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当前共找到 38791 篇文献，本页显示第 2141 - 2160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2141 | 2026-03-30 |
Multimodal learning for mapping genotype-phenotype dynamics
2025-04, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00765-7
PMID:39875699
|
研究论文 | 本研究提出了一个计算集成遗传学框架，用于同时分析和解释基因型及其相关表型的高维景观，并开发了一个多模态基础模型来探索人类转录组学在细胞水平上的基因型-表型关系流形 | 整合单细胞RNA测序等高通量基因分型方法与语言模型等先进学习方法，构建了一个用于分析基因型-表型动态关系的多模态基础模型，能够以更高分辨率解析细胞异质性 | NA | 解析复杂基因表达模式如何产生复杂表型这一生物学基本问题，探索基因表达与表型表现之间的动态相互作用 | 人类转录组学数据，特别是内皮细胞中的von Willebrand因子（VWF）基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 语言模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2142 | 2026-03-30 |
Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data
2024-03, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00597-5
PMID:38438786
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCORPION的工具，用于从单细胞/核RNA测序数据重建可比较的基因调控网络，以支持群体水平的比较 | SCORPION利用消息传递算法和相同基线先验，克服了数据稀疏性和细胞异质性，在合成数据上优于12种现有基因调控网络重建技术，并能准确识别野生型和转录因子扰动细胞间的调控网络差异 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种工具，用于从单细胞转录组学数据重建可比较的基因调控网络，以进行群体水平的比较 | 单细胞/核RNA测序数据，特别是来自结直肠癌和相邻健康组织的200,436个细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 消息传递算法 | 单细胞转录组学数据 | 200,436个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2143 | 2026-03-30 |
Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools
2024-02, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00595-7
PMID:38374363
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研究论文 | 本文介绍了CellBarcode工具包及其条形码模拟套件CellBarcodeSim，用于从批量或单细胞测序数据中高效、灵活地提取和过滤多种条形码类型 | 开发了支持多种条形码类型和分析策略的通用工具，并提供了条形码模拟功能以优化识别过程 | 未明确提及具体的技术限制或性能边界 | 提高DNA细胞条形码识别的准确性和可重复性 | DNA细胞条形码 | 生物信息学 | NA | PCR和测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞测序, 批量测序 | NA | NA |
| 2144 | 2026-03-30 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-09, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为HUNTRESS的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | HUNTRESS方法在运行时间上具有线性与二次方的优势，且在合理条件下能高概率计算肿瘤的真实进展历史 | NA | 开发一种快速且准确的算法来推断肿瘤内异质性 | 单细胞测序数据中的基因型矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因型矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2145 | 2026-03-29 |
Construction of TLS-related gene signature for predicting prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2026-Apr-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000925
PMID:41894176
|
研究论文 | 本研究构建了三级淋巴结构相关基因特征（TLSRS），用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次开发了基于三级淋巴结构相关基因的预后和免疫治疗反应预测模型，并利用单细胞、空间转录组学等技术验证了基因与TLS的关联 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床验证；基因特征的普适性需在更多独立队列中验证 | 预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应，推动精准医疗发展 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 差异基因表达分析、加权相关网络分析、LASSO回归、GSEA、单细胞RNA-seq、空间转录组学、免疫组化、多重免疫荧光 | LASSO回归模型 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量，涉及肝细胞癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2146 | 2026-03-29 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Chemotherapy-Induced Changes in Osteosarcoma With a Pyroptosis-Related Gene-Based Prognostic Model
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71110
PMID:41896410
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析化疗诱导的骨肉瘤变化，并基于焦亡相关基因构建了一个预后模型Pyroscore | 首次在单细胞水平上系统分析化疗对骨肉瘤细胞亚群和肿瘤微环境的影响，并开发了基于焦亡相关基因的预后模型Pyroscore，该模型整合了101种机器学习算法进行验证 | 研究未明确说明样本来源和数量细节，且模型验证可能受限于现有数据集 | 探究化疗对骨肉瘤细胞亚群和分子通路的影响，并开发预后模型以改善患者治疗策略 | 骨肉瘤细胞及其微环境中的各种细胞亚群 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法（包括BAK1、CASP1、CASP5、CASP6等基因的整合模型） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2147 | 2026-03-29 |
Application of GBD 2021 and multiple omics to reveal the association and potential mechanism between glycated hemoglobin and intervertebral disc degeneration
2026-Mar-27, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05208-w
PMID:41893906
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研究论文 | 本研究整合全球疾病负担数据、孟德尔随机化分析、多组学数据和单细胞转录组学，全面揭示了糖化血红蛋白与椎间盘退变之间的关联及潜在机制 | 首次通过整合全球流行病学数据、孟德尔随机化因果推断、多组学整合分析及单细胞转录组学，系统揭示了HbA1c与IVDD的因果关系，并鉴定了五个关键HbA1c相关基因及其在椎间盘退变中的细胞特异性作用 | 研究主要基于公共数据库和已有测序数据，缺乏实验验证；单细胞分析样本量有限；药物靶向预测需进一步实验确认 | 阐明糖化血红蛋白对椎间盘退变的因果影响，鉴定关键相关基因并探索其分子机制及潜在治疗靶点 | 全球人群糖尿病与腰痛流行病学数据、椎间盘退变相关基因组数据、人髓核组织单细胞转录组数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 椎间盘退变 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 流行病学数据、基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 全球人群流行病学数据、大型GWAS汇总统计数据、单细胞RNA测序人髓核组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2148 | 2026-03-29 |
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04916-2
PMID:41894110
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析，探讨了肥大细胞在结直肠癌肝转移中的作用，并构建了基于肥大细胞富集基因的预测模型 | 首次结合bulk-seq和scRNA-seq数据，系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化，并鉴定出三个关键基因构建预测模型 | 样本量相对有限（223个样本），且未深入探讨肥大细胞影响肝转移的具体分子机制 | 确定肥大细胞及其富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 | 结直肠癌患者组织样本（包括原发灶和肝转移灶） | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析、CIBERSORT算法、scRNA-seq、免疫组化 | 预测模型（基于基因表达） | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、临床数据 | 223个样本（来自四个bulk-seq数据集），外加scRNA-seq数据集和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2149 | 2026-03-29 |
Th17-driven CD8+ T cells in hUC-MSC and CAR T-cell dual immunotherapy for superior anti-tumor efficacy
2026-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08656-7
PMID:41896206
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合人脐带间充质干细胞与CD19 CAR-T细胞的双重细胞免疫疗法，以增强在高肿瘤负荷条件下的抗肿瘤疗效 | 首次提出并验证了hUC-MSCs与CAR-T细胞联合使用的双重免疫治疗策略，揭示了hUC-MSCs通过诱导Th17分化促进CD8+ NK样细胞毒性T淋巴细胞生成，从而增强CAR-T细胞功能并减轻CRS的新机制 | 研究主要在异种移植模型中进行，尚未在人体临床试验中验证；对hUC-MSCs作用的具体分子机制探索仍需深入 | 提高CAR-T细胞疗法在高肿瘤负荷血液恶性肿瘤中的疗效和安全性 | B细胞淋巴瘤异种移植模型、CD19 CAR-T细胞、人脐带间充质干细胞 | 细胞免疫治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2150 | 2026-03-29 |
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68621-y
PMID:41896210
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了奈瑟菌亚黄种在头孢曲松压力下的适应性机制，包括耐药性增强、生物膜形成和遗传重编程 | 整合实验进化和单细胞转录组学，首次在单细菌细胞水平上解析了奈瑟菌亚黄种从共生体向病原体转变的多维策略 | 研究主要基于实验室进化模型，临床样本验证有限，且未全面探讨其他环境因素对适应性的影响 | 探究抗生素压力如何驱动奈瑟菌亚黄种的适应性进化，以理解共生体向病原体转变的机制 | 奈瑟菌亚黄种（Neisseria subflava） | 微生物学与单细胞分析 | 慢性呼吸道疾病 | 全基因组测序，单细胞转录组学 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 实验进化菌株及临床分离株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2151 | 2026-03-29 |
HIF1 inhibition targets tumoral and myeloid cells, and is a promising therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer
2026-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08590-8
PMID:41896221
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学等方法，揭示了缺氧诱导因子HIF1在转移性去势抵抗性前列腺癌中的作用，并证明其抑制是一种有前景的治疗策略 | 结合单细胞和空间转录组学揭示了Pten/Trp53缺失小鼠前列腺肿瘤的缺氧微环境及免疫细胞组成，并首次证明HIF1抑制可通过靶向肿瘤细胞和髓系细胞来克服去势抵抗并消除转移灶 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接转化仍需验证；HIF1抑制对上皮可塑性的影响有限 | 探究转移性去势抵抗性前列腺癌的分子和细胞机制，并评估HIF1抑制作为治疗策略的潜力 | Pten和Trp53失活的小鼠前列腺癌模型及其肝转移灶 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫组织化学分析 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2152 | 2026-03-29 |
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09841-2
PMID:41896336
|
研究论文 | 本文提出了一个名为HarveST的异构图学习框架，用于整合空间、转录组和基因-基因相互作用数据，以识别空间转录组学中的空间域和标记基因 | 开发了一个统一的异构图计算模型，结合了自监督学习和部分监督细化策略，并采用带重启的随机游走算法识别空间域特异性可变基因，支持跨连续切片的一致功能域重建 | 未在摘要中明确说明 | 提高空间转录组学数据中空间域识别和标记基因检测的准确性和生物学意义 | 人类皮层组织、小鼠嗅球和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 异构图学习框架 | 空间转录组数据、基因表达数据、空间位置数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2153 | 2026-03-29 |
Single-cell analysis of signalling and transcriptional responses to type I interferons
2026-Mar-27, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00750-3
PMID:41896367
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析，探究了人类免疫细胞对I型干扰素的信号传导和转录反应 | 首次在多种原代细胞类型中，结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序，系统比较了17种不同I型干扰素诱导的细胞特异性反应 | 未发现不同I型干扰素亚型之间存在质的差异反应，且研究主要基于体外刺激模型 | 阐明不同I型干扰素在人类免疫细胞中是否诱导不同的信号传导和转录反应 | 人类外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞组学 | NA | 质谱流式细胞术, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质磷酸化数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2154 | 2026-03-29 |
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01382-5
PMID:41896593
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研究论文 | 本研究利用深度学习算法从CT图像中自动提取身体成分参数，揭示了其与非小细胞肺癌免疫治疗结果及分子背景的关联 | 首次通过AI驱动的身体成分图谱进行多中心、多维度的综合分析，并提供了生物学解释，揭示了性别差异和位置特异性 | 研究主要基于回顾性队列，前瞻性单细胞RNA-seq队列样本量较小（n=23），且结果可能存在人群特异性 | 探索身体成分参数与NSCLC免疫治疗疗效及分子机制之间的关联 | 非小细胞肺癌患者 | 计算机视觉 | 肺癌 | 深度学习算法、单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | 深度学习 | 图像、RNA-seq数据 | 2,132名NSCLC患者，包括1,919名免疫检查点抑制剂预后队列、190名bulk RNA-seq队列和23名前瞻性单细胞RNA-seq队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2155 | 2026-03-29 |
Microglia-mediated protection against Alzheimer's disease pathology and detrimental effects in white matter revealed by Ptpn6 deletion
2026-Mar-26, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.023
PMID:41895269
|
研究论文 | 本研究通过删除Ptpn6基因，揭示了小胶质细胞在阿尔茨海默病中的保护作用及其在白质中的潜在有害影响 | 首次在全基因组CRISPR筛选中识别Ptpn6作为巨噬细胞存活的关键调节因子，并展示了其在阿尔茨海默病模型中对小胶质细胞的双重作用 | 研究主要基于TauPS2APP小鼠模型，可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性，且未详细探讨Ptpn6缺失在其他神经退行性疾病中的影响 | 探究Ptpn6基因在小胶质细胞功能中的作用及其对阿尔茨海默病病理的影响 | 小胶质细胞、巨噬细胞、TauPS2APP阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | TauPS2APP小鼠模型 | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2156 | 2026-03-29 |
Circuit and molecular mechanisms underlying incubation of methamphetamine craving in the prelimbic cortex
2026-Mar-26, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.017
PMID:41895270
|
研究论文 | 本研究揭示了前边缘皮层中生长抑素和钙结合蛋白中间神经元在甲基苯丙胺渴求孵化中的时间和环路特异性作用 | 首次阐明了前边缘皮层中不同中间神经元亚型在药物渴求不同阶段的特异性贡献，并识别出KCNC2作为潜在的阶段特异性治疗靶点 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证 | 探究甲基苯丙胺使用障碍中渴求孵化的神经机制 | 前边缘皮层的生长抑素和钙结合蛋白中间神经元 | 神经科学 | 甲基苯丙胺使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2157 | 2026-03-29 |
SPTEdU-seq enables parallel optics-free newborn cell tracking and spatial total transcriptional dynamics in intact microenvironments
2026-Mar-26, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.03.001
PMID:41895283
|
研究论文 | 本文介绍了SPTEdU-seq技术，该技术整合了空间总转录组学和5-乙炔基-2'-脱氧尿苷追踪，用于同时分析基因表达和增殖动态 | SPTEdU-seq实现了超高的编码和非编码转录本及剪接异构体检测灵敏度，并通过单分子探针设计消除了光学成像需求，能够在完整微环境中并行追踪新生细胞和空间总转录动态 | NA | 研究生物过程中增殖和转录动态的时空映射 | 小鼠大脑（发育和成年）、小鼠缺血性中风模型、小鼠和人类肾脏肿瘤 | 空间转录组学 | 缺血性中风、肾脏肿瘤 | 空间总转录组学、5-乙炔基-2'-脱氧尿苷追踪 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间总转录组学 | NA | NA |
| 2158 | 2026-03-29 |
Exploring cell types and their dynamic states in adipose tissue
2026-Mar-26, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
DOI:10.1016/j.tem.2026.01.012
PMID:41896071
|
综述 | 本文综述了脂肪组织中细胞类型及其动态状态的研究现状，包括单细胞转录组学在识别新型细胞类型和状态方面的应用 | 整合了单细胞转录组学技术的最新进展，系统性地描述了脂肪组织中多种细胞类型（如脂肪细胞、免疫细胞等）的动态状态变化及其在病理生理刺激下的可塑性机制 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结，可能未覆盖所有最新研究 | 探索脂肪组织中细胞类型的异质性及其动态功能状态，以理解脂肪组织的功能可塑性 | 脂肪组织中的细胞类型，包括脂肪细胞、脂肪干细胞和祖细胞、免疫细胞、血管细胞和间皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2159 | 2026-03-29 |
Identification of Smmhc-expressing mesenchymal cells in orofacial bone at single-cell resolution
2026-Mar-23, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00518-4
PMID:41866504
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别并描述了小鼠口面部骨骼中表达Smmhc的间充质干细胞亚群，揭示了其在颅面骨稳态中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下识别出表达Smmhc的间充质干细胞亚群，并证明其作为多能祖细胞在口面部骨发育和稳态中的不可或缺功能 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证 | 阐明口面部间充质干/基质细胞的异质性及其在颅面骨再生和稳态中的作用 | 小鼠口面部骨骼组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2160 | 2026-03-29 |
Enhancing gastric cancer immunotherapy: Insights from multi-omics analysis and innovations in photodynamic-chemotherapy nanoplatforms
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102635
PMID:41747719
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胃癌免疫检查点阻断治疗耐药的关键机制，并开发了一种新型纳米平台以增强免疫治疗效果 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析胃癌免疫治疗耐药机制，并创新性地开发了巨噬细胞膜伪装的中空介孔二氧化硅纳米颗粒作为靶向递送系统 | 研究主要基于临床前模型，尚未在大型临床试验中验证其安全性和有效性 | 克服胃癌免疫检查点阻断治疗的耐药性并开发新型联合治疗策略 | 胃癌患者组织样本以及基因工程和同系胃癌模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 图像数据 | 接受新辅助免疫检查点阻断治疗的胃癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |