单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 21621 - 21640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21621 | 2024-08-08 |
Single-Cell Antibody Sequencing in Atherosclerosis Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1924-7_46
PMID:35238000
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研究论文 | 本文介绍了通过单细胞抗体测序（scAb-Seq）补充单细胞RNA测序（scRNA-seq）获得的转录组信息，特别是在免疫细胞中，这种方法的重要性在于mRNA与细胞表面表达之间的相关性很弱。 | scAb-Seq技术利用商业化的抗体和抗体混合物，能够检测到多达200种抗体，通过三部分DNA序列同时检测抗体特异性DNA序列和cDNA的延伸。 | NA | 探讨单细胞抗体测序在动脉粥样硬化研究中的应用。 | 研究对象包括组织或血液细胞的表面蛋白表达。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞抗体测序（scAb-Seq） | NA | 序列数据 | 涉及多达200种抗体 |
| 21622 | 2024-08-08 |
Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1
2022-Jan, Gland surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.21037/gs-21-908
PMID:35242686
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研究论文 | 本研究探讨了赖氨酰氧化酶（LOX）通过骨形态发生蛋白1（BMP1）促进间变性甲状腺癌（ATC）细胞增殖和转移的机制 | 本研究首次揭示了LOX和BMP1在ATC恶性进展中的作用，为ATC的治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 研究LOX和BMP1在间变性甲状腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 间变性甲状腺癌细胞及其增殖和转移机制 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析 | NA | RNA序列数据 | ATC组织和细胞系的数据 |
| 21623 | 2024-08-08 |
Identification of Rat Testicular Leydig Precursor Cells by Single-Cell-RNA-Sequence Analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.805249
PMID:35242757
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，识别了大鼠睾丸间质前体细胞，并探讨了其在成年睾丸中的特性与调控机制 | 研究揭示了间质细胞在成年睾丸中的再生机制，并提出了关于干细胞身份、增殖、分化及调控的新理论 | NA | 探讨大鼠睾丸间质干细胞在成年睾丸中的识别、特性及其调控机制 | 大鼠睾丸间质干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个间质细胞群 |
| 21624 | 2024-08-08 |
Investigation of an FGFR-Signaling-Related Prognostic Model and Immune Landscape in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.801715
PMID:35237609
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研究论文 | 本文研究了头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中与FGFR信号相关的预后模型和免疫景观 | 首次系统地研究了基于纤维化信号、缺氧和糖酵解的可靠预后标志物 | NA | 建立一个与纤维化-缺氧-糖酵解相关的预测模型，用于HNSCC的预后和相关免疫浸润 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC） | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 微阵列数据分析，ssGSEA算法，LASSO方法，免疫组化（IHC），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据，免疫细胞浸润数据 | 发现队列来自TCGA数据库，独立验证队列来自GEO数据库，单细胞RNA测序数据集用于澄清相关免疫浸润 |
| 21625 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Unveils the Heterogeneity of Nonimmune Cells in Chronic Apical Periodontitis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.820274
PMID:35237614
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research paper | 本研究通过单细胞测序技术揭示了慢性根尖周炎中非免疫细胞的异质性 | 首次构建了慢性根尖周炎的单细胞图谱，并揭示了非免疫细胞的多样性和异质性 | NA | 帮助理解根尖周组织的病理生理学 | 慢性根尖周炎中的非免疫细胞 | digital pathology | 口腔疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 26,737个高质量细胞 |
| 21626 | 2024-08-08 |
Mapping the developing human cardiac endothelium at single-cell resolution identifies MECOM as a regulator of arteriovenous gene expression
2022-11-10, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac023
PMID:35212715
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿心脏内皮细胞的转录组，揭示了内皮细胞亚型的多样性和转录动态，并识别出MECOM作为动静脉基因表达的调节因子 | 首次在单细胞分辨率下描绘了人类胎儿心脏内皮细胞的转录组，揭示了内皮细胞亚型的多样性和转录动态，并发现了MECOM在动静脉基因表达中的调节作用 | 研究主要基于人类胎儿心脏内皮细胞，未涉及成人心脏内皮细胞，且数据比较仅限于小鼠心脏发育 | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人类胎儿心脏内皮细胞的细胞异质性和转录动态，以深入理解心脏血管发育 | 人类胎儿心脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过10,000个胎儿心脏内皮细胞 |
| 21627 | 2024-08-08 |
CoSpar identifies early cell fate biases from single-cell transcriptomic and lineage information
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01209-1
PMID:35190690
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研究论文 | 本文开发了一种名为CoSpar的计算方法，用于从单细胞转录组学和谱系追踪信息中推断细胞动态 | CoSpar基于过渡图的连贯性和稀疏性假设，对严重降采样和分散的谱系数据具有鲁棒性，能够识别早期命运偏倚 | NA | 旨在从单细胞基因组广泛分析中重建细胞分化、疾病发生和药物反应的动态过渡 | 单细胞转录组学和谱系追踪信息 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | CoSpar | 转录组数据 | 涉及造血、重编程和定向分化的数据集 |
| 21628 | 2024-08-08 |
Mitochondrial variant enrichment from high-throughput single-cell RNA sequencing resolves clonal populations
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01210-8
PMID:35210612
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研究论文 | 本文结合单细胞转录组学和线粒体DNA变异检测，通过增加线粒体转录组富集的覆盖率，提高了复杂组织中线粒体变异的检测能力 | 本文采用3'单细胞RNA测序协议与线粒体转录组富集相结合的方法，使覆盖率提高了50倍以上，实现了高置信度的突变检测 | NA | 研究如何在复杂组织中建立人类细胞的谱系关系 | 人类细胞的线粒体变异和谱系关系 | 数字病理学 | 克隆性造血 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21629 | 2024-08-08 |
Single-cell atlases: shared and tissue-specific cell types across human organs
2022-07, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-022-00449-w
PMID:35217821
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在构建人类细胞图谱中的应用，并探讨了不同器官中细胞类型的共性和特异性 | 介绍了单细胞基因表达数据在人类和鼠类中的应用，对比了两者在细胞类型上的差异 | NA | 旨在生成一个整合的人类细胞图谱，涵盖人体所有细胞 | 研究了人类器官中的上皮细胞、成纤维细胞、血管细胞和免疫细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21630 | 2024-08-08 |
Entinostat Decreases Immune Suppression to Promote Antitumor Responses in a HER2+ Breast Tumor Microenvironment
2022-05-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0170
PMID:35201318
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析了entinostat和免疫检查点抑制剂联合治疗对HER2阳性乳腺癌肿瘤微环境的影响 | 首次全面描述了entinostat诱导的肿瘤微环境从促肿瘤向抗肿瘤转变的详细变化，特别是在髓系细胞中的变化 | NA | 探讨entinostat如何通过改变免疫抑制性肿瘤微环境来增强免疫检查点抑制剂的抗肿瘤反应 | HER2阳性乳腺癌肿瘤微环境中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受entinostat和ICI治疗的小鼠的HER2过度表达的乳腺癌肿瘤样本 |
| 21631 | 2024-08-08 |
Genomic Correlates of Outcome in Tumor-Infiltrating Lymphocyte Therapy for Metastatic Melanoma
2022-05-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1060
PMID:35190823
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）疗法在转移性黑色素瘤中的基因组相关性 | 首次揭示了新抗原负荷与总体生存率的正相关性，并发现特定基因表达与治疗反应之间的关系 | 样本量相对较小，且研究结果需要在更大规模的研究中验证 | 确定肿瘤浸润淋巴细胞疗法在转移性黑色素瘤中的治疗结果的基因组相关性 | 转移性黑色素瘤患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 全外显子测序（WES），RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 64个样本进行全外显子测序，34个样本进行RNA测序 |
| 21632 | 2024-08-08 |
Discovery and Application of Postnatal Nucleus Pulposus Progenitors Essential for Intervertebral Disc Homeostasis and Degeneration
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202104888
PMID:35195356
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，鉴定了在小鼠和人类样本中表达urotensin II受体（UTS2R）的产后髓核前体细胞（ProNPs），并探讨了其在椎间盘稳态和退变中的作用。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了产后髓核前体细胞的存在及其在椎间盘退变中的作用，并提出了潜在的诊断和治疗靶点。 | NA | 探讨产后髓核前体细胞在椎间盘稳态和退变中的作用及其潜在的诊断和治疗价值。 | 小鼠和人类的产后髓核前体细胞及其在椎间盘退变中的作用。 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠和人类样本 |
| 21633 | 2024-08-08 |
Neuropilin-1-Mediated SARS-CoV-2 Infection in Bone Marrow-Derived Macrophages Inhibits Osteoclast Differentiation
2022-05, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202200007
PMID:35195371
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research paper | 研究SARS-CoV-2通过神经纤毛蛋白-1（NRP1）感染骨髓来源的巨噬细胞（BMMs）并抑制破骨细胞分化的情况 | 首次发现NRP1而非ACE2是SARS-CoV-2进入BMMs的关键受体，并揭示了SARS-CoV-2感染抑制BMMs向破骨细胞分化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类情况存在差异 | 探讨SARS-CoV-2在骨髓来源巨噬细胞中的感染机制及其对破骨细胞分化的影响 | SARS-CoV-2感染的骨髓来源巨噬细胞及其对破骨细胞分化的影响 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 使用野生型和beta株（B.1.351）病毒感染的小鼠模型 |
| 21634 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics in human skin research: available technologies, technical considerations and disease applications
2022-05, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14547
PMID:35196402
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序技术在人类皮肤研究中的可用技术、技术考虑因素及其在皮肤病学中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够以前所未有的分辨率解析人类疾病病理生理学，通过评估细胞间的变异，有助于识别稀有细胞群体并阐明细胞异质性 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在皮肤病学中的应用 | 人类皮肤生物学及皮肤病 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21635 | 2024-08-08 |
Identification of new marker genes from plant single-cell RNA-seq data using interpretable machine learning methods
2022-05, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.18053
PMID:35211979
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研究论文 | 本研究开发了一种名为single-cell predictive marker (SPmarker)的机器学习流程，用于从拟南芥根部单细胞RNA测序数据中识别新型细胞类型标记基因 | 该方法采用可解释的机器学习模型来选择标记基因，与传统方法不同，能够识别出数百个之前未被发现的新标记基因，并在水稻单细胞集群中识别出更多的直系同源基因 | NA | 旨在从单细胞RNA测序数据中识别新型细胞类型标记基因 | 拟南芥根部的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 可解释的机器学习模型 | RNA测序数据 | 涉及多个非拟南芥物种的根毛细胞 |
| 21636 | 2024-08-08 |
Ulcerative colitis is characterized by a plasmablast-skewed humoral response associated with disease activity
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01680-y
PMID:35190725
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、单细胞IgH基因测序和蛋白质水平验证，全面定义了溃疡性结肠炎（UC）相关肠道炎症期间B细胞的组成、转录和克隆型景观 | 发现了黏膜B细胞区室的主要扰动，包括幼稚B细胞和IgG浆细胞的扩张，以及从UC肠道炎症中分离出的自身反应性浆细胞克隆 | NA | 全面定义溃疡性结肠炎相关肠道炎症期间B细胞的景观 | 溃疡性结肠炎患者的B细胞 | NA | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 主要队列145例，验证队列1为664例，验证队列2为143例 |
| 21637 | 2024-08-08 |
PathogenTrack and Yeskit: tools for identifying intracellular pathogens from single-cell RNA-sequencing datasets as illustrated by application to COVID-19
2022-Apr, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-021-0915-9
PMID:35192147
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研究论文 | 本文介绍了PathogenTrack和Yeskit两种工具，用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞内病原体，并以COVID-19为例进行了应用展示 | PathogenTrack是首个能够在单细胞水平上识别细菌的工具，并且与现有的先进工具如Viral-Track相比具有竞争力 | NA | 开发和验证用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞内病原体的计算工具 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的SARS-CoV-2病毒和副溶血性嗜血杆菌 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多个真实和模拟的单细胞RNA测序数据集 |
| 21638 | 2024-08-08 |
Clinically relevant orthotopic xenograft models of patient-derived glioblastoma in zebrafish
2022-04-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049109
PMID:35199829
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研究论文 | 研究建立了斑马鱼来源的胶质母细胞瘤异种移植模型，用于预测个体胶质母细胞瘤细胞的颅内浸润倾向和药物反应 | 开发了一种新的斑马鱼异种移植模型（zPDOX），能够在20天内预测胶质母细胞瘤患者的长期结果，并评估颅内浸润倾向和个体药物敏感性 | NA | 旨在克服现有小鼠模型在技术上的限制，如从小组织样本中生成足够样本数量的困难和结果的长潜伏期 | 胶质母细胞瘤细胞的颅内浸润倾向和药物反应 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 异种移植模型 | 单细胞RNA序列数据 | 多样本来源的斑马鱼胶质母细胞瘤异种移植模型 |
| 21639 | 2024-08-08 |
Identification of novel regulators required for early development of vein pattern in the cotyledons by single-cell RNA-sequencing
2022-04, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15719
PMID:35218590
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了3天龄子叶中的14117个单细胞，以揭示子叶子叶脉早期发育的调控机制 | 发现了多个新的标记基因和子叶子叶脉的发育特征，并揭示了CYCLING DOF FACTOR 5 (CDF5)和REPRESSOR OF GA (RGA)在子叶子叶脉早期发育和功能中的潜在作用 | 子叶子叶脉早期发育的机制仍不完全清楚 | 全面表征3天龄子叶子叶脉的早期分化和发育 | 子叶子叶脉的细胞类型和新型标记基因 | 植物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14117个单细胞 |
| 21640 | 2024-08-08 |
Intratumoral plasma cells predict outcomes to PD-L1 blockade in non-small cell lung cancer
2022-03-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.02.002
PMID:35216676
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞RNA测序数据，探讨了B细胞和浆细胞在非小细胞肺癌患者接受PD-L1抑制剂治疗中的作用 | 发现B细胞和浆细胞的基因特征与PD-L1抑制剂治疗后的总生存期延长相关，且与CD8 T细胞信号独立 | NA | 研究B细胞和浆细胞在非小细胞肺癌患者接受PD-L1抑制剂治疗中的预测作用 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和治疗反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 891个非小细胞肺癌肿瘤样本 |