单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 21721 - 21740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21721 | 2024-08-08 |
Identification of Synovial Fibroblast-Associated Neuropeptide Genes and m6A Factors in Rheumatoid Arthritis Using Single-Cell Analysis and Machine Learning
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/5114697
PMID:35186167
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研究论文 | 本研究利用单细胞分析和机器学习技术，探讨了神经肽和m6A在类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞的致病过程中的作用 | 首次通过单细胞分析和机器学习技术，识别了与滑膜成纤维细胞相关的神经肽基因和m6A因子，揭示了它们在类风湿性关节炎中的重要调控功能 | NA | 探究神经肽和N6-甲基腺苷（m6A）在滑膜成纤维细胞致病过程中的作用 | 滑膜成纤维细胞及其在类风湿性关节炎中的作用 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 21722 | 2024-08-08 |
The Neuronal Transcription Factor Creb3l1 Potential Upregulates Ntrk2 in the Hypertensive Microenvironment to Promote Vascular Smooth Muscle Cell-Neuron Interaction and Prevent Neurons from Ferroptosis: A Bioinformatic Research of scRNA-seq Data
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/8339759
PMID:35186168
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了高血压微环境中神经元转录因子Creb3l1上调Ntrk2以促进血管平滑肌细胞与神经元相互作用并防止神经元发生铁死亡的机制。 | 首次揭示了高血压微环境中Creb3l1通过上调Ntrk2促进血管平滑肌细胞与神经元相互作用，从而可能防止神经元铁死亡的新机制。 | 研究仅基于小鼠动脉细胞的单细胞RNA测序数据，未来需在更多物种和细胞类型中验证这些发现。 | 探讨高血压与铁死亡之间的关联，并研究神经肽表达变化在高血压微环境中导致铁死亡的机制。 | 高血压微环境中血管平滑肌细胞与神经元的相互作用及其对神经元铁死亡的影响。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 分析了来自SHR组和WKY组的24387个小鼠动脉细胞 |
| 21723 | 2024-08-08 |
Dissecting the mechanism of cytokine release induced by T-cell engagers highlights the contribution of neutrophils
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2039432
PMID:35186442
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞结合剂诱导细胞因子释放的生物机制，并强调了中性粒细胞的贡献 | 首次证明了中性粒细胞在T细胞结合剂介导的细胞因子释放中的作用，并通过单细胞RNA测序进行了验证 | NA | 研究T细胞结合剂治疗癌症时诱导的细胞因子释放综合征的机制，并探索预防措施 | T细胞结合剂、细胞因子释放综合征、中性粒细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了四种不同的T细胞双特异性抗体进行实验 |
| 21724 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA Sequencing Reveals Critical Functions of Mkx in Periodontal Ligament Homeostasis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.795441
PMID:35186919
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了转录因子Mkx在牙周韧带稳态中的关键作用 | 首次揭示了Mkx在牙周韧带细胞群中的精确和关键功能 | NA | 旨在阐明Mkx缺乏对牙周韧带细胞异质性和基因表达差异的影响 | 牙周韧带细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和Mkx敲除大鼠的牙周韧带组织 |
| 21725 | 2024-08-08 |
Deciphering Cell-Cell Communication in Abdominal Aortic Aneurysm From Single-Cell RNA Transcriptomic Data
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.831789
PMID:35187133
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序数据，揭示了腹主动脉瘤中的细胞间通信网络 | 首次基于单细胞转录组学分析了腹主动脉瘤中的细胞间通信网络，并预测了共同改变的信号通路 | NA | 揭示腹主动脉瘤中的细胞间通信机制 | 腹主动脉瘤中的细胞间通信 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的多个实验模型 |
| 21726 | 2024-08-08 |
IL-17 Receptor C Signaling Controls CD4+ TH17 Immune Responses and Tissue Injury in Immune-Mediated Kidney Diseases
2021-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021030426
PMID:35167487
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研究论文 | 本文研究了IL-17受体C信号在CD4+ TH17免疫反应和免疫介导的肾脏疾病中的组织损伤控制作用 | 发现了IL-17受体C信号在调节CD4+ TH17细胞和控制器官特异性自身免疫中的新功能 | NA | 探讨IL-17受体C信号在CD4+ TH17细胞中的功能及其在肾脏疾病中的作用 | IL-17A、IFNγ和Foxp3三重报告小鼠的肾CD4+ T细胞亚群 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IL-17A、IFNγ和Foxp3三重报告小鼠用于分选肾CD4+ T细胞亚群 |
| 21727 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Macrophages for Quality Control of The Cell Therapy Product
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.658862
PMID:35173760
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术评估了人多能干细胞衍生的巨噬细胞（iMACs）的生物学均一性，以用于细胞治疗产品的质量控制 | 首次使用单细胞RNA测序技术评估人多能干细胞衍生的巨噬细胞的生物学均一性，为细胞治疗产品的质量控制提供了新的方法 | 研究仅限于评估iMACs的转录组均一性，未涉及其他可能影响细胞治疗产品质量的因素 | 评估人多能干细胞衍生的巨噬细胞的生物学均一性，以确保细胞治疗产品的质量 | 人多能干细胞衍生的巨噬细胞（iMACs） | 细胞治疗 | 炎症性疾病和癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6,230个iMACs |
| 21728 | 2024-08-08 |
Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Cardiovascular Research
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.810232
PMID:35174168
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术如何帮助识别心血管疾病治疗的新靶点 | NA | 总结单细胞RNA测序技术在心血管系统胚胎发育和疾病发病机制及治疗中的最新发现 | 心血管系统的胚胎发育、心血管疾病的发病机制及治疗 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21729 | 2024-08-08 |
Complex Involvement of the Extracellular Matrix, Immune Effect, and Lipid Metabolism in the Development of Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.800747
PMID:35174208
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研究论文 | 本研究通过mRNA测序和其他技术分析了特发性肺纤维化（IPF）患者肺组织中的基因表达，揭示了细胞外基质（ECM）重塑、脂质代谢和免疫效应在IPF早期发展中的复杂作用 | 首次全面揭示了IPF中涉及的380个差异表达转录本（DETs），并验证了其中21个基因的表达，通过单细胞RNA测序追踪了这些基因的细胞来源 | 研究样本量较小，且仅包括早期和移植阶段的IPF患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨特发性肺纤维化（IPF）的病理机制，特别是细胞外基质重塑、脂质代谢和免疫效应的作用 | 特发性肺纤维化（IPF）患者的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | mRNA测序, 实时定量PCR (RT-qPCR), 免疫组化, 蛋白质印迹, 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 7例早期IPF患者, 2例移植阶段IPF患者, 6例健康对照 |
| 21730 | 2024-08-08 |
Loss of Foxd4 Impacts Neurulation and Cranial Neural Crest Specification During Early Head Development
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.777652
PMID:35178396
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研究论文 | 本研究探讨了Foxd4基因在早期头部发育中的作用，特别是在神经管闭合和颅神经嵴分化中的作用 | 通过CRISPR-Cas9基因编辑技术在胚胎干细胞中生成Foxd4的双等位基因移码突变，揭示了Foxd4在早期神经上皮发育中的关键作用 | NA | 研究Foxd4基因在早期头部发育中的功能和机制 | Foxd4基因在胚胎干细胞中的功能及其对头部发育的影响 | NA | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据 | E7.75和E8.25的小鼠胚胎 |
| 21731 | 2024-08-08 |
Single-Cell Differential Network Analysis with Sparse Bayesian Factor Models
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.810816
PMID:35186014
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研究论文 | 本文提出了一种稀疏分层贝叶斯因子模型，用于在不同生物条件下从单细胞RNA测序数据中识别网络结构的差异 | 利用潜在因子影响每个细胞的基因表达值，以解释单细胞RNA测序数据特有的零膨胀、细胞间变异增加和过度分散问题 | NA | 探索在不同生物条件下基因相互作用的变化 | 单细胞RNA测序数据中的基因-基因相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 稀疏分层贝叶斯因子模型 | 基因表达数据 | NA |
| 21732 | 2024-08-08 |
CD44-Mediated Poor Prognosis in Glioma Is Associated With M2-Polarization of Tumor-Associated Macrophages and Immunosuppression
2021, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2021.775194
PMID:35187044
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研究论文 | 本研究探讨了CD44在胶质瘤中的作用，通过大规模转录组、空间和单细胞转录组水平分析，发现CD44与胶质瘤的恶性程度和预后负相关，并与肿瘤相关巨噬细胞的M2极化和免疫抑制有关。 | 本研究首次揭示了CD44作为新的M2型肿瘤相关巨噬细胞标志物，在胶质瘤微环境中促进肿瘤进展和免疫抑制的作用。 | NA | 阐明CD44在胶质瘤中的作用及其与预后的关系。 | 胶质瘤及其相关基因CD44。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 研究包括来自TCGA、CGGA、Ivy Glioblastoma Atlas Project和GSE103224的多种胶质瘤样本。 |
| 21733 | 2024-08-08 |
Highly Regional Genes: graph-based gene selection for single-cell RNA-seq data
2022-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.01.004
PMID:35144027
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研究论文 | 提出了一种名为HRG的新特征选择方法，用于在单细胞RNA-seq数据中选择显示区域表达模式的基因 | HRG方法通过模仿人类在细胞二维可视化中的标记选择，能够找到具有区域表达模式的基因，提高了准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种新的基因选择方法，以提高单细胞RNA-seq数据分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21734 | 2024-08-08 |
Generation of a recessive dystrophic epidermolysis bullosa mouse model with patient-derived compound heterozygous mutations
2022-06, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-022-00735-5
PMID:35152273
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研究论文 | 本文通过CRISPR-based基因编辑技术i-GONAD，成功建立了携带患者来源的复合杂合突变的隐性营养不良型大疱性表皮松解症（RDEB）小鼠模型 | 首次成功建立了携带患者特异性复合杂合突变的RDEB小鼠模型，为研究RDEB的发病机制和治疗提供了新的工具 | NA | 建立一个可靠的RDEB小鼠模型，以研究其发病机制并开发治疗方法 | 隐性营养不良型大疱性表皮松解症（RDEB）及其小鼠模型 | NA | 隐性营养不良型大疱性表皮松解症 | CRISPR-based基因编辑技术 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序 | 包括c.5818delC和E2857X突变的小鼠 |
| 21735 | 2024-08-08 |
A Multicancer Malignant Pleural Effusion Diagnostic Test Using Hexokinase 2 and Single-Cell Sequencing
2022-05-18, Clinical chemistry
IF:7.1Q1
DOI:10.1093/clinchem/hvac003
PMID:35142335
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研究论文 | 本文报道了一种基于己糖激酶2（HK2）和单细胞测序的新型诊断方法（HK2-seq），用于多癌种恶性胸腔积液（MPE）的诊断 | HK2-seq方法利用HK2作为新的代谢功能相关标记物，通过检测多种癌症类型的胸腔积液中参与增加糖酵解的播散性肿瘤细胞，结合单细胞测序确认高糖酵解肿瘤细胞（hgTCs）的恶性程度，从而建立明确的MPE诊断 | NA | 开发一种新的诊断方法，用于提高多癌种恶性胸腔积液的诊断准确性 | 恶性胸腔积液及其相关肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 111名胸腔积液患者 |
| 21736 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of the prognostic and role in immune cell infiltration of MSR1 expression in lower-grade gliomas
2022-05, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.4603
PMID:35142109
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研究论文 | 本研究旨在验证巨噬细胞清道夫受体1（MSR1）在低级别胶质瘤（LGG）患者中的预后和免疫相关作用 | 首次全面分析了MSR1在低级别胶质瘤中的表达与预后及免疫细胞浸润的关系 | 研究数据来源于公共数据库，实验验证部分有限 | 验证MSR1在低级别胶质瘤患者中的预后价值和免疫相关作用 | 低级别胶质瘤（LGG）患者 | 数字病理学 | 脑瘤 | 基因集富集分析（GSEA） | NA | 基因表达数据 | 数据来源于公共数据库，具体样本量未详细说明 |
| 21737 | 2024-08-08 |
MAX deficiency impairs human endometrial decidualization through down-regulating OSR2 in women with recurrent spontaneous abortion
2022-May, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-022-03579-z
PMID:35146559
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫组化等技术，研究了MAX缺陷如何通过下调OSR2影响人类子宫内膜蜕膜化，进而导致习惯性流产 | 首次揭示了MAX通过直接调控OSR2的表达，影响子宫内膜蜕膜化和细胞增殖，从而导致习惯性流产的分子机制 | NA | 探讨习惯性流产中子宫内膜蜕膜化的分子机制 | 人类子宫内膜间质细胞和蜕膜组织 | NA | 习惯性流产 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化（IHC）、定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR）、RNA测序、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、切割目标并使用核酸酶释放测序（CUT&RUN-seq） | NA | RNA | 来自习惯性流产女性的蜕膜组织和子宫内膜间质细胞 |
| 21738 | 2024-08-08 |
An MRI radiomics approach to predict survival and tumour-infiltrating macrophages in gliomas
2022-04-29, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awab340
PMID:35136934
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研究论文 | 本研究构建了一个基于术前T2加权MRI的放射组学模型，用于预测胶质瘤患者的生存和肿瘤浸润巨噬细胞 | 开发了一个基于14个放射组学特征的预测模型，显示出高度稳健的预测能力，并关联了免疫反应，特别是肿瘤巨噬细胞浸润 | NA | 构建一个稳定且可验证的术前T2加权MRI放射组学模型，用于预测胶质瘤患者的生存 | 652名胶质瘤患者的术前T2加权MRI图像、RNA-seq和临床数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 放射组学 | 机器学习 | 图像 | 652名胶质瘤患者 |
| 21739 | 2024-08-08 |
Neuron-derived neuropeptide Y fine-tunes the splenic immune responses
2022-04-20, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.01.010
PMID:35139365
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研究论文 | 本文研究了神经系统和免疫系统之间的相互作用，特别是神经元衍生的神经肽Y（NPY）对脾脏免疫反应的精细调节作用 | 首次揭示了NPY在神经系统和免疫系统交叉对话中的古老语言作用，并探讨了其在调节感染期间的炎症风暴和自身免疫疾病中的潜在应用 | NA | 探讨神经肽Y在神经系统和免疫系统交叉对话中的作用及其在疾病治疗中的潜在应用 | 神经肽Y（NPY）及其在脾脏免疫反应中的作用 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | 涉及大鼠、果蝇模型以及人类自身免疫疾病患者和鼠模型实验 |
| 21740 | 2024-08-08 |
Optimal transport improves cell-cell similarity inference in single-cell omics data
2022-04-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac084
PMID:35157031
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研究论文 | 本文提出使用最优传输（OT）作为单细胞组学数据中细胞间相似性度量的方法 | 引入最优传输作为细胞间相似性度量，并通过熵正则化加速计算，以处理单细胞数据的高维度 | NA | 改进单细胞组学数据中细胞间相似性的推断和细胞聚类 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）和单细胞DNA甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 最优传输（OT） | NA | 单细胞组学数据 | 13个独立数据集，包括模拟数据、scRNA-seq、scATAC-seq和单细胞DNA甲基化数据 |