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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21521 | 2024-08-08 |
Expression and function of the luteinizing hormone choriogonadotropin receptor in human endometrial stromal cells
2022-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-12495-9
PMID:35597810
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研究论文 | 研究人类子宫内膜基质细胞中黄体生成激素/绒毛膜促性腺激素受体(LHCGR)的表达与功能 | 发现了一小部分表达LHCGR转录本的子宫内膜基质细胞亚群,这可能解释了文献中关于LHCGR表达的矛盾证据 | 未能重现LHCGR在子宫内膜基质细胞中的功能活性 | 探究LHCGR在人类子宫内膜中的表达及其功能活性 | 人类子宫内膜基质细胞中的LHCGR | NA | NA | 单细胞RNA测序 | G-蛋白偶联受体 | RNA | 包括整个周期的子宫内膜组织和培养的人类子宫内膜基质细胞的批量RNA测序数据,以及单细胞RNA测序数据 |
21522 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell RNA sequencing with spatial transcriptomics reveals immune landscape for interstitial cystitis
2022-05-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-00962-8
PMID:35589692
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,揭示了间质性膀胱炎的免疫景观 | 首次通过单细胞RNA测序与空间转录组学技术结合,详细描绘了间质性膀胱炎的免疫细胞分布和相互作用 | 研究样本仅限于女性患者,可能限制了结果的普遍性 | 探究免疫系统在间质性膀胱炎中的作用 | 间质性膀胱炎患者及压力性尿失禁对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | 间质性膀胱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 135,091个CD45免疫细胞来自15名间质性膀胱炎女性患者和9名对照组 |
21523 | 2024-08-08 |
A 3D gene expression atlas of the floral meristem based on spatial reconstruction of single nucleus RNA sequencing data
2022-05-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30177-y
PMID:35595749
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研究论文 | 本文提出了一种结合单核RNA测序和基于显微镜的3D空间重建技术,用于重建3D花序分生组织中个体细胞的全基因组基因表达模式 | 本文创新性地将单核RNA测序与3D空间重建技术结合,恢复了发育器官中细胞的原始位置,从而将基因活性与细胞身份和功能联系起来 | NA | 旨在通过空间重建的单细胞转录组图谱来理解植物形态发生 | 研究对象为花序分生组织中的细胞异质性及其基因表达模式 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
21524 | 2024-08-08 |
BMP4 drives primed to naïve transition through PGC-like state
2022-05-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30325-4
PMID:35589713
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了BMP4诱导的小鼠从激活态到原始态的转变过程,发现这一转变并非直接逆转细胞命运,而是通过类似原始生殖细胞的状态进行 | 揭示了从激活态到原始态转变的替代路径,并深入了解了生殖细胞的发育机制 | NA | 研究小鼠干细胞中从激活态到原始态的转变过程及其机制 | 小鼠的激活态和原始态干细胞及其转变过程 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
21525 | 2024-08-08 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal necroptosis-based molecular classification, tumor microenvironment infiltration characterization, and prognosis prediction in colorectal cancer
2022-05-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03431-6
PMID:35590418
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析揭示了基于坏死性凋亡的分子分类、肿瘤微环境浸润特征及结直肠癌的预后预测 | 首次全面探索了坏死性凋亡相关基因在结直肠癌中的作用,并开发了NRG_score用于预测患者生存结果 | NA | 揭示坏死性凋亡相关基因在肿瘤微环境中的潜在作用及其与临床病理参数和患者预后的关联 | 结直肠癌中的坏死性凋亡相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自复旦大学上海癌症中心的病人队列 |
21526 | 2024-08-08 |
Approaching deconvolution with Fermi's mindset
2022-05-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2022.04.004
PMID:35588698
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学(ST)技术在连接组织功能与细胞类型空间组织方面的应用,并介绍了利用ST数据生成过程细节的新算法以克服技术变异和细胞亚型差异带来的挑战。 | 本文引入了一种新的算法,该算法细致地结合了ST数据生成过程的细节,有望解决技术变异和细胞亚型差异带来的挑战。 | NA | 探索空间转录组学技术在连接组织功能与细胞类型空间组织方面的应用。 | 空间转录组学数据及其在组织功能与细胞类型空间组织中的应用。 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | NA |
21527 | 2024-08-08 |
Forward single-cell sequencing into clinical application: Understanding of ageing and rejuvenation from clinical observation to single-cell solution
2022-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.827
PMID:35593205
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
21528 | 2024-08-08 |
Extracellular vesicles from lung tissue drive bone marrow neutrophil recruitment in inflammation
2022-05, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12223
PMID:35595717
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研究论文 | 本文研究了肺组织来源的细胞外囊泡(EVs)在炎症条件下促进骨髓中性粒细胞趋化的作用 | 首次报道了肺EVs通过传递双链DNA(dsDNA)促进骨髓中性粒细胞的趋化,并揭示了其分子机制 | NA | 探讨肺EVs在体内生理或病理功能中的作用 | 肺组织来源的细胞外囊泡及其对骨髓中性粒细胞趋化的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及人类和鼠类肺组织样本 |
21529 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics provides insights into the origin and microenvironment of human oesophageal high-grade intraepithelial neoplasia
2022-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.874
PMID:35608199
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术,探讨了人食管高级别上皮内瘤变(HIN)的起源细胞及其微环境 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了HIN可能起源于慢循环的KRT15high STMN1low细胞,并描述了HIN独特的肿瘤微环境特征 | NA | 探究人食管高级别上皮内瘤变的分子和功能特性,特别是其起源细胞和微环境 | 人食管高级别上皮内瘤变及其邻近组织细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个HIN及邻近组织的细胞样本 |
21530 | 2024-08-08 |
Triple-serotype chimeric oncolytic adenovirus exerts multiple synergistic mechanisms against solid tumors
2022-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004691
PMID:35609942
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研究论文 | 本研究探讨了一种具有协同机制的溶瘤腺病毒(OncoViron)在治疗多种实体瘤中的疗效 | OncoViron通过选择性复制介导抗癌因子的高表达,特异性地针对多种实体瘤,并显著抑制癌细胞增殖。此外,OncoViron还能与程序性死亡1(PD-1)抗体和嵌合抗原受体(CAR)T细胞联合使用,显示出强大的抗癌效果 | NA | 研究溶瘤腺病毒OncoViron在治疗多种实体瘤中的疗效及其协同机制 | 溶瘤腺病毒OncoViron及其在多种实体瘤细胞系中的抗癌效果 | 癌症免疫治疗 | 实体瘤 | 细胞学实验、植入肿瘤模型、单细胞测序、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多种植入实体瘤模型的免疫缺陷小鼠、免疫活性小鼠和人类化小鼠 |
21531 | 2024-08-08 |
Selectively Imaging Cranial Sensory Ganglion Neurons Using AAV-PHP.S
2022 May-Jun, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0373-21.2022
PMID:35610024
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研究论文 | 本文利用AAV-PHP.S载体选择性地标记并成像小鼠颅神经的感觉神经节细胞 | 引入AAV-PHP.S衣壳,增强了对周围神经元的趋向性,并结合GFP或mScarlet荧光蛋白,实现了对特定感觉神经节的选择性标记 | NA | 探索并验证AAV-PHP.S在选择性标记和成像周围感觉神经元中的应用 | 小鼠颅神经V、VII、IX和X的感觉神经节细胞 | 神经科学 | NA | AAV-PHP.S | NA | 图像 | 约66%的膝状神经节神经元被转导 |
21532 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of macrophage infiltration in non-small cell lung cancer reveals determinants of sensitivity and resistance to anti-PD1/PD-L1 antibodies
2022-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003890
PMID:35618288
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研究论文 | 研究非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞浸润的空间转录组学,揭示对抗PD1/PD-L1抗体敏感性和抵抗性的决定因素 | 通过空间转录组学分析,揭示了肿瘤相关巨噬细胞在非小细胞肺癌中对抗免疫检查点抑制剂的敏感性和抵抗性的新机制 | 研究样本仅限于152名非小细胞肺癌患者,可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞浸润对非小细胞肺癌患者接受免疫检查点抑制剂治疗反应的预测价值 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本及其对免疫检查点抑制剂的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | NanoString GeoMx免疫通路检测 | NA | 转录组数据 | 152名非小细胞肺癌患者的肿瘤样本 |
21533 | 2024-08-08 |
Insight into the potential pathogenesis of human osteoarthritis via single-cell RNA sequencing data on osteoblasts
2022-04-20, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022297
PMID:35603405
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了人类骨关节炎中成骨细胞的潜在发病机制 | 首次全面分析了骨关节炎中成骨细胞的分子程序,并构建了miRNA-mRNA调控网络 | 实验验证的miRNA数量有限,可能未涵盖所有潜在的调控关系 | 探究骨关节炎中成骨细胞的分子功能及其在疾病发病机制中的作用 | 成骨细胞及其在骨关节炎中的分子表达和功能 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 4387个成骨细胞样本 |
21534 | 2024-08-08 |
Analysis of single-cell RNA-sequencing data identifies a hypoxic tumor subpopulation associated with poor prognosis in triple-negative breast cancer
2022-04-06, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022271
PMID:35603379
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析三阴性乳腺癌中的缺氧肿瘤亚群,并探讨其与不良预后的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与三阴性乳腺癌不良预后相关的缺氧肿瘤亚群,并构建了预测总体生存的风险评分模型 | 需要进一步研究缺氧肿瘤微环境中的细胞间通讯异质性 | 探索三阴性乳腺癌中缺氧肿瘤亚群与不良预后的机制 | 三阴性乳腺癌中的缺氧肿瘤亚群及其在肿瘤发展中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的单细胞RNA测序数据GSM4476488,以及来自The Cancer Genome Atlas和GEO的数据集 |
21535 | 2024-08-08 |
Deciphering the Molecular Mechanism of Flares in Patients with Systemic Lupus Erythematosus through Single-Cell Transcriptome Analysis of the Peripheral Blood
2022-Mar, Mediterranean journal of rheumatology
DOI:10.31138/mjr.33.1.94
PMID:35611101
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析技术,探索系统性红斑狼疮患者外周血中细胞和分子机制,以解释疾病从静止期到活动期的进展 | 采用单细胞测序技术,详细描绘了系统性红斑狼疮从静止期到活动期进展中免疫细胞亚群的分子和调控程序 | NA | 解码系统性红斑狼疮患者病情加重的细胞和分子基础 | 系统性红斑狼疮患者的外周血细胞 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 数千个细胞 |
21536 | 2024-08-08 |
NISC: Neural Network-Imputation for Single-Cell RNA Sequencing and Cell Type Clustering
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.847112
PMID:35591853
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研究论文 | 本研究开发了一种基于神经网络的单细胞RNA测序数据插补方法NISC,用于处理高稀疏性的scRNA-seq数据并提高细胞类型识别的准确性 | NISC利用自编码器结合加权损失函数和正则化技术,有效纠正scRNA-seq数据中的缺失值,其性能优于现有的插补方法 | NA | 开发一种新的插补方法以处理单细胞RNA测序数据中的高稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据及其细胞类型聚类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 数万个单个细胞 |
21537 | 2024-08-08 |
PRKAR1A and SDCBP Serve as Potential Predictors of Heart Failure Following Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.878876
PMID:35592331
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研究论文 | 本研究旨在通过转录组数据分析,识别急性心肌梗死后心力衰竭进展的新预测生物标志物,并揭示这些标志基因在心力衰竭进展中的病理机制 | 本研究首次发现PRKAR1A和SDCBP作为急性心肌梗死后心力衰竭的新预测生物标志物,并揭示了它们在心力衰竭进展中的潜在调控机制 | 研究样本量较小,需要在更大规模的研究中验证这些生物标志物的预测价值 | 识别急性心肌梗死后心力衰竭的新预测生物标志物,并揭示其病理机制 | 急性心肌梗死患者的心力衰竭进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | NA | 转录组数据 | 32名急性心肌梗死患者(16名心力衰竭进展,16名无进展),17名急性心肌梗死患者(9名心力衰竭进展,8名无进展),正常和梗死小鼠心脏组织中的白细胞 |
21538 | 2024-08-08 |
A Protocol for the Cryopreservation of Human Intestinal Mucosal Biopsies Compatible With Single-Cell Transcriptomics and Ex Vivo Studies
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.878389
PMID:35600311
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研究论文 | 本文介绍了一种用于人肠道黏膜活检的冷冻保存工作流程,该流程适用于单细胞转录组学和体外研究 | 该研究提供了一种可行的方法,用于从冷冻保存的肠道黏膜活检中进行单细胞转录组学研究 | NA | 旨在理解疾病状态下人肠道上皮细胞的异质性及其病理生理机制 | 人肠道黏膜活检和肠道上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 单细胞 | 59,653个肠道细胞,来自10名参与者 |
21539 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Targets for Parkinson's Disease
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.686739
PMID:35601482
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示帕金森病(PD)的细胞异质性、机制及治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析PD患者与健康人的中脑样本,揭示了PD的细胞异质性及其在细胞间通讯中的作用,并发现了五个可能的治疗靶点 | 研究样本量较小,且仅限于中脑样本,需要进一步的大规模临床研究验证 | 揭示帕金森病的细胞异质性、机制及治疗靶点 | 帕金森病患者与健康人的中脑样本 | 单细胞转录组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 主成分分析(PCA) | 转录组数据 | 18名帕金森病患者和18名健康人的血液样本 |
21540 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveal Intratumoral Heterogeneity and Tumor Microenvironment Characteristics in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.881345
PMID:35601491
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的肿瘤内异质性和肿瘤微环境特征 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了DLBCL中恶性细胞和免疫细胞的不同亚群,并构建了一个预测DLBCL患者预后的模型 | NA | 旨在深入解析弥漫大B细胞淋巴瘤的转录特征和肿瘤微环境 | 弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2个反应性淋巴结组织样本和2个DLBCL淋巴结活检组织样本 |