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当前共找到 40164 篇文献，本页显示第 2141 - 2160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2141 | 2026-05-16 |
Global transcriptome characterization of peripheral blood mononuclear cells in individuals with chronic HIV infection
2025-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111082
PMID:40639496
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研究论文 | 采用RNA-seq和单细胞测序技术探究慢性HIV感染者外周血单个核细胞的全局转录组特征及其免疫代谢差异 | 首次系统比较不同HIV感染状态组（免疫应答者、免疫无应答者、典型进展者和精英控制者）的免疫代谢谱差异，并发现在CD8+ T细胞亚群中存在的代谢通路变异 | 样本量较小（仅18例），且未对代谢通路差异进行深入的功能验证 | 探索不同HIV感染群体中是否存在独特的免疫代谢特征 | HIV感染者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 艾滋病 | RNA-seq，单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 18例，包括4例免疫应答者、5例免疫无应答者、5例典型进展者和4例精英控制者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2142 | 2026-05-16 |
Exploring the mechanism of action of trastuzumab-induced cardiomyocyte atrophy based on the FN1/PI3K/AKT-mediated mTOR-independent signaling pathway
2025-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111087
PMID:40683573
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序和生物信息学方法，探究曲妥珠单抗诱导心肌细胞萎缩及心脏毒性的潜在机制 | 发现免疫细胞来源的FN1通过细胞外基质激活心肌细胞中PI3K/AKT介导的mTOR非依赖性信号通路，导致过度自噬和心肌萎缩 | NA | 揭示曲妥珠单抗诱导心脏毒性的潜在靶点和信号通路 | HER-2阳性乳腺癌患者来源的心肌细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌、心血管疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq）、RT-PCR、Western blot、透射电镜、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2143 | 2026-05-16 |
The role of APOBEC mutagenesis in the progression and therapeutic guidance of pancreatic cancer
2025-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111098
PMID:40812519
|
研究论文 | 对APOBEC突变在胰腺癌进展和治疗指导中的作用进行全面分析 | 首次全面分析APOBEC突变在胰腺癌中的分布特征、微环境变化及临床意义，并开发基于APOBEC突变的机器学习模型预测预后，发现伊立替康作为APOBEC突变特征抑制剂的有效性 | 未能详细说明数据集的来源和样本量，以及机器学习模型的具体构建细节和验证队列信息 | 探究APOBEC突变在胰腺癌中的生物学特征和临床相关性，以及其作为预后和免疫治疗标志物的潜力 | 胰腺腺癌患者的数据，包括全外显子组测序、靶向二代测序、转录组分析、免疫图谱、免疫检查点阻断反应、患者生存和药物敏感性数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 全外显子组测序, 靶向二代测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据, 转录组数据, 免疫数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2144 | 2026-05-16 |
Targeting the HNRNPA2B1/HDGF/PTN Axis to Overcome Radioresistance in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-08, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0808
PMID:40643435
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研究论文 | 探究HNRNPA2B1/HDGF/PTN信号通路在非小细胞肺癌放疗抵抗中的作用机制，重点分析其通过调控自噬依赖性铁死亡影响肿瘤细胞存活 | 首次揭示HNRNPA2B1/HDGF/PTN通路通过调控自噬依赖性铁死亡促进非小细胞肺癌放疗抵抗的新机制 | 主要基于体外细胞系和动物模型，缺乏临床样本验证；具体分子间相互作用细节尚需进一步阐明 | 阐明HNRNPA2B1/HDGF/PTN信号通路在非小细胞肺癌放疗抵抗中的分子机制，寻找克服放疗抵抗的新治疗靶点 | 非小细胞肺癌放疗抵抗细胞系和小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 流式细胞术, 生化染色, 逆转录定量聚合酶链反应, 蛋白质印迹, 甲基化RNA免疫沉淀定量PCR | NA | 单细胞基因表达数据, 图像, 生物化学数据 | 放疗抵抗肺癌细胞系和小鼠肿瘤模型（具体样本量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2145 | 2026-05-16 |
Resolvin D1-mediated cellular crosstalk protects against MASH
2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101454
PMID:40671835
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研究论文 | 本研究探讨了Resolvin D1介导的细胞间对话对代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的保护作用及机制 | 首次揭示了RvD1通过缓解内质网应激减少肝细胞死亡和DAMP产生，进而抑制Kupffer细胞、T细胞和肝星状细胞激活的新型细胞间对话机制 | 文章未明确提及局限性 | 确定RvD1介导的细胞间对话在MASH中的作用和机制 | 小鼠和人类的肝脏细胞，包括肝细胞、Kupffer细胞、T细胞和肝星状细胞 | NA | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 共培养实验 | NA | 转录组数据 | 小鼠n=5-6, 人类n=9-10 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2146 | 2026-05-16 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
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研究论文 | 介绍了一种名为spRefine的参考免费框架，利用基因组语言模型对空间转录组数据进行去噪和插补 | 首次将基因组语言模型应用于空间转录组数据的去噪和插补，无需参考数据，并且能通过预训练发现新的生物学信号 | NA | 开发一个参考免费的深度学习框架，用于空间转录组数据的去噪和插补，以提高数据质量和下游分析效果 | 空间转录组数据，包括不同规模的数据集 | 机器学习 | NA | 基因组语言模型 | 深度学习 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2147 | 2026-05-16 |
Brain macrophages and pial fibroblasts promote inflammation in a hypomyelination model
2025-07-04, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02063-3
PMID:40615895
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研究论文 | 本研究通过条件性失活Pdgfra基因导致前脑髓鞘形成不足，探究脑巨噬细胞与软脑膜成纤维细胞在髓鞘形成障碍模型中的促炎作用 | 首次揭示脑膜边界相关巨噬细胞（BAMs）和软脑膜成纤维细胞在髓鞘形成障碍模型中通过细胞间相互作用促进慢性炎症和组织损伤 | 未提及具体限制 | 阐明脑巨噬细胞和软脑膜成纤维细胞在髓鞘形成不足所致进行性神经功能障碍中的机制 | 新生小鼠大脑皮层，特别是脑膜边界相关巨噬细胞、小胶质细胞和软脑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2148 | 2026-05-16 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2025-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09002-1
PMID:40369080
|
研究论文 | 本研究通过基因编辑小鼠、人类及黑猩猩神经祖细胞和皮层类器官模型，证明人类特有的HARE5增强子通过调节WNT信号通路，精细调控放射状胶质细胞增殖能力，从而影响皮层发育和连通性 | 首次揭示人类加速区HARE5增强子中4个人类特异性变异通过扩增经典WNT信号，驱动神经祖细胞增殖并增加皮层兴奋性神经元数量，为理解人类皮层扩张的分子机制提供新视角 | 未明确说明，但可能包括小鼠模型与人类发育的差异、类器官模型的局限性以及仅聚焦单一增强子的窄聚焦 | 探究人类加速区HARE5增强子在皮层发育中的物种特异性功能及其对神经祖细胞增殖和皮层扩张的调控机制 | 人类、小鼠和黑猩猩的神经祖细胞及皮层类器官 | 神经发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、基因编辑、活体成像、谱系分析 | 基因敲入小鼠模型、人类和黑猩猩皮层类器官模型 | 单细胞转录组数据、活体成像数据、组织学数据 | 包括基因编辑小鼠、人类和黑猩猩神经祖细胞及皮层类器官，具体样本量未详细说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2149 | 2026-05-16 |
A statistical framework for inferring genetic requirements from embryo-scale single-cell sequencing experiments
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.03.646654
PMID:40236139
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研究论文 | 提出从胚胎尺度单细胞测序实验中推断遗传需求的统计框架 | 开发了Hooke和Platt两种软件工具，利用单细胞数据集中的统计模式来表征实验干预的直接分子和细胞后果 | NA | 建立统计框架以识别直接受遗传、化学或环境扰动影响的基因和细胞类型 | 斑马鱼胚胎的单细胞图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 数千个扰动斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2150 | 2026-05-16 |
Oncogenic and tumor-suppressive forces converge on a progenitor-orchestrated niche to shape early tumorigenesis
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.656791
PMID:40661354
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研究论文 | 整合谱系追踪、单细胞和空间转录组学，揭示胰腺导管腺癌起始过程中祖细胞样细胞协调的微环境如何汇聚致癌和抑癌力量，塑造早期肿瘤发生 | 首次通过多组学整合方法识别出祖细胞样群体作为致癌突变、可塑性和组织重塑的汇聚点，并揭示KRAS抑制与p53抑制对肿瘤起始微环境的相反调控作用 | 主要基于小鼠模型，其结果在人类胰腺导管腺癌中的直接适用性需进一步验证；研究聚焦于肿瘤起始阶段，对后续恶性进展的机制阐述有限 | 阐明良性向恶性转化过程中分子、细胞和组织水平事件如何促进或抑制恶性肿瘤形成的机制 | 胰腺导管腺癌小鼠模型中的Kras突变细胞、祖细胞样细胞及肿瘤微环境 | 机器学期 | 胰腺导管腺癌 | 谱系追踪, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 谱系追踪数据 | 涉及多时间点、多基因型的小鼠胰腺组织样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium (用于单细胞测序), 10x Visium (用于空间转录组学) | 利用10x Chromium进行单细胞RNA测序分析，并使用10x Visium进行空间转录组分析 |
| 2151 | 2026-05-16 |
Substrate stiffness dictates unique doxorubicin-induced senescence-associated secretory phenotypes and transcriptomic signatures in human pulmonary fibroblasts
2025-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01507-x
PMID:39826027
|
研究论文 | 探究基质刚度如何影响人肺成纤维细胞中阿霉素诱导的衰老相关分泌表型和转录组特征 | 首次揭示了机械张力（通过底物刚度模拟）对衰老相关分泌表型和转录组特征的影响，特别是在高刚度条件下发现独特的胶原蛋白富集特征 | 研究主要基于体外细胞培养模型，体内验证仅限于小鼠模型和公共数据集分析，缺乏更直接的临床样本验证 | 研究机械环境对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响 | 人原代肺成纤维细胞（IMR-90细胞） | 机器学习 | 肺纤维化 | 质谱分析、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 不同刚度底物上培养的IMR-90细胞样本；博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型组织样本；人间质性肺疾病的单细胞RNA测序公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2152 | 2026-05-16 |
A multi-omic single-cell landscape of the aging mouse ovary
2025-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01556-2
PMID:39934558
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研究论文 | 结合小鼠年轻和年老卵巢的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，构建了卵巢老化的多组学单细胞图谱，揭示了细胞类型特异的转录变化及其调控元件 | 首次结合单细胞转录组和染色质可及性数据，全面表征小鼠卵巢老化过程中七种主要细胞类型的分子特征，并鉴定调控这些转录变化的顺式和反式调控元件 | NA | 研究卵巢老化的分子机制，特别是细胞类型特异的转录变化及其调控元件 | 年轻和年老小鼠的卵巢细胞 | 单细胞组学 | 卵巢老化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 小鼠年轻和年老卵巢样本 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 2153 | 2026-05-16 |
Transcriptomic profiling of senescence effects on blood-brain barrier-related gene expression in brain capillary endothelial cells in a mouse model of paclitaxel-induced chemobrain
2025-06, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01561-5
PMID:39976844
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析紫杉醇诱导的脑毛细血管内皮细胞衰老对血脑屏障相关基因表达的影响 | 首次在单细胞水平揭示紫杉醇诱导的脑毛细血管内皮细胞衰老通过转录组改变（如下调细胞连接组装通路、上调细胞外基质重塑和炎症信号通路）导致血脑屏障功能障碍的机制 | 研究基于小鼠模型，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何改变与血脑屏障完整性相关的基因表达模式 | 紫杉醇处理小鼠与对照组小鼠的脑毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 化疗引起的认知障碍（化学脑） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 紫杉醇处理组和对照组小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2154 | 2026-05-16 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Reveal a Tumor Immune Cell Profile for Predicting Bladder Cancer Risk and Immunotherapy Outcomes
2025-06, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.01.016
PMID:40122457
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研究论文 | 利用肿瘤浸润免疫细胞相关基因构建模型，预测膀胱癌风险和免疫治疗效果 | 首次结合20种机器学习算法与孟德尔随机化方法，基于肿瘤浸润免疫细胞特征评分构建膀胱癌预后及免疫治疗预测模型 | 未提及明确局限性 | 开发基于肿瘤浸润免疫细胞的膀胱癌预测模型 | 膀胱癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习集成模型（20种算法） | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多组RNA表达数据和单细胞RNA数据（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2155 | 2026-05-16 |
Identifying Immunomodulatory Subpopulations of Adipose Stromal Vascular Fraction and Stem/Stromal Cells Through Single-Cell Transcriptomics and Bulk Proteomics
2025-Jun, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10889-6
PMID:40366552
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和蛋白质组学整合分析，鉴定脂肪基质血管成分和干细胞/基质细胞中具有免疫调节功能的亚群 | 首次将单细胞RNA测序与蛋白质组学数据结合，利用Scissor算法识别出未培养SVF中存在的两种新型ASC亚群——Scissor阳性（类似细胞因子刺激的免疫调节细胞）和Scissor阴性（以细胞外基质重塑为特征） | 未明确说明局限性 | 解析脂肪组织中基质血管成分来源的ASC的异质性免疫调节潜力，为治疗策略提供依据 | 人脂肪组织来源的基质血管成分及其中的脂肪干细胞/基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序， 蛋白质组学 | NA | 单细胞基因表达数据， 蛋白质组数据 | 培养的P2代ASC（暴露于炎症细胞因子）和未培养的P0代SVF样本 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2156 | 2025-05-22 |
Corrigendum to "Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics"
2025-Jun, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2025.100088
PMID:40393347
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2157 | 2026-05-16 |
Exploring genetic and immune cell dynamics in systemic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection via machine learning
2025-05-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae537
PMID:39361430
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研究论文 | 通过机器学习探索系统性红斑狼疮合并EB病毒感染患者的遗传和免疫细胞动态变化 | 首次利用机器学习识别出IFI27作为SLE合并EBV感染的关键基因，并结合单细胞RNA测序揭示其在CD4 CTL和B细胞亚群中的表达模式 | 未提供具体局限性信息 | 识别SLE合并EBV感染患者中的关键基因和免疫细胞 | 系统性红斑狼疮合并EB病毒感染患者 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来源于GEO数据库的多个数据集（GSE50772、GSE81622、GSE85599、GSE45918） | NA | NA | NA | NA |
| 2158 | 2026-05-16 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing identifies APOC1 as a biomarker and therapeutic target for G0/G1 cell cycle arrest in cholangiocarcinoma
2025-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111028
PMID:40064358
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research paper | 通过整合单细胞和批量RNA测序，确定了APOC1作为胆管癌G0/G1细胞周期阻滞的生物标志物和治疗靶点 | 首次识别APOC1为胆管癌G0/G1期阻滞的特征基因，并利用单细胞RNA测序验证其表达峰与细胞周期的关联 | NA | 探索胆管癌中诱导G0/G1期阻滞的分子机制以及鉴定G0/G1期特征生物标志物 | 胆管癌细胞 | machine learning | 胆管癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2159 | 2026-05-16 |
Morphogenic, molecular and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-04-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 通过多尺度3D成像和单细胞转录组学，揭示了鸡肺单向气流适应性的形态发生、分子和细胞特征 | 首次阐明了鸡肺中支气管末梢融合形成副支气管的过程，并发现了一种鸡特有的KRT14阳性肺泡腔细胞类型 | 研究主要基于鸡肺，对于其他鸟类或物种的泛化性有限，且功能验证尚未深入 | 探索禽类肺单向气流的发育机制及其与哺乳动物双向呼吸肺的差异 | 鸡肺的关键发育阶段样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 3D图像，单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 多关键发育阶段的鸡肺样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒，Stereo-seq空间转录组学 |
| 2160 | 2026-05-16 |
Restorative Effects of Short-Chain Fatty Acids on Corneal Homeostasis Disrupted by Antibiotic-Induced Gut Dysbiosis
2025-04, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.010
PMID:39732390
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research paper | 本研究探讨了抗生素诱导的肠道菌群失调对小鼠角膜稳态的影响，并发现短链脂肪酸可恢复角膜功能 | 首次系统揭示了肠道菌群通过短链脂肪酸信号调控角膜昼夜节律基因表达、屏障完整性和神经密度的分子机制 | 未在人体样本中验证，且短链脂肪酸对无菌小鼠的治疗效果未涉及 | 研究肠道菌群失调对角膜稳态的影响及短链脂肪酸的恢复作用 | 小鼠角膜组织及肠道菌群 | digital pathology | geriatric disease | RNA-seq, single-cell sequencing | NA | gene expression data | 未明确说明样本量 | Illumina | RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | RNA测序和单细胞测序 |