单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 21701 - 21720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21701 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing for Analyzing the Intestinal Tract in Healthy and Diseased Individuals
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.915654
PMID:35874838
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在健康和患病个体肠道分析中的应用 | scRNA-seq技术能够揭示在整体水平上难以观察到的罕见和中间细胞状态 | NA | 探讨scRNA-seq在识别新的细胞亚型和状态、目标以及解释肠道疾病分子机制中的应用 | 肠道中的不同细胞系及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 21702 | 2024-08-08 |
Arecoline Is Associated With Inhibition of Cuproptosis and Proliferation of Cancer-Associated Fibroblasts in Oral Squamous Cell Carcinoma: A Potential Mechanism for Tumor Metastasis
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.925743
PMID:35875097
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研究论文 | 本文探讨了槟榔碱与口腔鳞状细胞癌（OSCC）中铜死亡和癌症相关成纤维细胞（CAFs）增殖的抑制之间的关系，以及这种关系对肿瘤转移的可能机制。 | 首次揭示了槟榔碱通过影响铜死亡和CAFs的增殖，可能在OSCC的转移中发挥重要作用。 | 研究主要基于基因表达数据和细胞实验，缺乏临床样本的直接验证。 | 探究槟榔碱在口腔鳞状细胞癌转移中的作用机制。 | 口腔鳞状细胞癌、癌症相关成纤维细胞、槟榔碱的作用。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 基因表达分析、LASSO回归、GO和KEGG分析、单细胞测序。 | NA | 基因表达数据 | GSE139869数据集（n=10）和TCGA-OSCC数据集（n=361）。 |
| 21703 | 2024-08-08 |
Epigenetic Regulation of Profibrotic Macrophages in Systemic Sclerosis-Associated Interstitial Lung Disease
2022-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42286
PMID:35849803
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研究论文 | 本研究探讨了系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）中促纤维化分泌磷蛋白1（SPP1）表达的巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，以揭示其在促进纤维化中的作用及相关的转录因子。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和染色质可及性测序技术，详细分析了SSc-ILD中SPP1巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，并预测了调控这些巨噬细胞分化的转录因子。 | 研究仅限于5个肺样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 旨在揭示SSc-ILD中促纤维化SPP1巨噬细胞的转录组和染色质结构变化，并识别相关的转录因子，为治疗SSc-ILD提供新的靶点。 | 系统性硬化症相关间质性肺病（SSc-ILD）中的促纤维化SPP1表达巨噬细胞。 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据 | 11个SSc-ILD和健康对照肺样本，5个肺样本用于染色质可及性测序 |
| 21704 | 2024-08-08 |
Different Molecular Features of Epithelioid and Giant Cells in Foreign Body Reaction Identified by Single-Cell RNA Sequencing
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.06.014
PMID:35853485
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间测序技术，分析了海绵和丝绸引起的外来体反应中的上皮细胞和巨细胞的分子特征 | 首次揭示了上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的独特分子特征，并识别了巨细胞特异性标记基因 | NA | 探索上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的分子特征，以促进皮肤外来体反应的预防和治疗管理策略 | 上皮细胞和巨细胞在外来体反应中的分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠和人类组织中的多种细胞类型 |
| 21705 | 2024-08-08 |
Comparative Spatial Transcriptomic and Single-Cell Analyses of Human Nail Units and Hair Follicles Show Transcriptional Similarities between the Onychodermis and Follicular Dermal Papilla
2022-12, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.06.022
PMID:35853486
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研究论文 | 本研究利用数字空间分析和单细胞RNA测序技术，比较了人类指甲单元和毛囊的空间转录组和单细胞分析，发现甲床和毛囊真皮乳头在转录水平上具有相似性 | 首次揭示了甲床中的特定间充质细胞群——甲床成纤维细胞的存在，并发现甲床和毛囊真皮乳头在Wnt和骨形态发生蛋白信号分子表达上的相似性 | NA | 探讨人类指甲单元和毛囊的转录组相似性及其生物学意义 | 人类指甲单元和毛囊 | 数字病理学 | NA | 数字空间分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21706 | 2024-08-08 |
Multidimensional Immunophenotyping of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Reveals Novel T Cell and Macrophage Signature
2022-Nov, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-022-12157-0
PMID:35831529
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和流式细胞术技术，全面分析了导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）中的免疫细胞浸润情况 | 发现了IPMN中T细胞和巨噬细胞的新型特征，并揭示了这些细胞在不同程度异型增生区域中的分布差异 | 研究样本量较小，仅包括12名患者的IPMN组织 | 探究导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）向癌症进展过程中的免疫细胞浸润情况 | 导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMN）及其不同程度异型增生区域中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 转录组数据 | 12名患者的IPMN组织 |
| 21707 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic profiling to evaluate the effects of Di(2-ethylhexyl)phthalate exposure on early meiosis of female mouse germ cells
2022-Nov, Chemosphere
IF:8.1Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了母体暴露于邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)后，胎鼠在胚胎第12.5天和第14.5天的卵巢，探讨DEHP对雌性小鼠生殖细胞早期减数分裂的影响。 | 首次通过单细胞转录组测序技术揭示DEHP暴露激活了生殖细胞中与DNA修复相关的通路，增加了DNA损伤相关基因的表达，并改变了生殖细胞的发育轨迹。 | 研究仅限于胎鼠的特定胚胎阶段，且未探讨DEHP对成年小鼠生殖细胞的影响。 | 探讨DEHP暴露对雌性小鼠生殖细胞早期减数分裂分子机制的影响。 | 雌性小鼠的生殖细胞及DEHP暴露对其的影响。 | 数字病理学 | 生殖健康问题 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 胎鼠卵巢样本 |
| 21708 | 2024-08-08 |
PTX3 mediates the infiltration, migration, and inflammation-resolving-polarization of macrophages in glioblastoma
2022-11, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.13913
PMID:35855654
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研究论文 | 本文探讨了PTX3在胶质母细胞瘤中对巨噬细胞浸润、迁移和炎症消解极化的作用 | 首次阐明了PTX3在胶质瘤肿瘤微环境中对免疫系统的调节作用 | NA | 研究PTX3在胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | PTX3在胶质母细胞瘤中的表达及其对巨噬细胞功能的影响 | 数字病理学 | 脑癌 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 组织切片 | 60个湘雅队列的胶质瘤样本 |
| 21709 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic atlas reveals distinct immunological responses between COVID-19 vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2022-11, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28012
PMID:35859327
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了接种CoronaVac疫苗与自然感染SARS-CoV-2后免疫反应的差异 | 首次揭示了灭活COVID-19疫苗与SARS-CoV-2感染在免疫细胞类型比例、B细胞激活分化及基因表达等方面的不同反应 | 研究样本量较小，仅包括六名接种疫苗的个体和来自单细胞联盟的COVID-19感染患者 | 探究灭活COVID-19疫苗与SARS-CoV-2感染在免疫反应上的差异 | 接种CoronaVac疫苗的个体和SARS-CoV-2感染患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六名接种疫苗的个体和COVID-19感染患者 |
| 21710 | 2024-08-08 |
Dimensionality Reduction of Single-Cell RNA Sequencing Data by Combining Entropy and Denoising AutoEncoder
2022-10, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0118
PMID:35834604
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研究论文 | 本文通过结合熵和去噪自编码器的方法，对单细胞RNA测序数据进行降维 | 提出了一种新的降维方法，结合了熵和去噪自编码器的优势 | NA | 研究如何有效地对单细胞RNA测序数据进行降维 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 去噪自编码器 | RNA测序数据 | NA |
| 21711 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in oral science: Current awareness and perspectives
2022-Oct, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13287
PMID:35842899
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在口腔科学中的发展与应用 | 首次全面回顾单细胞RNA测序在口腔科学领域的应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在口腔疾病、组织发育和再生研究中的应用前景 | 口腔科学中的组织发育、牙齿和颌疾病、颌面部肿瘤、感染等领域 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 数千个细胞 |
| 21712 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals effects of semaglutide on non-cardiomyocytes of obese mice
2022-09-24, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.07.034
PMID:35843090
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学方法探讨了Semaglutide对肥胖小鼠非心肌细胞的分子机制及其对心脏保护作用的影响 | 发现Semaglutide通过降低Serpinh1和Pcolce的表达，延缓心脏纤维化，从而具有心脏保护作用 | NA | 研究Semaglutide对肥胖小鼠心脏纤维化的分子机制及其心脏保护作用 | 肥胖小鼠的非心肌细胞 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 15种非心肌细胞，其中大部分为成纤维细胞 |
| 21713 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics prediction from histology jointly through Transformer and graph neural networks
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac297
PMID:35849101
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研究论文 | 本文开发了一种名为Hist2ST的深度学习模型，用于从组织学图像预测RNA-seq表达 | Hist2ST模型结合了Transformer和图神经网络模块，有效捕捉了2D视觉特征的内部关系和斑点间的空间依赖性 | NA | 旨在从相对容易且成本较低的组织学图像中预测基因表达 | 空间转录组学数据和组织学图像 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | Transformer和图神经网络 | 图像 | 在癌症和正常数据集上进行了综合测试 |
| 21714 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Intratumoral Heterogeneity and Molecular Features of Ductal Carcinoma In Situ
2022-Sep-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0090
PMID:35852797
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，揭示了原位导管癌（DCIS）的肿瘤内异质性和分子特征 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了DCIS的转录异质性，并发现了与侵袭性表型相关的特定转录本 | NA | 探讨原位导管癌的生物学特征和肿瘤内异质性 | 原位导管癌（DCIS）及其侵袭性导管癌（IDC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个DCIS和IDC样本的单细胞转录组数据 |
| 21715 | 2024-08-08 |
Benchmarking computational methods for B-cell receptor reconstruction from single-cell RNA-seq data
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac049
PMID:35855325
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研究论文 | 评估六种现有方法从单细胞RNA测序数据中重建全长B细胞受体的能力 | 提出了选择最佳方法的指南，并验证了组装的B细胞受体在表达为单克隆抗体时能识别其预期目标 | 缺乏对影响性能的因素如测序深度、读长或体细胞超突变数量的全面评估 | 评估不同方法从单细胞RNA测序数据中重建全长B细胞受体的性能 | 六种现有方法和四种SMART-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 一个模拟数据集和三个实验SMART-seq数据集 |
| 21716 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics reveal cellular-specific responses and microenvironment remodeling in aristolochic acid nephropathy
2022-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157360
PMID:35852860
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研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组学、批量转录组学和基于质谱的蛋白质组学分析，揭示了马兜铃酸肾病中细胞特异性反应和微环境重塑的机制。 | 首次综合运用单细胞RNA测序、批量RNA测序和蛋白质组学技术，详细阐明了马兜铃酸I引起的肾脏损伤的分子机制。 | 研究仅限于小鼠模型，可能限制了结果在人类中的直接应用。 | 旨在阐明马兜铃酸I引起的肾脏损伤的分子机制，并探索潜在的治疗干预途径。 | 研究对象为急性暴露于马兜铃酸I的小鼠肾脏。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、质谱蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 小鼠肾脏样本 |
| 21717 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Range of Transcriptional States of Circulating Human Neutrophils
2022-08-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200154
PMID:35858733
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了循环中人类中性粒细胞的转录状态多样性 | 本文通过改进数据分析流程，显著提高了单细胞RNA测序中人类中性粒细胞的检测率，并发现了中性粒细胞的四种可重复的转录簇 | NA | 研究人类中性粒细胞的转录异质性及其在健康和疾病中的潜在影响 | 人类循环中的中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 健康人类个体的样本 |
| 21718 | 2024-08-08 |
Effective enrichment of stem cells in regenerating Xenopus laevis tadpole tails using the side population method
2022-Aug, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12797
PMID:35839785
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研究论文 | 本文研究了使用侧群方法在再生非洲爪蟾蝌蚪尾巴中有效富集干细胞的方法 | 首次评估了侧群方法在非洲爪蟾蝌蚪尾巴再生中富集干细胞的有效性，并结合单细胞RNA测序进行分析 | 由于组织干细胞的稀有性，揭示其在尾巴再生过程中的行为动态较为困难 | 研究并分析在尾巴再生过程中稀有组织干细胞的行为动态 | 非洲爪蟾蝌蚪尾巴再生中的组织干细胞 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从再生芽中提取的侧群细胞 |
| 21719 | 2024-08-08 |
Panoramic comparison between NK cells in healthy and cancerous liver through single-cell RNA sequencing
2022-Jul-21, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了健康和癌症肝脏中的NK细胞，揭示了NK细胞在肝细胞癌环境中的生物学特征和潜在的预后标志物 | 首次详细描述了健康人肝脏中NK细胞的5个特定亚群，并发现肝细胞癌和癌旁组织中缺失某些具有强抗癌活性的NK细胞亚群 | 样本量较小，仅包括1个血液样本和3个健康肝脏组织样本，4个肝细胞癌肿瘤组织样本及1个癌旁肝脏组织样本 | 确定NK细胞在肝细胞癌发生和预后中的作用 | NK细胞在健康和肝细胞癌环境中的发育进程、转录组景观和功能亚型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1个血液样本，3个健康肝脏组织样本，4个肝细胞癌肿瘤组织样本，1个癌旁肝脏组织样本 |
| 21720 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome of the mouse retinal pigment epithelium in response to a low-dose of doxorubicin
2022-07-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03676-3
PMID:35859009
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研究论文 | 研究分析了正常小鼠和低剂量多柔比星诱导的视网膜色素上皮细胞衰老小鼠的单细胞转录组 | 首次详细描述了正常视网膜色素上皮细胞和衰老视网膜色素上皮细胞的单细胞RNA图谱，并发现了与衰老相关的新的基因表达变化 | NA | 探讨视网膜色素上皮细胞在衰老过程中的单细胞转录组变化 | 小鼠视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 正常小鼠和低剂量多柔比星处理的小鼠 |