication in apical periodontitis: A laboratory investigation
2024-09, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14080
PMID:38713190
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术,揭示了内皮细胞在慢性根尖周炎中的多样性及ICAM1-PTGS2通讯在铁死亡中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析慢性根尖周炎中内皮细胞亚群多样性,并发现ICAM1通过调控PTGS2影响铁死亡的新机制 | 样本量较小(5个CAP样本),主要基于体外细胞实验验证,需要更多临床样本进一步确认 | 探究慢性根尖周炎中内皮细胞多样性及ICAM1-PTGS2通讯在疾病发生发展中的作用机制 | 慢性根尖周炎患者组织样本、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、THP-1来源的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 实时PCR, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 基因表达数据 | 5个慢性根尖周炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2163 | 2025-10-06 |
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过吸入干细胞外泌体治疗心肌梗死的无创方法 | 首次报道通过吸入方式递送干细胞外泌体的无创治疗方法,并发现内皮细胞CD36在心脏修复中的新机制 | 研究主要基于动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发心肌梗死后心脏修复的无创治疗方法 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,心脏磁共振成像,超声心动图 | NA | 基因表达数据,影像数据,组织学数据 | 小鼠和猪的心肌梗死模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2164 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic map of the developing Atoh1 lineage identifies neural fate decisions and neuronal diversity in the hindbrain
2024-08-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.007
PMID:39106860
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序绘制发育中小鼠后脑Atoh1谱系的转录图谱,揭示神经命运决定和神经元多样性 | 首次在单细胞分辨率下揭示Atoh1谱系神经元的转录程序,发现增殖性单极刷细胞前体群 | 研究仅限于小鼠模型,人类相关性的验证需要进一步研究 | 解析Atoh1谱系神经元的命运决定机制和多样性 | 发育中小鼠后脑Atoh1谱系神经元 | 单细胞生物学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,ATOH1 DNA结合分析 | NA | 单细胞转录组数据,DNA结合数据 | 小鼠后脑Atoh1谱系神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2165 | 2025-10-06 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07187-5
PMID:38509377
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种表观遗传控制的记忆性星形胶质细胞亚群,该细胞在再次刺激时表现出加剧的促炎反应 | 首次发现星形胶质细胞具有表观遗传记忆能力,并阐明ACLY-p300代谢表观遗传轴在此过程中的调控机制 | 人类星形胶质细胞研究仅限于体外实验,需要更多体内验证 | 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性及其在神经系统疾病中的作用机制 | 星形胶质细胞,实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型,多发性硬化症 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, FICSEQ, 体内CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因组学数据,表观遗传学数据,转录组数据 | EAE急性和慢性模型,人类星形胶质细胞体外培养 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
2166 | 2025-10-06 |
deMULTIplex2: robust sample demultiplexing for scRNA-seq
2024-01-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03177-y
PMID:38291503
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序的鲁棒样本解复用算法deMULTIplex2 | 基于条形码交叉污染的机制模型,采用广义线性模型和期望最大化算法概率性确定细胞样本身份 | NA | 解决单细胞RNA测序中样本解复用的技术挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型, 期望最大化算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2167 | 2025-10-06 |
Heat Inactivation of Nipah Virus for Downstream Single-Cell RNA Sequencing Does Not Interfere with Sample Quality
2024-01-09, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens13010062
PMID:38251369
|
研究论文 | 本研究验证了热灭活步骤对尼帕病毒样本进行单细胞RNA测序的适用性,确认不影响样本质量 | 首次证明在单细胞RNA测序流程中加入热灭活步骤可有效灭活BSL-4级病原体尼帕病毒,且不影响测序质量 | 研究仅针对尼帕病毒和特定商业平台,未测试其他BSL-4病原体或平台 | 开发适用于BSL-4病原体样本的安全单细胞RNA测序流程 | 尼帕病毒感染的细胞样本 | 单细胞测序 | 病毒传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 微流控分区单细胞RNA测序平台 | 商业可用的微流控分区单细胞RNA测序平台 |
2168 | 2025-10-06 |
Microfluidics-free single-cell genomics with templated emulsification
2023-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01685-z
PMID:36879006
|
研究论文 | 开发了一种无需微流控设备的单细胞基因组学方法 | 基于颗粒模板乳化的单细胞封装和条形码技术,仅需涡旋混合器即可实现均匀液滴乳化 | NA | 开发更简单灵活的单细胞测序方法 | 小鼠-人类混合细胞、人类乳腺组织细胞、混合表型急性白血病细胞 | 单细胞基因组学 | 急性白血病、乳腺癌 | 单细胞RNA测序、多组学测量 | NA | 转录组数据、多组学数据 | 数千个样本或数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞多组学 | PIP-seq | 颗粒模板即时分区测序,兼容微孔板和大体积锥形管等多种乳化格式 |
2169 | 2025-10-06 |
Excess pancreatic elastase alters acinar-β cell communication by impairing the mechano-signaling and the PAR2 pathways
2023-07-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.05.007
PMID:37339634
|
研究论文 | 本研究探讨胰腺弹性蛋白酶通过损害机械信号传导和PAR2通路调控胰岛β细胞存活的新机制 | 首次发现胰腺弹性蛋白酶在2型糖尿病患者中上调并通过PAR2和机械信号通路负调控β细胞存活 | 研究主要基于体外和动物模型,需要进一步验证在人体中的治疗效果 | 探索胰腺弹性蛋白酶在糖尿病发病机制中的作用及潜在治疗策略 | 人类和啮齿类动物的胰岛β细胞及胰腺腺泡细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 高通量筛选、磷酸化抗体微阵列、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 2型糖尿病患者和胰岛素抵抗小鼠的胰腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2170 | 2025-10-06 |
deMULTIplex2: robust sample demultiplexing for scRNA-seq
2023-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.536275
PMID:37090649
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的鲁棒样本解复用算法deMULTIplex2 | 基于标签交叉污染物理机制构建统计模型,使用广义线性模型和期望最大化算法概率推断细胞样本身份 | NA | 解决大规模、样本细胞数不平衡和噪声数据中的单细胞样本解复用问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞样本标签 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型, 期望最大化算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2171 | 2025-10-06 |
Cisplatin Neurotoxicity Targets Specific Subpopulations and K+ Channels in Tyrosine-Hydroxylase Positive Dorsal Root Ganglia Neurons
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.853035
PMID:35586548
|
研究论文 | 本研究揭示顺铂通过靶向酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元中的特定亚群和K+通道导致神经毒性 | 首次在单细胞水平揭示顺铂神经毒性的特异性细胞靶点,发现K2P18.1钾通道在其中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本验证;维生素E的保护作用有限 | 探究顺铂化疗引起的外周神经病变的细胞机制 | 小鼠酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 | 神经科学 | 化疗引起的周围神经病变 | 单细胞转录组测序,电生理分析 | NA | 转录组数据,电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2172 | 2025-10-06 |
Cell type hierarchy reconstruction via reconciliation of multi-resolution cluster tree
2021-09-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab481
PMID:34125905
|
研究论文 | 开发了一种名为MRtree的算法,用于从单细胞RNA测序数据构建细胞类型层次结构 | 提出了一种高度灵活的树构建算法,能够从多个分辨率的平面聚类结果生成聚类层次结构 | 需要依赖现有的平面聚类算法,可能受到这些算法固有局限性的影响 | 解决单细胞RNA测序数据分析中分辨率参数选择困难和细胞簇演化特征难以比较的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 树构建算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2173 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Profound Alterations in Mechanosensitive Dorsal Root Ganglion Neurons with Vitamin E Deficiency
2019-Nov-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2019.10.064
PMID:31733517
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示维生素E缺乏对背根神经节机械敏感性神经元的分子特征和功能特性的深刻影响 | 发现维生素E缺乏主要影响机械敏感性TH+神经元而非预期的本体感觉神经元,揭示了电压门控钙钾通道上调的新机制 | 研究使用Ttpa基因敲除小鼠模型,在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 研究维生素E缺乏对背根神经节神经元分子特征和功能特性的影响 | 背根神经节神经元,特别是酪氨酸羟化酶阳性(TH+)的机械敏感性神经元 | 单细胞测序 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Ttpa基因敲除小鼠的背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2174 | 2025-10-06 |
NanoCRISPR-assisted biomimetic tissue-equivalent patch regenerates the intervertebral disc by inhibiting endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Nov, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 开发了一种纳米CRISPR辅助的仿生组织等效补片,通过抑制内皮-间质转化来促进椎间盘再生 | 首次将纳米CRISPR系统与仿生纳米纤维支架结合,靶向消除VEGF介导的血管生成因子,同时复制天然纤维环的层次结构 | NA | 开发能够同时解决纤维环物理缺损和血管生成障碍的椎间盘再生策略 | 椎间盘纤维环组织 | 组织工程 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2175 | 2025-10-06 |
Deciphering the regulatory networks of human male germline development from embryo to adulthood
2025-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167918
PMID:40409516
|
研究论文 | 构建了从胚胎到成年的人类男性生殖细胞发育图谱,揭示了调控网络重配置和关键信号通路 | 首次整合从6周胚胎到老年男性的92,488个睾丸细胞,构建了全面的人类男性生殖细胞发育图谱 | 研究主要基于单细胞转录组数据,需要进一步功能验证 | 解析人类男性生殖细胞从胚胎到成年的发育调控网络 | 人类睾丸细胞,包括从胚胎期到老年期的生殖细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 92,488个睾丸细胞,涵盖从6周胚胎到老年男性 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2176 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune profile changes in patients with diarrhoeal-irritable bowel syndrome
2025-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167945
PMID:40456298
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示腹泻型肠易激综合征患者免疫特征变化及潜在治疗靶点 | 首次在IBS-D中绘制T淋巴细胞单细胞图谱,发现FOS信号通路作为新治疗靶点,并鉴定PLK3和NFKBIZ异常表达 | 样本量较小(4例患者+4例对照),动物模型与人类疾病存在差异 | 解析T淋巴细胞在腹泻型肠易激综合征发病机制中的作用 | IBS-D患者血液样本、健康对照血液样本、IBS-D大鼠模型血清和结肠组织 | 单细胞组学 | 肠易激综合征 | 单细胞RNA测序,ELISA,三参数荧光分析 | 轨迹分析,单细胞调控网络推断聚类分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质浓度数据,荧光信号数据 | 8例人类血液样本(4患者+4对照),IBS-D大鼠模型组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2177 | 2025-10-06 |
Anti-tumor effects on tumor-infiltrating natural killer cells by localized ablative immunotherapy and immune checkpoint inhibitors: An integrated and comparative study using scRNAseq analysis
2025-Sep-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217825
PMID:40436260
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的调控作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统比较LAIT和ICI对NK细胞的转录调控,发现二者通过不同但互补的机制增强NK细胞抗肿瘤反应 | 研究主要基于小鼠乳腺癌模型,临床转化需要进一步验证 | 阐明局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的调控机制 | 肿瘤浸润自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠乳腺癌模型,TCGA数据库乳腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2178 | 2025-10-06 |
BCLAF1 restrains stress responses in hematopoietic stem cells to support expansion and repopulation
2025-Aug-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014916
PMID:40435510
|
研究论文 | 本研究揭示了转录调节因子BCLAF1通过限制造血干细胞应激反应来维持其发育和移植后重建功能的新机制 | 首次发现BCLAF1在造血干细胞中通过限制应激反应基因表达来维持干细胞功能的新作用机制 | BCLAF1与染色质结合的具体分子机制尚不明确,需要进一步研究 | 探究BCLAF1在造血干细胞发育和移植后重建功能中的调控作用 | 小鼠胎儿和成年造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,染色质结合分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,染色质结合数据 | 小鼠造血干细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2179 | 2025-10-06 |
Zn-Based Multi-Active Framework Nanoparticles TSA-CAN-Zn Inhibit Skin Glycation via Dual Blockade of HMGB1/RAGE and AGEs/RAGE Pathways
2025-Aug, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500664
PMID:40370206
|
研究论文 | 本研究开发了锌基多活性框架纳米颗粒TSA-CAN-Zn,通过双重阻断HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE通路抑制皮肤糖化损伤 | 首次设计可同时抑制HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE两条通路的纳米颗粒,并通过单细胞RNA测序揭示其对皮肤不同细胞类型的影响机制 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发治疗糖化诱导皮肤损伤的新型纳米疗法 | HaCaT细胞和小鼠皮肤糖化模型 | 纳米医学 | 皮肤糖化损伤 | 分子对接,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2180 | 2025-10-06 |
Visualization of the Spiral Ganglion Neuron in Vivo Using a Novel 177Lu Nuclear Molecule Label
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504464
PMID:40387257
|
研究论文 | 开发了一种新型放射性核素标记的抗体药物,实现了耳蜗螺旋神经节神经元的活体成像 | 首次利用放射性核素标记的抗VGLUT1抗体实现耳蜗螺旋神经节神经元的活体成像 | 目前仅在动物模型水平验证,尚未应用于临床 | 开发评估耳蜗神经完整性的新方法,为人工耳蜗植入术前评估提供依据 | 小鼠和猪模型的螺旋神经节神经元 | 分子影像学 | 听力损失 | 核素成像,单细胞测序分析 | NA | 影像数据,分子探针数据 | SGN损伤的小鼠和猪模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |