单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2141 - 2160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2141 | 2025-10-06 |
Improving reproducibility of differentially expressed genes in single-cell transcriptomic studies of neurodegenerative diseases through meta-analysis
2025-Aug-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62579-z
PMID:40796563
|
研究论文 | 开发了一种基于相对差异表达排序可重复性的非参数元分析方法，用于提高单细胞转录组研究中差异表达基因的可重复性 | 提出了SumRank元分析方法，基于跨数据集相对差异表达排序的可重复性来识别差异表达基因，相比传统方法具有更好的预测能力 | 未明确说明样本量限制，且方法在不同疾病类型中的效果存在差异 | 提高单细胞转录组研究中差异表达基因的可重复性 | 帕金森病、亨廷顿病、阿尔茨海默病、精神分裂症和COVID-19的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 非参数元分析方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2142 | 2025-10-06 |
Galectin-9 inhibition of the MIF-CD74/CD44 pathway suppresses chronic arthritis
2025-Aug-11, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.016
PMID:40798883
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现类风湿关节炎中MIF亚群的作用，并证明galectin-9通过抑制MIF-CD74/CD44通路可有效抑制关节炎破坏性表型 | 首次在单细胞水平识别RA-FLSs中的MIF功能亚群，并发现sGal-9作为新型抗MIF剂可通过阻断CD44抑制关节炎破坏进程 | 目前尚无临床批准药物，研究主要基于动物模型和体外实验 | 探索galectin-9通过抑制MIF-CD74/CD44通路治疗类风湿关节炎的机制和效果 | 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞（RA-FLSs）和小鼠关节炎模型 | 单细胞测序 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，异种移植关节炎模型，胶原诱导性关节炎模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2143 | 2025-10-06 |
Impact of intercellular adhesion molecule 1-positive dental pulp stem cells in deep caries progression
2025-08, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14248
PMID:40343788
|
研究论文 | 本研究探讨了ICAM1阳性牙髓干细胞在深龋进展中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示了深龋组织中ICAM1+ DPSCs的增多及其与单核巨噬细胞的相互作用 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体验证 | 研究ICAM1+ DPSCs在深龋免疫微环境中的作用以开发治疗策略 | 人源和小鼠模型的牙髓组织及THP-1细胞系 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞测序, 免疫荧光, 流式细胞术, RT-qPCR, Western Blot, ELISA, SCENIC, RNA-seq | NA | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人源和小鼠深龋及健康牙髓组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2144 | 2025-10-06 |
Astrocytic AEG-1 drives neuroinflammation and enhances seizure susceptibility
2025-08, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106957
PMID:40383165
|
研究论文 | 本研究探讨星形胶质细胞中AEG-1基因在神经炎症和癫痫易感性中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AEG-1表达星形胶质细胞亚群与炎症反应的关联，并证实AEG-1通过NF-κB信号通路介导神经炎症和癫痫易感性 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型和体外培养模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究星形胶质细胞AEG-1在神经炎症和癫痫易感性中的分子机制 | 小鼠模型和体外星形胶质细胞培养模型 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2145 | 2025-10-06 |
Multi-omics characterization of oncosis in spinal cord injury
2025-08, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106982
PMID:40467009
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法首次系统描绘了脊髓损伤后oncosis相关基因的时空表达图谱 | 首次在脊髓损伤中系统研究oncosis的作用，揭示了6个关键基因的时空表达模式和细胞特异性 | 研究主要基于动物模型，需要进一步验证在人类脊髓损伤中的适用性 | 阐明oncosis在脊髓损伤中的作用机制并寻找潜在治疗靶点 | 脊髓损伤大鼠模型和LPS处理的PC12细胞系 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 免疫荧光, 透射电镜 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 多个时间点的脊髓损伤大鼠样本和细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2146 | 2025-10-06 |
Emerging molecular Therapeutic targets in breast Cancer: Pathologic identification and clinical implications
2025-Aug, Human pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.humpath.2025.105881
PMID:40759284
|
综述 | 本文总结了乳腺癌当前和新兴的分子生物标志物及其在精准肿瘤学中的应用 | 系统梳理了包括液体活检、空间转录组学和高通量技术在内的新兴生物标志物发现方法及其临床转化潜力 | 生物标志物的标准化、可重复性和临床验证仍面临挑战 | 总结乳腺癌分子治疗靶点的病理学识别和临床意义 | 乳腺癌分子生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序, 液体活检, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 分子标志物数据, 肿瘤微环境数据 | NA | NA | 空间转录组学, 液体活检 | NA | NA |
| 2147 | 2025-10-06 |
MEBOCOST maps metabolite-mediated intercellular communications using single-cell RNA-seq
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf569
PMID:40568942
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序和代谢通量平衡分析的算法MEBOCOST，用于检测代谢物介导的细胞间通讯 | 首个专门针对代谢物介导的细胞间通讯设计的计算方法，克服了现有蛋白质导向方法的局限性 | NA | 开发检测代谢物介导细胞间通讯的计算工具 | 人类白色脂肪组织、小鼠棕色脂肪组织中的单细胞 | 生物信息学 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序、代谢通量平衡分析 | 计算算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2148 | 2025-10-06 |
Differences in transcriptome characteristics and drug repositioning of Alzheimer's disease according to sex
2025-06-15, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106909
PMID:40220916
|
研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病患者外周血和前额叶皮层组织的转录组特征，探索性别差异对疾病的影响并进行药物重定位分析 | 首次系统比较男女AD患者在外周血和单细胞水平上前额叶皮层转录组的差异，并基于性别差异进行药物重定位预测 | 样本量较小（共54例），仅使用公开数据库的补充数据，需要更大规模研究验证 | 探究阿尔茨海默病中的性别特异性转录组差异及其在药物重定位中的应用 | 阿尔茨海默病患者、轻度认知障碍患者和健康对照者的外周血样本及前额叶皮层组织 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, snRNA-seq, 转录组分析 | NA | RNA测序数据, 单细胞转录组数据 | 54例外周血样本（15例男性AD，10例女性AD，7例男性MCI，11例女性MCI，6例男性对照，5例女性对照），另加GEO数据库中的前额叶皮层单细胞数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2149 | 2025-10-06 |
Comprehensive profiling of migratory primordial germ cells reveals niche-specific differences in non-canonical Wnt and Nodal-Lefty signaling in anterior vs posterior migrants
2025-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610420
PMID:39257761
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠迁移期原始生殖细胞及其周围体细胞，揭示前后位置PGCs在非经典Wnt和Nodal-Lefty信号通路的差异 | 首次系统比较前后位置迁移原始生殖细胞的转录组差异，发现位置特异性信号通路变化 | 研究仅限于小鼠模型，人类数据仅通过重新分析已发表数据集验证 | 阐明迁移期原始生殖细胞在不同体细胞微环境中的转录异质性 | 小鼠原始生殖细胞和周围体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，全胚胎免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 13,262个小鼠PGCs和7,868个周围体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2150 | 2025-10-06 |
Molecular mechanism of PANoptosis and programmed cell death in neurological diseases
2025-06-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106907
PMID:40204169
|
综述 | 系统解析PANoptosis在神经疾病中的分子机制及靶向治疗策略 | 首次系统阐述PANoptosis作为新型程序性细胞死亡在神经疾病中的整合调控机制 | 主要基于临床前研究证据，尚未进行大规模临床试验验证 | 阐明PANoptosis在神经疾病发病机制中的作用并开发靶向治疗策略 | 神经炎症疾病中的程序性细胞死亡通路 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2151 | 2025-10-06 |
CD200-based cell sorting results in homogeneous transplantable striatal neuroblasts for human cell therapy for Huntington's disease
2025-06-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106905
PMID:40220917
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于CD200标记的细胞分选方法，用于生产均质可移植的纹状体神经母细胞，用于亨廷顿病的细胞治疗 | 首次鉴定CD200作为人类纹状体神经母细胞的表面标志物，并建立了基于CD200的免疫磁珠分选流程 | 研究仅在成年小鼠模型中验证了移植效果，尚未进行人体临床试验 | 开发减少异质性的细胞治疗策略，用于神经退行性疾病的治疗 | 人类纹状体神经母细胞和人类多能干细胞 | 细胞治疗 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序，免疫磁珠分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2152 | 2025-10-06 |
Erythroid progenitor cell-mediated spleen-tumor interaction deteriorates cancer immunity
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417473122
PMID:40014568
|
研究论文 | 本研究揭示了红细胞祖细胞介导的脾脏-肿瘤相互作用如何通过免疫抑制机制恶化癌症免疫 | 首次发现红细胞祖细胞在脾脏与肿瘤之间建立免疫抑制桥梁的新机制 | 研究主要聚焦头颈鳞状细胞癌，在其他癌症类型中的普适性需进一步验证 | 探索肿瘤发展过程中系统性免疫的动态变化及其对免疫治疗的影响 | 红细胞祖细胞、脾脏-肿瘤相互作用、癌症免疫微环境 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2153 | 2025-10-06 |
A transcriptome-wide association study integrating multi-omics bioinformatics and Mendelian randomization reveals the prognostic value of ADAMDEC1 in colon cancer
2025-02, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-024-03910-3
PMID:39680087
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法，揭示了ADAMDEC1基因在结肠癌预后中的保护作用 | 首次结合单细胞测序数据、批量转录组数据和孟德尔随机化方法系统鉴定结肠癌预后相关细胞和基因 | NA | 探索结肠癌预后相关的生物标志物 | 结肠癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞测序, 批量转录组测序, 孟德尔随机化, 免疫组化 | scissor算法, 摘要数据孟德尔随机化(SMR) | 基因表达数据, GWAS数据, 免疫组化图像 | 两个独立外部验证数据集(GSE17536和GSE39582)及真实世界组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2154 | 2025-10-06 |
Cholinergic waves have a modest influence on the transcriptome of retinal ganglion cells
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627027
PMID:39713433
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胆碱能波对小鼠视网膜神经节细胞转录组的影响 | 首次在单细胞水平揭示胆碱能波对视网膜神经节细胞转录组的类型特异性调控作用，而非普遍性影响 | 转录组变化幅度相对较小，仅关注出生后第一周特定发育阶段 | 探究β2烟碱型乙酰胆碱受体缺失对单个功能类型视网膜神经节细胞基因表达的影响 | 野生型和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞 | 单细胞转录组学 | 视觉系统发育障碍 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 全细胞记录 | NA | 单细胞转录组数据, 电生理数据 | 野生型和β2KO小鼠出生后第一周的视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2155 | 2025-10-06 |
Toll-like receptor agonists promote the formation of tertiary lymphoid structure and improve anti-glioma immunity
2025-Jan-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae167
PMID:39188155
|
研究论文 | 本研究通过颅内给予Toll样受体激动剂成功诱导胶质瘤微环境中三级淋巴结构形成，增强抗胶质瘤免疫反应 | 首次在胶质瘤微环境中成功诱导三级淋巴结构形成，并发现巨噬细胞/小胶质细胞和Th17细胞分别作为“LTo”和“LTi”细胞通过LTα/β-LTβR相互作用促进TLS形成 | 临床研究仅为初步探索性研究，样本量有限，需要更大规模的临床试验验证 | 探索在胶质瘤微环境中诱导三级淋巴结构形成的治疗策略，改善抗胶质瘤免疫治疗效果 | 胶质瘤小鼠模型和初步临床研究患者 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，BCR/TCR测序，染色分析，抗体中和 | NA | 基因表达数据，序列数据，图像数据 | 胶质瘤荷瘤小鼠和初步临床研究患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2156 | 2025-10-06 |
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Jan-09, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-024-00980-x
PMID:39789293
|
综述 | 本文总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用与发现 | 首次系统总结空间转录组技术在透明细胞肾癌中的研究发现，揭示肿瘤微环境的空间异质性特征 | 目前仅针对透明细胞肾癌这一亚型进行研究，缺乏其他肾癌亚型的空间转录组数据 | 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的应用价值 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2157 | 2025-10-06 |
Contributions of T Cell Signaling for Wound Healing
2024-11-14, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irae151
PMID:39110034
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光成像技术揭示了T细胞在伤口愈合过程中的信号传导特征 | 首次在伤口愈合过程中发现并验证了耗竭T细胞的存在，并揭示了不同T细胞亚群具有独特的信号传导特征 | 耗竭T细胞在伤口愈合中的分子机制和具体作用需要未来更深入的研究 | 探索T细胞在伤口愈合过程中的信号传导作用 | 伤口愈合过程中的T细胞亚群 | 免疫学 | 伤口愈合 | scRNA-seq, 免疫荧光成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2158 | 2025-10-06 |
The unveiled mosaic of intra-tumor heterogeneity in ovarian cancer through spatial transcriptomic technologies: A systematic review
2024-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.08.001
PMID:39111726
|
系统综述 | 通过空间转录组技术揭示卵巢癌肿瘤内异质性的系统综述 | 系统整合空间转录组技术在卵巢癌研究中的应用，强调空间背景对理解肿瘤异质性和微环境的重要性 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有文献分析 | 探讨空间转录组技术在卵巢癌肿瘤内异质性和肿瘤微环境研究中的应用价值 | 卵巢癌肿瘤组织及其微环境 | 数字病理 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2159 | 2025-10-06 |
Perivascular NOTCH3+ Stem Cells Drive Meningioma Tumorigenesis and Resistance to Radiotherapy
2024-Oct-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1459
PMID:38742767
|
研究论文 | 本研究揭示了血管周围NOTCH3+干细胞在脑膜瘤发生和放疗抵抗中的关键作用 | 首次发现血管周围NOTCH3+干细胞在人类、犬类和鼠类脑膜瘤中保守存在，并驱动肿瘤发生和放疗抵抗 | NA | 探索脑膜瘤发生和放疗抵抗的细胞类型及信号机制 | 人类、犬类和鼠类脑膜瘤模型 | 肿瘤生物学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、成像技术 | 基因工程小鼠模型、异种移植模型 | 基因表达数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2160 | 2025-10-06 |
DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013
PMID:38823437
|
研究论文 | 本研究探讨树突状细胞来源的CXCL10通过激活细胞毒性T淋巴细胞抑制卵巢癌的机制 | 首次揭示CXCL10在卵巢癌微环境中作为树突状细胞与细胞毒性T淋巴细胞相互作用的关键调节因子 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床验证 | 阐明树突状细胞及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中的作用机制 | 卵巢癌微环境中的树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 免疫浸润分析, 体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |