单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
21741 2024-08-08
Single-cell transcriptional analysis of human endothelial colony-forming cells from patients with low VWF levels
2022-04-07, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自低VWF水平患者的内皮集落形成细胞,以识别VWF水平的新调节因子 首次通过单细胞RNA测序技术识别内皮集落形成细胞中VWF水平的新调节因子,并通过siRNA实验进一步验证 NA 旨在识别内皮集落形成细胞中VWF水平的新调节因子 来自低VWF水平患者和健康对照的内皮集落形成细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 来自低VWF水平患者和健康对照的内皮集落形成细胞,以及人脐静脉内皮细胞作为对照
21742 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals induction of distinct trained-immunity programs in human monocytes
2022-04-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类单核细胞在训练免疫诱导下的不同转录程序 首次探索了先天免疫细胞中训练免疫诱导的潜在异质性 NA 研究训练免疫在单核细胞中的转录程序及其在免疫介导疾病中的影响 人类单核细胞及其在不同诱导剂下的训练免疫反应 NA 溃疡性结肠炎、脓毒症、COVID-19 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及多个患者样本
21743 2024-08-08
Fusion prior gene network for high reliable single-cell gene regulatory network inference
2022-Apr, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本文提出了一种名为FGRNAE的框架,用于提高单细胞基因调控网络推断的可靠性 利用随机游走重启算法和随机森林算法,结合共功能网络数据,提高了单细胞基因调控网络推断的准确性 NA 提高单细胞基因调控网络推断的准确性 单细胞基因调控网络 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 随机森林算法 基因网络数据 NA
21744 2024-08-08
The atlas of ACE2 expression in fetal and adult human hearts reveals the potential mechanism of heart-injured patients infected with SARS-CoV-2
2022-04-01, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 本研究深入分析了胎儿和成人心脏中单细胞表达谱,以探索SARS-CoV-2对心脏造成伤害的潜在机制 通过单细胞转录组分析,揭示了心脏发育不同阶段中ACE2表达水平的变化,并确认了其在SARS-CoV-2感染风险中的作用 NA 探索SARS-CoV-2通过ACE2感染心脏的潜在机制 胎儿和成人心脏中的ACE2表达 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 蛋白质-蛋白质相互作用网络 单细胞转录组数据 涉及胎儿和成人心脏样本
21745 2024-08-08
Uterine fluid microRNAs are dysregulated in women with recurrent implantation failure
2022-04-01, Human reproduction (Oxford, England)
研究论文 本研究探讨了反复植入失败(RIF)女性子宫液中microRNAs(miRNAs)的组成与健康生育女性之间的差异,并发现RIF女性的子宫液miRNAs组成与健康女性不同,这些失调的miRNAs与子宫内膜容受性和胚胎植入受损有关。 首次全面分析了具有生育能力健康女性和被诊断为RIF女性的接受期子宫液中总miRNAs的分布,为RIF的分子机制提供了新的见解,并可能对未来的生物标志物和临床治疗研究产生影响。 这是一项描述性研究,参与研究的人数有限。此外,识别出的差异丰富的miRNAs应在更大的研究队列中进行验证,并且RIF中预测的miRNA靶基因和富集途径需要在体外进一步确认和探索。 研究反复植入失败女性子宫液中miRNAs的组成与健康生育女性之间的差异。 反复植入失败女性和健康生育女性的子宫液中的miRNAs。 NA 生殖健康问题 small RNA sequencing, quantitative real-time PCR (RT-PCR) NA miRNA 健康生育女性17人,反复植入失败女性34人
21746 2024-08-08
Second Heart Field-Derived Cells Contribute to Angiotensin II-Mediated Ascending Aortopathies
2022-03-29, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究探讨了第二心场(SHF)来源的细胞在血管紧张素II(AngII)介导的升主动脉病变中的作用 发现SHF来源的细胞通过LRP1和转化生长因子-β信号通路在维持血管完整性中起关键作用,并揭示了PAI1在AngII诱导的升主动脉病变中的重要作用 NA 确定SHF来源的细胞是否以及如何参与升主动脉病变 升主动脉病变患者和AngII注射小鼠的升主动脉 心血管疾病 NA 质谱辅助蛋白质组学和单细胞转录组分析 NA 蛋白质和mRNA 人类升主动脉瘤组织和AngII注射小鼠的升主动脉
21747 2024-08-08
Blue light responses in Cancer borealis stomatogastric ganglion neurons
2022-03-28, Current biology : CB IF:8.1Q1
研究论文 研究了蓝光对Cancer borealis螃蟹的口胃神经系统(STG)神经元活动的影响 首次发现并研究了STG神经元对蓝光的固有反应,并识别了潜在的介导分子cryptochrome NA 探索蓝光如何影响STG神经元的活动及其潜在机制 Cancer borealis螃蟹的STG神经元 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
21748 2024-08-08
Evidence of islet CADM1-mediated immune cell interactions during human type 1 diabetes
2022-03-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析免疫细胞群,揭示了CADM1介导的细胞间相互作用在人类1型糖尿病中的作用 首次揭示了CADM1在1型糖尿病中作为细胞间相互作用的关键分子,可能成为预防该病的新治疗靶点 NA 探讨CADM1在1型糖尿病中的作用及其作为治疗靶点的可能性 人类1型糖尿病患者的胰腺组织 NA 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括1型糖尿病患者、自身抗体阳性个体及无糖尿病个体
21749 2024-08-08
JEBIN: analyzing gene co-expressions across multiple datasets by joint network embedding
2022-03-10, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为JEBIN的方法,通过联合嵌入多个二分网络来分析跨多个数据集的基因共表达关系 JEBIN能够以非线性和全局相似性的方式推断基因共表达关联,并能在线性时间复杂度内整合具有不同分布的数据集 NA 旨在通过元分析多源数据有效解决从单一数据集推断稳定基因共表达关联的难题 基因共表达模式及其在肝细胞癌(HCC)中的应用 生物信息学 肝癌 联合嵌入 二分网络 转录组数据 涉及多个表达数据集,包括肝细胞癌及其邻近正常组织的数据,以及最新的肝细胞癌单细胞RNA-seq数据
21750 2024-08-08
scHFC: a hybrid fuzzy clustering method for single-cell RNA-seq data optimized by natural computation
2022-03-10, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为scHFC的混合模糊聚类方法,该方法通过自然计算优化,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 scHFC方法结合了模糊C均值(FCM)和Gath-Geva(GG)算法,并通过模拟退火算法和遗传算法进行优化,提高了聚类准确性和算法稳定性 NA 研究单细胞RNA测序数据的聚类方法,以提高细胞类型识别的准确性 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 混合模糊聚类 基因表达数据 17个单细胞RNA测序数据集
21751 2024-08-08
Improving bulk RNA-seq classification by transferring gene signature from single cells in acute myeloid leukemia
2022-03-10, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为scPAGE的新方法,用于开发单细胞基因对签名(scGPS),以改善急性髓系白血病(AML)中的批量RNA-seq分类 scPAGE方法通过解决不同测序技术间的差异,成功将单细胞基因签名转移到批量数据中,提高了分类性能 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术提高批量RNA-seq数据的分类准确性 急性髓系白血病(AML)的单细胞和批量RNA-seq数据 基因组学 血液病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA-seq数据 NA
21752 2024-08-08
Erratum: Monitoring CAR T cell generation with a CD8-targeted lentiviral vector by single-cell transcriptomics
2022-Mar-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
correction NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
21753 2024-08-08
Heterogeneity of human corneal endothelium implicates lncRNA NEAT1 in Fuchs endothelial corneal dystrophy
2022-Mar-08, Molecular therapy. Nucleic acids
研究论文 研究通过单细胞RNA测序发现人类角膜内皮细胞的异质性,并揭示长非编码RNA NEAT1在Fuchs内皮角膜营养不良发展中的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了角膜内皮细胞的四个亚群,并发现NEAT1在Fuchs内皮角膜营养不良中的关键作用 NA 探讨Fuchs内皮角膜营养不良的发展机制 人类角膜内皮细胞和Fuchs内皮角膜营养不良 NA 角膜疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 健康人类角膜和UVA诱导的小鼠Fuchs内皮角膜营养不良模型
21754 2024-08-08
Correction to: Redefining intestinal immunity with single-cell transcriptomics
2022-Mar, Mucosal immunology IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
21755 2024-08-08
Spatial components of molecular tissue biology
2022-03, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文探讨了在空间分辨率下分析RNA和蛋白质表达的方法,并强调了开发相应计算工具的重要性 本文提出了将生物学问题和相关计算算法分类的方法,以促进空间转录组学和蛋白质组学的发展 NA 旨在最大化利用这些技术获得的生物学见解 细胞和组织在健康和疾病中的空间分析 生物信息学 NA 空间转录组学和蛋白质组学 NA RNA和蛋白质表达数据 NA
21756 2024-08-08
Upregulation of CD14 in mesenchymal stromal cells accelerates lipopolysaccharide-induced response and enhances antibacterial properties
2022-Feb-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究通过系统方法比较不同遗传背景的间充质干细胞(MSCs)的抗菌活性,发现CD14的上调能加速MSCs对脂多糖(LPS)的反应并增强其抗菌特性 首次揭示了CD14在MSCs中的上调能显著增强其抗菌活性,并通过单细胞RNA测序展示了CD14上调后MSCs的转录状态变化 研究主要集中在体外实验,未来需要进一步的体内实验验证CD14上调的MSCs在实际感染治疗中的效果 探究调控间充质干细胞抗菌特性的遗传机制 间充质干细胞(MSCs)及其抗菌活性 NA NA CRISPR, 单细胞RNA测序 NA 转录组, 蛋白质组 不同遗传背景的MSCs样本
21757 2024-08-08
SkewC: Identifying cells with skewed gene body coverage in single-cell RNA sequencing data
2022-Feb-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为SkewC的质量评估工具,用于识别单细胞RNA测序数据中基因体覆盖偏斜的细胞 SkewC工具通过评估每个细胞的基因覆盖及其偏斜度作为质量指标,能够处理任何类型的scRNA-seq数据集,无论使用何种协议 NA 开发一种新的质量控制方法,以避免单细胞RNA测序数据中的错误聚类或虚假聚类 单细胞RNA测序数据中的质量较差的细胞 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 NA
21758 2024-08-08
PD-L1+CD8+ T cells enrichment in lung cancer exerted regulatory function and tumor-promoting tolerance
2022-Feb-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过CyTOF和IMC技术分析了原发性肺癌中的CD8 T细胞,发现PD-L1CD8 T细胞在肿瘤病变中富集,并通过PD-L1/PD-1轴抑制CD8 T细胞的增殖和细胞毒性能力。 首次揭示了PD-L1在CD8 T细胞中的图形模式和特征,并阐明了其在肺癌中的调节功能和促肿瘤耐受作用。 NA 研究PD-L1在CD8 T细胞中的作用及其在肺癌治疗中的潜在价值。 PD-L1在CD8 T细胞中的表达模式及其在肺癌中的功能。 数字病理学 肺癌 CyTOF, IMC, 单细胞RNA测序 NA 图像, 基因表达数据 原发性肺癌样本
21759 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals time- and sex-specific responses of mouse spinal cord microglia to peripheral nerve injury and links ApoE to chronic pain
2022-02-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠脊髓微胶质细胞在外周神经损伤后的时间性和性别特异性反应,并发现ApoE与慢性疼痛之间的关联。 首次展示了外周神经损伤后,小鼠脊髓微胶质细胞中性别特异性的炎症亚型生成,并揭示了ApoE在慢性疼痛中的作用。 NA 探究外周神经损伤后脊髓微胶质细胞的动态变化及其与慢性疼痛的关系。 小鼠和人类的脊髓微胶质细胞。 数字病理学 慢性疼痛 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及小鼠和人类的脊髓微胶质细胞样本。
21760 2024-08-08
Three-dimensional spatial transcriptomics uncovers cell type localizations in the human rheumatoid arthritis synovium
2022-02-11, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用三维空间转录组学技术,探索了人类类风湿关节炎滑膜中的细胞类型定位 首次采用空间转录组学技术,对慢性滑膜炎症部位的局部组织相互作用进行研究,结合形态特征和高通量空间解析转录组学,提供更高的统计能力和更深入的疾病严重程度及治疗特定反应的监测 NA 研究类风湿关节炎滑膜中的细胞类型定位及其在组织中的相互作用 人类类风湿关节炎滑膜中的细胞类型及其定位 数字病理学 类风湿关节炎 空间转录组学 NA RNA-Seq数据 NA
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